罗布麻AvFLS密码子偏好性与进化

黄酮醇合成酶(FLS)是黄酮醇合成的关键酶,对植物花色的色调和强度形成有重要作用,研究该基因密码子偏好性有助于进一步了解黄酮醇的功能.为明确罗布麻黄酮醇合成酶基因密码子的使用特性,采用CondoW、Tbtools、SPSS软件及EMBOSS在线程序分析AvFLS密码子偏好性,通过ENc绘图、中性绘图和PR2-plot分析FLS基因密码子偏好性形成的可能原因,比较AvFLS与模式生物的密码子使用频率获得最佳受体.结果表明:AvFLS的有效密码子数(ENc)、密码子适应指数(CAI)和GC含量分别为47.09、0.2和39.48%,表明AvFLS基因密码子偏好性较弱.AvFLS基因偏好性密码子有27个(RSCU>1),其中22个以A/T结尾,表明该基因偏好使用A/T结尾的密码子;基因序列进化分析及RSCU聚类分析表明,AvFLS基因的密码子使用偏好性与同源关系较近的桔梗相似;密码子碱基成分和相关性分析发现,AvFLS密码子偏好性主要受突变压力的影响;密码子使用频率比较分析发现,酵母真核表达系统更适合AvFLS异源表达.本研究表明模式植物拟南芥、烟草、番茄、甜菜和蒺藜苜蓿均可作为AvFLS的遗传转化受体,结果可为后续AvFLS改造和功能验证研究提供一定参考.(图6表3参44)