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HLA新等位基因B* 13:92的确认及蛋白质三级结构的初步分析 被引量:1
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作者 裴永峰 黄惠妮 +1 位作者 李恒聪 吴国光 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1558-1562,共5页
目的:人类白细胞抗原(HLA)新等位基因B*13:92的确认及蛋白质空间结构的分析。方法:应用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction sequencing based typing,PCR-SBT)进行HLA常规实验分型,HLA-B位点分型结... 目的:人类白细胞抗原(HLA)新等位基因B*13:92的确认及蛋白质空间结构的分析。方法:应用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction sequencing based typing,PCR-SBT)进行HLA常规实验分型,HLA-B位点分型结果与等位基因B*13:01:01,B*58:01:01在189位有1个碱基不匹配,不能指定为任何HLA-B位点等位基因,用针对B*13、B*58的组特异性测序引物(GSSP),确认与同源性最高的HLA等位基因序列的差异,使用SWISS-MODEL方法建立该新基因的空间模型并进行分析。结果:测序结果证实,该等位基因与其同源性最高的等位基因是B*13:01:01,两者的差异是在第2外显子189位的C〉A,密码子39由GAC变为GAA,编码的氨基酸由天冬氨酸(D)转变为谷氨酸(E)。空间结构分析表明替代氨基酸位于抗原肽结合区α螺旋上。结论:该等位基因是在中国广西壮族人群发现的一个新HLA-B位点等位基因,世界卫生组织(WHO)HLA命名委员会将其正式命名为HLA-B*13:92。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 等位基因b*13 蛋白质三级结构
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新等位基因HLA-B*9526的确认和序列分析 被引量:2
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作者 陈阳 刘显智 +3 位作者 李晓丰 章旭 张坤莲 李剑平 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期705-708,共4页
目的鉴定中国人群中人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)新等位基因HLAB*9526,并进行核苷酸序列分析。方法使用序列特异性寡核苷酸PCR技术进行HLA基因分型,发现1个反应格局异常的等位基因,应用分子克隆和DNA双向测序技术... 目的鉴定中国人群中人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)新等位基因HLAB*9526,并进行核苷酸序列分析。方法使用序列特异性寡核苷酸PCR技术进行HLA基因分型,发现1个反应格局异常的等位基因,应用分子克隆和DNA双向测序技术测定新等位基因的核苷酸序列,并与已知等位基因进行序列比对分析。结果检出反应格局异常的DNA样本,经过克隆测序得到两个等位基因,分型结果一个为B*5403,另一个的核苷酸序列与已知的HI。A等位基因均不同,该基因序列与同源性最高的HLAB*1507基因序列相比在第3外显子区域中425位碱基发生A→G突变,导致142位编码氨基酸由酪氨酸变成半胱氨酸。结论一个新的HLA—B等位基因被确认,并被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLAB*9526。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原分型 HLA- b新等位基因 人类白细胞抗原-b*9526
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