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牛BBOX1基因3'UTR变异体的克隆及其多态性分析
1
作者
宋雨霏
郭彦
+2 位作者
辛友志
崔建伟
周国利
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2017年第2期120-123,共4页
为鉴定牛BBOX1基因选择性多聚腺苷酸化的不同变异体及其3'UTR的多态性,采用3'RACE的方法检测出BBOX1基因3个不同3'UTR全长的APA变异体,短APA变异体3'UTR长度为229 bp,长APA变异体3'UTR长度分别为664 bp和678 bp。利...
为鉴定牛BBOX1基因选择性多聚腺苷酸化的不同变异体及其3'UTR的多态性,采用3'RACE的方法检测出BBOX1基因3个不同3'UTR全长的APA变异体,短APA变异体3'UTR长度为229 bp,长APA变异体3'UTR长度分别为664 bp和678 bp。利用SSCP与测序相结合的方法,在BBOX1基因的3'UTR中检测到10个多态性,其中7个为SNP,分别为c.12T>C、c.100A>G、c.241T>C、c.480T>C、c.557T>C、c.606T>C和c.650T>C;3个为插入或缺失突变,分别为c.28_29ins C、c.434_435del GT和c.512_513ins TGC。SNP c.650T>C定位在Poly(A)加尾信号PAS3中,使加尾信号序列AAUAAA突变成AACAAA,导致3'UTR长度为678 bp的变异体出现。
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关键词
牛
bbox1
基因
选择性多聚腺苷酸化
多态性
3'UTR
下载PDF
职称材料
题名
牛BBOX1基因3'UTR变异体的克隆及其多态性分析
1
作者
宋雨霏
郭彦
辛友志
崔建伟
周国利
机构
聊城大学生命科学学院
出处
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2017年第2期120-123,共4页
基金
国家自然科学基金项目(31571274)
山东省自然科学基金项目(ZR2015CM025)
聊城大学博士启动基金项目(31805)
文摘
为鉴定牛BBOX1基因选择性多聚腺苷酸化的不同变异体及其3'UTR的多态性,采用3'RACE的方法检测出BBOX1基因3个不同3'UTR全长的APA变异体,短APA变异体3'UTR长度为229 bp,长APA变异体3'UTR长度分别为664 bp和678 bp。利用SSCP与测序相结合的方法,在BBOX1基因的3'UTR中检测到10个多态性,其中7个为SNP,分别为c.12T>C、c.100A>G、c.241T>C、c.480T>C、c.557T>C、c.606T>C和c.650T>C;3个为插入或缺失突变,分别为c.28_29ins C、c.434_435del GT和c.512_513ins TGC。SNP c.650T>C定位在Poly(A)加尾信号PAS3中,使加尾信号序列AAUAAA突变成AACAAA,导致3'UTR长度为678 bp的变异体出现。
关键词
牛
bbox1
基因
选择性多聚腺苷酸化
多态性
3'UTR
Keywords
cattle
bbox1 gene
APA
polymorphisms
3'UTR
分类号
S813.2 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牛BBOX1基因3'UTR变异体的克隆及其多态性分析
宋雨霏
郭彦
辛友志
崔建伟
周国利
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2017
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