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黑龙江省和海南省稻瘟病菌中AVR-Pita家族的分布及变异分析 被引量:2
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作者 刘瑞 赵羽涵 +4 位作者 顾欣怡 王艳霞 靳学慧 吴伟怀 张亚玲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期466-480,共15页
【目的】通过检测黑龙江省和海南省不同稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)菌株群体中AVR-Pita家族的分布情况和变异特征,了解其变异类型的致病表型,为区域内抗病种质的筛选与选育提供参考。【方法】通过参考NCBI中公布的AVR-Pita家族序列分... 【目的】通过检测黑龙江省和海南省不同稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)菌株群体中AVR-Pita家族的分布情况和变异特征,了解其变异类型的致病表型,为区域内抗病种质的筛选与选育提供参考。【方法】通过参考NCBI中公布的AVR-Pita家族序列分别对启动子区和CDS区设计特异性引物共6对,对2020年采自黑龙江省和海南省不同地区的397个稻瘟病菌单孢菌株提取DNA,进行PCR扩增。通过电泳检测结果,分别选取囊括不同地区的代表菌株对扩增片段进行测序。测序结果与NCBI中相应的碱基与氨基酸序列进行比较分析,并利用水稻抗性单基因系,对不同变异类型的稻瘟病菌菌株进行无毒功能验证。【结果】在PCR电泳检测结果中,黑龙江省稻瘟病菌菌株携带所有待测基因,分布广泛且检出频率较高;而海南省稻瘟病菌菌株中仅携带AVR-Pita1和AVR-Pita2,并以低频率集中存在。无毒基因组成分析结果显示,黑龙江稻区的稻瘟病菌菌株复杂多样,携带的基因型种类较海南菌株丰富。PCR产物测序检测结果显示,AVR-Pita家族以点突变、插入和缺失为主要变异类型划分为19种,且不同稻瘟病菌群体来源的菌株,其变异类型具有特异性。AVR-Pita1检测出10种变异类型,其中AVR-Pita1-(1-5)为黑龙江省稻瘟病菌菌株独有的变异类型,AVR-Pita1-(6-10)为海南省稻瘟病菌菌株独有。对这10种变异类型经功能验证后发现,无毒功能均已丧失。AVR-Pita2检测出8种变异类型,其中AVR-Pita2-(1-4)为黑龙江省稻瘟病菌菌株独有,AVR-Pita2-(5-8)为海南省稻瘟病菌菌株独有。经功能验证后发现,无毒功能均已丧失。AVR-Pita3在黑龙江省仅检测出1种变异类型AVR-Pita3-1。【结论】黑龙江和海南稻瘟病菌群体中AVR-Pita家族均为突变后的等位基因型存在,经致病性鉴定后,检测出的所有突变类型均不能被相对应抗性基因Pi-ta和Pi-ta2所识别,表现为感病。因此,抗性基因Pi-ta和Pi-ta2在黑龙江省和海南省对稻瘟病的抗病育种与利用过程中可聚合其他抗性基因应用来保证品种抗病性。同时,不同地理来源的稻瘟病菌菌株群体中AVR-Pita家族的分布和变异类型具有特异性。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 avr-pita家族 变异 无毒基因 黑龙江省 海南省
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稻瘟病菌AVR-pita等位基因的遗传多样性研究(简报) 被引量:1
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作者 马炳田 曲广林 +4 位作者 石军 陈德西 林瑜凡 黄文娟 李仕贵 《分子细胞生物学报》 CSCD 北大核心 2008年第6期495-499,共5页
由真菌Magnaporthe grisea引起的稻瘟病是我国水稻三大病害之一.也是遍及世界各水稻产区的重要病害.每年均有不同程度的发生.流行年份一般减产10%-20%.严重的达40%-50%.局部田块甚至颗粒无收。稻瘟病菌在进化过程中形成了遗传... 由真菌Magnaporthe grisea引起的稻瘟病是我国水稻三大病害之一.也是遍及世界各水稻产区的重要病害.每年均有不同程度的发生.流行年份一般减产10%-20%.严重的达40%-50%.局部田块甚至颗粒无收。稻瘟病菌在进化过程中形成了遗传多样性和毒性易变的特性.是水稻品种抗病性容易丧失的主要原因之一。对稻瘟病系统研究的证据表明.水稻与稻瘟病菌之间的互作.符合“基因对基因”假说。也就是说.水稻有一抗病基因,稻瘟病菌中就会有相对应的无毒基因. 展开更多
关键词 稻瘟病菌 avr-pita 多样性 变异 抗病育种
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黑龙江省稻瘟病菌无毒基因AVR-Pita及其同源基因的检测与分析 被引量:4
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作者 孟峰 张亚玲 靳学慧 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期143-149,共7页
【目的】为了检测黑龙江省稻瘟病菌无毒基因AVR-Pita及其同源基因分布情况与变异机制,了解其变异类型的致病表型。【方法】采用3个无毒基因AVR-Pita1、AVR-Pita2和AVR-Pita3的特异性引物,对202个采自黑龙江省各稻区的稻瘟病菌单孢分离... 【目的】为了检测黑龙江省稻瘟病菌无毒基因AVR-Pita及其同源基因分布情况与变异机制,了解其变异类型的致病表型。【方法】采用3个无毒基因AVR-Pita1、AVR-Pita2和AVR-Pita3的特异性引物,对202个采自黑龙江省各稻区的稻瘟病菌单孢分离菌株的DNA进行PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳检测分析,挑选不同带型和不同地区代表菌株的PCR产物进行测序。测序结果与相应无毒基因序列进行碱基与氨基酸序列的比较分析,并利用水稻抗性单基因系,对不同变异类型的稻瘟病菌株进行功能验证【。结果】AVR-Pita1的出现频率为36.14%,AVR-Pita3出现频率为59.41%。AVR-Pita2在黑龙江省202个菌株DNA中未扩增出目的条带。对AVR-Pita1和AVR-Pita3的部分PCR产物进行序列分析,检测出AVR-Pita1有5种变异类型,它们是AVR-Pita1-1、AVR-Pita1-A、AVR-Pita1-B、AVR-Pita1-C和AVR-Pita1-D。经功能验证,AVR-Pita1-1、AVR-Pita1-A、AVR-Pita1-B和AVR-Pita1-D无毒功能丧失。而无毒基因AVR-Pita3未检测出变异菌株。【结论】AVR-Pita1变异能力较强,导致大多数菌株无毒功能丧失,需与其他抗性基因搭配使用。在黑龙江省稻瘟病菌生理小种中未发现AVR-Pita2基因。AVR-Pita3基因序列在菌株中比较稳定。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 avr-pita及其同源基因 功能验证
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Induction of avirulence by AVR-Pita1 in virulent U.S. field isolates of Magnaporthe oryzae’ 被引量:2
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作者 Yuntao Dai Eugenia Winston +1 位作者 James C.Correll Yulin Jia 《The Crop Journal》 SCIE CAS 2014年第1期1-9,共9页
The AVR-Pita1 gene,from the Chinese isolate O-137 of Magnaporthe oryzae,is an effector that determines the efficacy of the Pi-ta rice blast resistance gene.In the present study,the avirulence function of AVR-Pita1 was... The AVR-Pita1 gene,from the Chinese isolate O-137 of Magnaporthe oryzae,is an effector that determines the efficacy of the Pi-ta rice blast resistance gene.In the present study,the avirulence function of AVR-Pita1 was induced by transformation of field isolates(TM2,ZN19,B2 and B8)that originally were collected from the U.S.and are virulent on Pi-ta-carrying rice cultivars.The presence of AVR-Pita1 from O-137 in independent transformants was detected by PCR using AVR-Pita1 specific primers and verified by DNA sequencing and Southern blot analysis using the AVR-Pita1 coding region as a probe.The results of pathogenicity assays showed that the AVR-Pita1-transformed isolates were not able to infect rice cultivars Katy and Drew carrying Pi-ta.Control isolates that were transformed with inserts lacking the AVR-Pita1gene remained virulent.Our findings demonstrate that AVR-Pita1 can be used to induce novel gene-specific blast resistance in nature. 展开更多
关键词 AVIRULENCE gene avr-pita1 Pi-ta RICE BLAST resistance
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菲律宾稻瘟病菌生理小种中AVR-Pita及其同源基因的序列与功能分析 被引量:3
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作者 甘玉姿 肖贵 +4 位作者 邓启云 吴俊 柏斌 卢向阳 周波 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2018年第3期488-498,共11页
根据已克隆的AVR-Pita及其同源基因序列设计4对引物,对来自菲律宾的74个稻瘟病单孢菌株DNA进行PCR扩增和序列分析,研究了与水稻抗病基因Pi-ta互作的稻瘟病菌无毒基因AVR-Pita及其同源基因序列多态性与进化关系。结果显示,在42个菌株中... 根据已克隆的AVR-Pita及其同源基因序列设计4对引物,对来自菲律宾的74个稻瘟病单孢菌株DNA进行PCR扩增和序列分析,研究了与水稻抗病基因Pi-ta互作的稻瘟病菌无毒基因AVR-Pita及其同源基因序列多态性与进化关系。结果显示,在42个菌株中扩增出AVR-Pita1基因目的条带,31个菌株中扩增出AVR-Pita3基因目的条带,55个菌株中扩增出AVR-Pita4基因目的条带,但所有供试菌株均未扩增出AVR-Pita2基因目的条带。对PCR产物进行测序分析,发现AVR-Pita1基因在菲律宾的生理小种中存在序列多态性,可划分为5个单倍型,共有10个多态性位点;AVR-Pita3和AVR-Pita4基因序列较保守,序列比对后没有发现多态性。对不同单基因系接种鉴定,发现除第3种AVR-Pita1单倍型外,含有AVR-Pita1单倍型1、2、4及5的生理小种均不能与Pi-ta基因互作,从而使Pi-ta单基因系IRBLta-CT2在接种后表现为感病。以上试验结果说明AVR-Pita1基因变异性较强,且序列改变后会导致基因功能的变化。 展开更多
关键词 稻瘟病菌 AVR—Pita及其同源基因 序列分析 功能分析
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稻瘟菌无毒基因的分子检测及其指纹类型分析 被引量:1
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作者 孙庚 靳春鹏 +5 位作者 陈婷婷 刘金亮 任金平 刘晓梅 张世宏 潘洪玉 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期122-126,共5页
针对稻瘟菌中Avr-Pita与AvrPiz-t两个无毒基因,设计特异性引物,利用PCR方法对吉林省103株稻瘟菌菌株进行分子检测,并结合AVR-Pih、AVR-CO39、PWL2和ACE1 4个无毒基因在其中85个菌株中的分布情况,绘制出基于这6个无毒基因的指纹类型。结... 针对稻瘟菌中Avr-Pita与AvrPiz-t两个无毒基因,设计特异性引物,利用PCR方法对吉林省103株稻瘟菌菌株进行分子检测,并结合AVR-Pih、AVR-CO39、PWL2和ACE1 4个无毒基因在其中85个菌株中的分布情况,绘制出基于这6个无毒基因的指纹类型。结果表明,Avr-Pita基因和AvrPiz-t基因在吉林省稻瘟菌中的分布频率分别为86.41%和62.14%;建立的指纹类型显示,85株稻瘟菌分布于9种类型中,其中类型1为主要类型,其分布频率为40.00%;根据30个已知生理小种的菌株在指纹类型中的分布情况,初步发现类型7与吉林省优势生理小种ZE1可能存在对应关系,并应用于稻瘟菌优势生理小种的特异性分子检测;其他指纹类型与中国生理小种并无明显对应关系。明确了无毒基因Avr-Pita与AvrPiz-t在吉林省稻瘟菌中的分布情况,构建了无毒基因的指纹类型,为水稻抗瘟育种和稻瘟菌优势小种的分子监测提供理论依据。 展开更多
关键词 稻瘟菌 无毒基因 avr-pita AvrPiz-t DNA指纹类型
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An expedited method for isolation of DNA for PCR from Magnaporthe oryzae stored on filter paper
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作者 Yulin Jia Yeshi A. Wamishe Bo Zhou 《The Crop Journal》 SCIE CAS 2014年第5期267-271,共5页
The fungus Magnaporthe oryzae is the causal agent of a wide range of cereal diseases. For long-term preservation, the fungus is grown and stored desiccated on filter papers at –20 °C.Inoculated filter papers are... The fungus Magnaporthe oryzae is the causal agent of a wide range of cereal diseases. For long-term preservation, the fungus is grown and stored desiccated on filter papers at –20 °C.Inoculated filter papers are cut into pieces of 0.5–1.0 cm diameter prior to storage. In the present study, a fast(11 min) and simple method of preparing DNA suitable for amplifying avirulence genes of M. oryzae by polymerase chain reaction(PCR) was developed. A piece of filter paper containing the fungus was removed from a glass bottle and placed in a 0.2 mL Eppendorf tube containing 100 μL 10 × TE. The suspension was heated for 10 min at 95 °C in a PCR machine. The tube was then centrifuged for 1 min at 3000 r min-1. One μL of 10 × TE solution containing DNA was used for PCR. A total of 28 samples were PCR tested. As a positive control, fungal DNA was extracted using a conventional DNA preparation method. DNA samples obtained from both methods were stored at 4 °C. PCR was performed with DNA on the preparation day and after 4, 8,10, and 18 days of refrigerated storage. In four samples, samples 12, 13, 14, and 28, AVR-Pi9 failed to be amplified. These four samples were tested with a different set of primers for AVR-Pi9, and for AVR-Pita1, confirming that the quality of the samples was insufficient for PCR. Overall, for nearly 90%(24/28) of the samples, the quality of the DNA prepared directly from the fungus on filter paper appeared suitable for a rapid survey of genetic identity of the rice blast fungus by PCR.This method will be useful and effective for reducing cost and time and could readily be adopted worldwide for analysis of M. oryzae and possibly other fungi. 展开更多
关键词 avr-pita1 GENE identification DNA extraction PCR TEN × TE
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Genetic Analysis of Rice Mutants Identifi es a New Locus at the Pi-ta Region Controlling Pathogen Recognition
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作者 Y.L. Jia 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第2期173-174,共2页
Understanding the molecular mechanisms of host and parasite interactions should facilitate the development of novel strategies to control plant diseases. Host interactions with biotrophic and hemi-biotrophic pathogens
关键词 突变体 区域控制 基因 稻子
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