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基于权重基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘双酚A代替物的分子作用机制
1
作者
周蕾
吕钧慧
+1 位作者
王悦
李培锋
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期785-790,共6页
评估双酚A(bisphenol A,BPA)代替物的内分泌干扰活性并挖掘其分子作用机理。采用分子对接技术模拟预测BPA代替物对人雌激素受体α(estrogen receptor,ERα)的结合活性;构建权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network ...
评估双酚A(bisphenol A,BPA)代替物的内分泌干扰活性并挖掘其分子作用机理。采用分子对接技术模拟预测BPA代替物对人雌激素受体α(estrogen receptor,ERα)的结合活性;构建权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)找到BPA代替物和细胞增殖之间强相关的模块和基因;构建蛋白互作网络(protein protein interaction network,PPI),找到BPA代替物发挥雌激素活性的枢纽基因(Hub gene);基因-疾病关联(gene-disease associations)分析找到与BPA代替物高度相关的人类疾病。结果表明,6种BPA均具有雌激素活性;WGCNA分析找到2个模块共1090个基因与细胞增殖强相关的基因;PPI挖掘到BPA代替物发挥雌激素作用的Hub gene是孕酮受体(rrogesterone receptor,PGR)、Myb相关蛋白(Myb-related protein like 1,MYBL1)、过氧化物酶体增殖剂激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor,PPAR)和MYB原癌基因转录因子(MYB);基因-疾病关联分析表明BPA代替物可能对机体的乳腺肿瘤、子宫内膜癌和糖尿病等疾病的发生发展过程产生不良影响。
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关键词
bpa代替物
分子对接
权重基因共表达网络分析
蛋白互作网络
基因-疾病关联分析
原文传递
题名
基于权重基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘双酚A代替物的分子作用机制
1
作者
周蕾
吕钧慧
王悦
李培锋
机构
内蒙古农业大学兽医学院
北京大学城市与环境学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期785-790,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(21777003,41330637.21377007)。
文摘
评估双酚A(bisphenol A,BPA)代替物的内分泌干扰活性并挖掘其分子作用机理。采用分子对接技术模拟预测BPA代替物对人雌激素受体α(estrogen receptor,ERα)的结合活性;构建权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)找到BPA代替物和细胞增殖之间强相关的模块和基因;构建蛋白互作网络(protein protein interaction network,PPI),找到BPA代替物发挥雌激素活性的枢纽基因(Hub gene);基因-疾病关联(gene-disease associations)分析找到与BPA代替物高度相关的人类疾病。结果表明,6种BPA均具有雌激素活性;WGCNA分析找到2个模块共1090个基因与细胞增殖强相关的基因;PPI挖掘到BPA代替物发挥雌激素作用的Hub gene是孕酮受体(rrogesterone receptor,PGR)、Myb相关蛋白(Myb-related protein like 1,MYBL1)、过氧化物酶体增殖剂激活受体(peroxisome proliferators-activated receptor,PPAR)和MYB原癌基因转录因子(MYB);基因-疾病关联分析表明BPA代替物可能对机体的乳腺肿瘤、子宫内膜癌和糖尿病等疾病的发生发展过程产生不良影响。
关键词
bpa代替物
分子对接
权重基因共表达网络分析
蛋白互作网络
基因-疾病关联分析
Keywords
bpa
substitutes
molecular docking
WGCNA
PPI
gene-disease associations
分类号
S852.21 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于权重基因共表达网络分析(WGCNA)挖掘双酚A代替物的分子作用机制
周蕾
吕钧慧
王悦
李培锋
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
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