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Cytotoxic sesquiterpene aryl esters from Armillaria gallica 012m
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作者 Yanping Li Shuizhu Lou +5 位作者 Run Yang Ling Zhang Qiuping Zou Shanzhai Shang Lu Gao Weiguang Wang 《Chinese Herbal Medicines》 CAS 2023年第2期343-346,共4页
Objective:To study the chemical constituents of the EtOAc extract of Armillaria gallica 012m.Methods:The chemical constituents of the EtOAc extract of A.gallica 012m were isolated and purified by various column chroma... Objective:To study the chemical constituents of the EtOAc extract of Armillaria gallica 012m.Methods:The chemical constituents of the EtOAc extract of A.gallica 012m were isolated and purified by various column chromatography and their structures were elucidated on the basis of the 1D and 2D NMR spectroscopic and HRESIMS data.Cytotoxicity of all isolates against A549,HCT-116,M231 and W256 human tumor cells was determined by the MTT method.Results:A new sesquiterpene aryl ester,armimelleolide C(1),and eight known ones including armillarivin(2),melleolide F(3),6'-chloromelleolide F(4),melleolide(5),melleolide K(6),melledonol(7),13-hydroxydihydromelleolide(8),and armillane(9),were isolated from the EtOAc extract of A.gallica 012m.All isolates showed potential cytotoxic activities against at least one of the human cancer cell lines with IC_(50) values ranging from(3.17±0.54)to(17.57±0.47)μmol/L.Compound 1 showed significant inhibitory activity against M231 with an IC_(50) value of(7.54±0.24)μmol/L compared with paclitaxel as the positive control.Compounds 2,3,and 7,9 showed obvious inhibitory activity against HCT-116 and were better than that of the positive control.Conclusion:The chemical constituents including a new sesquiterpene aryl ester armimelleolide C(1)from the EtOAc extract of A.gallica 012m have a variety of structures and potential antitumor activities. 展开更多
关键词 armillaria gallica 012m armimelleolide C cytotoxic activity sesquiterpene aryl esters TRICHOLOMATACEAE
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用ISSR标记研究高卢蜜环菌系统发生学的尝试 被引量:31
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作者 孙立夫 杨国亭 +2 位作者 秦国夫 宋玉双 宋瑞清 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期317-322,共6页
用ISSR(Inter SimpleSequenceRepeat)标记对黑龙江省牡丹江地区高卢蜜环菌的系统发生学进行了研究 ,用 6个引物对 35个菌株的DNA模板进行扩增。结果表明该地区的 35个菌株分属 3个不同的发育系 ,并且 3个发育系在地理分布上是交错在一... 用ISSR(Inter SimpleSequenceRepeat)标记对黑龙江省牡丹江地区高卢蜜环菌的系统发生学进行了研究 ,用 6个引物对 35个菌株的DNA模板进行扩增。结果表明该地区的 35个菌株分属 3个不同的发育系 ,并且 3个发育系在地理分布上是交错在一起的。同时表明ISSR标记是研究蜜环菌系统发育关系的理想的分子标记手段。 展开更多
关键词 ISSR标记 高卢蜜环菌 系统发生学 担子菌亚门
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北半球高卢蜜环菌的遗传多样性与分子鉴定 被引量:14
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作者 秦国夫 赵俊 +1 位作者 田淑敏 JarkkoHantula 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2001年第2期61-68,共8页
从北美、欧洲和中国收集 2 3个高卢蜜环菌菌株 ,PCR扩增其rDNA的IGS和ITS区域 ,用AluⅠ、HaeⅢ、HinfⅠ和TagⅠ四种限制性内切酶进行酶切 ,同时结合随机扩增微卫星 (RAMS)多态性 ,对北半球的高卢蜜环菌的遗传多样性进行了分析。结果发... 从北美、欧洲和中国收集 2 3个高卢蜜环菌菌株 ,PCR扩增其rDNA的IGS和ITS区域 ,用AluⅠ、HaeⅢ、HinfⅠ和TagⅠ四种限制性内切酶进行酶切 ,同时结合随机扩增微卫星 (RAMS)多态性 ,对北半球的高卢蜜环菌的遗传多样性进行了分析。结果发现了高卢蜜环菌的 6种IGS RFLP图谱类型 ,其中gal(B)和gal(D)是国内外尚无报道的新的IGS RFLP型。RFLP系统树发现该种有明显的大陆之间遗传分化 ,存在中国、欧洲、北美和亚洲 4个亚群体。RAMS分析表明北半球高卢蜜环菌存在亚洲、欧洲、北美 中国和北美 欧洲等 4个高卢蜜环菌发育系 ,而且不同大陆的高卢蜜环菌具有较近的亲缘关系 ,而相同大陆的却具有不同的起源 ,特别是北美的高卢蜜环菌两个发育系异源性很高 ,北美东部的发育系同欧洲的关系比较近 ,而北美西部的同亚洲关系比较近。 展开更多
关键词 高卢蜜环菌 遗传多样性 IGS-RFLP RAMS分析 遗传分化 林木病原菌
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高卢蜜环菌杂交菌株筛选初探 被引量:2
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作者 赵俊 赵杰 秦国夫 《食用菌学报》 2007年第4期31-35,共5页
提出蜜环菌单孢亲本菌株及杂交菌株的筛选标准,从114个高卢蜜环菌菌株中选出15个欧洲、北美及中国的单孢亲本菌株,通过杂交,筛选出6个具有杂交优势的组合(A3E3、A3C1、A3C3、A3C4、A3C3和A1C3)。
关键词 高卢蜜环菌 杂交 筛选
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蜜环菌胞外酶和多糖含量变化规律研究 被引量:11
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作者 刘天睿 张薇薇 +4 位作者 王忠巧 杨勇述 徐怀有 宋明海 包海鹰 《中药材》 CAS 北大核心 2019年第1期57-61,共5页
目的:比较高卢蜜环菌M1、M2两菌株胞外酶活性、菌丝多糖变化规律及菌株生长量,初步筛选出优良菌株。方法:利用改良PDA固体培养基培养菌株M1和M2,采用十字交叉法测定生长量,ABTS法及DNS显色法检测胞外酶活性,用浓硫酸-苯酚法对二者多糖... 目的:比较高卢蜜环菌M1、M2两菌株胞外酶活性、菌丝多糖变化规律及菌株生长量,初步筛选出优良菌株。方法:利用改良PDA固体培养基培养菌株M1和M2,采用十字交叉法测定生长量,ABTS法及DNS显色法检测胞外酶活性,用浓硫酸-苯酚法对二者多糖含量进行测定。结果:M1菌株生长速度快,菌索粗壮,分支较多,长势较好。木聚糖酶是蜜环菌主要作用的胞外酶,其活力远高于纤维素酶、漆酶和果胶酶,M1菌株的木聚糖酶活力更高。M1和M2菌丝体多糖含量最高分别为38.958 mg/g和32.717 mg/g,多糖的累积与其分泌的胞外酶漆酶、木聚糖酶活力呈现显著相关性。结论:通过对M1、M2两菌株生长量、胞外酶活力及菌丝体多糖的比较和分析,初步认为M1为优势菌株。 展开更多
关键词 高卢蜜环菌 胞外酶 多糖
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一株适合红天麻伴栽的蜜环菌菌株筛选 被引量:8
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作者 程瑞 刘天睿 +3 位作者 李仰华 周俊辉 赵玉洋 袁媛 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期374-381,共8页
为了筛选适宜红天麻伴栽的蜜环菌菌株,该研究通过对不同产区伴栽天麻的蜜环菌菌株的分离鉴定、蜜环菌菌株的生长特征比较及伴栽天麻实验,筛选出了1株适宜红天麻伴栽的高卢蜜环菌菌株。收集4个天麻产区伴栽天麻使用的菌材,分离菌材上的... 为了筛选适宜红天麻伴栽的蜜环菌菌株,该研究通过对不同产区伴栽天麻的蜜环菌菌株的分离鉴定、蜜环菌菌株的生长特征比较及伴栽天麻实验,筛选出了1株适宜红天麻伴栽的高卢蜜环菌菌株。收集4个天麻产区伴栽天麻使用的菌材,分离菌材上的蜜环菌菌株(G、Y、S、H),采用形态学鉴定与系统发育树相结合的方法,对蜜环菌菌株进行鉴定,确定栽培天麻常用的蜜环菌菌株种类;基于课题组的前期研究对蜜环菌菌株蔗糖酶基因型进行鉴定,以确定蜜环菌菌株的基因型特征;通过对蜜环菌菌株菌索生长速度、直径、干重及多糖含量的测定确定蜜环菌菌株的生长特征;结合蜜环菌菌株的生物学特性和蔗糖酶基因型特征,选择了2株不同的菌株进行天麻伴栽实验,测定天麻产量、天麻素和对羟基苯甲醇含量,筛选出最适合红天麻伴栽的菌株。该研究发现4株蜜环菌菌株均为高卢蜜环菌Armillaria gallica;同一蔗糖酶基因型的菌株G、H菌索总长度、生长速度、直径、分支数、干重和多糖含量均高于同一蔗糖酶基因型的菌株S、Y;分别使用菌株H、S伴栽天麻,发现使用生长速度更快、分支数更多的菌株H伴栽天麻的产量为6.528 kg·m^(-2)、天麻素和对羟基苯甲醇总量为0.566%,均高于菌株S伴栽的天麻,分别是菌株S伴栽的4.58、1.30倍。通过比较4株蜜环菌的生长特性和蔗糖酶基因型筛选出了2株蜜环菌菌株H、S,结合2株菌株伴栽天麻的产量、天麻素和对羟基苯甲醇总含量,优选出了菌株H为红天麻伴栽的优势菌株,为天麻的高产优质栽培提供依据。 展开更多
关键词 高卢蜜环菌 天麻 蔗糖酶基因型 生长特性
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中国与欧洲高卢蜜环菌的遗传多样性 被引量:1
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作者 孙立夫 裴克全 +5 位作者 张艳华 赵俊 杨国亭 秦国夫 宋玉双 宋瑞清 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期224-230,共7页
高卢蜜环菌(Armillaria gallica)为北半球广布种,不同大陆间的菌株遗传相似性和多样性水平能反映出该种在洲际大陆尺度上的地理遗传变异关系。作者用ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记技术,对从中国和欧洲收集到的高卢蜜环菌7... 高卢蜜环菌(Armillaria gallica)为北半球广布种,不同大陆间的菌株遗传相似性和多样性水平能反映出该种在洲际大陆尺度上的地理遗传变异关系。作者用ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记技术,对从中国和欧洲收集到的高卢蜜环菌79个菌株进行了遗传多样性分析。用6个ISSR引物扩增得到210个位点,其中多态性位点(频率<0.95)为202个,占96.2%,平均每个引物多态位点多达33.6个,表明ISSR标记在蜜环菌中存在较高的多态性。根据非加权类平均法(UPGMA)聚类分析,中国53个菌株中的49个在0.773的相似性水平上聚成了中国类群(China group);而欧洲26个菌株遗传分化较大,分别在0.775和0.763的相似性水平上聚成了欧洲类群A(Europe group A)和B(Europe group B);2个欧洲类群间的相似性水平仅为0.738,而欧洲类群A与中国类群间的相似性却达到了0.770;两个大陆均有少数菌株表现出较为明显的遗传分化,个别菌株的种内遗传相似性甚至低于蜜环菌种间的遗传相似性。结果表明,中欧两个大陆间的A.gallica菌株因地理隔离已经表现出明显的遗传分化,处于异域物种形成过程中;欧洲大陆的菌株遗传分化更为明显,可能是两个大陆A.gallica菌株的起源地。 展开更多
关键词 armillaria gallica 遗传多样性 遗传相似性 聚类分析 地理隔离
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柱前衍生化UPLC-MS/MS测定12种单糖含量的方法学研究及其应用 被引量:12
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作者 梁宇庭 周骏辉 +4 位作者 南铁贵 钱丹 宋瑞琦 赵雅秋 袁媛 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第22期4469-4473,共5页
建立了1-苯基-3-甲基-5-吡唑啉酮(PMP)柱前衍生化UPLC-MS/MS检测12种单糖的方法,同时对蜜环菌中多糖的单糖组成成分进行了分析。安捷伦ZORBAX RRHD Eclipse Plus C18分析柱(2. 1 mm×100 mm,1. 8μm),95%乙腈(A)和乙酸铵-5%乙腈-水... 建立了1-苯基-3-甲基-5-吡唑啉酮(PMP)柱前衍生化UPLC-MS/MS检测12种单糖的方法,同时对蜜环菌中多糖的单糖组成成分进行了分析。安捷伦ZORBAX RRHD Eclipse Plus C18分析柱(2. 1 mm×100 mm,1. 8μm),95%乙腈(A)和乙酸铵-5%乙腈-水(B)为流动相梯度洗脱,质谱为电喷雾离子源(ESI)接口,采用负离子多反应监测模式(MRM)进行检测。结果表明,基于UPLC-MS/MS所建立的单糖检测方法,12种单糖成分在各自线性范围内线性关系良好(R^2> 0. 990),加样回收率为92. 30%~105. 6%。在蜜环菌样品中,可检测出除阿洛糖外的11种单糖组分。该试验所建立的方法稳健,重复性和准确度高,适用于蜜环菌等的单糖成分的含量测定。 展开更多
关键词 UPLC-MS/MS PMP衍生化 单糖组成 蜜环菌
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高卢蜜环菌几丁质酶基因的生物信息学分析与表达 被引量:5
9
作者 黄靖雯 刘娟 +3 位作者 周骏辉 袁媛 杨全 黄璐琦 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1151-1155,共5页
高卢蜜环菌是一种兼性寄生真菌,在天麻栽培过程中作为天麻的唯一营养源。几丁质酶作为一种糖苷水解酶,在高卢蜜环菌的生长发育及其与天麻的共生过程中发挥重要作用。高卢蜜环菌几丁质酶基因共有22条,对这些几丁质酶基因的氨基酸序列进... 高卢蜜环菌是一种兼性寄生真菌,在天麻栽培过程中作为天麻的唯一营养源。几丁质酶作为一种糖苷水解酶,在高卢蜜环菌的生长发育及其与天麻的共生过程中发挥重要作用。高卢蜜环菌几丁质酶基因共有22条,对这些几丁质酶基因的氨基酸序列进行生物信息分析,发现有12条几丁质酶基因均含有糖苷水解酶18家族(GH18)结构域。对高卢蜜环菌、奥氏蜜环菌、天麻、酿酒酵母和哈茨木霉的几丁质酶氨基酸序列进行系统进化分析,进一步预测高卢蜜环菌中几丁质酶基因功能。利用独角金内酯类似物GR24诱导高卢蜜环菌分枝,并分析22条几丁质酶基因的表达模式,发现8条基因可能参与蜜环菌分枝、细胞壁降解和重塑等生理过程。 展开更多
关键词 蜜环菌 几丁质酶 独角金内酯 生物信息学分析 表达分析
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高卢蜜环菌PCR-RFLP快速鉴别方法研究 被引量:12
10
作者 梁宇庭 蒋超 +2 位作者 周骏辉 胡启跳 袁媛 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第17期3622-3626,共5页
蜜环菌是名贵中药天麻、猪苓栽培过程中必备的共生菌,蜜环菌的菌索侵入天麻块茎或猪苓菌核后被后者消化利用,成为它们重要的营养源。不同性质的蜜环菌影响天麻、猪苓的生长。作者收集了13个地区的市售蜜环菌,经过IGS鉴定均为高卢蜜环菌... 蜜环菌是名贵中药天麻、猪苓栽培过程中必备的共生菌,蜜环菌的菌索侵入天麻块茎或猪苓菌核后被后者消化利用,成为它们重要的营养源。不同性质的蜜环菌影响天麻、猪苓的生长。作者收集了13个地区的市售蜜环菌,经过IGS鉴定均为高卢蜜环菌。在基因水平和代谢水平上筛选出了蔗糖含量具有显著差异的2种高卢蜜环菌,命名为A型和B型,并建立了简单、准确的高卢蜜环菌DNA分子标记鉴定方法。通过比较高卢蜜环菌A型和B型蔗糖酶基因序列差异,根据差异片段设计聚合酶链反应-限制性内切酶酶切长度多态(PCR-RFLP)鉴别方法,即引物ZTM.F/ZTM.R可扩增高卢蜜环菌A型和B型,产生约304 bp长度条带,限制性内切酶EcoR V可以识别高卢蜜环菌A型和B型的差异序列,仅高卢蜜环菌B型可以被酶切形成2个片段,从而特异性鉴别高卢蜜环菌为B型。该实验建立的PCR-RFLP可以作为高卢蜜环菌A型和B型的DNA鉴别方法。在天麻和猪苓的栽培过程中,可根据品种、生长阶段、生态环境等不同需要,选择合适的菌株,因地制宜提升它们的产量和品质。 展开更多
关键词 高卢蜜环菌 聚合酶链反应-限制性内切酶酶切长度多态性 分子鉴定
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蜜环菌和冬荪菌侵染与降解菌材的比较研究 被引量:12
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作者 杨杰 张进强 +8 位作者 周涛 郭兰萍 徐娇 袁青松 江维克 王晓 张光文 潘成 刘大会 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期472-477,共6页
天麻菌材浪费的现象十分普遍,实践证明种植过天麻的旧菌材用于种植冬荪可取得较好的效益,但其机制还不清楚。该研究通过对天麻旧菌材及冬荪旧菌材的形态学解剖,比较蜜环菌和冬荪菌对菌材侵染能力的差异;采用硝酸-95%乙醇法、硫酸法、四... 天麻菌材浪费的现象十分普遍,实践证明种植过天麻的旧菌材用于种植冬荪可取得较好的效益,但其机制还不清楚。该研究通过对天麻旧菌材及冬荪旧菌材的形态学解剖,比较蜜环菌和冬荪菌对菌材侵染能力的差异;采用硝酸-95%乙醇法、硫酸法、四溴化法分别测定蜜环菌、冬荪菌对菌材中纤维素、木质素和半纤维素的消耗量,比较两者在菌材成分消耗上的差异,以探讨蜜环菌、冬荪菌循环利用菌材的机制,为天麻旧菌材循环利用提供科学依据。结果表明,蜜环菌对菌材维管形成层以外的部分入侵能力较强,而对维管形成层以内的部分入侵能力较弱;冬荪菌对2部分组织的侵染能力都较强;在菌材维管形成层以外的部分,蜜环菌对木质素及纤维素消耗量较大,冬荪菌对半纤维素消耗量较大;在菌材维管形成层以内的部分,蜜环菌对纤维素消耗量较大,冬荪菌对半纤维素消耗量较大。上述结果提示,蜜环菌和冬荪菌通过差异性地利用菌材中的不同成分来吸收碳源,以实现冬荪菌对天麻旧菌材的循环利用,蜜环菌以利用木质素、纤维素为主的碳源,冬荪菌则以利用半纤维素为主的碳源。 展开更多
关键词 蜜环菌 冬荪菌 纤维素 木质素 半纤维素
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农杆菌介导的高卢蜜环菌遗传转化体系的优化 被引量:3
12
作者 滕夕莹 韩鹏杰 +4 位作者 张雪艳 周骏辉 赵玉洋 黄璐琦 袁媛 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期124-130,共7页
目的:该研究在已有高卢蜜环菌遗传转化体系的基础上,对遗传转化体系进行优化以提高转化效率,为后续蜜环菌分子标记辅助育种、基因功能的研究奠定基础。方法:首先构建遗传转化的质粒pH101-PAgGPD-GFP-TrpC,将其转化到大肠埃希菌中扩大培... 目的:该研究在已有高卢蜜环菌遗传转化体系的基础上,对遗传转化体系进行优化以提高转化效率,为后续蜜环菌分子标记辅助育种、基因功能的研究奠定基础。方法:首先构建遗传转化的质粒pH101-PAgGPD-GFP-TrpC,将其转化到大肠埃希菌中扩大培养并提取质粒。提取的质粒分别转化LBA4404,EHA105,GV3101,AGL-1共4种不同的农杆菌。用转化后的农杆菌浸染高卢蜜环菌,筛选出转化率最高的农杆菌。再分别从抗生素种类及浓度、共培养时间、菌液浓度和浸染方法 5个方面对农杆菌介导的高卢蜜环菌遗传转化体系进行优化。采用Synbiosis ProtoCol 3测量影像分析仪观察蜜环菌在不同条件下的表型谱。结果:优化后高卢蜜环菌遗传转化条件为农杆菌菌株采用EHA105,菌液浓度为吸光度A_(600nm)=0.6;共培养时间为2 d,浸染方式为负压浸染10 min,初筛培养基为含400 mg·L^(-1)头孢噻肟钠,10 mg·L^(-1)潮霉素的PDA培养基,复筛培养基为含12 mg·L^(-1)潮霉素的PDA培养基。结论:该研究在已经建立的高卢蜜环菌的遗传转化体系的基础上成功对该体系进行了优化,且优化前后的转化率差异存在明显统计学意义(P<0.05),即优化后高卢蜜环菌的转化效率约为4.33%,相比于优化前提高了约8倍。 展开更多
关键词 遗传转化 高卢蜜环菌 体系优化
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一种大豆秸秆蜜环菌培养基及其生产条件的优化 被引量:5
13
作者 刘天睿 李仰华 +3 位作者 韩鹏杰 周骏辉 赵玉洋 袁媛 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第15期100-106,共7页
目的:为了解决天麻栽培中对木材的大量使用造成的森林资源破坏及栽培成本增加问题,该研究对农作物余料替代木材(或木屑)培养蜜环菌的可行性进行了探讨,以期降低天麻的栽培成本,同时使农作物余料得到有效利用,进而保护林木资源。方法:观... 目的:为了解决天麻栽培中对木材的大量使用造成的森林资源破坏及栽培成本增加问题,该研究对农作物余料替代木材(或木屑)培养蜜环菌的可行性进行了探讨,以期降低天麻的栽培成本,同时使农作物余料得到有效利用,进而保护林木资源。方法:观察蜜环菌的生长情况,划线法测量蜜环菌生长速度;苯酚浓硫酸法测定不同培养基中蜜环菌的总多糖含量;为了进一步优化大豆秸秆培养基配比,对主料配比、蔗糖含量、无机盐含量及含水量进行四因素三水平L9(34)正交优化试验。结果:通过比较不同培养基培养中蜜环菌的生长情况,发现大豆秸秆培养基培养的蜜环菌从接种第4天就开始生长,菌丝长势好,生长速度为0.352 cm·d^(-1),是桦木屑培养基生长速度0.283 cm·d^(-1)的1.48倍;大豆秸秆培养基培养的蜜环菌总多糖含量最高,为39.260 mg·g^(-1),远远高于桦木屑培养的蜜环菌总多糖含量17.028 mg·g^(-1),大豆秸秆培养基优势明显;主料(大豆秸秆与麦麸)配比为8∶2,蔗糖含量为主料的1%,无机盐含量为主料含量的0.5%,含水量50%时,蜜环菌生长速度稳定为0.392 cm·d^(-1)。结论:该研究结果为天麻栽培中使用大豆秸秆培养基替代木材(或木屑)培养基培养的蜜环菌提供了依据,为天麻在栽培中减少林木资源浪费、保护自然环境提供了参考。 展开更多
关键词 农作物余料 大豆秸秆 蜜环菌 条件优化 天麻栽培
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盐胁迫蜜环菌Real-time PCR内参microRNA的筛选 被引量:2
14
作者 余祺瑞 华中一 +4 位作者 周骏辉 胡启跳 袁媛 杨全 黄璐琦 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第19期35-42,共8页
目的:在利用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)进行microRNA(miRNA)表达分析的过程中,选择合适的内参miRNA对数据标准化起到重要作用。方法:该文挑选了13个蜜环菌候选miRNA对其前体进行生物信息分析,PMRD预测其前体相似序列,并... 目的:在利用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)进行microRNA(miRNA)表达分析的过程中,选择合适的内参miRNA对数据标准化起到重要作用。方法:该文挑选了13个蜜环菌候选miRNA对其前体进行生物信息分析,PMRD预测其前体相似序列,并用RNAfold对候选miRNA前体及其相似序列进行二级结构预测。利用Real-time PCR检测在受盐胁迫前后两种基因型蜜环菌(基因型A,基因型B)miRNA的表达量,并结合geNorm,NormFinder,BestKeeper软件分析其表达稳定性,筛选合适的内参。结果:对候选miRNA的9条前体进行二级结构预测以及特征分析,证明预测的miRNA属于miR家族具有典型的茎-环结构且成熟的miRNA位于其前体的5'或是3'端;geNorm分析表明,基因型A蜜环菌可选择Novel-4^*,Novel-9作为内参组合,基因型B可选择Novel-9,Novel-16作为内参组合;NormFinder分析结果显示,Novel-9在基因型A蜜环菌和基因型B蜜环菌中都有较好的稳定性;BestKeeper分析显示Novel-12^*在基因型A蜜环菌中稳定性较好,Novel-2^*在基因型B蜜环菌中稳定性较好。结论:稳定性最优的内参miRNA为Novel-9,为进一步开展蜜环菌miRNA调控机制研究奠定了基础。 展开更多
关键词 蜜环菌 盐胁迫 内参miRNA 实时荧光定量聚合酶链式反应
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SmartRoot在蜜环菌菌索表型谱分析中的应用 被引量:3
15
作者 张雪艳 胡启跳 +1 位作者 方成武 袁媛 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第19期23-28,共6页
目的:建立获取精确的表型谱数据研究平台,是目前中药资源研究亟待解决的技术难点。如传统的蜜环菌菌索表型表征方式多为描述性文字,存在较大的主观性和经验性,亟需一种客观并准确的方法进行蜜环菌菌索表型的表征。方法:基于图像处理软件... 目的:建立获取精确的表型谱数据研究平台,是目前中药资源研究亟待解决的技术难点。如传统的蜜环菌菌索表型表征方式多为描述性文字,存在较大的主观性和经验性,亟需一种客观并准确的方法进行蜜环菌菌索表型的表征。方法:基于图像处理软件Image J和根系识别插件SmartRoot与Synbiosis ProtoCol 3影像分析仪相结合,对蜜环菌平板生长图片进行分析,测定蜜环菌菌索长度、生长速度、分枝情况、新生菌索夹角等,建立蜜环菌菌索表型谱分析测量体系。结果:基于该文开发的方法,可以在不影响蜜环菌生长情况下,实时分析蜜环菌菌索的生长长度、生长速度、分枝数、新生菌索夹角等表型谱变化,继代后9~12 d的蜜环菌生长最为迅速,新生菌索与母体菌索之间夹角接近垂直。该方法与传统的蜜环菌生物量表型参数干重呈现一定的相关性,具有较好的实际应用价值。结论:该研究建立了一套客观、准确、快捷和实时的蜜环菌菌索表型谱分析测量体系,拓展了SmartRoot的应用范围,可用于受控实验条件下中药资源的表型谱分析。 展开更多
关键词 SmartRoot 表型谱 蜜环菌 菌索 生长速度 菌索总长度
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