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广东地区汉族群体线粒体DNA 9bp序列缺失频率研究 被引量:2
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作者 李彬彬 龙燕 +2 位作者 罗世英 王槐高 钟志国 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第12期112-114,共3页
旨在研究中国广东省部分地区汉族人群线粒体DNA Region Ⅴ 9bp序列缺失情况。采用PCR-PAGE和直接测序法对3个群体144份样本mtDNA Region Ⅴ进行序列分析。结果只检测到标准型和短型(即9bp缺失)两种多态。广东汉族人群的平均缺失频率为21... 旨在研究中国广东省部分地区汉族人群线粒体DNA Region Ⅴ 9bp序列缺失情况。采用PCR-PAGE和直接测序法对3个群体144份样本mtDNA Region Ⅴ进行序列分析。结果只检测到标准型和短型(即9bp缺失)两种多态。广东汉族人群的平均缺失频率为21.5%,广州、东莞和湛江汉族人群的缺失频率依次为20.8%、19.2%和25.0%。由此得出,广东汉族人群mtDNA9bp缺失频率较高,与其它地区汉族群体存在一定的差异。 展开更多
关键词 广东汉族 线粒体DNA 9 bp缺失
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广西壮、苗族和越南京族人线粒体DNA 9 bp缺失频率的分析 被引量:4
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作者 方玲 胡启平 +6 位作者 潘尚领 马军 季米娜 窦霄云 陈晶 陈文诚 袁志刚 《国际遗传学杂志》 CAS 2007年第5期329-331,共3页
目的探讨广西壮、苗族和越南京族人的mtDNA V区的遗传多态性。方法PCR—PAGE扩增和检测COⅡ与tRNA^Lys基因之间的片段,随机选择部分PCR扩增产物进行测序予以确认。结果在广西壮、苗族和越南京族人样本中只发现标准型和短型两种类型的... 目的探讨广西壮、苗族和越南京族人的mtDNA V区的遗传多态性。方法PCR—PAGE扩增和检测COⅡ与tRNA^Lys基因之间的片段,随机选择部分PCR扩增产物进行测序予以确认。结果在广西壮、苗族和越南京族人样本中只发现标准型和短型两种类型的扩增产物。广西壮、苗族和越南京族人的9bp缺失频率分别为20.83%、33.01%和33.31%。结论来自不同地区种族和人群的9bp缺失频率有所不同。研究结果支持中国南方人群与越南人在遗传上有较为密切的关系。 展开更多
关键词 壮族 苗族 越南京族 线粒体DNA 9 bp缺失
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实时定量PCR分析健康人外周血线粒体DNA 4977 bp缺失 被引量:8
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作者 陈晓培 王平 +3 位作者 赵阳辉 韩林 王喜爱 吕玉民 《中国卫生检验杂志》 CAS 2007年第7期1186-1188,1209,共4页
目的:用实时定量PCR方法分析健康人外周血线粒体DNA4 977 bp的缺失情况。方法:收集27例年龄在17~44岁的健康人外周血,用荧光实时定量PCR方法对每个样品同时检测线粒体DNA 4 977 bp缺失的量和无4 977 bp缺失的量,进行定量分析。结果:在2... 目的:用实时定量PCR方法分析健康人外周血线粒体DNA4 977 bp的缺失情况。方法:收集27例年龄在17~44岁的健康人外周血,用荧光实时定量PCR方法对每个样品同时检测线粒体DNA 4 977 bp缺失的量和无4 977 bp缺失的量,进行定量分析。结果:在27例健康人外周血样品中,线粒体DNA4 977 bp缺失的阳性率为70.37%(19/27);19例有线粒体DNA4 977 bp缺失的样品,其扩增产物的CT值在第35个循环到第39个循环之间;无线粒体DNA 4 977 bp缺失的扩增产物的CT值在第15个循环到第21个循环之间;不同年龄组间线粒体DNA 4 977 bp缺失和无线粒体DNA4 977 bp缺失的量均无统计学差异。结论:本文中超过2/3的健康人外周血含有线粒体DNA 4 977 bp的缺失;在有该缺失的样品中大约每106~107拷贝中携带有一个线粒体DNA4 977 bp缺失;随年龄的增长外周血中线粒体DNA 4 977 bp的缺失未显示出累积现象。 展开更多
关键词 线粒体DNA 4977BP缺失 年龄 实时定量PCR
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河南汉族群体线粒体DNA Region V的遗传多态性 被引量:1
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作者 武红艳 王克杰 +4 位作者 郭利伟 李聪 王晓丹 刘向阳 黄艳梅 《新乡医学院学报》 CAS 2009年第2期132-134,共3页
目的研究中国河南地区汉族人群线粒体DNA Region V区的遗传多态性。方法采用聚合酶链反应-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PCR-PAGE)法对277份河南汉族样本的线粒体DNA RegionⅤ进行多态性分析,并随机选取部分DNA扩增产物进行测序予以确认。结果在... 目的研究中国河南地区汉族人群线粒体DNA Region V区的遗传多态性。方法采用聚合酶链反应-聚丙烯酰胺凝胶电泳(PCR-PAGE)法对277份河南汉族样本的线粒体DNA RegionⅤ进行多态性分析,并随机选取部分DNA扩增产物进行测序予以确认。结果在河南汉族群体中发现标准型和缺失型2种多态类型,缺失型多态(即9 bp缺失)出现频率为15.88%。结论河南省汉族群体DNA RegionⅤ缺失型多态基因频率较低,与其他民族或人种有一定差异。 展开更多
关键词 线粒体DNA 遗传多态性 9bp缺失
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ANN-CE:一种预测DNA结合位点的改进神经网络方法 被引量:1
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作者 徐东 王翼飞 《应用科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期187-191,共5页
基于误差平方和最小原则的神经网络方法并不适于解决DNA结合位点的预测问题,提出了一种改进的神经网络方法(ANN CE)被用于对DNA结合位点进行预测.这是一个以交叉熵函数为目标函数的三层反向传播神经网络.计算结果表明,与基于误差平方和... 基于误差平方和最小原则的神经网络方法并不适于解决DNA结合位点的预测问题,提出了一种改进的神经网络方法(ANN CE)被用于对DNA结合位点进行预测.这是一个以交叉熵函数为目标函数的三层反向传播神经网络.计算结果表明,与基于误差平方和最小原则的同规模BP网络相比,其对DNA结合位点预测的敏感性Sn(sensitivity)和特异性Sp(specificity)可分别提高11.40%和11.91%. 展开更多
关键词 神经网络方法 结合位点 DNA 反向传播神经网络 误差平方和 最小原则 预测问题 计算结果 目标函数 BP网络 熵函数 特异性 敏感性 点预测
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DNA优化的神经网络在故障诊断中的应用 被引量:1
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作者 师黎 王希萍 《微计算机信息》 2009年第10期148-150,共3页
将基于DNA优化的BP网络用于飞机发动机气路的故障诊断。首先,用DNA进化算法优化BP网络的初始权值和阈值,然后采用误差反馈算法训练BP网络,最后将经过训练的网络用于故障诊断。仿真实验结果说明,该方法可以对飞机发动机气路故障进行快速... 将基于DNA优化的BP网络用于飞机发动机气路的故障诊断。首先,用DNA进化算法优化BP网络的初始权值和阈值,然后采用误差反馈算法训练BP网络,最后将经过训练的网络用于故障诊断。仿真实验结果说明,该方法可以对飞机发动机气路故障进行快速、有效诊断,避免了BP网络易于限于局部极小、收敛速度慢等缺点,具有较好的工程应用前景。 展开更多
关键词 BP网络 DNA算法 飞机发动Sit 故障诊断
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鸡Visfatin基因9 bp indel杂合突变异源双链DNA的鉴定 被引量:1
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作者 韩瑞丽 康相涛 +3 位作者 魏杨 李国喜 蓝贤勇 陈宏 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第8期756-761,共6页
内脂素(Visfatin)是脂肪细胞因子家族的新成员,主要由内脏脂肪组织产生.研究表明内脂素具有类胰岛素样作用.在检测固始鸡-安卡鸡资源群体3代(亲本,F1,F2)964只鸡Visfatin基因9bp插入/缺失(9 bp 'TAACCTGTG' insertion-deletion... 内脂素(Visfatin)是脂肪细胞因子家族的新成员,主要由内脏脂肪组织产生.研究表明内脂素具有类胰岛素样作用.在检测固始鸡-安卡鸡资源群体3代(亲本,F1,F2)964只鸡Visfatin基因9bp插入/缺失(9 bp 'TAACCTGTG' insertion-deletion)多态的过程中,发现其杂合子的变性和非变性聚丙烯酰胺胶上除2条同源双链DNA(282bp和273bp)外有2条未知条带(命名为A和B).A,B条带经回收、二次PCR、再次聚丙烯酰胺凝胶电泳及DNA测序表明:Visfatin基因第10内含子中9bp insertion-deletion突变杂合子的PCR产物中,本身包含2种同源双链DNA片段和2种异源双链DNA片段,不需要经过额外的变性、退火处理,其PCR产物可以直接进行突变检测,在229个杂合突变中异源双链DNA的检出率为100%.因此,通过异源双链DNA这一标示物作为基因分型时的依照或者参考,建立适当的异源双链DNA分析法可进行基因中几个核苷酸插入/缺失多态的检测. 展开更多
关键词 Visfatin基因 9bp插入/缺失 杂合子突变 异源双链DNA
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宣威燃煤,燃柴烟尘提取物对小鼠肺组织BP—DNA...
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作者 王黎霞 何兴舟 《中国环境科学》 EI CAS CSSCI CSCD 北大核心 1991年第3期179-182,共4页
关键词 燃煤 燃柴 烟尘提取物 bp-dna 小鼠
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不孕症患者子宫内膜细胞线粒体DNA缺失研究 被引量:1
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作者 蔡学泳 赵京卉 +1 位作者 陈燕 刁瑞英 《生殖医学杂志》 CAS 2015年第7期567-571,共5页
目的女性受孕期间子宫内膜能量代谢正常与否,直接决定受精卵的种植成功率及胚胎正常发育。本研究拟探讨子宫内膜细胞线粒体DNA(mtDNA)缺失及能量变化与不孕症发生的关系。方法收集原发性不孕症(n=30)、继发性不孕症(n=27)及对照组(n=26... 目的女性受孕期间子宫内膜能量代谢正常与否,直接决定受精卵的种植成功率及胚胎正常发育。本研究拟探讨子宫内膜细胞线粒体DNA(mtDNA)缺失及能量变化与不孕症发生的关系。方法收集原发性不孕症(n=30)、继发性不孕症(n=27)及对照组(n=26)的子宫内膜组织,采用巢式多聚酶链反应(PCR)检测各组子宫内膜细胞中mtDNA缺失差异;采用实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测各组mtDNA拷贝数变化;最后,比较各组子宫内膜组织的ATP含量差异。结果巢式PCR检测显示,原发和继发性不孕症患者子宫内膜细胞mtDNA 4 977bp缺失率分别为86.67%和78.78%,均显著高于对照组(38.46%)(P<0.05);原发和继发性不孕症子宫内膜细胞mtDNA拷贝数明显增加,分别比对照组高48.49%和51.01%(P<0.01),而ATP含量显著下降,分别比对照组低57.00%和61.29%(P<0.01)。结论子宫内膜mtDNA缺失率增加,mtDNA拷贝数增加,引起子宫内膜能量代谢失调进而参与不孕症的发生。 展开更多
关键词 线粒体DNA缺失 4977BP缺失 不孕症 能量代谢
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大鼠BPDE-DNA加合物生成及其高效液相色谱测定
10
作者 杨柳桦 刘渠 +2 位作者 孙成均 郭淑妍 林少杰 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期302-304,共3页
目的研究苯并(a)芘(BaP)诱导大鼠产生(7R,8S)-二羟基-(9S,10R)-环氧-7,8,9,10-四氢苯并(a)芘(BPDE)-DNA加合物的生成。建立以血液为样品的检测染毒大鼠BPDE-DNA加合物的高效液相色谱法。方法选用清洁级SD大鼠,一次性腹腔注射苯并(a)芘... 目的研究苯并(a)芘(BaP)诱导大鼠产生(7R,8S)-二羟基-(9S,10R)-环氧-7,8,9,10-四氢苯并(a)芘(BPDE)-DNA加合物的生成。建立以血液为样品的检测染毒大鼠BPDE-DNA加合物的高效液相色谱法。方法选用清洁级SD大鼠,一次性腹腔注射苯并(a)芘二甲基亚砜溶液(以1%羧甲基纤维素钠为助溶剂)100 mg/kg,5 h后取股静脉血。提取抗凝全血中的DNA,采用琼脂糖凝胶电泳确认DNA的提取效果。将提取的DNA在0.1 nmol/L HCl、90℃恒温水浴箱中酸水解4 h,乙酸乙酯提取酸水解产物——四醇-苯并(a)芘,高效液相色谱法检测,最后用高效液相色谱-质谱法确认。结果BaP染毒组与溶剂对照组和阴性对照组比较,高效液相色谱检测有新的色谱峰产生,质谱确定其相对分子质量与四醇-苯并(a)芘一致。结论本实验的染毒方法能使大鼠产生BPDE-DNA加合物;建立的高效液相色谱法可以血液为样品检测BPDE-DNA加合物。 展开更多
关键词 (7R 8S)-二羟基-(9S 10R)-环氧-7 8 9 10-四氢苯并(a)芘 苯并(A)芘 DNA加合物 四醇-苯 并(a)芘 高效液相色谱法(HPLC) 液相色谱-质谱(HPLC/MS)
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二苯甲酮类紫外吸收剂与鲱鱼精DNA的相互作用研究 被引量:3
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作者 周铭源 王柯惠 +1 位作者 沈昊宇 孙美娜 《化学研究与应用》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期418-427,共10页
本文采用电子光谱法、荧光光谱、粘度法等方法研究了4种二苯甲酮类(benzophenone,BPs)紫外吸收剂:二苯甲酮(BP)、2,4-二羟基二苯甲酮(UV-0)、2-羟基-4-辛氧基二苯甲酮(UV-531)和2-羟基-4-甲氧基二苯甲酮(UV-9)与鲱鱼精DNA(hs-DNA)的相... 本文采用电子光谱法、荧光光谱、粘度法等方法研究了4种二苯甲酮类(benzophenone,BPs)紫外吸收剂:二苯甲酮(BP)、2,4-二羟基二苯甲酮(UV-0)、2-羟基-4-辛氧基二苯甲酮(UV-531)和2-羟基-4-甲氧基二苯甲酮(UV-9)与鲱鱼精DNA(hs-DNA)的相互作用,并采用凝胶电泳考察了BPs对pBR322质粒DNA迁移作用的影响。结果表明,BPs可引起DNA在~260 nm处的特征紫外吸收峰小的红移(~2 nm)和明显的增色效应(2.1~106%);BPs可竞争亚甲基蓝(methylene blue,MB)与DNA的结合,使得DNA-MB体系中的荧光强度随着BPs的加入而增大;DNA在Tris缓冲液中的相对粘度几乎不随BPs浓度的增加而改变;BPs虽然可以使pBR322质粒DNA的超螺旋构型(Form I)比例有所下降,但对其构型和迁移速率的影响均不显著。热力学研究表明BPs与DNA的结合常数K为10~4~10^(5 )L·mol^(-1)。结合分子对接模型计算推测:BPs与DNA可能通过范德华力以沟槽式相结合。 展开更多
关键词 二苯甲酮类紫外吸收剂(BPs) 鲱鱼精DNA 相互作用模式 热力学结合常数 分子对接模型
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DNA优化的BP神经网络在故障诊断中的应用 被引量:4
12
作者 付琴 《科学技术与工程》 北大核心 2012年第29期7592-7597,共6页
针对BP神经网络收敛速度慢和容易陷入局部极小值问题,将DNA算法和神经网络有机结合,利用DNA算法的全局搜索能力,优化网络的初始权值和阈值,解决其本身固有的两个缺陷,进而提高了BP神经网络诊断故障时的准确性和快速性。以道岔控制电路... 针对BP神经网络收敛速度慢和容易陷入局部极小值问题,将DNA算法和神经网络有机结合,利用DNA算法的全局搜索能力,优化网络的初始权值和阈值,解决其本身固有的两个缺陷,进而提高了BP神经网络诊断故障时的准确性和快速性。以道岔控制电路的故障诊断为研究对象,建立了基于DNA优化的BP神经网络的故障诊断优化模型,使用MATLAB仿真软件对故障诊断模型进行了仿真分析。结果表明,DNA算法优化的BP神经网络的泛化能力、诊断精确性都要优于BP神经网络。 展开更多
关键词 DNA算法 BP神经网络 道岔控制电路 故障诊断
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基于DNA优化的BP网络在齿轮故障检测中的应用
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作者 周磊 刘瑞清 冯冬清 《机械工程师》 2008年第1期99-101,共3页
齿轮是汽车中的一个重要部件,齿轮故障在汽车故障中占有重要比例,因此对齿轮的故障进行早期诊断具有重要意义。文中利用BP网络建立故障诊断模型,然后采用DNA算法来优化BP网络的权值和阈值,最后通过实验证明,这种方法可以对齿轮故障进行... 齿轮是汽车中的一个重要部件,齿轮故障在汽车故障中占有重要比例,因此对齿轮的故障进行早期诊断具有重要意义。文中利用BP网络建立故障诊断模型,然后采用DNA算法来优化BP网络的权值和阈值,最后通过实验证明,这种方法可以对齿轮故障进行成功诊断。 展开更多
关键词 BP网络 DNA算法 齿轮 故障诊断
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制备12kb重组质粒载体的方法
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作者 周晓强 《中山大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2000年第z2期48-51,共4页
利用质粒载体pGEM-7Zf(+)克隆了一个长达9224bp的DNA片段,重组质粒大小达到12003bp.该重组质粒可以转化到JM109受体菌中,并且在随后的继代培养过程中具有较高的产量和相当高的稳定性.对于利用质粒... 利用质粒载体pGEM-7Zf(+)克隆了一个长达9224bp的DNA片段,重组质粒大小达到12003bp.该重组质粒可以转化到JM109受体菌中,并且在随后的继代培养过程中具有较高的产量和相当高的稳定性.对于利用质粒载体来克隆DNA片段来说,设计的方法具有普遍的使用价值,对于较大的DNA片段克隆,该方法具有简便、可靠的特点,不仅能够保证克隆成功,而且极大的减少了筛选或鉴定重组菌的工作量. 展开更多
关键词 质粒载体 克隆 9224pbDNA插入片段
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云南大理白族和汉族弱精子症患者精子mtDNA 4977 bp缺失相关性研究 被引量:2
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作者 杨勇琴 肖杨 +4 位作者 自加吉 李素芬 于成和 张若鹏 熊伟 《井冈山大学学报(自然科学版)》 2019年第1期23-28,共6页
探讨云南大理白族和汉族弱精子症患者精子线粒体DNA(mtDNA) 4977 bp缺失的相关性。收集云南大理白族弱精子症患者137例,汉族弱精子症患者121例,正常对照组大理白族和白族精子活力正常人各120例,提取精液基因组DNA,采用聚合酶链式反应(P... 探讨云南大理白族和汉族弱精子症患者精子线粒体DNA(mtDNA) 4977 bp缺失的相关性。收集云南大理白族弱精子症患者137例,汉族弱精子症患者121例,正常对照组大理白族和白族精子活力正常人各120例,提取精液基因组DNA,采用聚合酶链式反应(PCR)技术进行精子mtDNA4977bp缺失的研究。结果显示,120例正常对照的大理白族精子活力正常人中有10例(8.33%)存在mtDNA4977 bp缺失;而137例大理白族弱精子症患者中有89例(64.96%)存在mtDNA 4977 bp缺失。两组4977 bp缺失频率比较有极显著性差异(P <0.01)。120例正常对照的汉族精子活力正常人中有7例(5.83%)存在mtDNA 4977 bp缺失;121例大理白族弱精子症患者中有85例(70.25%)存在mtDNA 4977 bp缺失。两组4977 bp缺失频率比较差异有极显著性(P <0.01)。同时发现大理白族弱精子症患者与汉族弱精子症患者mtDNA 4977 bp缺失频率无显著性差异(P> 0.05)。大理白族和汉族人群mt DNA 4977 bp缺失与弱精子症的发病有明显的关联,提示mtDNA 4977 bp缺失在弱精子症的发生中可能起重要作用。 展开更多
关键词 弱精子症 线粒体DNA 4977BP缺失 大理白族
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Alterations of mtDNA copy number and 4977 bp deletion induced by ionizing radiation in human peripheral blood
16
作者 LIU Yulong WANG Ping +4 位作者 HAN Lin ZHAO Fengling GUO Fei WANG Xiai LYU Yumin 《Nuclear Science and Techniques》 SCIE CAS CSCD 2013年第6期67-73,共7页
Alterations of mitochondria DNA(mtDNA)4977 bp common deletion(CD)and mtDNA copy number induced by ionizing radiation were observed in human different cell lines and total body irradiation patients.However,only few exp... Alterations of mitochondria DNA(mtDNA)4977 bp common deletion(CD)and mtDNA copy number induced by ionizing radiation were observed in human different cell lines and total body irradiation patients.However,only few experiments have evaluated the levels of the CD and mtDNA copy number in human peripheral blood exposed to ionizing radiation till now.The aim of this study is to analyze the mtDNA alterations in irradiated human peripheral blood from healthy donors as well as to explore their feasibility as biomarkers for constructing new biodosimeter.Peripheral blood samples were collected from six healthy donors,and exposed to 60Co gamma ray with the doses of 0 Gy,1 Gy,2 Gy,3 Gy,4 Gy and 5 Gy.Levels of the CD and mtDNA copy number in irradiated samples after 2h or 24h incubation were detected using TaqMan real-time PCR,and the CD ratio was calculated.The results showed that the mean of the CD ratio and the CD copy number exhibited a dose-dependent increase 2 h in the dose range from 0–5 Gy,and of the mtDNA copy number significantly increased 24 h in irradiated groups compared with 0 Gy group after irradiation.It indicates that the parameters in human peripheral blood may be considered as molecular biomarkers to applying construction of new biodosimeter. 展开更多
关键词 线粒体DNA 电离辐射诱导 人外周血 拷贝数 分子生物标志物 BP mtDNA 全身照射
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巢式PCR分析电离辐射诱导人外周血线粒体DNA4977bp缺失 被引量:25
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作者 封江彬 陆雪 +2 位作者 陈德清 陈晓穗 刘青杰 《中华放射医学与防护杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期533-536,共4页
目的 探索对不同剂量电离辐射诱导的人外周血线粒体DNA 4 977bp缺失进行分析的方法。方法 采用 3对引物对γ射线诱导的人外周血线粒体DNA缺失进行PCR扩增 ,建立对人线粒体DNA 4 977bp缺失进行分析的巢式PCR方法 ,扩增线粒体DNA缺失区... 目的 探索对不同剂量电离辐射诱导的人外周血线粒体DNA 4 977bp缺失进行分析的方法。方法 采用 3对引物对γ射线诱导的人外周血线粒体DNA缺失进行PCR扩增 ,建立对人线粒体DNA 4 977bp缺失进行分析的巢式PCR方法 ,扩增线粒体DNA缺失区片段 ,纯化PCR产物进行测序。采集 5例正常人外周血进行 0~ 5Gy6 0 Coγ射线的外照射 ,利用巢式PCR技术 ,分析6 0 Coγ射线照射后外周血有核细胞中线粒体DNA 4 977bp缺失的发生情况。结果 用建立的巢式PCR方法可在受到照射的外周血样品中检测到mtDNA 4 977bp缺失。所有外周血样本在照射前均无线粒体DNA 4 977bp缺失 ,1~ 5Gy6 0 Coγ线照射后均诱导出此缺失。结论 本研究所建立的巢式PCR方法可用来分析电离辐射诱导的人外周血淋巴细胞线粒体DNA 4 977bp缺失。 展开更多
关键词 人外周血 巢式PCR 线粒体DNA 照射 缺失 ^60Coγ射线 电离辐射诱导 PCR产物 测序 纯化
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电离辐射诱导的两种新线粒体DNA缺失的分析鉴定 被引量:3
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作者 刘青杰 封江彬 +3 位作者 赵宝锋 陆雪 田梅 陈德清 《中华放射医学与防护杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期9-12,共4页
目的筛选电离辐射诱导的线粒体DNA(mtDNA)缺失类型,并进行鉴定。方法用10Gy^60Coγ射线照射正常人淋巴细胞细胞系,用2对引物的长PCR扩增照射前后样品的mtDNA基因组。发现可能缺失片段后用限制条件的普通PCR进行确认,并对PCR产物进... 目的筛选电离辐射诱导的线粒体DNA(mtDNA)缺失类型,并进行鉴定。方法用10Gy^60Coγ射线照射正常人淋巴细胞细胞系,用2对引物的长PCR扩增照射前后样品的mtDNA基因组。发现可能缺失片段后用限制条件的普通PCR进行确认,并对PCR产物进行纯化、克隆、测序和核酸同源性(BLAsT)分析。结果照射前的淋巴细胞系mtDNA样品只扩增出预期全长片段,照射后每对引物还扩增出可能为缺失造成的短片段;进一步限制条件的普通PCR证实了mtDNA缺失的存在。PCR产物经纯化、克隆后测序进行BLAST分析表明两种mtDNA缺失分别为7455bp(重链nt475~7929)、9225bp(重链nt7714~369)的mtDNA缺失,均发生在8bp正向重复序列之间。进一步的生物信息学检索得出两种mtDNA缺失为新发现的mtDNA缺失类型。结论电离辐射诱导出人淋巴细胞mtDNA 7455bp和9225bp缺失。 展开更多
关键词 电离辐射 淋巴细胞系 线粒体DNA 缺失 7455 BP 9225 BP
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妇科肿瘤组织中线粒体DNA4 977 bp缺失及生物学意义 被引量:1
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作者 沈慧 李玉娟 +1 位作者 谢静燕 左绪磊 《中国妇幼保健》 CAS 2015年第21期3707-3709,共3页
目的明确线粒体DNA4 977bp大片段缺失在妇科肿瘤组织及对应患者血清中的频率,为妇科肿瘤的早期临床诊断寻找简便、准确的分子标记。方法运用引物转化PCR的方法对25例妇科恶性肿瘤患者(观察组)、13例癌旁正常组织(对照组)和25例妇科良性... 目的明确线粒体DNA4 977bp大片段缺失在妇科肿瘤组织及对应患者血清中的频率,为妇科肿瘤的早期临床诊断寻找简便、准确的分子标记。方法运用引物转化PCR的方法对25例妇科恶性肿瘤患者(观察组)、13例癌旁正常组织(对照组)和25例妇科良性肿瘤患者(对照组)的肿瘤组织及对应患者术前血清标本mt DNA 4 977 bp缺失进行分析比较。结果在19例卵巢良性肿瘤中12例有缺失(缺失率为63%),6例子宫肌瘤患者正常内膜均没有缺失(缺失率为0),6例卵巢癌均无缺失(缺失率为0),7例子宫颈癌和癌旁正常组织各3例有缺失(缺失率为43%),6例子宫内膜癌中5例有缺失(缺失率为83%),6例外阴癌癌组织缺失率为100%,癌旁正常组织无缺失。妇科恶性肿瘤患者血清中没有缺失,25例妇科良性肿瘤患者血清中4例有缺失(缺失率为16%)。结论妇科恶性肿瘤中线粒体DNA4977 bp大片段缺失的不同发生率提示检测这种缺失可能会成为区分不同妇科肿瘤的分子标记物。检测妇科肿瘤患者血清mt DNA4 977bp大片段缺失对预测妇科肿瘤的发生没有临产意义。 展开更多
关键词 MTDNA 4 977 bp缺失 生殖器肿瘤
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线粒体DNA 4 977 bp缺失与冠心病的关系
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作者 李志强 王静恩 +2 位作者 郑兴 郭志福 柳伟伟 《临床心血管病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期510-514,共5页
目的:探讨人外周血线粒体DNA 4977 bp(mtDNA 4977)缺失与冠心病(CAD)传统危险因素的关系以及与CAD发病的关系。方法:选择90例经冠状动脉造影证实的无亲属关系的CAD患者和60例年龄与CAD组相匹配的健康受试者作为对照组。所有受试者均采... 目的:探讨人外周血线粒体DNA 4977 bp(mtDNA 4977)缺失与冠心病(CAD)传统危险因素的关系以及与CAD发病的关系。方法:选择90例经冠状动脉造影证实的无亲属关系的CAD患者和60例年龄与CAD组相匹配的健康受试者作为对照组。所有受试者均采用巢式PCR法测定外周血mtDNA 4977缺失相对数量,检测TC、TG、LDL-C、HDL-C、空腹血糖(FPG)、餐后2 h血糖(2hPG)水平以及收缩压(SBP)、舒张压(DBP)、体质指数(BMI)等相关指标,同时询问吸烟史、高血压病史及糖尿病史,研究它们与mtDNA 4977缺失的关系。结果:①CAD患者外周血mtDNA 4977缺失发生率和相对数量显著高于正常对照组(P<0.01)。②CAD组高血压、糖尿病和血脂异常者的mtDNA 4977缺失相对数量显著升高(P<0.05)。mtDNA 4977缺失相对数量与年龄、SBP、DBP、TC、LDL-C、FPG、2 hPG呈明显正相关,与HDL-C呈明显负相关,与吸烟、BMI、TG无相关性。③Logistic多元回归分析显示,调整其他传统危险因素后,mtDNA 4977缺失仍与CAD显著相关。结论:CAD患者外周血mtDNA 4977缺失发生率和相对数量显著升高,与年龄、SBP、DBP、TC、LDL-C、FPG、2hPG呈明显正相关,与HDL-C呈明显负相关。mtDNA 4977缺失与CAD的发生机制有关。 展开更多
关键词 线粒体DNA 4 977 BP 冠心病 危险因素
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