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基于重测序的BBLa过表达烟草雄性不育变异检测分析
1
作者
王麟麒
罗徐
+3 位作者
万克
石远帅
崔杨子力
刘洋
《种子》
北大核心
2024年第2期37-43,共7页
BBLa基因编码小檗碱桥状酶(Berberine bridge enzyme-like, BBLa),烟草小檗碱桥状酶参与烟碱生物合成的最终催化步骤。课题组前期研究发现,BBLa过表达烟草T0代植株中出现雄蕊败育表型。为进一步了解该雄性不育表型的遗传机制,本研究以...
BBLa基因编码小檗碱桥状酶(Berberine bridge enzyme-like, BBLa),烟草小檗碱桥状酶参与烟碱生物合成的最终催化步骤。课题组前期研究发现,BBLa过表达烟草T0代植株中出现雄蕊败育表型。为进一步了解该雄性不育表型的遗传机制,本研究以过表达BBLa烟草雄性不育表型OE1和野生型烟草WT为材料,基于全基因组重测序技术,对单核苷酸多态性(SNP)、插入-缺失(InDel)及染色体结构变异(SV)3种变异类型进行标记注释,平均测序深度≥14×,平均覆盖率≥95%。结果表明,在2个样本中共检测到7 505 620个SNP、628 034个InDel、79 576个SV。通过2个样本的SNP差异比对筛选,最终得到174个候选基因。
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关键词
烟草
重测序
bbla
基因
雄性不育
下载PDF
职称材料
题名
基于重测序的BBLa过表达烟草雄性不育变异检测分析
1
作者
王麟麒
罗徐
万克
石远帅
崔杨子力
刘洋
机构
贵州大学烟草学院/贵州省烟草品质研究重点实验室
出处
《种子》
北大核心
2024年第2期37-43,共7页
基金
中国烟草总公司贵州省公司重点研发项目(2021XM04)。
文摘
BBLa基因编码小檗碱桥状酶(Berberine bridge enzyme-like, BBLa),烟草小檗碱桥状酶参与烟碱生物合成的最终催化步骤。课题组前期研究发现,BBLa过表达烟草T0代植株中出现雄蕊败育表型。为进一步了解该雄性不育表型的遗传机制,本研究以过表达BBLa烟草雄性不育表型OE1和野生型烟草WT为材料,基于全基因组重测序技术,对单核苷酸多态性(SNP)、插入-缺失(InDel)及染色体结构变异(SV)3种变异类型进行标记注释,平均测序深度≥14×,平均覆盖率≥95%。结果表明,在2个样本中共检测到7 505 620个SNP、628 034个InDel、79 576个SV。通过2个样本的SNP差异比对筛选,最终得到174个候选基因。
关键词
烟草
重测序
bbla
基因
雄性不育
Keywords
tobacco
re-sequencing
bbla gene
male sterility
分类号
S572 [农业科学—烟草工业]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于重测序的BBLa过表达烟草雄性不育变异检测分析
王麟麒
罗徐
万克
石远帅
崔杨子力
刘洋
《种子》
北大核心
2024
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