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HLA新等位基因B* 13:92的确认及蛋白质三级结构的初步分析
被引量:
1
1
作者
裴永峰
黄惠妮
+1 位作者
李恒聪
吴国光
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期1558-1562,共5页
目的:人类白细胞抗原(HLA)新等位基因B*13:92的确认及蛋白质空间结构的分析。方法:应用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction sequencing based typing,PCR-SBT)进行HLA常规实验分型,HLA-B位点分型结...
目的:人类白细胞抗原(HLA)新等位基因B*13:92的确认及蛋白质空间结构的分析。方法:应用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction sequencing based typing,PCR-SBT)进行HLA常规实验分型,HLA-B位点分型结果与等位基因B*13:01:01,B*58:01:01在189位有1个碱基不匹配,不能指定为任何HLA-B位点等位基因,用针对B*13、B*58的组特异性测序引物(GSSP),确认与同源性最高的HLA等位基因序列的差异,使用SWISS-MODEL方法建立该新基因的空间模型并进行分析。结果:测序结果证实,该等位基因与其同源性最高的等位基因是B*13:01:01,两者的差异是在第2外显子189位的C〉A,密码子39由GAC变为GAA,编码的氨基酸由天冬氨酸(D)转变为谷氨酸(E)。空间结构分析表明替代氨基酸位于抗原肽结合区α螺旋上。结论:该等位基因是在中国广西壮族人群发现的一个新HLA-B位点等位基因,世界卫生组织(WHO)HLA命名委员会将其正式命名为HLA-B*13:92。
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关键词
人类白细胞抗原
新
等位基因
b
*13
蛋白质三级结构
下载PDF
职称材料
新等位基因HLA-B*9526的确认和序列分析
被引量:
2
2
作者
陈阳
刘显智
+3 位作者
李晓丰
章旭
张坤莲
李剑平
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期705-708,共4页
目的鉴定中国人群中人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)新等位基因HLAB*9526,并进行核苷酸序列分析。方法使用序列特异性寡核苷酸PCR技术进行HLA基因分型,发现1个反应格局异常的等位基因,应用分子克隆和DNA双向测序技术...
目的鉴定中国人群中人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)新等位基因HLAB*9526,并进行核苷酸序列分析。方法使用序列特异性寡核苷酸PCR技术进行HLA基因分型,发现1个反应格局异常的等位基因,应用分子克隆和DNA双向测序技术测定新等位基因的核苷酸序列,并与已知等位基因进行序列比对分析。结果检出反应格局异常的DNA样本,经过克隆测序得到两个等位基因,分型结果一个为B*5403,另一个的核苷酸序列与已知的HI。A等位基因均不同,该基因序列与同源性最高的HLAB*1507基因序列相比在第3外显子区域中425位碱基发生A→G突变,导致142位编码氨基酸由酪氨酸变成半胱氨酸。结论一个新的HLA—B等位基因被确认,并被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLAB*9526。
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关键词
人类白细胞抗原分型
HLA-
b新等位基因
人类白细胞抗原-
b
*9526
原文传递
题名
HLA新等位基因B* 13:92的确认及蛋白质三级结构的初步分析
被引量:
1
1
作者
裴永峰
黄惠妮
李恒聪
吴国光
机构
南宁输血医学研究所
出处
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期1558-1562,共5页
基金
南宁市科学研究与技术开发计划项目(201003048C-3)
文摘
目的:人类白细胞抗原(HLA)新等位基因B*13:92的确认及蛋白质空间结构的分析。方法:应用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(polymerase chain reaction sequencing based typing,PCR-SBT)进行HLA常规实验分型,HLA-B位点分型结果与等位基因B*13:01:01,B*58:01:01在189位有1个碱基不匹配,不能指定为任何HLA-B位点等位基因,用针对B*13、B*58的组特异性测序引物(GSSP),确认与同源性最高的HLA等位基因序列的差异,使用SWISS-MODEL方法建立该新基因的空间模型并进行分析。结果:测序结果证实,该等位基因与其同源性最高的等位基因是B*13:01:01,两者的差异是在第2外显子189位的C〉A,密码子39由GAC变为GAA,编码的氨基酸由天冬氨酸(D)转变为谷氨酸(E)。空间结构分析表明替代氨基酸位于抗原肽结合区α螺旋上。结论:该等位基因是在中国广西壮族人群发现的一个新HLA-B位点等位基因,世界卫生组织(WHO)HLA命名委员会将其正式命名为HLA-B*13:92。
关键词
人类白细胞抗原
新
等位基因
b
*13
蛋白质三级结构
Keywords
Human leukocyte antigen
HLA-
b
* 13 allele
protein 3D model structure
分类号
R457.1 [医药卫生—治疗学]
下载PDF
职称材料
题名
新等位基因HLA-B*9526的确认和序列分析
被引量:
2
2
作者
陈阳
刘显智
李晓丰
章旭
张坤莲
李剑平
机构
辽宁省血液中心
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期705-708,共4页
基金
基金项目:辽宁省自然科学基金(20062127)
沈阳市科学计划项目(1081324-9-00)
文摘
目的鉴定中国人群中人类白细胞抗原(humanleukocyteantigen,HLA)新等位基因HLAB*9526,并进行核苷酸序列分析。方法使用序列特异性寡核苷酸PCR技术进行HLA基因分型,发现1个反应格局异常的等位基因,应用分子克隆和DNA双向测序技术测定新等位基因的核苷酸序列,并与已知等位基因进行序列比对分析。结果检出反应格局异常的DNA样本,经过克隆测序得到两个等位基因,分型结果一个为B*5403,另一个的核苷酸序列与已知的HI。A等位基因均不同,该基因序列与同源性最高的HLAB*1507基因序列相比在第3外显子区域中425位碱基发生A→G突变,导致142位编码氨基酸由酪氨酸变成半胱氨酸。结论一个新的HLA—B等位基因被确认,并被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLAB*9526。
关键词
人类白细胞抗原分型
HLA-
b新等位基因
人类白细胞抗原-
b
*9526
Keywords
human leukocyte antigen typing
a novel HLA-
b
allele
HLA-
b
* 9526
分类号
R392.1 [医药卫生—免疫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HLA新等位基因B* 13:92的确认及蛋白质三级结构的初步分析
裴永峰
黄惠妮
李恒聪
吴国光
《中国实验血液学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
下载PDF
职称材料
2
新等位基因HLA-B*9526的确认和序列分析
陈阳
刘显智
李晓丰
章旭
张坤莲
李剑平
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2009
2
原文传递
已选择
0
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