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产EPA海洋细菌Shewanella baltica 6-42全基因组测序及比较基因组分析 被引量:2
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作者 肖康 彭云峰 +2 位作者 罗玲 彭方 万霞 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期404-413,共10页
新近发现来源于北极的海洋细菌Shewanella baltica 6-42在低温条件下合成超长链多不饱和脂肪酸二十碳五烯酸(eicosapentaenoic acid C20∶5,EPA)。为了进一步探讨EPA合成调控机理,本研究通过第三代高通量测序技术对S.baltica 6-42菌株... 新近发现来源于北极的海洋细菌Shewanella baltica 6-42在低温条件下合成超长链多不饱和脂肪酸二十碳五烯酸(eicosapentaenoic acid C20∶5,EPA)。为了进一步探讨EPA合成调控机理,本研究通过第三代高通量测序技术对S.baltica 6-42菌株进行全基因组测序,得到高质量且无间断的总长度为5.15 Mb的全基因组序列信息。分析表明全基因组的GC含量为46.17%,预测编码基因有4 597个,共有2 577个基因具有明确的生物学功能,其中348个基因参与环境适应性调节,60个基因参与油脂代谢途径。全基因组存在64 053个甲基化修饰位点,且甲基化修饰类型主要是m6A和少量的m4C。根据同源序列比对,解析了该菌株中参与EPA合成的聚酮合酶(polyketide synthase,PKS)途径5个关键基因及调控因子。同时对脂肪酸合成途径的其他关键基因和次级代谢产物合成基因簇进行了预测。根据已报道的另两株不同亚种S.baltica OS155和S.baltica OS678的基因组信息进行全基因组关联比较分析,结果显示三株细菌都保存有参与合成EPA的PKS基因簇,但其他功能基因的进化差异较大。本研究结果为S.baltica 6-42 EPA合成关键基因以及其他功能基因的挖掘和应用提供数据支持。 展开更多
关键词 SHEWANELLA baltica 二十碳五烯酸 第三代全基因组测序 聚酮合酶途径
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Organic-walled Microfossils from the Early Middle Cambrian sediments of the Holy Cross Mountains,Poland:Possible Implications for Sedimentary Environment in the SE Margin of the Baltica
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作者 Marta BAK Lucyna NATKANIEC-NOWAK +2 位作者 Beata NAGLIK Krzysztof BAK Pawel DULEMBA 《Acta Geologica Sinica(English Edition)》 SCIE CAS CSCD 2017年第1期39-50,共12页
An association of organic-walled microfossils consisting of filamentous cyanobacteria, algal coenobia and acanthomorphic acritarch have been documented from non-calcareous claystones and mudstones of the Pepper Mounta... An association of organic-walled microfossils consisting of filamentous cyanobacteria, algal coenobia and acanthomorphic acritarch have been documented from non-calcareous claystones and mudstones of the Pepper Mountains Shale Formation(PMSF), located in its stratotype area in the Pepper Mountains, which are part of the Holy Cross Mountains in Poland. These sediments represent the oldest strata of the ?ysogóry Unit, deposited on the edge of the East European Craton(Baltica). Non-branched, ribbon-like and thread-like cyanobacteria trichomes exhibit morphological similarities to families Nostocaceae and Oscillatoriaceae. Cells assembled in rounded to irregular clusters of monospecific agglomerations represent multicellular algal coenobia, attributed to the family Scenedesmaceae. The co-occurrence of acritarchs belonging to species as Eliasum llaniscum, Cristallinium ovillense and Estiastra minima indicates that the studied material corresponds to the lower Middle Cambrian. Deposition of the PMSF took place in shallow marine environment, influenced by periodical freshwater inputs. The varying degree of coloration of organic-walled microfossils is interpreted in this study as factor indication of possible different source of their derivation. Dark brown walls of cells assembled in algal coenobia might have sustained previous humification in humid, terrestrial environments, which preceded their river transport into the sea together with nutrients, causing occasional blooms of cyanobacteria in the coastal environment and the final deposition of both groups of organisms in marine deposits. 展开更多
关键词 algal coenobia filamentous cyanobacteria ACRITARCHS CAMBRIAN baltica Holy Cross Mountains
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Late Paleoproterozoic Paleogeography of Baltica and Laurentia: New Paleomagnetic Data from 1.80–1.75 Ga Mafic Intrusions of Fennoscandia and Sarmatia
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作者 Natalia V.LUBNINA Sergei A.PISAREVSKY +1 位作者 Svetlana V.BOGDANOVA Svetoslav J.SOKOLOV 《Acta Geologica Sinica(English Edition)》 SCIE CAS CSCD 2016年第S1期37-,共1页
Tectonic evolution and paleogeography of the two major continental blocks Fennoscandia and VolgoSarmatia during their docking to form the East European Craton(Baltica)at 1.8–1.7 Ga represent important‘puzzle
关键词 Late Paleoproterozoic Paleogeography of baltica and Laurentia New Paleomagnetic Data from 1.80 Ga Mafic Intrusions of Fennoscandia and Sarmatia
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Shewanella baltica luxR基因缺失菌株的构建及其功能初步研究 被引量:2
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作者 揭金鑫 韩云艳 +2 位作者 张彩丽 刘尊英 曾名湧 《食品科技》 CAS 北大核心 2018年第6期28-32,共5页
细菌的luxR基因作为群体感应信号分子受体蛋白的编码基因,在细菌的群体感应及其调控的功能中发挥着重要作用。为探究冷藏凡纳滨对虾特定腐败菌波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)(WT SA03)的群体感应现象,采用PCR融合和同源重组法构... 细菌的luxR基因作为群体感应信号分子受体蛋白的编码基因,在细菌的群体感应及其调控的功能中发挥着重要作用。为探究冷藏凡纳滨对虾特定腐败菌波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)(WT SA03)的群体感应现象,采用PCR融合和同源重组法构建了S.baltica的luxR基因缺失菌株(ΔluxR WT SA03),对比研究了luxR基因缺失后WT SA03的生长、产硫能力及蛋白表达的差异。结果表明,经PCR扩增融合后的重组质粒在大肠杆菌中成功表达,并通过接合反应将质粒从大肠杆菌转移到野生型S.baltica WT SA03中,构建了S.baltica的luxR基因缺失株。进一步研究表明,S.baltica的luxR基因缺失对其生长并无影响,但luxR基因对其产硫能力影响显著。表明luxR基因与WT SA03的致腐能力密切相关。研究结果为深入解析S.baltica的luxR基因功能及其调控的细菌群体感应与致腐机制提供了基础。 展开更多
关键词 波罗的海希瓦氏菌 PCR融合 同源重组 缺陷菌株
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羊源波氏希瓦氏菌的鉴定及其生物学特性
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作者 刘紫石 王利 +2 位作者 魏勇 俄木曲者 向益 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2023年第3期63-68,共6页
为了探究从川南黑山羊体内分离获得的1株细菌LZS-01的致病性和生物学特性,本试验采用革兰染色、细菌形态观察、生化鉴定、16S rDNA基因序列分析、小鼠致病性试验和药敏试验对其进行研究。结果显示:菌株LZS-01为短杆状革兰阴性菌,16S rDN... 为了探究从川南黑山羊体内分离获得的1株细菌LZS-01的致病性和生物学特性,本试验采用革兰染色、细菌形态观察、生化鉴定、16S rDNA基因序列分析、小鼠致病性试验和药敏试验对其进行研究。结果显示:菌株LZS-01为短杆状革兰阴性菌,16S rDNA基因扩增后得到的DNA片段长度为1 446 bp,与GenBank中波氏希瓦氏菌(Shewanella baltica)的同源性为100%,在系统进化树中与波氏希瓦氏菌(NCTC10737)聚为一支,综上结果推测该菌株为波氏希瓦氏菌;该菌株对小鼠致病性较强,可导致其肺泡壁增厚、肺泡腔狭窄,纤维样物质充满肺泡,肾小管上皮细胞水肿严重、管腔狭窄等;该菌株对环丙沙星、四环素等抗菌药物敏感,对氟苯尼考、青霉素和氧氟沙星等抗菌药物耐药。结果表明,波氏希瓦氏菌对动物具有一定致病性和耐药性。本试验结果为波氏希瓦氏菌感染性疾病的研究和临床防治积累了科学资料。 展开更多
关键词 波氏希瓦氏菌 分离鉴定 病理组织学
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EGCG抑制波罗的海希瓦氏菌生物被膜和腐败活性的研究 被引量:4
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作者 叶晓锋 张芳 +2 位作者 朱军莉 张蕾 谢杜梅 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期201-209,共9页
以海产品腐败菌波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)为对象,评价了儿茶素单体抑制生物被膜的效果,并分析效果最佳的单体对该菌生物被膜和腐败活性的影响.结果表明,5种儿茶素单体均能抑制S. baltica生物被膜形成,其中表没食子儿茶素... 以海产品腐败菌波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)为对象,评价了儿茶素单体抑制生物被膜的效果,并分析效果最佳的单体对该菌生物被膜和腐败活性的影响.结果表明,5种儿茶素单体均能抑制S. baltica生物被膜形成,其中表没食子儿茶素没食子酸酯(Epigallocatechin gallate,EGCG)抑制率最高,其最小抑菌质量浓度为40 μg·mL-1,亚抑菌质量浓度10-30 μg·mL-1的EGCG对细菌生长无显著影响.在30 μg·mL^-1 EGCG作用下,群体感应(Quorum sensing,QS)信号分子呋喃酮酰硼酸二酯(Autoinducer-2,AI-2)、二酮哌嗪类化合物(Diketopiperazine,DKPs)cyclo-(L-Pro-L-Leu)和cyclo-(L-Pro-L-Phe)活性显著下降(P〈0.05),其抑制率分别为63.95%、27.43%和21.94%.亚抑菌浓度EGCG能显著抑制S. baltica生物被膜形成、泳动能力和蛋白酶活性(P〈0.05),呈现浓度依赖性,在30 μg·mL^-1时抑制率分别为55.18%,66.71%和46.67%.因此,EGCG在亚抑菌浓度下能够干扰S. baltica的QS系统,有效抑制生物被膜形成,减弱致腐能力,研究为EGCG作为新型的QS抑制剂调控食品腐败菌奠定基础. 展开更多
关键词 波罗的海希瓦氏菌 EGCG 生物被膜 腐败 群体感应 抑制
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甲醛对中华绒鳌蟹各期溞状幼体及隐藻的急性毒性 被引量:17
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作者 沈和定 蒋宏雷 《上海水产大学学报》 CSCD 1998年第1期25-32,共8页
通过静水试验法,用甲醛对中华绒螯蟹各期状幼体及隐藻进行急性毒性试验,结果分别为:Z1:24hLC50为41.214mg/L,48hLC50为33.364mg/L,SC为3.34mg/L。Z2:24hLC50为125.497mg/L,48hLC50为54.258mg/L,SC为5.43mg/L。Z3:... 通过静水试验法,用甲醛对中华绒螯蟹各期状幼体及隐藻进行急性毒性试验,结果分别为:Z1:24hLC50为41.214mg/L,48hLC50为33.364mg/L,SC为3.34mg/L。Z2:24hLC50为125.497mg/L,48hLC50为54.258mg/L,SC为5.43mg/L。Z3:24hLC50为143.617mg/L,48hLC50为93.817mg/L,SC为9.38mg/L。Z4:24hLC50为200.679mg/L,48hLC50为98.414mg/L,SC为9.84mg/L。甲醛对Z5的毒性状况比较特殊,虽经10次试验仍无规律性。试验表明,30mg/L以下的甲醛,24小时内波海红胞藻全部成活,甲醛对波海红胞藻的6hLC50为:90mg/L,12hLC50为:60.77mg/L,24hLC50为:57.5mg/L。一定浓度的甲醛可杀死苗池水中的赤潮生物,蓄水池中的赤潮生物可用含氯化合物杀灭,以降低赤潮生物对中华绒螯蟹幼体的毒性,提高幼体的变态成活率和育苗产量。 展开更多
关键词 甲醛 中华绒螯蟹 溲状幼体 波海红胞藻 急性毒性
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大黄鱼来源波罗的海希瓦氏菌SB-19的hfq基因功能分析 被引量:2
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作者 江京洋 韦旭航 +2 位作者 朱军莉 吴敏 冯立芳 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第8期135-141,共7页
为分析大黄鱼来源波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)中分子伴侣Hfq的功能,对具有强致腐能力的波罗的海希瓦氏菌SB-19中hfq基因进行敲除,比较野生株(wide type,WT)和敲除株(knock out,KO)在生长速率、群体感应、抗逆境以及对灭菌鱼... 为分析大黄鱼来源波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)中分子伴侣Hfq的功能,对具有强致腐能力的波罗的海希瓦氏菌SB-19中hfq基因进行敲除,比较野生株(wide type,WT)和敲除株(knock out,KO)在生长速率、群体感应、抗逆境以及对灭菌鱼汁致腐效果的差异。结果表明:波罗的海希瓦氏菌SB-19中存在1个hfq基因,其基因表达水平随着细胞密度的增加而升高;在30℃培养条件下,WT株和KO株的生长速率接近,但在4℃培养条件下,与WT株相比,KO株的生长出现明显迟滞且稳定期的细胞密度较低;WT株与KO株分泌信号分子的能力相近,但KO株表现出较低的生物被膜形成能力和胞外蛋白酶活性,而且接种KO株的灭菌鱼汁也产生较少的挥发性盐基氮和三甲胺;此外,KO株对盐分、营养、重金属、消毒剂等胁迫条件更为敏感。上述结果表明Hfq参与波罗的海希瓦氏菌SB-19株的多种代谢调控,影响细菌的生长、群体感应、致腐能力、抗逆境能力等,即Hfq是一种全局性调控因子,整体调节波罗的海希瓦氏菌SB-19的诸多生理活动。本实验为波罗的海希瓦氏菌的基础生物学研究和海产品中微生物的致腐机制提供理论基础。 展开更多
关键词 大黄鱼 波罗的海希瓦氏菌 HFQ 致腐 功能分析
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海产品嗜冷菌波罗的海希瓦氏菌中3个冷激蛋白功能分析
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作者 冯立芳 邓靖民 +2 位作者 叶蔚 朱军莉 曲道峰 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期4283-4301,共19页
【目的】波罗的海希瓦氏菌是冷藏海产品中常见的腐败菌,而该菌中关于冷激蛋白的功能研究尚未见报道。本研究从分子生物学角度分析波罗的海希瓦氏菌中3个冷激蛋白各自的功能。【方法】采用BEAST软件分析γ-变形菌纲中部分食源性微生物的... 【目的】波罗的海希瓦氏菌是冷藏海产品中常见的腐败菌,而该菌中关于冷激蛋白的功能研究尚未见报道。本研究从分子生物学角度分析波罗的海希瓦氏菌中3个冷激蛋白各自的功能。【方法】采用BEAST软件分析γ-变形菌纲中部分食源性微生物的冷激蛋白进化时间,接着利用实时荧光定量PCR方法检测波罗的海希瓦氏菌3个冷激蛋白基因的表达规律,进而构建3个冷激蛋白的基因敲除株,分析敲除株在不同温度和不同环境胁迫条件下的生长状况、群体感应现象以及致腐能力,最后构建3个冷激蛋白的异源表达菌株并分析它们在不同温度和不同环境胁迫条件下的生长状况。【结果】波罗的海希瓦氏菌中鉴定到3个冷激蛋白,分别为cspC、cspD、cspG。所有γ-变形菌纲的cspD基因单独聚成一支,并于1109.6百万年前与其他csp基因相分离,波罗的海希瓦氏菌的cspC和cspG在858.8百万年前互相分开。cspG基因是波罗的海希瓦氏菌低温生存的必需基因,且广泛响应环境胁迫条件;cspC基因对cspG基因功能的实施起辅助作用;cspD不响应冷激,但却会随生长阶段的变化而发生变化。此外,cspC基因和cspG基因在低温条件下与细菌的致腐能力相关。【结论】波罗的海希瓦氏菌3个冷激蛋白基因各有不同,且cspC基因和cspG基因与该菌致腐能力有关,这为今后研究腐败菌的冷适应和致腐机制提供了新思路。 展开更多
关键词 波罗的海希瓦氏菌 冷激蛋白 进化 冷激 压力耐受 致腐能力
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波罗的海希瓦氏菌AI-2/LuxS对生物被膜和致腐的调控 被引量:4
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作者 叶晓锋 严羽萍 +2 位作者 唐蓉 朱军莉 高海春 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1309-1321,共13页
【目的】波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)是冷藏海产鱼类的特定腐败菌。研究群体感应信号AI-2/Lux S对鱼源S.baltica生物被膜和致腐的调控作用。【方法】扩增SB11分离株的lux S基因,用自杀性质粒构建lux S基因缺失株,通过结晶紫... 【目的】波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)是冷藏海产鱼类的特定腐败菌。研究群体感应信号AI-2/Lux S对鱼源S.baltica生物被膜和致腐的调控作用。【方法】扩增SB11分离株的lux S基因,用自杀性质粒构建lux S基因缺失株,通过结晶紫染色、珠涡流法、显微镜观察和HPLC,比较分析野生株与缺失株△lux S在4°C和28°C下生物被膜形成、粘附能力、泳动性和致腐产物的差异。【结果】S.baltica SB11中扩增获得lux S基因,生物信息学分析显示Lux S蛋白由169个氨基酸构成,含有保守的His-Thr-Leu-Glu-His(HTLEH)模体和关键氨基酸位点,蛋白三维空间结构与其他细菌相似。与野生株相比,△lux S缺失株上清荧光信号散失,但不影响生长,生物被膜形成期和成熟期的含量显著低于野生株,在4°C培养96 h和28°C培养24 h被膜分别减少20.1%和27.9%。缺失株在不锈钢片的粘附能力明显减弱,其中在4°C培养72 h和28°C培养24 h后的粘附量比野生株分别减少6.48%和6.57%。荧光显微镜观察发现,野生株能快速粘附于玻璃片,聚集形成大量生物被膜,而△lux S仅形成平坦稀疏的被膜,粘附细菌降低,CLSM证实野生株和△lux S的成熟被膜厚度分别为68.95μm和36.44μm。并且,△lux S株在4°C和28°C下泳动性均显著强于野生株。然而,野生株和△lux S株三甲胺和腐胺积累无差异。【结论】鱼源S.baltica中Lux S蛋白保守,AI-2/Lux S参与被膜、粘附能力及泳动性等多种生物被膜形成相关的调控作用,然而不是该菌致腐能力的功能性群体感应信号。 展开更多
关键词 SHEWANELLA baltica 群体感应AI-2 LUXS 生物被膜 致腐性
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大黄鱼源波罗的海希瓦氏菌致腐性与产生物胺能力研究 被引量:4
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作者 陈帅 朱军莉 +1 位作者 石双妮 胡鑫欣 《食品科技》 CAS 北大核心 2021年第7期161-166,共6页
为探究波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)产生物胺能力对致腐性的作用,研究测定6株波罗的海希瓦氏菌在灭菌大黄鱼鱼汁4 ℃冷藏条件下挥发性盐基氮(Total volatile basic nitrogen,TVB-N)、三甲胺(Trimethylamine,TMA)生成和生物胺含... 为探究波罗的海希瓦氏菌(Shewanella baltica)产生物胺能力对致腐性的作用,研究测定6株波罗的海希瓦氏菌在灭菌大黄鱼鱼汁4 ℃冷藏条件下挥发性盐基氮(Total volatile basic nitrogen,TVB-N)、三甲胺(Trimethylamine,TMA)生成和生物胺含量,分析其生物胺生成能力与腐败性的相关性,并比较生物胺产生相关基因相对表达量的差异。结果表明,接种于灭菌鱼汁的6株波罗的海希瓦氏菌在4 ℃冷藏5 d生长达到稳定期,并随着冷藏时间的延长接种波罗的海希瓦氏菌的鱼汁中的TVB-N和TMA含量增大;6株波罗的海希瓦氏菌生长和2种胺类代谢产物存在差异,其中菌株S19致腐性最强,菌株S31次之,菌株S12最弱。而且,6株波罗的海希瓦氏菌的产腐胺和尸胺能力也存在差异,其中腐败能力较强的S19和S31还能产生少量的组胺。产腐胺、尸胺与细菌生长、TVB-N和TMA形成呈正相关。此外,强致腐菌S19和S31的产胺基因odc、hdc、torA相对基因表达量高于弱致腐菌。可见,波罗的海希瓦氏菌的生物胺生成能力与腐败能力密切相关,腐败能力越强其产生物胺能力越强。研究结果可为大黄鱼保鲜和生物胺的控制提供理论支持。 展开更多
关键词 大黄鱼 波罗的海希瓦氏菌 生物胺 腐败能力 荧光PCR检测
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Deeply concealed half-graben at the SW margin of the East European Craton(SE Poland)-Evidence for Neoproterozoic rifting prior to the break-up of Rodinia
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作者 P.Krzywiec P.Poprawa +2 位作者 M.Mikotajczak S.Mazur M.Malinowski 《Journal of Palaeogeography》 SCIE CSCD 2018年第1期88-97,共10页
Baltica was one of continents formed as a result of Rodinia break-up 850-550 Ma. It was separated from Amazonia(?) by the Tornquist Ocean, the opening of which was preceded by Neoproterozoic extension in a network of ... Baltica was one of continents formed as a result of Rodinia break-up 850-550 Ma. It was separated from Amazonia(?) by the Tornquist Ocean, the opening of which was preceded by Neoproterozoic extension in a network of continental rifts. Some of these rifts were subsequently aborted whereas the Tornquist Rift gave rise to splitting of Rodinia and formation of the Tornquist Ocean. The results of 1-D subsidence analysis at the fossil passive margin of Baltica provided insight in the timing and kinematics of continental rifting that led to break-up of Rodinia. Rifting was associated with Neoproterozoic syn-rift subsidence accompanied by deposition of continental coarse-grained sediments and emplacement of continental basalts.Transition from a syn-rift to post-rift phase in the latest Ediacaran to earliest early Cambrian was concomitant with deposition of continental conglomerates and arkoses, laterally passing into mudstones. An extensional scenario of the break-up of Rodinia along the Tornquist Rift is based on the character of tectonic subsidence curves, evolution of syn-rift and post-rift depocenters in time, as well as geochemistry and geochronology of the syn-rift volcanics. It is additionally reinforced by the high-quality deep seismic reflection data from SE Poland, located above the SW edge of the East European Craton. The seismic data allowed for identification of a deeply buried(11-18 km), well-preserved extensional half-graben, developed in the Palaeoproterozoic crystalline basement and filled with a Neoproterozoic syn-rift volcano-sedimentary succession. The results of depth-to-basement study based on integration of seismic and gravity data show the distribution of local NE-SW elongated Neoproterozoic depocenters within the SW slope of the East European Craton. Furthermore,they document the rapid south-eastwards thickness increase of the Neoproterozoic succession towards the NW-SE oriented craton margin. This provides evidence for extensive crustal thinning occurring prior to the break-up of Rodinia and formation of the Tornquist Ocean. 展开更多
关键词 RODINIA baltica Tornquist rift Orsha-Volyn Aulacogen Tornquist Ocean NEOPROTEROZOIC Seismic data Gravity data
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luxR基因对希瓦氏菌群体感应特性的影响研究 被引量:8
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作者 韩云燕 李渐鹏 +2 位作者 于红雷 刘尊英 曾名湧 《食品科技》 CAS 北大核心 2019年第3期27-32,共6页
希瓦氏菌(Shewanella baltica)是冷藏水产品常见的优势腐败菌,可通过LuxR受体系统感受酰基高丝氨酸内酯(AHLs)和二酮哌嗪类化合物(DKPs)信号分子,从而调控水产品的腐败进程。通过构建希瓦氏菌LuxR基因不同片段缺陷菌株,对比研究希瓦氏... 希瓦氏菌(Shewanella baltica)是冷藏水产品常见的优势腐败菌,可通过LuxR受体系统感受酰基高丝氨酸内酯(AHLs)和二酮哌嗪类化合物(DKPs)信号分子,从而调控水产品的腐败进程。通过构建希瓦氏菌LuxR基因不同片段缺陷菌株,对比研究希瓦氏菌野生型与LuxR基因缺陷型菌株生长、生物膜形成、蛋白酶产生、产硫能力等群体感应特性的差异,揭示希瓦氏菌的致腐机制。结果表明,希瓦氏菌LuxR基因缺陷菌株生长、产蛋白酶能力及生物膜形成能力均降低,部分缺陷菌株群集运动能力和产硫能力也同步降低。希瓦氏菌群体感应相关的大部分性状受LuxR基因影响,且不同LuxR基因片的片段所控制的群体感性状不同。研究结果为LuxR系统作为希瓦氏菌控制的新靶点提供了理论依据与技术支撑。 展开更多
关键词 希瓦氏菌 LuxR缺陷菌株 群体感应
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基于比较基因组学分析大黄鱼来源波罗的海希瓦氏菌的防御系统 被引量:1
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作者 徐敏慧 朱昕熠 +3 位作者 陈子嫣 朱军莉 曲道峰 冯立芳 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1876-1891,共16页
【目的】波罗的海希瓦氏菌是冷藏海产品中常见的腐败菌,通过全基因组测序和转录组测序,分析它们的规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)系统和限制修饰(restricted modificat... 【目的】波罗的海希瓦氏菌是冷藏海产品中常见的腐败菌,通过全基因组测序和转录组测序,分析它们的规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)系统和限制修饰(restricted modification,R-M)系统,为波罗的海希瓦氏菌的基础生物学研究和海产品中微生物的致腐机制提供理论基础。【方法】分析大黄鱼来源波罗的海希瓦氏菌SB-19株和W-3株的致腐能力,对W-3株的全基因组序列进行测序、组装和注释,结合已报道的SB-19株和27株希瓦氏菌的全基因组序列,采用比较基因组学方法探究它们的CRISPR和R-M系统的差异,进而对SB-19株和W-3株在不同生长时期进行转录组测序,以及两株菌内致腐相关基因的共进化分析。【结果】灭菌大黄鱼汁中产生挥发性盐基总氮和三甲胺值显示波罗的海希瓦氏菌SB-19株和W-3株分别为强致腐能力和弱致腐能力菌株;平均核苷酸一致性证实SB-19株和W-3株为波罗的海希瓦氏菌,但基于全基因组构建的系统发育树则发现二者之间存在遗传信息上的差异;SB-19株具有相对完善的CRISPR系统,而W-3株则有更丰富的R-M系统;转录组测序反映出SB-19株在对数期和平台期的生长阶段具有更为活跃的新陈代谢能力和环境适应能力;但是这2株细菌中与致腐相关基因在进化过程中较为保守。【结论】CRISPR系统和R-M系统为异养型的波罗的海希瓦氏菌提供了较好的异源遗传信息入侵屏障,在维持物种遗传稳定性方面发挥了重要作用,但不参与该菌致腐能力差异的进化过程。 展开更多
关键词 大黄鱼 波罗的海希瓦氏菌 比较基因组 规律成簇间隔短回文重复序列 限制修饰系统
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