慢性髓系白血病bcrabl融合基因在真核细胞中的表达

克隆慢性髓系白血病 (CML)融合基因bcr abl融合位点周围的cDNA序列 ,构建重组真核表达载体并表达于 p815细胞 ,探索bcr abl基因免疫治疗CML的可行性。设计两条引物扩增bcr abl融合位点周围 46 8bp的cDNA ,测序正确后 ,将其克隆至真核表达载体pcDNA 3.1,通过电穿孔法转染至 p815细胞中 ,应用G418筛选阳性细胞克隆 ,在含 10 %FCS的RPMI16 40中常规培养 ,收集细胞进行RT PCR鉴定。结果PCR扩增出了可用于基因免疫的位于bcr abl融合基因位点周围的 46 8bp的cDNA ,序列测定除第 44 8位碱基C突变为T外其余序列均正确 ;构建了重组真核表达载体 ,并用电穿孔法将其转染 p815细胞 ,RT PCR法检测到该细胞系有bcr

基于乡愁文化基因解码的乡村文旅融合路径研究

基于乡村居民视觉系统解析乡愁文化内涵,并探讨乡村文旅深度融合发展路径,是留住乡愁、助力乡村振兴的有效途径。借鉴生物学基因遗传研究中的逆转录提取法,结合扎根理论提取出乡愁文化的八大基因,进一步运用共现分析和社会网络分析法,探究乡愁文化基因的层级结构。研究发现:(1)乡愁文化基因包括家庭牵绊、乡村生活、自然景观、建筑风貌、劳作场景、文化记忆、地方节庆、传统技艺;(2)乡愁文化基因按照其重要程度呈现四大层级结构,结合功能属性将八大乡愁文化基因划分为主体基因、附着基因、混合基因、变异基因;(3)基于乡愁文化基因及其层次结构特征,最终提出四大乡村旅游融合发展的路径:主体基因决定旅游发展主题、附着基因指导旅游景观设计、混合基因融入旅游文化空间建设、变异基因指导文创产品开发。

Xp11.2易位/TFE3基因融合相关性肾细胞癌的超声表现

目的探讨Xp11.2易位/TFE3基因融合相关性肾细胞癌(Xp11.2/TFE3-tRCC)的超声表现。资料与方法回顾性分析四川大学华西医院2009年4月—2022年2月手术经病理证实Xp11.2/TFE3-tRCC的10例患者,收集其超声图像及临床资料。观察肿块的边界、形态、内部回声、血流信号情况及超声造影表现等。结果共纳入10例肿块,其中4例行超声造影。Xp11.2/TFE3-tRCC的超声表现呈多样性及多变性,肿块好发于髓质(5例)。常规超声上6例表现为类似良性病灶的边界较清楚、形态较规则的实性结节,彩色多普勒显示5例为点状血流信号。超声造影上则更倾向于恶性肿块(3例),具体表现为不均匀强化,多伴有周边不均匀增强环。结论Xp11.2/TFE3-tRCC的常规超声表现多倾向良性,而超声造影则表现为恶性病灶,因此超声造影可作为诊断可疑Xp11.2/TFE3-tRCC的潜在方法。

BCR-ABL融合基因检测在慢性粒细胞白血病诊断中的价值

目的:探讨BCR-ABL融合基因检测对慢性粒细胞白血病(CML)鉴别、诊断的价值,以及对慢性粒细胞白血病各个病程(慢性期、加速期与急变期)进行监测的临床意义。方法:应用实时荧光定量PCR方法对临床常见骨髓增殖性肿瘤(慢性粒细胞白血病、真性红细胞增多症和原发性血小板增多症)患者标本进行BCR-ABL融合基因的定量检测。结果:慢性粒细胞白血病初发患者中,BCR-ABL融合基因水平均阳性,而真性红细胞增多症和原发性血小板增多症均为阴性。在CML患者中,初发患者与加速期和急变期的患者相比,白细胞计数、血红蛋白含量和血小板计数的差异具统计学意义,P值分别为0.046、0.039和0.001,而BCR-ABL融合基因水平的差异无统计学意义;初发与缓解后患者的BCR-ABL融合基因水平相比,差异具有统计学意义(P<0.001)。结论:BCR-ABL融合基因检测可以对CML与临床常见骨髓增殖性肿瘤做鉴别诊断,并对其病程进行监测,是一个有价值的指标,可为临床用药提供依据。

线粒体融合基因多态性与中国南方客家人群原发性高血压的相关性

目的探讨线粒体融合基因多态性与中国南方客家人群原发性高血压(EH)的相关性。方法选择2022年7—8月我院心内科收治的100例中国南方客家人群EH患者作为观察组,同时选择同期46例非高血压患者作为对照组。统计两组的一般资料,检测两组外周血样本中线粒体融合基因的多态性,对等位基因频率及Hardy-Weinberg平衡性做分析;通过比值比(OR)和95%可信区间(CI)分析线粒体融合基因多态性与中国南方客家人群EH的相关性。结果观察组和对照组在年龄、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、空腹血糖(FPG)及尿素氮(UN)比较,差异无统计学意义(P>0.05);收缩压(SBP)、舒张压(DBP)、总胆固醇(TC)、血尿酸(UA)、血肌酐(Cr)及低密度脂蛋白(LDL)比较,差异有统计学意义(P<0.05)。基因多态位点rs 11916762和rs 7620017中的AG、rs 2336384中的TT、rs 2236057中的GG、rs 7620342中的GT、rs 11925699中的AA+AG在观察组中的表达高于对照组(P<0.05),且各位点的基因分布符合Hardy-Weinberg平衡规律(P>0.05)。线粒体融合基因的rs 11916762位点、rs 2236057位点和rs 11925699位点的AA和AG基因型、rs 7620017位点的AA和GG基因型、rs 2336384位点的GG基因型、rs 7620342位点的GG、GT和TT与中国南方客家人群EH存在相关性(P<0.05)。结论线粒体融合基因(Mfn 1、Mfn 2、Opa 1)与中国南方客家人群EH存在正相关性,线粒体融合基因作为分子标志在中国南方客家人群EH监测中具有应用价值。

微滴式数字PCR在检测胃腺癌和结直肠腺癌NTRK基因融合中的应用

目的评估微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)应用于NTRK基因融合检测的可行性。方法回顾性分析830例原发性结直肠腺癌和560例胃腺癌样本,分别运用免疫组织化学(IHC)和荧光原位杂交(FISH)技术检测石蜡包埋肿瘤组织中pan-TRK蛋白表达情况以及NTRK1/2/3基因断裂情况。FISH及IHC阳性样本进一步行二代测序(NGS)检测及ddPCR检测。结果所有石蜡包埋肿瘤样本均成功进行IHC和FISH检测。FISH或IHC阳性样本合计26例,其中FISH阳性21例,IHC阳性18例。26例阳性样本进一步行RNA Seq NGS、DNA Seq NGS及ddPCR检测。DNA Seq NGS合计检测到14例NTRK基因融合,2例扩增。RNA Seq NGS合计检测到3例NTRK基因融合,ddPCR检测结果与RNA Seq NGS完全一致。结论ddPCR可有效区分FISH和DNA Seq NGS检测为NTRK非典型融合的结直肠腺癌和胃腺癌病例,可以作为除FISH之外NTRK基因初筛方法的补充。

靶向药物甲磺酸伊马替尼的分子标志物BCR-ABL融合基因定量检测平台的质量评价方法的研究

目的:使用BCR-ABL定量标准品,评价BCR-ABL融合基因检测试剂盒(数字PCR法)的性能。方法:提取BCR-ABL定量标准品的RNA,测定其浓度和纯度。使用BCR-ABL融合基因定量检测试剂盒(数字PCR法)和数字PCR仪进行检测,得到标准品的BCR-ABL融合基因的分子学反应。结果:用于准确度项目检测的标准品WS2和WS3的BCR-ABL融合基因的MR绝对偏差均不超过±0.5 log,用于检出限项目检测的标准品WS4能检出BCR-ABL融合基因突变阳性,用于重复性项目检测的标准品WS1和WS4的BCR-ABL融合基因的MR的变异系数(CV)均<3.0%。结论:BCR-ABL融合基因定量检测试剂盒(数字PCR法)的准确度、检出限和重复性的性能指标符合制定的《断裂点簇集区-艾贝尔逊白血病病毒(BCR-ABL)融合基因检测试剂盒》标准的相应要求,为标准的实施提供了技术支撑。

TEL-AML1融合基因在儿童急性淋巴细胞白血病中的表达及对其疗效及预后的影响

目的探讨TEL-AML1融合基因在儿童急性淋巴细胞白血病中的表达及对其疗效及预后的影响。方法收集儿童急性淋巴细胞白血病106例,应用巢式PCR技术检测TEL-AML1基因表达,根据TEL-AML1基因是否表达,分为TEL/AML1+组、TEL/AML1-组。结果两组患儿年龄、发热率比较,差异有统计学意义(P<0.05),两组患儿其他临床特征比较,差异无统计学意义(P>0.05)。TEL/AML1+组与TEL/AML1-组临床疗效比较,差异具有统计学意义(χ^(2)=7.617,P=0.022)。第12周MRD水平可能为TEL-AML1融合基因阳性儿童急性淋巴细胞白血病患者预后的影响因素(P<0.05)。结论TEL-AML1融合基因阳性儿童急性淋巴细胞白血病患儿生存率更高,第12周MRD水平可能是影响患儿预后因素。

基于连接酶链式反应的EML4-ALK融合基因分型检测

针对棘皮动物微管相关蛋白样4-间变性淋巴瘤激酶(EML4-ALK)融合基因变异体V1、V2、V3a、V3b设计引物、探针,优化连接探针长度及其浓度,建立基于连接酶链式反应的qPCR法检测方案,并对该方案的特异性、检出限、抗干扰性进行验证。结果表明:基于连接酶链式反应的qPCR法能对EML4-ALK融合基因进行有效分型;连接探针长度在30 nt(nucleotide)时检测灵敏度、特异性最高;连接探针终浓度在0.1~1.0 nmol/L较为合适;设计的引物、探针特异性好,只扩增靶RNA,对其他RNA无扩增;对EML4-ALK融合基因变异体V1、V2的检出限为10 copies/μL,变异体V3a、V3b的检出限为100 copies/μL;在EML4-ALK融合基因RNA标准品检测过程中加入100 ng的肺癌样本RNA作为干扰,检测结果未受到明显干扰。

融合基因检测方法的最新研究进展

融合基因指的是由两个或多个基因片段在基因组中发生重组而形成的新序列,其在肿瘤发生、发展过程中具有重要的生物学功能和临床意义。融合基因的检测可以为肿瘤的早期诊断、风险分层和靶向治疗等提供重要指导。传统的融合基因检测方法占据主导地位,但存在灵敏度偏低,成本偏高或技术复杂,难以大规模应用的局限。随着生物新技术的迅猛发展,一系列全新的融合基因检测方法逐渐涌现,为融合基因检测提供新的思路。该文综述了融合基因检测的传统方法以及近年来发展的测序技术,旨在为融合基因的检测提供思路,为相关疾病的诊断及精准治疗提供指导。

1例罕见ADGRG1-ALK融合突变肺腺癌的基因诊断与治疗

目的回顾性分析1例罕见ADGRG1-间变性淋巴瘤激酶(ALK)融合突变肺腺癌的诊治资料,旨在为此类疾病的基因诊断和治疗提供参考。方法回顾1例肺腺癌患者的病历资料,并对其肺穿刺活检标本进行基因检测,结合基因检测结果选择相应的ALK酪氨酸激酶抑制剂(ALK-TKIs)治疗。结果患者女,61岁,因“咳嗽、咯血丝痰10天”入院。CT检查提示,右肺下叶肿物疑似肺癌,锁骨上淋巴结、纵隔淋巴结肿大及双肾上腺结节疑似转移,右肺中叶不张。经肺穿刺活检病理回报为腺癌,最终诊断为右肺下叶腺癌(T1cN3M1b,ⅣA期)。二代测序技术(NGS)基因检测提示ADGRG1-ALK融合突变,予阿来替尼600 mg口服、2次/天,疗效明显。但治疗期间发生药物性肝炎伴肝功能衰竭、溶血性贫血、肺部感染等不良反应,经对症支持治疗好转。停药45天后半量予阿来替尼口服仍然有效,且未再出现新的严重药物不良反应。结论本研究发现了1例新型罕见ALK融合突变的晚期肺腺癌患者,NGS基因检测属于ADGRG1-ALK融合突变,阿来替尼可获得显著治疗反应。但治疗期间要密切监测血常规和肝功能。

媒体融合背景下红色基因传承的正向正行

推进红色基因传承是培育时代新人之需,是增强文化自信之要。在媒体融合背景下,红色基因传承在传播主流价值、壮大主流舆论、创造主流文化中的作用更加凸显,也面临着虚化弱化泛化异化的挑战和风险。本文从媒体融合传播的实践规律和发展趋势出发,坚持问题导向、目标导向、社会导向,剖析现状现象,提出路径策略,着力推进媒体融合背景下红色基因传承的正向正行,引导人们坚定历史自信、增强历史主动。

TEL/AML1融合基因儿童急性白血病的临床特点与预后

目的通过对71例TEL/AML1阳性的儿童急性白血病患儿行回顾性分析,明确该融合基因阳性白血病的临床特点,并评估其预后关系。方法2015年11月至2023年7月上海市儿童医院单中心71例TEL/AML1融合基因阳性的急性白血病患儿,男36例,女35例,年龄2~15岁,所有患儿均进行MICM的诊断,除形态、免疫分型和细胞遗传学外,均应用实时荧光探针PCR法进行56种融合基因筛选,并同步予FISH的方法行TEL/AML1探针检测。结果71例患儿PCR法和FISH结果均显示TEL/AML1融合基因阳性,符合率100%。71例患儿中位生存时间为54个月,其中持续缓解59例,放弃6例,死亡2例,复发4例,5年无事件生存率(EFS)是83.2%,5年累积复发率为5.6%。其中2例复发后放弃,另外2例复发患儿经过Car-T和造血干细胞移植后持续缓解至今。有1例患儿停药5年后复发,尽管加强化疗和移植,仍未改善预后,最后死亡;另外1例因高白细胞血症,在诱导缓解期间因感染而死亡。除放弃的6例外,将其他65例分为缓解组(59/65)和非缓解组(6/65),通过对两组多因素分析发现年龄≥6岁,危险分层以及D19d MRD≥0.1%是影响预后的危险因素。结论TEL/AML1融合基因阳性的急性白血病患儿可以获得较高的缓解率,常规化疗就可让其预后较好,诱导缓解后的MRD水平等可为后续治疗方案调整提供依据,复发后应用Car-T联合造血干细胞移植有望进一步改善其预后。

急性混合型白血病伴BCR-ABL融合基因阳性1例并文献复习

对1例BCR-ABL融合基因阳性急性混合表型白血病患者的诊治过程作回顾性分析,并复习相关文献。经骨髓细胞学及相关免疫遗传学等检查后,本例患者诊断为B淋系/髓系急性混合型白血病伴BCR-ABL1融合基因阳性,给予了针对淋系化疗方案并联合达沙替尼治疗。完全缓解后,行造血干细胞移植,疗效显著。混合表型急性白血病(mixed phenotype acute leukemia,MPAL)临床少见,预后差,根据患者自身情况综合考虑,选择合适的化疗方案并联合造血干细胞移植有可能改善预后。

克唑替尼治疗伴有ROS1基因融合晚期肺鳞癌1例并文献复习

非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)分为非鳞状细胞癌和鳞状细胞癌,大约有30%新诊断的NSCLC为鳞状细胞癌[1]。ROS1基因融合主要发生在不吸烟的年轻女性晚期肺腺癌患者中,突变概率仅为1%~2%[2-4],伴有ROS1基因融合的肺鳞癌患者极为罕见[5-9]。多项数据表明[10-13],克唑替尼对ROS1基因融合的NSCLC表现出良好的治疗效果,被推荐为伴有ROS1基因融合的晚期NSCLC的一线治疗方案[14-15]。本文报道1例伴有ROS1基因融合的晚期肺鳞癌患者经克唑替尼治疗后肿瘤病灶得到良好控制,病情稳定时间为9个月,提示伴有ROS1基因融合的肺鳞癌对克唑替尼治疗敏感,为临床中对伴有ROS1基因融合肺鳞癌患者的诊疗提供一定的参考。

产教融合视域下制药工程专业教学改革与实践——以基因工程制药课程为例

文章以遗传工程药物制造的教学为案例,考察了在产学研结合的视角下,药物工程领域的教育革新与应用。面对目前药物制造工艺领域教育过程中遭遇的难题,包括教育课程与行业需求不相符、教学手段过时等问题,提出了一系列详细的教改方案,并且通过实践研究证明了这些方案的实效性。改革议程涵盖了提升教育课程质量、更新教学手段、增强教师团队素质、改进教学环境以及优化评估机制等多个方面。经验数据分析揭示这些革新方案对于增进学生的满足感和教学效果颇为有利,进而推动了教育与产业的紧密结合,为药物工程领域的创新性成长提供了有益的参考。

RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性急性髓系白血病骨髓形态学特点分析

目的探讨RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性急性髓系白血病(AML)骨髓形态学特点。方法选取2017年1月至2023年1月该院初诊的20例RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性AML病例作为A组,20例融合基因阴性的AML病例为B组,24例PML-RARA融合基因阳性AML病例为C组,对骨髓形态学、免疫学、细胞遗传学和分子生物学检查进行回顾性分析,同时结合国内外文献分析类似病例骨髓细胞形态学特点。结果A组骨髓中出现不同程度增多的早幼粒细胞,早幼粒细胞数目与B组相比,差异有统计学意义(P<0.05),与C组相比差异亦有统计学意义(P<0.001)。A组部分早幼粒细胞存在形态异常且A组融合基因的表达量与骨髓早幼粒细胞数目呈正相关(r=0.478,P=0.039)。A组CD56、CD19表达及c-Kit突变情况明显高于B组(P<0.05),A、B两组1个疗程化疗缓解情况比较差异无统计学意义(P>0.05)。A组易出现CD56和CD19同时表达,易伴随性染色体的缺失。结论RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性AML在骨髓形态学、免疫学、细胞遗传学和分子生物学方面有其独特的特点。骨髓中粒细胞系统易见不同程度的病态造血,变异性大,早幼粒细胞数目的增多及形态异常亦可作为RUNX1-RUNX1T1融合基因阳性AML骨髓形态学特点之一。

Xp11.2易位/TFE3基因融合相关性肾癌(罕见型)多模态影像表现、病理特点及应用

目的 探讨Xp11.2易位/TFE3基因融合相关性肾癌多模态影像表现及病理学特点。方法 收集西部战区总医院2017年1月—2021年12月Xp11.2易位/TFE3基因融合相关性肾细胞癌患者5例,结合文献资料综合分析该病的多模态影像学表现及病理学特点,并探讨应用价值。结果 超声示:3例为等或稍强回声,2例回声混杂;4例彩色多普勒血流显像(CDFI)显示其内血流信号丰富。CT示:4例等或稍高密度,1例高低混杂密度;平扫CT值29~68 HU,增强2例强化明显,2例轻度强化,1例强化不明显。MRI示:4例患者病灶信号呈等T1、等或稍长T2信号,1例信号较混杂,2例病灶内出现短T1、短T2出血信号,3例DWI弥散受限,增强与CT强化特点一致。单光子发射计算机断层成像术(SPECT)检查2例出现骨转移。行^(18)F-FDG PET/CT检查,放射性摄取较高共3例,放射性摄取较低2例,其中SUVmax为2.5~12.7,平均4.3。大体:4例呈实性,1例呈囊实性;切面4例灰白,1例杂色,5例切面伴囊性变,3例可见出血。镜下:肿瘤由嗜酸性细胞或透明细胞构成的乳头状、巢状及腺泡状结构,乳头轴心为纤维血管轴心,肿瘤细胞界限较清楚,胞浆丰富,嗜酸或透明,4例核仁较明显,均见砂砾体。免疫组化:4例TFE3、CD10、Vim(+),3例E-cadherin(+),2例CK8/18、RCC、EMA(+),1例CK、PAX-8、CAIX(+)。结论 Xp11.2易位/TFE3基因融合相关性肾癌多模态影像学能全面反映瘤灶形态学的特点,确诊需结合病理,影像检查手段序贯应用有助于该病的精确诊断,并各有侧重点及优势互补,可协助手术规划,合理安排复查并及时更改治疗方案。

TMPRSS2-ERG融合基因在前列腺癌中的研究进展

在前列腺癌中,跨膜丝氨酸蛋白酶2(transmembrane serine protease 2,TMPRSS2)-E26转化特异性相关基因[E26 transformation-specific(ETS)-related gene,ERG]融合基因由雄激素调控基因TMPRSS2(染色体21q22.2)与ERG(染色体21q22.3)融合形成。TMPRSS2-ERG可导致ERG过表达,过表达的ERG在多种因素协同作用下可引起相关靶基因表达并激活下游信号通路,从而参与前列腺癌的发生、发展过程。TMPRSS2-ERG有望成为前列腺癌的有效治疗靶点。本文对TMPRSS2-ERG在前列腺癌中的作用机制及其在前列腺癌诊疗中的研究进展进行综述。

基于TaqMan技术构建软组织肉瘤多种融合基因探针及临床辅助诊断应用分析

目的应用TaqMan技术设计PCR联合探针一次性可检测多种软组织肉瘤主要驱动基因的表达,结合病理诊断和FISH结果探讨该联合探针能否较好辅助临床病理诊断需求。方法基于TaqMan技术设计软组织肉瘤相关32对融合基因联合探针,对福建医科大学附属漳州市医院70例相关融合基因软组织肉瘤患者的病理组织学样本进行一次性融合基因联合检测,并设置30例非相关融合基因其他软组织肉瘤患者的病理组织学样本作为对照;常见肉瘤类型结合FISH探针检测结果进行分析;同时对该联合探针检测性能进行多种方法学评价。结果课题组设计的软组织肉瘤相关融合基因探针检测已确诊的软组织肉瘤,结果显示最高敏感性高达100%;选取隆突性皮肤纤维肉瘤、滑膜肉瘤、黏液性脂肪肉瘤3种类型肿瘤结合FISH技术验证,两种方法检测结果一致性高,差异无统计学意义(P>0.05);选取隆突性皮肤纤维肉瘤、滑膜肉瘤、黏液性脂肪肉瘤进行重复性实验,结果完全一致;对所有融合基因RNA阳性质粒进行3种不同浓度检测限检测,确定25拷贝/μL为最低浓度检测下限。结论结合已知病理诊断结果,应用TaqMan技术设计针对软组织肉瘤的PCR联合探针,具备高敏感性和高特异性,方法学性能良好,该探针设计相关融合基因的覆盖位点能满足基层医疗机构一次性快速辅助常见软组织肉瘤病理诊断的需求,为临床软组织肉瘤多种融合基因检测提供了一种快速可靠的检测方法。