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姜曲海猪ATP2B1基因克隆、生物信息学及组织表达分析
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作者 徐盼 赵为民 +4 位作者 倪黎纲 张君胜 闫伟 刘家兴 陶勇 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第8期150-156,共7页
克隆姜曲海猪质膜钙转运ATP酶1(ATPase Plasma Membrane Ca2+Transporting 1,ATP2B1)基因CDS区序列,对其进行生物信息学分析,并探究ATP2B1基因在不同日龄姜曲海猪子宫组织的表达水平,以期为研究ATP2B1基因在姜曲海猪繁殖性能方面的作用... 克隆姜曲海猪质膜钙转运ATP酶1(ATPase Plasma Membrane Ca2+Transporting 1,ATP2B1)基因CDS区序列,对其进行生物信息学分析,并探究ATP2B1基因在不同日龄姜曲海猪子宫组织的表达水平,以期为研究ATP2B1基因在姜曲海猪繁殖性能方面的作用提供参考依据,采用RT-PCR技术扩增姜曲海猪子宫ATP2B1基因CDS区序列,利用生物信息学软件对其进行分析,利用实时荧光定量PCR检测ATP2B1基因在1月龄和8月龄姜曲海猪子宫组织中的表达量。结果显示,姜曲海猪ATP2B1基因CDS区全长3 663 bp,编码1 220个氨基酸,与野猪同源性最高、亲缘关系最近。姜曲海猪ATP2B1蛋白分子质量约为134 737.94 u,原子总数为19 102个,理论等电点(pI)为5.63,带正电荷、负电荷的氨基酸数分别为141、161个。该蛋白最可能位于细胞膜上,为跨膜、非分泌型疏水蛋白质,有159个磷酸化位点和5个N-糖基化位点,无规则卷曲在预测的二级结构中占比最大。实时荧光定量PCR结果显示,ATP2B1基因在8月龄姜曲海猪子宫组织中的表达量显著低于1月龄姜曲海猪子宫组织(P<0.05)。本试验为探明ATP2B1基因对猪繁殖性状的影响提供了分子理论依据。 展开更多
关键词 姜曲海猪 ATP2b1基因 克隆 生物信息学 组织表达
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ApoE和SLCO1B1基因多态性对高脂血症患者降脂治疗的效果影响
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作者 刘佳 尤佳 +2 位作者 朱华 张清洋 朱业 《中国医药导报》 CAS 2023年第35期19-23,共5页
目的 探究ApoE、SLCO1B1基因多态性及其对高脂血症患者他汀类药物降脂疗效的影响。方法 选择江苏省苏北人民医院2020年1月至2022年1月常规体检中发现的247例高脂血症患者,应用PCR-焦磷酸测序法对患者的ApoE、SLCO1B1基因位点的多态性进... 目的 探究ApoE、SLCO1B1基因多态性及其对高脂血症患者他汀类药物降脂疗效的影响。方法 选择江苏省苏北人民医院2020年1月至2022年1月常规体检中发现的247例高脂血症患者,应用PCR-焦磷酸测序法对患者的ApoE、SLCO1B1基因位点的多态性进行检测,对基因型分型进行哈迪-温伯格定律分析,比较不同基因型在性别中的分布特点。根据ApoE、SLCO1B1基因多态性对患者进行分类,比较不同基因型患者服用他汀类药物3个月前后的血脂指标差异。结果 247例高脂血症患者ApoE、SLCO1B1基因位点观察值符合哈迪-温伯格定律(P>0.05)。患者ApoE等位基因分别为E2(133例)、E3(173例)和E4(41例),涉及6种不同基因型,分别为E2/E2、E2/E3、E2/E4、E3/E3、E3/E4和E4/E4,不同基因型性别分布比较,差异无统计学意义(P>0.05)。SLCO1B1基因表型共检出3类(6种基因型),分别为Ⅰ(*1a/*1a、*1a/*1b、*1b/*1b,185例)、Ⅱ(*1a/*15、*1b/*15,58例)、Ⅲ类(*15/*15,4例)基因型。SLCO1B1基因型患者性别分布比较,差异有统计学意义(P<0.05)。治疗3个月后,ApoE2、E3、E4患者总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)均低于治疗前,差异有统计学意义(P<0.05)。治疗3个月后,SLCO1B1基因型Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ类患者TC、TG、LDL-C均低于治疗前,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 ApoE和SLCO1B1的基因频率呈规律性分布,SLCO1B1基因型存在性别差异,ApoE和SLCO1B1基因多态性对高脂血症患者他汀类药物治疗可能无影响。 展开更多
关键词 APOE基因 SLCO1b1基因 高脂血症 基因多态性
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APOE、SLCO1B1基因多态性与老年2型糖尿病认知功能障碍的相关研究进展
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作者 郭晓玲 张毅 +2 位作者 陈芸 张瑶 胡玮璟 《临床神经病学杂志》 CAS 2023年第5期382-385,共4页
老年人2型糖尿病和认知功能障碍是复杂且高发的疾病。有证据表明,认知功能障碍是2型糖尿病的一种内在表型,尤其在老年人群中。2型糖尿病与注意力、工作记忆和面孔记忆之间存在显著的遗传相关性,这表明2型糖尿病与这些认知领域之间存在... 老年人2型糖尿病和认知功能障碍是复杂且高发的疾病。有证据表明,认知功能障碍是2型糖尿病的一种内在表型,尤其在老年人群中。2型糖尿病与注意力、工作记忆和面孔记忆之间存在显著的遗传相关性,这表明2型糖尿病与这些认知领域之间存在基因重叠。临床指南也强调了轻度认知障碍在老年2型糖尿病患者管理中的重要性。在精准医疗时代,基因组学可以为研究和治疗疾病提供有效的方法,特别是在优化药物疗效、减少不良反应方面。本文主要围绕APOE、SLCO1B1基因多态性对老年2型糖尿病认知功能障碍的影响进行阐述,并对该领域的未来研究方向进行了探讨。 展开更多
关键词 老年人 2型糖尿病 轻度认知功能障碍 APOE基因 SLCO1b1基因
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孟鲁司特钠治疗汉族儿童支气管哮喘疗效与ABCC1、SLCO2B1基因单核苷酸多态性的相关性研究
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作者 石慧莉 杨一民 +4 位作者 王珊珊 陈茜 洪菲萍 黄永莲 李溦 《发育医学电子杂志》 2023年第6期434-440,共7页
目的探讨白三烯受体拮抗剂(leukotriene receptor antagonists,LTRA)与ATP结合盒亚家族C1(ATP-binding cassette sub-family C member 1,ABCC1)基因rs119774位点、溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员2B1(solute carrier organic anion ... 目的探讨白三烯受体拮抗剂(leukotriene receptor antagonists,LTRA)与ATP结合盒亚家族C1(ATP-binding cassette sub-family C member 1,ABCC1)基因rs119774位点、溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员2B1(solute carrier organic anion transporter family member 2B1,SLCO2B1)基因rs12422149位点的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)治疗汉族儿童支气管哮喘疗效的相关性。方法选取2019年4月至2021年12月于福建中医药大学附属厦门市中医院就诊的4~13岁汉族支气管哮喘患儿100例为研究对象,采用一代测序法对患儿的ABCC1基因rs119774位点、SLCO2B1基因rs12422149位点进行检测,分析比较2个位点的SNP分布情况。入组患儿均应用LTRA进行治疗,分别于治疗前与治疗12周时进行肺通气功能及脉冲震荡功能检测,并评估临床症状控制水平,分析患儿疗效与SNP的相关性。统计学方法采用t检验、χ^(2)检验。结果治疗前与治疗12周后,ABCC1基因rs119774位点CC型哮喘患儿应用孟鲁司特钠第1秒用力呼气容积(forced expiratory volume in the first second,FEV_(1))[(87.0±16.5)与(93.2±15.1)L,t=-2.071,P=0.038]、峰值呼气流速(peak expiratory flow,PEF)[(77.1±16.9)与(86.5±16.6)L/s,t=-3.233,P=0.001]和25%肺活量的呼气流速(forced expiratory flow 25,FEF25)[(69.6±18.8)与(78.1±19.9)L/s,t=-1.985,P=0.047]均有明显提高,脉冲震荡各项指标显著改善(P<0.05)。治疗后SLCO2B1基因rs12422149位点AA型肺功能指标PEF高于治疗前[(79.0±16.0)与(93.0±9.4)L/s,t=-2.547,P=0.011],治疗后GG型肺功能各指标显著高于治疗前(P<0.05)。ABCC1治疗前后控制率[59%(59/100)与78%(78/100),78%(78/100),χ^(2)=20.964,P<0.001];治疗前后SLCO2B1基因rs119774位点AA型、AG型、GG型的控制率分别为[59%(59/100)与78%(78/100),78%(78/100),χ^(2)=20.964,P<0.001]、[53%(8/15)与80%(12/15),93%(14/15)χ^(2)=12.786,P=0.002]与[56%(23/41)与78%(32/41),78%(32/41),χ^(2)=6.583,P=0.037]与[73%(32/44)与77%(34/44),73%(32/44),χ^(2)=6.471,P=0.039],均显著改善。结论LTRA治疗汉族支气管哮喘患儿与ABCC1、SLCO2B1基因SNP的效果存在相关性。 展开更多
关键词 支气管哮喘 AbCC1基因 SLCO2b1基因 单核苷酸多态性 白三烯受体拮抗剂 汉族儿童
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CYP1B1基因RS1800440A/G与RS1056836 C/G联合基因型多态性与子宫内膜异位症易感性的相关性
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作者 王玉凤 毛婷 《吉林医学》 CAS 2023年第8期2092-2095,共4页
目的:探讨中国南方汉族妇女CYP1B1基因rs1800440及rs1056836多态性协同作用与子宫内膜异位症发病的相关性。方法:收集经手术证实的432例子宫内膜异位症患者和499名对照人群外周血,采用高分辨率熔解曲线技术检测CYP1B1基因rs1800440及rs1... 目的:探讨中国南方汉族妇女CYP1B1基因rs1800440及rs1056836多态性协同作用与子宫内膜异位症发病的相关性。方法:收集经手术证实的432例子宫内膜异位症患者和499名对照人群外周血,采用高分辨率熔解曲线技术检测CYP1B1基因rs1800440及rs1056836多态性。结果:由于两组中CYP1B1基因rs1800440及rs1056836位点同时分型成功的例数分别为431例、499例,测得内异症组CYP1B1基因rs1800440及rs1056836联合基因型分布频率为AACC 79.35%、AACG 18.79%、AAGG 0.70%、AGCC 1.16%、AGCG 0%、AGGG 0%、GGCC 0%、GGCG 0%、GGGG 0%;对照组中联合基因型分布分别为AACC 77.15%、AACG 20.64%、AAGG 1.40%、AGCC 0.40%、AGCG 0.40%、AGGG 0%、GGCC 0%、GGCG 0%、GGGG 0%;两组患者联合基因型分布比较,差异无统计学意义(F=4.596,P=0.312)。携带AGCC型基因者内异症发病风险最高[OR值:2.814,95%CI为(0.543~14.600)],AGCG型内异症的发病风险也略有增加[OR值:1.888,95%CI为(1.763~2.022)]。CYP1B1基因rs1800440为野生AA型时,随着rs1056836含等位基因“G”比例升高,内异症的发病风险逐渐降低。而CYP1B1基因rs1056836为野生CC型时,随着rs1800440位点含“G”比例升高,内异症的发病风险逐渐增加。结论:中国南方汉族妇女外周血CYP1B1基因rs1800440多态性无GG型存在。rs1800440、rs1056836联合基因型分布中,AACC型最多,但联合基因的多态性的分布与子宫内膜异位症的发病无明显关联。CYP1B1基因rs1800440中的等位基因G可增加内异症的风险,而rs1056836中的等位基因G对内异症的易感性有保护作用。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症 芳香化酶P450 CYP1b1基因 单核苷酸多态性
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CYP2C19、APOE以及SCLO1B1基因与对比剂肾病发生的相关性研究
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作者 李慧敏 李猛 《内蒙古医学杂志》 2023年第8期943-947,共5页
目的探讨氯吡格雷(CYP2C19)基因、他汀基因(APOE基因以及SCLO1B1基因)与对比剂肾病发生的相关性。方法选取包头市中心医院心内科2021年10月至2022年10月收治的行冠状动脉CTA及PCI的患者500例,依据注射对比剂前后48~72 h肌酐水平分为对... 目的探讨氯吡格雷(CYP2C19)基因、他汀基因(APOE基因以及SCLO1B1基因)与对比剂肾病发生的相关性。方法选取包头市中心医院心内科2021年10月至2022年10月收治的行冠状动脉CTA及PCI的患者500例,依据注射对比剂前后48~72 h肌酐水平分为对比剂肾病组(CIN组,49例)和非对比剂肾病组(非CIN组,451例)。比较两组患者一般生物学资料、血脂、尿酸、糖化血红蛋白、肌钙蛋白I、血浆NT-proBNP浓度、血浆CK-MB浓度和氯吡格雷基因、他汀基因、对比剂用量相关指标等。结果氯吡格雷基因慢代谢组CIN发病率高于快代谢组,差异存在统计学意义(P=0.001,P<0.0167);E2/E2,E2/E3组CIN发病率高于E2/E4,E3/E3组,差异有统计学意义(P=0.002,P<0.0167)。结论(1)氯吡格雷基因慢代谢型相比快代谢人群更容易发生对比剂肾病;(2)APOE基因的E2/E2,E2/E3组人群比E2/E4,E3/E3人群更容易发生对比剂肾病。 展开更多
关键词 对比剂肾病 CYP2C19基因 APOE基因 SCLO1b1基因
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NFκB1基因多态性与溃疡性结肠炎相关性研究 被引量:18
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作者 郭俊宇 韦叶生 +2 位作者 周喜汉 杨昌谋 覃安强 《广东医学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期724-726,共3页
目的探讨NFκB1基因单核苷酸多态性rs3774963 C>G和rs11722146 A>G与溃疡性结肠炎的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测149例溃疡性结肠炎患者组和168例健康对照组NFκB1基因多态性。结果在rs3... 目的探讨NFκB1基因单核苷酸多态性rs3774963 C>G和rs11722146 A>G与溃疡性结肠炎的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测149例溃疡性结肠炎患者组和168例健康对照组NFκB1基因多态性。结果在rs3774963 C>G位点,溃疡性结肠炎组GG基因型占53.0%,明显高于对照组(38.7%),差异具有统计学意义(P=0.005)。G等位基因频率(73.2%)亦明显高于对照组(61.9%),差异具有统计学意义(P=0.003)。在rs11722146 A>G位点,两组间基因型和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。两位点溃疡性结肠炎不同分型基因型和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。结论NFκB1基因rs3774963 C>G多态性与溃疡性结肠炎的发病具有相关性,其中G等位基因可能是溃疡性结肠炎的遗传危险因素。 展开更多
关键词 NFκb1基因 单核苷酸多态性 溃疡性结肠炎
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SF3B1基因突变与骨髓增生异常综合征伴环形铁粒幼细胞增多 被引量:8
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作者 孟凡凯 黄丽芳 +1 位作者 周剑峰 孙汉英 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期1088-1090,共3页
骨髓增生异常综合征(MDS)是一种克隆性的造血干细胞疾病,以病态造血为特征,机制多样,预后不同。环形铁粒幼细胞(ring sideroblasts,RS)增多是MDS病态造血的重要表现,其机制不清,治疗困难。剪接因子在真核生物mRNA的成熟过程中发挥了重... 骨髓增生异常综合征(MDS)是一种克隆性的造血干细胞疾病,以病态造血为特征,机制多样,预后不同。环形铁粒幼细胞(ring sideroblasts,RS)增多是MDS病态造血的重要表现,其机制不清,治疗困难。剪接因子在真核生物mRNA的成熟过程中发挥了重要作用。最近发现,剪接因子3B第1亚单位(SF3B1)基因突变与MDS-RS的发病密切相关,呈因果关系。深入研究SF3B1突变后的下游分子通路,对于明确MDS-RS的发病机制,寻找治疗靶点具有重要意义。 展开更多
关键词 SF3b1基因 骨髓增生异常综合征 环形铁粒幼细胞
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血脂异常人群ApoE和SLCO1B1基因多态性及相关性研究 被引量:24
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作者 孙谦 周辉 郭丽娜 《现代检验医学杂志》 CAS 2017年第6期28-31,共4页
目的分析湘雅医院血脂异常人群中ApoE和(SLCO1B1)基因型频率分布特征,探究ApoE和SLCO1B1基因型与各项血脂指标的相关性,为防治动脉粥样硬化性疾病提供依据。方法收集湘雅医院2016年6月~2017年4月共87例血脂异常人群三酰甘油(triglycerid... 目的分析湘雅医院血脂异常人群中ApoE和(SLCO1B1)基因型频率分布特征,探究ApoE和SLCO1B1基因型与各项血脂指标的相关性,为防治动脉粥样硬化性疾病提供依据。方法收集湘雅医院2016年6月~2017年4月共87例血脂异常人群三酰甘油(triglyceride,TG)、总胆固醇(total cholesterol,TC)、低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein cholesterol,LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(high density lipoprotein cholesterol,HDL-C)数据,采用PCR荧光探针法检测87例血脂异常人群的ApoE和SLCO1B1基因型,分析基因频率分布特征并比较各基因型间各项血脂指标的差异。结果87例血脂异常人群ApoE各基因型频率为:E2/E2型1.15%,E2/E3型13.79%,E2/E4型1.15%,E3/E3型56.32%,E3/E4型26.44%和E4/E4型1.15%,各等位基因频率分布以E3占比最高,为76.44%,E2与E4分别为8.62%和14.94%。E4表型组TC和LDL-C浓度大于E2,E3组,3组表型TG,TC,LDL-C,HDL-C浓度水平差异无统计学意义。SLCO1B1各基因型频率为:*1a/*1a型6.90%,*1a/*1b型36.78%,*1a/*15型13.79%,*1b/*1b型26.44%和*1b/*15型16.09%,各单体型频率分布以*1b占比最高,为52.87%,*1a与*15分别为32.18%和14.94%,未检测到*5型。SLCO1B1各组TG,TC,LDL-C和HDL-C浓度水平差异无统计学意义。结论 ApoE基因型频率分布不均,其多态性与血脂水平可能存在相关性;SLCO1B1基因频率分布存在种族差异性,其多态性与血脂水平不相关。临床医师可以根据ApoE和SLCO1B1基因型合理选择用药剂量,以防治冠状动脉粥样硬化性疾病。 展开更多
关键词 APOE基因 SLCO1b1基因 血脂异常 多态性
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CYP72B1基因和AUR3基因响应光、生长素和油菜素内酯的转录调控机制研究 被引量:3
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作者 张长青 王进 +1 位作者 朱怀球 高翔 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1215-1221,共7页
为研究光、生长素和油菜素内酯在基因层次上的互作机制,开发了转录调控元件识别工具OCMMat,其中,在对共表达基因信息和直系同源基因信息进行整合时,利用了转录调控元件在直系同源基因启动子中的富集性.利用该方法发现,CYP72B1基因和AUR... 为研究光、生长素和油菜素内酯在基因层次上的互作机制,开发了转录调控元件识别工具OCMMat,其中,在对共表达基因信息和直系同源基因信息进行整合时,利用了转录调控元件在直系同源基因启动子中的富集性.利用该方法发现,CYP72B1基因和AUR3基因启动子含有3个相同的调控模序GAGACA、AAGAAAAA、ATCATG,它们分别承担了AuxRE元件、GT元件和GT辅助元件的功能.其中,ATCATG模序是目前尚未报道过的调控元件,与AAGAAAAA模序的距离相对恒定.基于调控元件识别结果,构建了CYP72B1基因和AUR3基因响应光、生长素和油菜素内酯的转录调控模型,模型显示:光信号和生长素、油菜素内酯信号在CYP72B1基因和AUR3基因的转录调控元件上相互交叠,而生长素和油菜素内酯信号则在转录因子ARF水平上相交. 展开更多
关键词 CYP72b1基因 AUR3基因 转录调控 元件识别 GT元件 AuxRE元件
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水牛HSD17B1基因克隆分析及其真核表达载体构建 被引量:3
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作者 朱鹏 庞春英 +5 位作者 邓廷贤 段安琴 陆杏蓉 陈明棠 杨炳壮 梁贤威 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第3期559-567,共9页
为了阐明水牛17β-羟类固醇脱氢酶1(17beta-hydroxysteroid dehydrogenase 1,HSD17B1)基因对水牛繁殖性能的影响,本试验采用了3′-RACE克隆获得HSD17B1基因,并对其核苷酸序列和蛋白质序列进行了生物信息学分析,通过构建其真核表达载体... 为了阐明水牛17β-羟类固醇脱氢酶1(17beta-hydroxysteroid dehydrogenase 1,HSD17B1)基因对水牛繁殖性能的影响,本试验采用了3′-RACE克隆获得HSD17B1基因,并对其核苷酸序列和蛋白质序列进行了生物信息学分析,通过构建其真核表达载体并转染293T细胞验证所构建载体的准确性。结果表明,水牛HSD17B1基因编码区长954bp,3′-UTR区长58bp,编码317个氨基酸。BLAST分析显示水牛HSD17B1核苷酸序列与牛、绵羊、猪、马、犬、非洲象和人的相似性分别为100%、100%、92%、94%、87%、87%和87%,系统进化树分析结果表明,HSD17B1基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性。蛋白质分析结果表明HSD17B1蛋白呈弱酸性,无信号肽,亚定位于细胞质,存在type1_17beta-HSD-like_SDR_c、PRK05993、LPOR和FabG等结构域。试验成功构建了水牛HSD17B1基因真核表达载体pEGFPN1-HSD17B1,转染293T后,产生较强的绿色荧光信号,表明能够形成HSD17B1-EGFP融合蛋白。水牛HSD17B1基因的克隆及其真核表达载体的成功构建,为今后阐明HSD17B1基因在水牛卵泡及胚胎发生过程中的作用及分子机制奠定了理论基础。 展开更多
关键词 水牛 HSD17b1基因 克隆分析 载体构建
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CYP1B1基因多态性与妊娠期肝内胆汁淤积症易感性的关系 被引量:3
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作者 王晓莉 谭欣 +4 位作者 张力 欧容清 颜爱华 陈强 邹海 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期434-437,共4页
目的研究CYP1B1基因外显子2密码子119(G-T)和外显子3密码子432(C-G)多态性与妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)发病的关系。方法分别应用等位基因特异性PCR(AS-PCR)技术和人工修饰双等位基因特异性引物扩增(diASA-AMP)法,对100例ICP患者和100... 目的研究CYP1B1基因外显子2密码子119(G-T)和外显子3密码子432(C-G)多态性与妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)发病的关系。方法分别应用等位基因特异性PCR(AS-PCR)技术和人工修饰双等位基因特异性引物扩增(diASA-AMP)法,对100例ICP患者和100例正常对照孕妇CYP1B1基因外显子2密码子119(G-T)和外显子3密码子432(C-G)多态性进行分析。结果1CYP1B1基因密码子119多态分析表明ICP组T等位基因频率高于对照组(P<0.05),ICP组基因型GG、GT、TT频率与对照组相比差异有统计学意义(P<0.05)。与野生型(GG)相比,ICP组GT基因型和TT基因型增加ICP的发病风险(OR值分别为2.435和3.600);2CYP1B1基因密码子432多态分析表明两组均未检测到GG突变型,基因型CC、CG频率和等位基因C、G频率的比较差异均无统计学意义(P>0.05)。结论CYP1B1基因外显子2密码子119多态性可能与成都地区ICP易感性有关。 展开更多
关键词 妊娠期肝内胆汁淤积症 CYP1b1基因 遗传多态性
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SH2B1基因多态性与妊娠糖尿病的相关性研究 被引量:4
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作者 孙桂霞 王宁 +1 位作者 张红霞 杨少琴 《中国现代医学杂志》 CAS 北大核心 2017年第12期55-59,共5页
目的探讨SH2B1基因多态性与妊娠糖尿病患者胰岛素抵抗的关系。方法选取164例妊娠期糖尿病(GDM)患者和130例糖耐量正常孕妇。采用限制性片段多态性聚合酶链反应检测SH2B1基因型,并且分析相关临床资料。结果 GDM组SH2B1(rs4788102)基因GA... 目的探讨SH2B1基因多态性与妊娠糖尿病患者胰岛素抵抗的关系。方法选取164例妊娠期糖尿病(GDM)患者和130例糖耐量正常孕妇。采用限制性片段多态性聚合酶链反应检测SH2B1基因型,并且分析相关临床资料。结果 GDM组SH2B1(rs4788102)基因GA型与GG型比较,差异有统计学意义[OR=1.531,(95%CI:1.093,2.374)P=0.04],A等位基因频率与G等位基因频率比较,差异有统计学意义[OR=1.436,(95%CI:1.091,1.972)P=0.01]。GDM组GA+AA基因型与GG基因型比较,差异有统计学意义[OR=1.699,(95%CI:1.185,2.479)P=0.02]。GDM组中GA+AA基因型体重指数、三酰甘油、瘦素及稳态模型评估胰岛素抵抗指数与GG基因型比较,差异有统计学意义(P<0.05)。经Logistic回归分析显示,GA+AA基因型为稳态模型法测定胰岛素抵抗指数升高的危险因素。结论 SH2B1(rs4788102)基因多态性可能是GDM的一个易感位点,监测孕妇该基因位点,可以用于GDM发生风险的预测。 展开更多
关键词 妊娠糖尿病 SH2b1基因多态性 胰岛素抵抗
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CYP1B1基因多态性与食管鳞状细胞癌易感性及预后关系的研究 被引量:2
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作者 刘月平 张玲玲 +3 位作者 王顺平 李洁 安景辉 王小玲 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第33期4122-4127,共6页
目的探讨CYP1B1基因C432G及A453G两个多态性位点分布频率特征与食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)之间的相关性;分析其与临床病理指标及预后的关系。方法以河北医科大学第四医院2004年间120例有完整随访资料的E... 目的探讨CYP1B1基因C432G及A453G两个多态性位点分布频率特征与食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)之间的相关性;分析其与临床病理指标及预后的关系。方法以河北医科大学第四医院2004年间120例有完整随访资料的ESCC患者术后石蜡包埋组织为研究对象,以120例内镜检查的食管正常组织标本作为对照组,酚氯仿法抽提基因组DNA,PCR-SSP法检测CYP1B1基因C432G及A453G两个多态性位点基因型分布频率,分析各基因型与ESCC患者临床病理特征及其发病风险的相关性。COX回归模型进行多因素生存分析,Kaplan-Meier生存曲线进行单因素生存分析,Log-Rank法比较各基因型5年生存率的差别。方法 CYP1B1A453G位点不具多态性;CYP1B1C432G基因CC、CG、GG基因型在ESCC患者组与对照组的分布频率分别为67.50%、18.33%、14.17%和74.17%、17.50%、8.33%,无明显统计学差异(P>0.05)。G等位基因携带者患病风险是CC基因型的1.477倍(OR=1.477,95%CI=0.942~2.317)。临床病理特征分析结果显示CYP1B1C432G基因CG、GG基因型在有淋巴结转移组和临床分期较晚组分布频率较高。Kaplan-Meier单变量分析结果表明CG+GG基因型患者5年生存率明显低于CC基因型患者。而COX模型多因素生存分析结果提示CYP1B1C432G基因多态性与ESCC5年生存率无关。结论食管癌组和对照组CYP1B1A453G等位基因多态性均为AA基因型,中国河北汉族人群此位点可能不存在多态性。C432G等位基因具有多态性。CYP1B1C432G基因多态性可能与增加ESCC的易感性无关联,但与ESCC患者是否有淋巴结转移和临床分期相关,CG+GG基因型可能是预测ESCC患者不良预后的辅助指标。 展开更多
关键词 食管癌 CYP1b1基因多态性 PCR-SSP 预后
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贵州地区105例血脂异常人群ApoE和SLCO1B1基因多态性及血脂特征分析 被引量:3
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作者 骆姝琳 任凌雁 +5 位作者 陈琨 令狐克燕 卓召振 靳倩 安宇 黄盛文 《贵州医科大学学报》 CAS 2022年第2期155-162,共8页
目的探讨105例贵州地区血脂异常人群载脂蛋白E(ApoE)和溶质载体有机阴离子转运蛋白家族1B1(SLCO1B1)基因多态性特点及血脂特征。方法选取贵州地区就诊的血脂异常患者105例,采用全自动生化分析仪检测血清总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高... 目的探讨105例贵州地区血脂异常人群载脂蛋白E(ApoE)和溶质载体有机阴离子转运蛋白家族1B1(SLCO1B1)基因多态性特点及血脂特征。方法选取贵州地区就诊的血脂异常患者105例,采用全自动生化分析仪检测血清总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、载脂蛋白A1(Apo-A1)及载脂蛋白B(Apo-B),分析血脂异常人群性别差异和血脂异常类型差异,采用连接酶测序技术检测全血ApoE[c.388T>C(Cys130Arg)和c.526C>T(Arg176Cys)]和SLCO1B1基因位点[c.521T>C(Val174Ala)和c.388A>G(Asn130Asp)]的多态性;收集“The 1000 Genomes Project”中千人基因组南方人群数据与105例贵州地区血脂异常人群比较,分析基因多态性位点分布频率。结果贵州地区血脂异常人群中,女性血清TC、HDL-C、Apo-A1水平高于男性(P<0.05);贵州地区血脂异常人群中,男性和女性ApoE 526C>T位点基因型频率及等位基因频率比较,差异有统计学意义(P<0.05);贵州地区血脂异常人群中,男性和女性ApoE各基因表型组E2、E3、E4比较,差异有统计学意义(P<0.05);贵州地区血脂异常人群中,男性和女性SLCO1B1 388A>G位点基因型频率及等位基因频率比较,差异有统计学意义(P<0.05);贵州地区血脂异常人群中,男性和女性SLCO1B1各基因表型组Ⅰ类、Ⅱ类、Ⅲ类比较,差异无统计学意义(P>0.05);贵州地区血脂异常人群和普通人群ApoE 526C>T位点基因型频率比较,差异有统计学意义(P<0.05);贵州地区血脂异常人群ApoE基因E2型者TG、TC、HDL-C及Apo-A1水平均高于E4型,其中TG指标比较、差异有统计学意义(P<0.05)。结论105例贵州地区血脂异常人群中,女性血脂水平高于男性;ApoE基因分布以E3型最高、E2型最低,男性E4型比例高于女性,E2型人群总体血脂水平高于E4型;SLCO1B1各基因型分布无性别差异。 展开更多
关键词 血脂异常 血脂水平 APOE基因 SLCO1b1基因 基因多态性 贵州
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弓形虫B1基因套式PCR检测技术研究 被引量:11
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作者 糜祖煌 秦玲 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 1999年第2期63-64,共2页
本文以弓形虫多拷贝的B1基因为靶基因建立了套式PCR检测技术。弓形虫RH株、新疆、上海、昆山分离株DNA均能出现清晰条带,而人组织及其它微生物DNA不出现任何条带,弓形虫套式PCR较普遍PCR敏感100倍。昆山分离株... 本文以弓形虫多拷贝的B1基因为靶基因建立了套式PCR检测技术。弓形虫RH株、新疆、上海、昆山分离株DNA均能出现清晰条带,而人组织及其它微生物DNA不出现任何条带,弓形虫套式PCR较普遍PCR敏感100倍。昆山分离株经套式PCR扩增并进行DNA测序与RH株完全一致。80例孕妇外周血经弓形虫套式PCR扩增4例阳性,阳性率5%。 展开更多
关键词 弓形体病 DNA测序 b1基因 聚合酶链反应
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高迁移率族蛋白B1基因的克隆及其与神经管发育的相关关系 被引量:2
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作者 于丽 管英俊 +1 位作者 高英茂 孙秀宁 《解剖学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期141-145,共5页
目的:构建神经管cDNA文库,寻找神经管发育相关基因。方法:提取E8.5 d金黄地鼠神经管总RNA;SMART技术构建神经管cDNA噬菌体表达文库;重组噬菌体PCR鉴定。将出现频率很高的重组噬菌斑,经质粒转化、酶切鉴定和DNA序列分析,证实为高迁移率... 目的:构建神经管cDNA文库,寻找神经管发育相关基因。方法:提取E8.5 d金黄地鼠神经管总RNA;SMART技术构建神经管cDNA噬菌体表达文库;重组噬菌体PCR鉴定。将出现频率很高的重组噬菌斑,经质粒转化、酶切鉴定和DNA序列分析,证实为高迁移率族蛋白B1基因(HMGB1)。将HMGB1 cDNA片段回收、纯化,制备探针;Northern杂交检测不同发育阶段神经管中HMGB1 mRNA的表达变化。结果:构建的HMGB1cDNA片段含有完整的cDNA序列。Northern杂交显示:随胚胎发育,神经管HMGB1 mRNA表达量逐渐增加,E10 d增加最为明显,E12 d仍处于较高水平;而8.5 d高温致畸胚神经管,HMGB1 mRNA表达量较对照组明显减少。结论:HMGB1基因的表达与神经管发育及高温致神经管畸形的发生密切相关。 展开更多
关键词 神经管 生长与发育 高迁移率族蛋白b1基因 克隆 分子
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Cyclin B1基因在大鼠肝癌组织中的表达及意义 被引量:1
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作者 秦虹 欧超 +3 位作者 曹骥 苏建家 李媛 杨春 《山东医药》 CAS 2014年第5期4-6,共3页
目的探讨Cyclin B1基因在大鼠肝癌组织中的表达及意义。方法实验组为15只腹腔注射黄曲霉毒素B1诱发形成肝癌的大鼠,在诱癌第13、33、53周行肝活检取肝组织,第73周处死全部大鼠取肝组织。采用QPCR、Western blot和免疫组化方法检测其肝... 目的探讨Cyclin B1基因在大鼠肝癌组织中的表达及意义。方法实验组为15只腹腔注射黄曲霉毒素B1诱发形成肝癌的大鼠,在诱癌第13、33、53周行肝活检取肝组织,第73周处死全部大鼠取肝组织。采用QPCR、Western blot和免疫组化方法检测其肝组织中Cyclin B1 mRNA和蛋白的表达。对照组为10只腹腔注射等量溶媒DMSO大鼠,研究方法同上。结果实验组第73周的肝组织Cyclin B1 mRNA表达明显高于其他时间点和对照组(P均<0.05)。实验组第53、73周的肝组织Cyclin B1蛋白表达阳性率高于其他时间点和对照组,第53、73周表达比较有统计学差异(P均<0.05)。结论在肝癌发生过程中,Cyclin B1表达随肝癌形成而升高,且在肝癌组织中表达最高,Cyclin B1基因可能是参与肝癌发生的关键基因之一。 展开更多
关键词 肝肿瘤 CYCLIN b1基因 黄曲霉毒素b1 大鼠
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SH2B1基因及miR-276-3p对猪背部脂肪沉积的影响 被引量:1
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作者 刘欣 巩建飞 +7 位作者 李寒妹 颜华 张龙超 王立刚 赵福平 高红梅 侯欣华 王立贤 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2019年第7期2038-2044,共7页
本试验旨在研究SH2B衔接因子蛋白1(SH2B adaptor protein 1,SH2B1)基因在猪不同组织和生长发育各阶段背部脂肪中的表达情况,预测调控该基因的miR-276-3p对猪背部脂肪表达的影响。应用实时荧光定量PCR技术检测SH2B1基因在猪脂肪、下丘脑... 本试验旨在研究SH2B衔接因子蛋白1(SH2B adaptor protein 1,SH2B1)基因在猪不同组织和生长发育各阶段背部脂肪中的表达情况,预测调控该基因的miR-276-3p对猪背部脂肪表达的影响。应用实时荧光定量PCR技术检测SH2B1基因在猪脂肪、下丘脑等6种组织,以及在30、60、90、120和180 d猪背部脂肪组织中的相对表达量。靶标预测SH2B1基因的调控miRNA,并通过实时荧光定量PCR检测miR-276-3p对该基因的调控作用。结果显示,SH2B1基因在猪的6种组织中均有表达,且在脂肪组织中表达量最高,在肌肉组织中表达量最低。在猪生长发育各阶段背部脂肪中SH2B1基因均有表达,在前期(30和60 d)表达量较低,在中、后期(90、120和180 d)持续高表达,且显著高于前期表达量(P<0.05)。高、低背膘厚组背部脂肪中miR-276-3p与SH2B1基因均呈差异表达,且两者表达呈相反趋势,miR-276-3p在高背膘厚组中的表达量显著低于低背膘厚组(P<0.05),而SH2B1基因在高背膘厚组中的表达量却显著高于低背膘厚组(P<0.05)。miR-276-3p可通过靶向负调控SH2B1基因,影响猪背部脂肪的沉积。本试验结果为进一步深入研究猪背部脂肪沉积和背膘厚差异的分子机制提供参考。 展开更多
关键词 SH2b1基因 miR-276-3p 背膘厚
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宁夏汉族Graves病与CYP27B1基因启动子-1260C/A多态性相关性研究 被引量:2
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作者 康毓芝 陈耀平 +4 位作者 杨宝珍 王立斌 吴若芬 师志云 尹琳琳 《宁夏医科大学学报》 2011年第6期540-542,共3页
目的探讨CYP27B1(Cytochromo P450 CYP)基因启动子C-1260A位点多态性与宁夏汉族Graves病(GD)的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction restriction frag-ment length polymorphism,PCR-RFLP)技... 目的探讨CYP27B1(Cytochromo P450 CYP)基因启动子C-1260A位点多态性与宁夏汉族Graves病(GD)的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction restriction frag-ment length polymorphism,PCR-RFLP)技术,分析汉族GD 99例和正常对照83例CYP27B1基因启动子-1260C/A多态性。结果宁夏汉族CYP27B1基因-1260C/A检出GD组与对照组的基因型频率分别为37.37%、53.54%、9.09%和43.37%、40.96%、15.66%,两组差异无统计学意义(χ2=4.19,P>0.05);等位基因频率为64.16%、35.86%和63.86%、43.14%,两组差异无统计学意义(χ2=0.00,P>0.05)。结论 CYP27B1基因1260C/A的与宁夏地区汉族GD无相关性。 展开更多
关键词 GRAVES病 CYP27b1基因 基因多态性
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