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Genome-wide identification of apple auxin receptor family genes and functional characterization of MdAFB1 被引量:1
1
作者 Zhiwen Qiao Hongliang Li +2 位作者 Xiaofei Wang Xinglong Ji Chunxiang You 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2023年第4期645-658,共14页
The auxin receptor(TIR1/AFBs)family encodes the F-box protein subunit,which is involved in the formation of the E3 ubiquitin ligase SCFTIR1/AFBs complex,a key component of the auxin signaling pathway.However,there are... The auxin receptor(TIR1/AFBs)family encodes the F-box protein subunit,which is involved in the formation of the E3 ubiquitin ligase SCFTIR1/AFBs complex,a key component of the auxin signaling pathway.However,there are few studies on the auxin receptor family in apple(Malus×domestica).In this study,eight MdAFBs were identified,and phylogenetic analysis showed that they were classified into four groups and distributed on eight chromosomes.Herein,a comprehensive analysis of the MdAFB gene family was conducted to identify cis-acting elements,gene structures,protein structures,aligned sequences,conserved motifs,conserved amino acids,and the protein–protein interaction network.The results of yeast two-hybrid assays showed that MdAFB1 interacted with three auxin repressor proteins.The results of qRT-PCR showed that MdAFB1 responded to osmotic and salt stress.The overexpression of MdAFB1 increased osmotic and salt resistance in apple calli,and the ectopic expression of MdAFB1 enhanced osmotic and salt tolerance in Arabidopsis.This study provided a basis for the identification of auxin receptor genes in apple and their functions in mediating osmotic and salt stress. 展开更多
关键词 Malus×domestica auxin receptor TIR1/AFB Genome-wide analysis Abiotic stress
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Seek and Ye Shall [eventually] Find: The End of the Search for the Auxin Receptor 被引量:1
2
作者 Lawrence HOBBIE 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2005年第12期1412-1417,共6页
The mechanism by which the plant hormone auxin regulates gene expression has been shown to involve regulated degradation, through the ubiquitin-proteasome pathway, of transcriptional repressor proteins. However, the k... The mechanism by which the plant hormone auxin regulates gene expression has been shown to involve regulated degradation, through the ubiquitin-proteasome pathway, of transcriptional repressor proteins. However, the key first component in this pathway, the receptor that binds auxin and initiates auxin signaling, has remained a mystery. Two recent papers identify the F-box protein TIR1, part of the complex that attaches ubiquitin to its targets, as an auxin receptor. This breakthrough reveals a new mode of signal transduction and lays the groundwork for a more complete understanding of auxin physiology. 展开更多
关键词 auxin auxin receptor SCF complex signal transduction ubiquitin.
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和而不同:根毛发育过程中生长素与氧化还原信号
3
作者 谢彦杰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1-4,共4页
活性氧与生长素在植物生长发育过程中均发挥着重要作用,它们的信号转导与调控机制一直是植物科学研究的重要领域。细胞核内经典通路TIR1/AFB-Aux/IAA-ARF通过转录调控来介导生长素信号,然而生长素信号在细胞质和细胞核之间进行传递的过... 活性氧与生长素在植物生长发育过程中均发挥着重要作用,它们的信号转导与调控机制一直是植物科学研究的重要领域。细胞核内经典通路TIR1/AFB-Aux/IAA-ARF通过转录调控来介导生长素信号,然而生长素信号在细胞质和细胞核之间进行传递的过程尚不清楚。近期,华东师范大学李超团队发现氧化还原信号参与了受生长素调控的根毛发育过程。生长素受体蛋白TIR1/AFB2发生氧化后促进其向细胞核迁移,启动根毛发育的生长素转录信号,而这一过程同时受上游FER/LLG1-RAC/ROP-RBOHC分子模块的调控。该研究深入解析了根毛发育过程中生长素与氧化还原信号的交谈模式,是蛋白质氧化翻译后修饰调控生物学过程的经典范式。 展开更多
关键词 氧化还原调控 氧化翻译后修饰 生长素受体 根毛发生
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银腺杨生长素受体基因PagFBL3对茎生长发育的影响
4
作者 左雯腾 孟佳慧 +1 位作者 卢孟柱 王留强 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第11期59-67,共9页
【目的】本研究分析了银腺杨生长素受体基因PagFBL3的序列结构、组织表达特异性和亚细胞定位,并创制了过表达PagFBL3转基因杨树,探讨其对茎次生生长的影响,为进一步阐明生长素受体在茎次生生长中的作用机制提供帮助。【方法】利用生物... 【目的】本研究分析了银腺杨生长素受体基因PagFBL3的序列结构、组织表达特异性和亚细胞定位,并创制了过表达PagFBL3转基因杨树,探讨其对茎次生生长的影响,为进一步阐明生长素受体在茎次生生长中的作用机制提供帮助。【方法】利用生物信息学方法及相关软件分析系统进化关系、序列相似性及生化特征;克隆并鉴定了银腺杨PagFBL3基因,利用实时荧光定量PCR技术,分析该基因在根、幼叶、成熟叶、幼茎、维管形成层、木质部和韧皮部中的表达;利用Gateway技术,构建融合表达载体35S::PagFBL3-GFP,通过瞬时转化烟草叶片表皮分析PagFBL3的亚细胞定位;同时,将PagFBL3编码区序列重组进入pMDC32载体,构建植物过表达载体35S::PagFBL3,利用农杆菌介导法创制转基因银腺杨,通过表型观察和组织切片分析过表达PagFBL3基因对转基因杨树茎部生长发育的影响。【结果】PagFBL3基因可编码571个氨基酸残基,其编码蛋白定位于细胞核。PagFBL3基因在根、茎和叶中均有表达,并在成熟叶和次生茎中表达量较高。基于抗性筛选和分子水平鉴定,创制了11个过表达PagFBL3转基因杨树株系,选择两个表达量较高的转基因株系进行功能分析。与非转基因植株相比,过量表达PagFBL3基因促进转基因杨树木质部发育,显著增加了转基因杨树的木质部宽度,提高了转基因杨树的径向生长,地径分别增加6.7%和8.5%,第15节间木质部宽度分别增加17.3%和19.9%。此外,过量表达PagFBL3基因也增强了植株的高生长,株高分别增加6.3%和6.9%。【结论】PagFBL3基因主要在成熟叶和次生茎中表达并发挥作用,通过影响木质部发育,提高木质部宽度,进而参与调控杨树的径向生长,该研究为进一步揭示PagFBL3基因参与杨树茎部生长发育的分子机制提供了参考。 展开更多
关键词 银腺杨 生长素受体 PagFBL3 过量表达 木质部发育
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茶树生长素受体基因CsTIR1的克隆与表达分析 被引量:9
5
作者 曹红利 岳川 +5 位作者 周艳华 王璐 郝心愿 曾建明 杨亚军 王新超 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期45-54,共10页
吲哚-3-乙酸(又称IAA或生长素),在植物生长发育中具有重要的调控作用,其作用主要通过信号转导途径来完成。生长素受体是其信号转导的关键元件之一。本研究通过RACE克隆,获得了茶树中生长素受体Cs TIR1基因的c DNA全长序列(NCBI登录号:JX... 吲哚-3-乙酸(又称IAA或生长素),在植物生长发育中具有重要的调控作用,其作用主要通过信号转导途径来完成。生长素受体是其信号转导的关键元件之一。本研究通过RACE克隆,获得了茶树中生长素受体Cs TIR1基因的c DNA全长序列(NCBI登录号:JX050147)。Cs TIR1序列全长2 315 bp,含1 746 bp的完整开放阅读框,编码581个氨基酸,预测分子量65.18 k D,理论等电点(p I)5.64。茶树Cs TIR1与烟草TIR1的相似性最高达82%,亲缘关系最近。Cs TIR1含有1个F-box结构域和6个LRR结构域,三级结构形如"蘑菇状"。Cs TIR1在茶树的根、茎、叶和花中具有组织表达特异性;其表达受IAA诱导,3种不同浓度的IAA均能诱导Cs TIR1上调表达,且在50μmol·L-1浓度下表达量最大;ABA、GA3、Me JA和BR等激素也能够显著上调其表达;Cs TIR1在越冬休眠芽中的表达量低,在活跃期中上调表达。 展开更多
关键词 茶树 植物激素 生长素 生长素受体基因CsTIR1 芽休眠
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超级杂交水稻TIR1类似基因cDNA的克隆与生物信息学分析 被引量:6
6
作者 黄志刚 胡皝 +2 位作者 赵玄之 王若仲 萧浪涛 《植物学通报》 CSCD 北大核心 2008年第6期695-700,共6页
生长素受体TIR1通过形成SCFTIR1复合体与生长素直接结合,即为Aux/IAA在26S蛋白酶体降解过程中的关键蛋白质。在Blast检索和生物信息学分析的基础上设计特异引物,以超级杂交水稻(Oryza sativa)亲本株1S为材料,通过RT-PCR扩增并经T-A克隆... 生长素受体TIR1通过形成SCFTIR1复合体与生长素直接结合,即为Aux/IAA在26S蛋白酶体降解过程中的关键蛋白质。在Blast检索和生物信息学分析的基础上设计特异引物,以超级杂交水稻(Oryza sativa)亲本株1S为材料,通过RT-PCR扩增并经T-A克隆后测序,获得一条长度为2219bp的序列,其开放阅读框长度为1764bp,编码含587个氨基酸残基的肽链。该序列经生物信息学分析发现,其与拟南芥TIR1相似性为77%,同样具有2个保守的结构域,即F-box和亮氨酸富集重复区域(LRR),且都不具有跨膜结构域和信号肽。该cDNA序列命名为OsTIR1。 展开更多
关键词 生长素受体 生物信息学 超级杂交水稻 TIR1
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植物生长素结合蛋白ABP1的研究进展 被引量:3
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作者 乔麟轶 张文萍 +1 位作者 张磊 王玺 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第7期230-232,共3页
ABP1(Auxin Binding Protein)是最早发现的生长素结合蛋白之一,作为一种生长素受体参与质膜上生长素的响应过程,在细胞周期、细胞扩增、质膜内吞作用和基于ROP的细胞骨架重建等快速反应中起着重要的作用。因此,对ABP1最新的研究进展进... ABP1(Auxin Binding Protein)是最早发现的生长素结合蛋白之一,作为一种生长素受体参与质膜上生长素的响应过程,在细胞周期、细胞扩增、质膜内吞作用和基于ROP的细胞骨架重建等快速反应中起着重要的作用。因此,对ABP1最新的研究进展进行了综述,以期为生长素受体作用机制的深度阐明提供参考。 展开更多
关键词 ABP1 生长素受体 细胞周期和扩增 内吞作用 细胞骨架重建
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生长素受体与信号转导机制研究进展 被引量:19
8
作者 刘进平 《生物技术通报》 CAS CSCD 2007年第3期22-30,共9页
对生长素受体ABP1和TIR1及调控泛素化蛋白降解的生长素信号转导途径研究进展进行综述。
关键词 生长素 受体 信号转导 泛素化途径 ABP1 TIR1 AUX/IAA ARF SCF^TM
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ARF、Aux/IAA和生长素受体对基因表达的调控 被引量:11
9
作者 李亚男 冯霞 陈大清 《安徽农学通报》 2008年第7期36-39,共4页
本文阐述了ARF和Aux/IAA的作用机制,分析了生长素受体及泛素介导的蛋白质降解途径,概括了生长素调控的基因表达模式。
关键词 ARF AUX/IAA 生长素受体 基因调控
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生长素结合蛋白ABP1研究进展 被引量:2
10
作者 黄妤 张学文 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2007年第29期9119-9120,共2页
就生长素结合蛋白在植物体内的分布、结构和性质、亚细胞定位及其受体功能的研究概况作了简要介绍。
关键词 受体 生长素结合蛋白 分布 亚细胞定位
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植物激素受体的三维结构及其分子识别机制研究进展 被引量:3
11
作者 郝格非 朱晓磊 杨光富 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期1-7,共7页
许多研究表明,第一次"绿色革命"与植物激素的相关基因编码是密不可分的。植物激素是一类具有调节植物生长发育功能的有机内源物质,激素受体是植物激素调控生长的中心环节,一直备受关注,而激素受体结构的发现可以使人们更深入... 许多研究表明,第一次"绿色革命"与植物激素的相关基因编码是密不可分的。植物激素是一类具有调节植物生长发育功能的有机内源物质,激素受体是植物激素调控生长的中心环节,一直备受关注,而激素受体结构的发现可以使人们更深入地了解其调节植物生长的分子机制。综述了生长素、赤霉素和脱落酸3种经典植物激素受体结构的发现及其作用机制的最新研究成果,旨在为开展基于结构的新型人工植物激素的生物合理设计提供参考。 展开更多
关键词 生长素 赤霉素 脱落酸 植物激素受体 分子机制
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生长素极性运输抑制剂(综述) 被引量:3
12
作者 李春俭 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1995年第S1期89-93,共5页
概述了在研究中常用的一些生长素极性运输抑制剂的种类、抑制的作用机理和抑制剂及其受体在植物生长发育中的重要作用。
关键词 生长素极性运输 抑制剂 受体
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玉米AFB2基因的克隆、表达及功能分析 被引量:4
13
作者 杨春文 唐宁 +1 位作者 林东波 李正国 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2012年第6期1068-1072,共5页
通过生物信息学分析从玉米基因组数据库中筛选出一条全长cDNA序列,命名为ZmAFB2(GenBank登录号为NM_001143136.1)。通过特异引物克隆该基因,ZmAFB2全长1 722 bp,编码574个氨基酸。N端含有F-box结构域,属于F-box基因家族,与水稻Os04g3246... 通过生物信息学分析从玉米基因组数据库中筛选出一条全长cDNA序列,命名为ZmAFB2(GenBank登录号为NM_001143136.1)。通过特异引物克隆该基因,ZmAFB2全长1 722 bp,编码574个氨基酸。N端含有F-box结构域,属于F-box基因家族,与水稻Os04g32460.1同源性很高,属于AFB2亚家族。qRT-PCR结果表明,该基因在玉米的根、茎和叶中均有表达,但在茎中的表达量最强。为进一步研究玉米ZmAFB2基因的功能,构建玉米ZmAFB2基因的超表达载体pCAMBIA-35S-AFB2,并通过农杆菌介导法对番茄进行遗传转化,共获得3个转基因株系,对转基因番茄表型进行鉴定,结果发现,叶片稍厚颜色暗绿,果实较小,无籽或少籽,房室发育不健全,因此,推测AFB2可能参与植物生长发育与调控,这为进一步阐明AFB2基因功能奠定基础。 展开更多
关键词 ZmAFB2 生长素受体 克隆 超表达 QRT-PCR
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百子莲生长素受体基因TIR1的全长cDNA克隆及功能分析 被引量:4
14
作者 邹梦雯 岳建华 +1 位作者 张荻 申晓辉 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2015年第3期36-42,52,共8页
采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)方法获得百子莲生长素受体TIR1基因cDNA全长序列,对该序列进行生物信息学分析的结果显示,TIR1基因的mRNA序列全长为2 235bp;5’非编码区296bp,3’非编码区172bp;该基因的OR... 采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)方法获得百子莲生长素受体TIR1基因cDNA全长序列,对该序列进行生物信息学分析的结果显示,TIR1基因的mRNA序列全长为2 235bp;5’非编码区296bp,3’非编码区172bp;该基因的ORF全长为1 764bp,编码一个含有588个氨基酸的蛋白。百子莲TIR1推导蛋白序列与葡萄(Vitis vinifera)、二穗短柄草(Brachypodium distachyon)、高粱(Sorghum bicolor),玉米(Zea mays)等植物均具有较高的同源性,同源性最高的是葡萄,可达78%。系统进化树表明,百子莲与葡萄距离最近。由α-螺旋,随机卷曲和延伸链组成一个磁状结构,为亲水蛋白,疏水性值为-0.092,在百子莲体细胞胚胎发生过程中,实时荧光定量PCR结果表明TIR1基因表达量在愈伤组织中含量最低,在胚性愈伤组织和体细胞胚胎中含量均有所升高,而在体胚幼苗中表达量最高,表明该基因介导的生长素信号在体细胞胚胎发生过程中发挥着非常重要的作用。 展开更多
关键词 百子莲 生长素受体基因 TIR1 克隆 基因表达
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番茄SlmiR393基因超表达载体的构建及其靶基因鉴定 被引量:2
15
作者 林冬波 杨迎伍 李正国 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期133-140,共8页
为研究番茄(Lycopersicum esculentum)的SlmiR393基因功能,采用生物信息学方法从番茄基因组数据库中获得SlmiR393的前体序列及其潜在的靶基因。以基因组DNA为模板,克隆了番茄SlmiR393前体基因并整合到pLP35S-100植物表达载体;采用5′RAC... 为研究番茄(Lycopersicum esculentum)的SlmiR393基因功能,采用生物信息学方法从番茄基因组数据库中获得SlmiR393的前体序列及其潜在的靶基因。以基因组DNA为模板,克隆了番茄SlmiR393前体基因并整合到pLP35S-100植物表达载体;采用5′RACE RT-PCR技术验证SlmiR393对预测靶基因mRNA的剪切作用,采用定量PCR技术检测SlmiR393及其靶标基因在番茄不同组织的表达。结果表明,SlmiR393的前体序列含有完整的茎环结构;成熟miR393与3个生长素受体同源基因(SlTIR1、SlTIR1-like1和SlAFB)之间具有识别作用位点。SlmiR393可对番茄3个靶基因的转录本进行剪切降解;SlmiR393与3个不同靶基因(SlTIR1、SlTIR1-like1和SlAFB)的表达模式在叶和茎、花蕾、花中存在一定的互补关系。因此,推断番茄中的SlmiR393可能在特定的组织或发育时期介导特定的靶基因mRNA的剪切降解,初步证实生长素受体同源基因为SlmiR393的靶基因。此外,成功构建以CaMV 35S为启动子的植物表达载体pLP35S-pre-SlmiR393,为深入研究SlmiR393在番茄生长素信号转导中的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄 SlmiR393 生长素受体同源基因 载体构建
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大白菜生长素受体基因家族生物信息学鉴定与表达分析 被引量:2
16
作者 代真林 张荣琴 +4 位作者 杨俊 张晋豪 魏兰芳 刘棋 姬广海 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2020年第6期938-949,共12页
【目的】对大白菜生长素受体BrTIR1/AFBs基因家族进行系统分析,为大白菜BrTIR1/AFBs基因家族的功能挖掘和性状遗传改良提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法,分析大白菜生长素受体基因家族的进化关系、编码蛋白、保守结构域和顺式... 【目的】对大白菜生长素受体BrTIR1/AFBs基因家族进行系统分析,为大白菜BrTIR1/AFBs基因家族的功能挖掘和性状遗传改良提供理论依据。【方法】利用生物信息学方法,分析大白菜生长素受体基因家族的进化关系、编码蛋白、保守结构域和顺式作用元件。基于NCBI转录组测序(RNA-sep)数据,分析BrTIR1/AFBs基因家族在大白菜不同组织中的表达模式以及在根肿病入侵条件下的表达情况。【结果】从大白菜基因组数据库中鉴定得到10个BrTIR1/AFBs基因。拟南芥、茎瘤芥和大豆生长素受体基因家族多序列比对以及系统进化树分析结果显示:BrTIR1/AFBs基因分为6个亚家族(TIR1、AFB1、AFB2、AFB3、AFB4和AFB5),处于同一亚族的基因具有相似的结构。染色体定位结果显示:BrTIR1/AFBs基因家族成员分布在除Chr5、Chr6和Chr10号染色体之外的7条染色体上,呈现出不均匀分布。顺式作用元件分析结果显示:所有的BrTIR1/AFBs基因家族成员都含有响应生长素、防御和逆境胁迫的作用元件,预示着这些基因可能参与相应的生物学过程。组织表达模式分析发现:10个BrTIR1/AFBs基因的转录本在6个组织中被检测到,且不同组织中的表达量存在明显差异。大白菜BrTIR1/AFBs基因家族成员在根肿病病原菌入侵时表达量发生显著变化。【结论】大白菜生长素受体BrTIR1/AFBs基因家族成员具有保守的基因结构和功能结构域,在大白菜不同组织中发挥着特异的功能,且在抵御病害和干旱等逆境中发挥重要作用。 展开更多
关键词 大白菜 生长素受体基因家族 全基因组鉴定 顺势作用元件 表达谱
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植物TIR1/AFBs基因家族研究进展 被引量:2
17
作者 滕青云 乐丽娜 +1 位作者 宋冰倩 陈英 《农业工程》 2020年第2期93-97,共5页
TIR1/AFBs基因家族是一种存在于细胞核中的生长素受体,属于F-box蛋白基因中的一个小亚族。它们通过与相关生长素相结合活化转录因子来促进基因的表达,从而进行调控,是生长素信号转导过程中的关键部分。为了深入研究生长素信号转导机制,... TIR1/AFBs基因家族是一种存在于细胞核中的生长素受体,属于F-box蛋白基因中的一个小亚族。它们通过与相关生长素相结合活化转录因子来促进基因的表达,从而进行调控,是生长素信号转导过程中的关键部分。为了深入研究生长素信号转导机制,从TIR1/AFBs基因家族的发现与结构,家族成员表达模式的差异及对植物生长发育方面的调节等方面概括介绍了TIR1/AFBs基因家族的分子调控机制,总结了TIR1/AFBs基因的功能。最后探讨了TIR1/AFBs基因的研究方向。 展开更多
关键词 TIR1/AFBs基因家族 生长素受体 信号转导 基因功能 调控机制
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柳暗花明:胞外生长素信号感受的新突破 被引量:1
18
作者 孔祥培 张蒙悦 丁兆军 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期861-865,共5页
生长素在植物生长发育过程中发挥重要作用,其信号转导机制一直是植物学领域关注的热点。前期研究表明,ABP1-TMK分子模块参与胞外生长素信号感受,但ABP1作为生长素受体备受争议。近期,福建农林大学徐通达团队和杨贞标团队鉴定到ABL蛋白... 生长素在植物生长发育过程中发挥重要作用,其信号转导机制一直是植物学领域关注的热点。前期研究表明,ABP1-TMK分子模块参与胞外生长素信号感受,但ABP1作为生长素受体备受争议。近期,福建农林大学徐通达团队和杨贞标团队鉴定到ABL蛋白作为生长素结合蛋白参与胞外生长素信号感受。与传统的功能冗余不同,ABL和ABP1通过蛋白结构的相似性实现功能补偿效应,进而与TMK在细胞膜上形成复合体,作为胞外生长素的共受体介导生长素信号驱动的快速反应。该研究深入解析了胞外生长素信号感受的重要机制,是生长素研究领域的重大突破。 展开更多
关键词 生长素 生长素受体 ABL1 ABL2 ABP1 TMK
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龙眼生长素受体基因TIR1密码子偏好性分析 被引量:41
19
作者 赖瑞联 林玉玲 +1 位作者 钟春水 赖钟雄 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期771-780,共10页
为了解龙眼生长素受体基因TIR1密码子的使用特性,采用CodonW、SPSS软件及EMBOSS在线程序分析龙眼TIR1密码子的偏好性,并分别与龙眼基因组、其他29个物种TIR1以及模式生物基因组进行比较。结果显示,龙眼TIR1与龙眼基因组的密码子选择偏... 为了解龙眼生长素受体基因TIR1密码子的使用特性,采用CodonW、SPSS软件及EMBOSS在线程序分析龙眼TIR1密码子的偏好性,并分别与龙眼基因组、其他29个物种TIR1以及模式生物基因组进行比较。结果显示,龙眼TIR1与龙眼基因组的密码子选择偏性较弱且较偏好以A/T结尾,而物种间TIR1密码子选择偏性则存在一定差异;进化树分析表明,基于TIR1编码序列聚类结果比密码子使用偏性分类结果能更准确地反映物种间的亲缘关系;密码子使用频率比较结果发现,酵母真核表达系统更适用于龙眼TIR1异源表达试验,而龙眼TIR1与模式植物基因组之间密码子使用偏性差异较小,尤其烟草和番茄可能为该基因转基因研究最为理想的受体。 展开更多
关键词 龙眼 密码子偏好性 生长素受体 聚类分析
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龙眼生长素受体基因TIR1的克隆及其与miR393互作关系 被引量:9
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作者 赖瑞联 林玉玲 赖钟雄 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期95-102,共8页
为了解龙眼生长素受体基因TIR1的功能,以龙眼胚性愈伤组织为材料,在转录水平上对TIR1(命名为Dl TIR1-3)及其启动子进行克隆和分析,并在转录后水平上研究TIR1与mi R393的相互调控关系.结果表明,Dl TIR1-3 c DNA全长2196 bp,包含ORF 1 716... 为了解龙眼生长素受体基因TIR1的功能,以龙眼胚性愈伤组织为材料,在转录水平上对TIR1(命名为Dl TIR1-3)及其启动子进行克隆和分析,并在转录后水平上研究TIR1与mi R393的相互调控关系.结果表明,Dl TIR1-3 c DNA全长2196 bp,包含ORF 1 716 bp,编码571个氨基酸(Gen Bank登录号:KR558761);生物信息学分析发现,Dl TIR1-3属于不稳定蛋白,不含有信号肽,含有跨膜螺旋结构,具有F-box保守结构域和富含异亮氨酸重复结构,且Dl TIR1-3与碧桃TIR1保持较高的同源性.染色体步移法克隆获得Dl TIR1-3启动子序列2909 bp(Gen Bank登录号:KR558763),该启动子不存在Cp G岛但含有大量光反应、激素应答、组织特异性调控、胁迫响应以及其他生长发育相关的作用元件.ps RNAtarget结合改良RLM-RACE验证表明mi R393能够裂解Dl TIR1-3从而抑制其m RNA转录;q PCR结果显示,Dl TIR1-3与mi R393相互平衡能够调节龙眼体胚形态建成及响应激素调控.由此可见,Dl TIR1-3通过转录水平的调控作用在龙眼生长发育、激素应答、组织分化及胁迫响应等过程中发挥重要功能,而在转录后水平上mi R393通过裂解Dl TIR1-3参与相关调控过程. 展开更多
关键词 龙眼 体胚发生 生长素受体 启动子 miR393 激素 定量PCR
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