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BBN模型在江苏居民氰戊菊酯长期膳食暴露评估中的应用
被引量:
2
1
作者
田野
闵捷
+1 位作者
刘沛
王灿楠
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2012年第5期661-663,666,共4页
目的应用贝塔二项-正态分布模型(BBN模型)对氰戊菊酯长期膳食暴露进行评估。方法利用贝塔二项分布构建阳性摄入频率模型,用正态分布构建长期阳性暴露量模型。从分布中抽样,进行MonteCarlo模拟获得氰戊菊酯的长期暴露量,并应用bootstrap...
目的应用贝塔二项-正态分布模型(BBN模型)对氰戊菊酯长期膳食暴露进行评估。方法利用贝塔二项分布构建阳性摄入频率模型,用正态分布构建长期阳性暴露量模型。从分布中抽样,进行MonteCarlo模拟获得氰戊菊酯的长期暴露量,并应用bootstrap方法对评估结果进行不确定性分析。结果不同性别、不同年龄组人群各暴露水平的暴露量均位于95%可信区间内,暴露量百分位数能够达到稳定,BBN模型方法较好地量化了由短期调查数据得到的长期暴露量的变异性。结论 BBN模型可以较好地解决利用短期调查数据进行长期暴露量估计的问题,在评价氰戊菊酯长期膳食暴露风险中应用效果良好。
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关键词
bbn模型
长期膳食暴露评估
氰戊菊酯
下载PDF
职称材料
膀胱癌免疫治疗相关肿瘤微环境及其在人和小鼠肿瘤中的组成特征初探
被引量:
1
2
作者
周炳坤
王博
+3 位作者
贺情情
黄孝东
陈俊宇
黄健
《岭南现代临床外科》
2022年第2期143-153,共11页
目的应用生物信息学分析鉴定膀胱癌免疫治疗中起关键作用的肿瘤微环境(TME)组成特征,初步分析这些组分在人膀胱癌组织和BBN(N-butyl-N-(4-hydroxybutyl)-nitrosamine)诱导的自发小鼠膀胱肿瘤中表型的相似性。方法分析晚期膀胱癌PD-L1阻...
目的应用生物信息学分析鉴定膀胱癌免疫治疗中起关键作用的肿瘤微环境(TME)组成特征,初步分析这些组分在人膀胱癌组织和BBN(N-butyl-N-(4-hydroxybutyl)-nitrosamine)诱导的自发小鼠膀胱肿瘤中表型的相似性。方法分析晚期膀胱癌PD-L1阻断治疗IMvigor210数据集,利用DESeq2筛选与疗效相关的差异基因,通过GO和KEGG通路富集分析找出差异富集的通路;采用IOBR分析TME中的细胞浸润特征。通过TCGA数据库分析差异浸润细胞基因集与膀胱癌预后和分期的关系,在我院32例膀胱癌组织标本中进行免疫组化验证。建立BBN诱导的自发小鼠膀胱肿瘤模型,通过H&E染色和免疫组化对BBN诱导的自发小鼠膀胱肿瘤和人膀胱癌进展相似性及其TME主要组分进行比较。结果在IMvigor210数据集中存在521个与免疫治疗疗效相关的差异基因,其中44个差异基因富集在含胶原细胞外基质上,提示成纤维细胞与免疫治疗疗效相关。TME分析发现细胞周期、组蛋白等肿瘤细胞基因集与NK细胞、CD8^(+)T细胞基因集在膀胱癌免疫治疗有效组中富集,而炎症性肿瘤相关成纤维细胞基因集在免疫治疗无效组中富集。TCGA分析显示:NK细胞和CD8^(+)T细胞基因集与膀胱癌患者总体生存时间呈正相关,CD56表达与膀胱癌病理分期呈正相关;PDGFRB表达与膀胱癌病理分期呈正相关。相比于低分期膀胱癌,PDGFRB^(+)成纤维细胞在高分期膀胱癌中数量更多。在BBN小鼠模型中,BBN诱导的自发小鼠膀胱肿瘤发生率随着诱导时间逐渐升高,最终发展为肌层浸润性膀胱癌。免疫组化染色显示:小鼠和人膀胱肿瘤的TME中NK细胞和CD8^(+)T细胞以及成纤维细胞的浸润特征相似。结论本研究结合生信分析和免疫组化评分发现:膀胱癌中NK细胞、CD8^(+)T细胞和成纤维细胞与免疫治疗疗效和预后具有相关性;这些细胞在BBN诱导的自发小鼠膀胱肿瘤与人膀胱癌组织中的浸润表型相似。这些结果可为研究膀胱癌免疫治疗的机制提供理论依据和动物模型。
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关键词
膀胱癌
生物信息学
肿瘤微环境
肿瘤相关成纤维细胞
bbn
诱导的自发小鼠膀胱肿瘤
模型
下载PDF
职称材料
题名
BBN模型在江苏居民氰戊菊酯长期膳食暴露评估中的应用
被引量:
2
1
作者
田野
闵捷
刘沛
王灿楠
机构
东南大学公共卫生学院流行病与卫生统计教研室
出处
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2012年第5期661-663,666,共4页
基金
国家自然科学基金资助项目(81072304)
文摘
目的应用贝塔二项-正态分布模型(BBN模型)对氰戊菊酯长期膳食暴露进行评估。方法利用贝塔二项分布构建阳性摄入频率模型,用正态分布构建长期阳性暴露量模型。从分布中抽样,进行MonteCarlo模拟获得氰戊菊酯的长期暴露量,并应用bootstrap方法对评估结果进行不确定性分析。结果不同性别、不同年龄组人群各暴露水平的暴露量均位于95%可信区间内,暴露量百分位数能够达到稳定,BBN模型方法较好地量化了由短期调查数据得到的长期暴露量的变异性。结论 BBN模型可以较好地解决利用短期调查数据进行长期暴露量估计的问题,在评价氰戊菊酯长期膳食暴露风险中应用效果良好。
关键词
bbn模型
长期膳食暴露评估
氰戊菊酯
Keywords
bbn
model
Long-term dietary exposure
Fenvalerate
分类号
R151 [医药卫生—营养与食品卫生学]
下载PDF
职称材料
题名
膀胱癌免疫治疗相关肿瘤微环境及其在人和小鼠肿瘤中的组成特征初探
被引量:
1
2
作者
周炳坤
王博
贺情情
黄孝东
陈俊宇
黄健
机构
中山大学孙逸仙纪念医院广东省恶性肿瘤表观遗传学与基因调控重点实验室
中山大学孙逸仙纪念医院泌尿外科
出处
《岭南现代临床外科》
2022年第2期143-153,共11页
基金
国家自然科学基金(81825016)。
文摘
目的应用生物信息学分析鉴定膀胱癌免疫治疗中起关键作用的肿瘤微环境(TME)组成特征,初步分析这些组分在人膀胱癌组织和BBN(N-butyl-N-(4-hydroxybutyl)-nitrosamine)诱导的自发小鼠膀胱肿瘤中表型的相似性。方法分析晚期膀胱癌PD-L1阻断治疗IMvigor210数据集,利用DESeq2筛选与疗效相关的差异基因,通过GO和KEGG通路富集分析找出差异富集的通路;采用IOBR分析TME中的细胞浸润特征。通过TCGA数据库分析差异浸润细胞基因集与膀胱癌预后和分期的关系,在我院32例膀胱癌组织标本中进行免疫组化验证。建立BBN诱导的自发小鼠膀胱肿瘤模型,通过H&E染色和免疫组化对BBN诱导的自发小鼠膀胱肿瘤和人膀胱癌进展相似性及其TME主要组分进行比较。结果在IMvigor210数据集中存在521个与免疫治疗疗效相关的差异基因,其中44个差异基因富集在含胶原细胞外基质上,提示成纤维细胞与免疫治疗疗效相关。TME分析发现细胞周期、组蛋白等肿瘤细胞基因集与NK细胞、CD8^(+)T细胞基因集在膀胱癌免疫治疗有效组中富集,而炎症性肿瘤相关成纤维细胞基因集在免疫治疗无效组中富集。TCGA分析显示:NK细胞和CD8^(+)T细胞基因集与膀胱癌患者总体生存时间呈正相关,CD56表达与膀胱癌病理分期呈正相关;PDGFRB表达与膀胱癌病理分期呈正相关。相比于低分期膀胱癌,PDGFRB^(+)成纤维细胞在高分期膀胱癌中数量更多。在BBN小鼠模型中,BBN诱导的自发小鼠膀胱肿瘤发生率随着诱导时间逐渐升高,最终发展为肌层浸润性膀胱癌。免疫组化染色显示:小鼠和人膀胱肿瘤的TME中NK细胞和CD8^(+)T细胞以及成纤维细胞的浸润特征相似。结论本研究结合生信分析和免疫组化评分发现:膀胱癌中NK细胞、CD8^(+)T细胞和成纤维细胞与免疫治疗疗效和预后具有相关性;这些细胞在BBN诱导的自发小鼠膀胱肿瘤与人膀胱癌组织中的浸润表型相似。这些结果可为研究膀胱癌免疫治疗的机制提供理论依据和动物模型。
关键词
膀胱癌
生物信息学
肿瘤微环境
肿瘤相关成纤维细胞
bbn
诱导的自发小鼠膀胱肿瘤
模型
Keywords
bladder cancer
bioinformatics analysis
tumor microenvironment
cancer-associated fibroblast
bbn
-driven spontaneous mouse bladder tumor
分类号
R737.1 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
BBN模型在江苏居民氰戊菊酯长期膳食暴露评估中的应用
田野
闵捷
刘沛
王灿楠
《中国卫生统计》
CSCD
北大核心
2012
2
下载PDF
职称材料
2
膀胱癌免疫治疗相关肿瘤微环境及其在人和小鼠肿瘤中的组成特征初探
周炳坤
王博
贺情情
黄孝东
陈俊宇
黄健
《岭南现代临床外科》
2022
1
下载PDF
职称材料
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