如何运用ATLAS.ti分析定性数据和发掘研究主题

本文通过图文简要介绍定性数据分析软件ATLAS.ti的数据编码、数据分析、以及结果呈现等几个常用的功能,并提供每项操作的具体步骤。结合实际研究案例,帮助读者理解为什么可以借助ATLAS.ti来帮助我们更好地开展定性研究。同时,介绍四个借助ATLAS.ti来帮助研究者找出研究主题的常用方法:一是找出出现频率最多的编码;其次,找出重合率较高的编码;第三找出出现频率不合乎常理/不寻常的编码或编码关系;最后,找出对研究对象有中大影响的特殊事件或关键问题。应当强调的是,ATLAS.ti只是一个辅助的研究工具,好的定性研究,需要很多其他的因素,例如良好的研究设计,丰富的研究数据,研究者的研究学识背景和对研究主题的敏感度等等。在具备这些基础之上,利用ATLAS.ti来分析定性研究数据,才有可能进一步提高定性研究的水平。

江西旅游交通的游客心理感知研究——基于Atlas.ti的游记文本分析

旅游交通与游客的心理感知是两个相互影响的概念。以网络游记文本为研究对象,对江西旅游交通的游客心理感知进行研究,并利用Atlas.ti对网络游记文本进行分析。分析结果表明,作为基础性产业,旅游交通会影响旅游者的心理感知,进而影响旅游体验和重游意愿。因此,在旅游发展的过程中,要注意提升服务意识、创新意识和变革意识,尤其要加强智能交通和专业化发展,同时依托当地优秀的自然文化资源进行开拓创新。

长非编码RNA PART1抑制喉鳞癌细胞增殖和侵袭

长非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)PART1可作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA),在多种肿瘤的发生发展中发挥关键作用,然而PART1在喉鳞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)中的研究尚属空白。我们基于前期lncRNA测序数据发现,PART1在LSCC组织中显著低表达。进一步分析TCGA等公共数据库中的测序和临床数据,共发现了LSCC癌/癌旁组织中146个差异表达的lncRNA(95个上调,51个下调)和2424个差异表达的mRNA,结果显示,PART1在LSCC中普遍低表达(P<0.0001),且PART1高表达组预后明显更好(P<0.05)。本文采用生物信息学手段构建了LSCC中PART1的ceRNA调控网络,并确定与之相互作用的miRNA与mRNA。在体外验证了PART1对LSCC细胞的重要性。通过过表达载体,显著提高了PART1在LSCC细胞中的表达量(P<0.001);5-乙炔基-20-脱氧尿苷染色实验、凋亡分析、划痕愈合实验、Transwell实验和鬼笔环肽染色等研究结果显示,体外过表达PART1可以显著影响LSCC细胞的增殖、凋亡、迁移和侵袭(P<0.001)。因此,PART1可能参与并抑制LSCC的发生和发展。本研究将为阐明PART1在LSCC中的作用提供理论依据。

肝细胞癌双硫死亡相关LncRNA预后模型的构建和验证

目的:评估双硫死亡相关LncRNA在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)患者中作为预后指标的潜在价值。方法:从TCGA数据库中获取HCC的RNA-Seq和临床信息数据,从相关文献中获得10个双硫死亡相关基因,通过共表达分析获得双硫死亡相关LncRNA。然后利用单因素Cox回归、Lasso风险回归分析和多因素Cox回归构建基于双硫死亡相关LncRNA的预后模型,根据训练集的风险评分中位值将HCC样本划分高、低风险组,通过K-M生存曲线、ROC曲线、主成分分析(PCA)以及C-指数评估模型效果。此外,对高、低风险组差异基因进行GSEA富集分析,并对高、低风险组进行免疫功能差异分析和免疫治疗效果分析。结果:从TCGA-LIHC数据库筛选得到320个双硫死亡相关LncRNA,单因素Cox回归分析得到40个与患者预后相关的LncRNA(P<0.05),LASSO风险回归和多因素Cox回归分析构建了6个双硫死亡相关LncRNA的预后模型(ELFN1-AS1、AL049840.2、MKLN1-AS、CYTOR、AL161645.1和AC069307.1),且K-M生存曲线、ROC曲线、主成分分析(PCA)以及C-指数验证了该模型具有良好的预测能力。对高、低风险组差异基因进行GO和KEGG富集分析,GO富集分析显示,生物学过程主要富集在外部封装结构组织,细胞组分主要富集在含胶原的细胞外基质,分子功能主要富集在细胞外基质成分。KEGG主要富集在PI3K/AKT信号通路。此外,对高低风险组差异表达基因进行功能富集分析,发现高风险组主要富集在细胞外基质受体途径,而低风险组主要富集在药物代谢细胞色素p450途径。采用GSEABase包分析高、低风险组免疫功能之间的差异,结果显示高风险组抗原呈递细胞共刺激(APC_CO_stimulation)、趋化因子受体(CCR)、主要组织相容性复合体Ⅰ类呈递(MHC_class_Ⅰ)、副炎症和辅助性T细胞2(Th2)的表达高于低风险组,高风险组的TIDE评分高于低风险组。结论:基于TCGA数据库构建了具有良好预测性能的HCC预后模型,为进一步研究双硫死亡相关LncRNA在肝细胞癌中的作用提供了新思路。

基于扎根理论的旅游虚拟社区分享帖功能研究

旅游虚拟社区的迅速发展对旅游者影响日益显著,帖子是旅游虚拟社区用户进行各种活动的主要途径。本文以旅游虚拟社区分享帖为研究对象,采用扎根理论和Atlas.ti软件对分享帖的回复帖进行逐级编码分析,得出对于不同浏览者,分享帖功能是不同的。功能主要包括以下6个方面:引发评价,分享信息,引起遐想或回忆,刺激旅行渴望,交流和修正印象。

基于DSP的快速控制原型系统

为了在实际控制系统开发中缩短控制算法的设计周期,提高控制器的可靠性,并简化在调试过程中对控制算法的修改,设计与开发了基于DSP的快速原型控制系统.该系统包括基于TI F2812DSP的硬件控制器和基于MATLAB/Simulink的软件开发环境.用户可以在Simulink环境中利用RTW功能直接从Simulink模型自动生成可执行代码,并下载到DSP控制器中进行实时控制,从而降低了开发人员繁重的编程任务,提高了控制系统开发的效率.通过带有神经网络补偿和前馈补偿的智能PD控制器的实时控制实验,验证了系统的有效性.

基于DSP模型的快速代码的生成

TMS320F2812DSP是控制系统开发中很好的硬件设计平台,但传统的TI DSP代码开发方法周期较长,效率不高。为了在实际控制系统开发中缩短控制算法的设计周期,提高控制器的可靠性,并简化在调试过程中对控制算法的修改,设计与开发了基于DSP的快速原型控制系统。该系统包括基于TI F2812DSP的硬件控制器和基于Matlab/Simulink的软件开发环境。用户可以在Simulink环境中利用RTW功能直接从Simulink模型自动生成可执行代码并下载到目标板,直接运行程序,从而简化DSP系统开发过程,提高开发效率。通过闪烁灯实验实时控制实验,验证了系统的有效性。

安徽省地图集专题信息分类编码与方法

围绕《安徽省地图集》专题信息管理、更新与共享的需要,针对专题信息的特点,在借鉴相关行业分类标准的基础上,结合安徽省的地域特色,研究了地图集专题信息的分类方法,设计了专题信息的分类编码结构体系,为地图集专题信息数据库和专题地图数据管理应用系统的建立提供了有力的支持。

国家自然地图数据库信息分类与编码体系

本文着重研究利用《中华人民共和国国家自然地图集》,作为主要的信息来源,建立“国家自然地图数据库的信息分类与编码体系,分类原则和子分类体系。在此基础上完成了编码方案、分类原则、编码标准和专题编码的结构,同时描述了建立“国家自然地图数据库”的技术路线、地理数据组织、元数据库及数据字典等。

计算机辅助质化分析与新闻传播研究

本文以近年来新闻传播研究领域采用Nvivo、Atlas.ti等软件进行质化数据分析的若干研究个案为例,梳理了计算机辅助质化分析软件的最近发展在新闻传播研究领域的应用,以及其给方法论带来的挑战。

基于癌症基因图谱数据库的口底鳞状细胞癌长链非编码RNA风险预测模型的构建

目的 利用癌症基因图谱(TCGA)数据库建立口底鳞状细胞癌(简称口底鳞癌)患者预后的长链非编码RNA(lncRNA)风险预测模型。方法 下载TCGA数据库中口底鳞癌及对应癌旁组织的基因表达谱数据及临床相关数据,在R软件中通过edgeR包对口底鳞癌组织与癌旁组织中的基因表达数据进行分析,筛选差异表达lncRNA;采用单变量和多变量Cox风险回归模型筛选和建立lncRNA风险预测模型;绘制风险评分曲线、患者生存状态散点图、lncRNA表达热图、Kaplan-Meier生存曲线及受试者工作特征(ROC)曲线以评估风险模型与口底鳞癌患者预后的相关性。结果 从TCGA数据库中得到54例口底鳞癌组织和3例对应癌旁组织的基因表达数据,使用R软件edgeR包进行差异基因分析(筛选标准:P≤0.001,倍数变化≥2)得到差异lncRNA 138个。单变量Cox回归分析及多变量Cox回归分析得到基于3个lncRNA(MIR1-1HG、HOXC13-AS、RAMP2-AS1)的多变量风险预测模型,一致性系数为0.77。患者风险评分、生存状态散点图显示,风险评分越高口底鳞癌患者的死亡率越高。Kaplan-Meier生存曲线显示,高风险口底鳞癌患者的总生存率低于低风险口底鳞癌患者(P<0.001)。模型的ROC曲线下面积为0.895。结论 本研究筛选出3个具有临床意义的lncRNA,为口底鳞癌基础研究提供有价值的生物标志物;基于MIR1-1HG、HOXC13-AS、RAMP2-AS1的风险预测模型可有效预测口底鳞癌患者的预后,有望用于指导临床治疗。

机构创新设计经验知识库建库技术

提出了一种创新设计经验知识库建库方法,它可以将设计实例及经验转换成专家系统可识别的知识表达形式并存储起来,为机构创新设计过程提供计算机支持。首先给出了经验知识库的建库流程,然后介绍了若干建库关键技术,最后分别针对无轨迹信息的机构和有轨迹信息的机构阐述其建库方法并给出了相应实例,实例表明了这种建库技术方法具有简单易行的优点。

胶质母细胞瘤预后预测lncRNA模型的建立及验证

目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)对胶质母细胞瘤(GBM)患者预后的影响。方法利用肿瘤基因组图谱数据库下载并提取lncRNA表达矩阵和临床资料,筛选差异表达lncRNA,采用单因素Cox、Lasso和多因素Cox回归筛选预后相关lncRNA,建立GBM患者预后相关的2种lncRNA风险评分模型进行比较,并对重要的lncRNA进行预后的验证。结果通过差异基因分析(logFC≥2或≤-2,P<0.01)得到1255个差异lncRNA。单因素Cox、Lasso回归分析筛选出23个lncRNA,多因素Cox回归分析得到5个lncRNA。分别用23个和5个lncRNA建立风险评测模型,2种模型3 a生存率曲线下面积(AUC)分别为0.955和0.890,5 a生存率AUC分别为0.961和0.849。对5种lncRNA预后进行验证,AC066612.2和胶质母细胞瘤预后相关性最强。结论2种风险预测模型均可有效预测胶质母细胞瘤患者的预后,可以用于指导临床治疗。

一种改进的基于子空间估计的检测器

针对现阶段广泛应用信号子空间跟踪算法PAST算法在低信噪比和强多址干扰情况下,估计出信号子空间有较大的误差而提出一种新的信号子空间概念。通过理论分析和仿真,验证了新的算法能够克服PAST算法的缺点。并在此基础上构成的一种新的MMSE检测器,该检测器具有良好的误码率和抗“远-近”能力,结构简单,计算复杂度低,而且对信号子空间维数大小估计错误时并不敏感。

文物地图集的制作特点分析

本文分析了文物地图集的基本内容和制作要求,提出了一种"专家标点,分类编码,自动转贴,自动索引"的技术思路。根据这个思路,采用CorelScript开发了基于CorelDRAW的文物对象上图工具,具有效率高、一致性强、索引准确的特点。该方法还可以应用到其他图集的制作过程中去。

运动链拓扑图的自动生成及图谱库的建立

以Windows为平台,以VC++6．0为工具,利用面向对象的程序设计方法,基于周长拓扑图概念及与其具有一一对应关系的特征描述代码,开发了一套根据运动链的特征描述代码自动生成运动链拓扑图的软件系统。该软件系统还可以根据拓扑图的拓扑特性自动分类,保存运动链拓扑图,并且还具有智能模糊查找功能,为拓扑图图谱库的建立及机械概念设计的自动化、智能化和网络化创造了条件。

NECP-Atlas程序中多群光子核数据处理模块的开发与验证

在核数据处理程序NECP-Atlas的基础上开发了多群光子核数据处理模块,根据用户给定的能群结构及权重谱,基于反应率守恒分别对多群光子产生截面和多群光原子反应截面进行计算处理,并利用辐射屏蔽基准题库SINBAD中的基准题对多群光子数据库进行了验证。计算结果表明,用NECP-Atlas程序与NJOY2016程序制作得到的多群光子数据库具有相近的计算精度。

缺氧相关长链非编码RNA与乳腺癌患者预后的相关性及其在预测乳腺癌预后的风险中的价值

目的探讨缺氧相关长链非编码RNA(lncRNA)与乳腺癌患者预后的相关性及其在预测乳腺癌预后的风险中的价值。方法 (1)从癌症基因组图谱数据库中获得981例乳腺癌患者的RNA转录组测序数据和临床数据。采用Spearman检验筛选与缺氧相关的lncRNA。依次采用批量单因素Cox回归、LASSO回归、多因素Cox回归模型筛选和确定影响乳腺癌患者生存情况的缺氧相关lncRNA,并根据相关系数建立风险评分模型。(2)根据风险评分(中位值为1.27分)将乳腺癌患者分为高危组和低危组,比较两组患者的生存情况;并采用时间依赖性受试者工作特征(ROC)曲线评估风险评分预测乳腺癌患者预后的效能。(3)以风险评分和年龄及肿瘤分级、原发肿瘤-区域淋巴结-远处转移(TNM)分期等临床病理特征为自变量,采用单因素和多因素Cox回归模型分析乳腺癌患者预后的独立影响因素;利用获得的独立影响因素构建预测乳腺癌患者1年、3年、5年生存情况的Nomogram模型;应用ROC曲线评价并比较Nomogram模型与年龄及肿瘤分级、TNM分期等临床病理指标预测乳腺癌患者生存情况的效能。结果 (1)12个缺氧相关lncRNA(TNFRSF14-AS1、AL606834.2、LINC01871、AL136368.1、SEMA3B-AS1、AL136531.1、BAIAP2-DT、AC061992.1和AC008105.3、Z68871.1、LINC01235和AC090198.1)与乳腺癌患者的预后密切相关。(2)高危组乳腺癌患者生存时间短于低危组(P<0.05)。风险评分对乳腺癌患者预后的预测准确度较好(一致性指数为0.798),其预测乳腺癌患者1年、3年和5年生存情况的效能较好(曲线下面积分别为0.699、0.755、0.729,均P<0.05)。(3)年龄和风险评分是影响乳腺癌患者预后的独立危险因素(均P<0.05)。基于年龄和风险评分的Nomogram模型预测乳腺癌患者生存情况的曲线下面积为0.750。结论 12个缺氧相关lncRNA与乳腺癌患者的生存情况密切相关,由其组成的风险评分模型对乳腺癌患者的预后具有较好的预测价值。

铁死亡相关lncRNA结肠癌预后风险模型的构建及临床应用

目的 基于肿瘤基因图谱计划(TCGA)数据库筛选铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNA),建立结肠癌预后风险模型,并探讨其临床应用价值。方法 选取行结肠癌根治术的患者48例,收集术中切除的癌组织及对应的癌旁组织(距离癌组织边缘2~3 cm)。从TCGA数据库中收集结肠癌的转录组数据(结肠癌组织428例、正常结肠组织41例)及对应患者的临床资料。筛选结肠癌组织与正常结肠组织差异表达的铁死亡相关基因,并进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组数据库(KEGG)通路分析。筛选与结肠癌预后相关的铁死亡lncRNA,采用共识聚类分析对结肠癌患者进行分组,并比较总体生存率。采用LASSO-Cox回归分析建立预后风险模型。建立用于预测结肠癌患者总体生存率的列线图。采用细胞学实验分析关键lncRNAITGB1-DT在结肠癌中的生物学功能。结果 从TCGA数据库中筛选出72个差异表达的铁死亡相关基因,其中表达上调47个、表达下调25个,GO和KEGG通路分析结果显示这72个基因广泛参与了铁代谢和脂肪酸氧化等生物学过程。共筛选出20个结肠癌组织与正常组织有差异的铁死亡lncRNA。根据共识聚类分析结果分组的2个结肠癌集群之间总体生存率差异有统计学意义(P<0.001)。根据LASSO-Cox回归分析结果筛选出10个lncRNA,并构建预后风险模型,将428例结肠癌患者按7∶3的比例随机分为训练组和验证组。在训练组、验证组和总体结肠癌患者中,高风险组的总体生存率均显著低于低风险组(P<0.001)。结肠癌组织ITGB1-DT相对表达量显著高于癌旁组织(P<0.001)。细胞实验结果显示,ITGB1-DT可促进结肠癌细胞的增殖并抑制其铁死亡。结论 成功构建了基于铁死亡相关lncRNA的结肠癌预后风险模型,并建立了可用于判断结肠癌患者总体生存率的列线图。ITGB1-DT或可促进结肠癌的发展。

Ti－Code12合金焊后退火对组织性能的影响

研究了Ｔｉ－Ｃｏｄｅ１２合金（Ｔｉ－０．３Ｍｏ－０．８Ｎｉ）焊后退火对组织和性能的影响．结果表明焊后退火将引起残存β相的共析分解，共析分解产物Ｔｉ２Ｎｉ相具有面心立方结构．合金的耐蚀性来源于α基体上Ｔｉ２Ｎｉ相的存在，Ｔｉ２Ｎｉ相既可在晶间沉淀，也能在晶内沉淀．本研究对Ｔｉ－Ｃｏｄｅ１２合金耐蚀性机理提出了直接证据．