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题名香型椰子BADH2基因生物信息学及表达分析
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作者
周丽霞
吕湘
孙熹微
杨耀东
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机构
中国热带农业科学院椰子研究所
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出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2023年第8期2527-2531,共5页
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基金
中国热带农业科学院基本科研业务费专项(No.1630152022008)
海南省重大科技计划项目(No.ZDKJ-2021012)共同资助。
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文摘
2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)是香型椰子香味物质的主要成分,BADH2是调控2AP合成的关键基因,分析香型椰子BADH2 (A-CnBADH2)基因的理化性质及组织表达特性,为香型椰子中香味物质2AP合成与积累的分子调控机理研究提供理论参考。本研究通过分析A-CnBADH2基因结构,发现其含有11个外显子和10个内含子,A-CnBADH2为非分泌蛋白,其大小为503 aa,等电点为5.35,分子量为54.92 kD,含有多个磷酸化位点,定位在细胞质中,二级结构以α-螺旋为主。系统进化分析表明,在遗传系数为0.587处,香型椰子、非香型椰子和水稻BADH2蛋白为同一个进化分支。通过对香型椰子和非香型椰子BADH2基因的序列进行比对,发现在基因的1 371位点,非香型椰子为G,而香型椰子为C,该位点的突变使得第442位点的丙氨酸变为脯氨酸,即P442A。荧光定量PCR分析得知,A-CnBADH2基因在根和茎中的相对表达量均显著低于在叶和椰肉中的相对表达量(P<0.05),但该基因在叶片和椰肉中的表达量无显著差异。该结果为BADH2基因调控2AP合成的分子机理提供参考。
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关键词
香型椰子
badh2基因
生物信息学
表达分析
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Keywords
Aromatic coconut
ba dh2 gene
Bioinformatics
Expression analysis
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分类号
S667.4
[农业科学—果树学]
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