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题名黑皮冬瓜NBS类抗病基因同源序列克隆与分析
被引量:5
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作者
赵芹
谢大森
何晓明
罗少波
李明珠
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机构
广东省农业科学院蔬菜研究所
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出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2014年第10期2071-2077,共7页
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基金
国家自然科学青年基金(No.31311643)
广东省自然科学基金(No.10451064001006063)
广州市珠江科技新星项目(No.2013086)
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文摘
以黑皮冬瓜"B98K"种质为试材,根据已克隆的植物NBS类抗病基因保守结构域设计简并引物,PCR扩增冬瓜基因组DNA,获得对应区段的DNA片段,回收克隆与测序后,得到19条抗病同源序列(命名为DNB1至DNB19)。利用DNAStar软件进行序列分析及同源性比对发现,这些抗病同源序列长度在249-252 nt之间,其核苷酸序列同源性在48.4%-98.8%之间,氨基酸序列同源性为23.2%-100.0%,推导氨基酸序列具有P-loop(GGVGKTT)、Kinase-2a(VLDDVW)典型的NBS保守结构域。同源进化分析将其全部归为non TIR-NBS-LRR类,与推导氨基酸序列多重比较结果一致;该序列与其他作物已克隆抗病基因的氨基酸序列同源性在24.7%-99.0%之间。该组序列已登录Genbank,登录号为KF776401-KF776419。
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关键词
冬瓜
NBS
抗病同源序列
同源克隆
序列分析
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Keywords
ax gourd
NBS
Resistance gene analogs
Homologous clone
Sequence analysis
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分类号
S642
[农业科学—蔬菜学]
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