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散发性乳腺癌组织BRCA1基因启动子甲基化与蛋白表达的相关性
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作者 魏敏杰 任婕 +1 位作者 赵海山 金万宝 《中国药理通讯》 2006年第3期32-32,共1页
目的:探讨BRCA1基因启动子甲基化对BRCA1蛋白表达的影响,与散发性乳腺癌发病之间的关系。方法:采用甲基化特异性PCR(MS-PCR)检测51例散发的乳腺浸润性导管癌和10例乳腺良性组织的BRCA1基因启动子甲基化状态,免疫组织化学SP法检测... 目的:探讨BRCA1基因启动子甲基化对BRCA1蛋白表达的影响,与散发性乳腺癌发病之间的关系。方法:采用甲基化特异性PCR(MS-PCR)检测51例散发的乳腺浸润性导管癌和10例乳腺良性组织的BRCA1基因启动子甲基化状态,免疫组织化学SP法检测相应组织的石蜡标本BRCA1蛋白表达水平。结果:10例乳腺良性组织中均未检测到BRCA1启动子的异常甲基化,结合免疫组织化学检测,BRCA1蛋白均在细胞核阳性表达,其中70%为强阳性表达;在51例散发性乳腺浸润性导管癌组织中检测到7例BRCA1启动子发生异常甲基化,甲基化比例为13.73%(7/51);其余44例(44/51,86.27%)未检测到BRCA1启动子甲基化。 展开更多
关键词 散发性乳腺癌组织 brca1基因启动子 甲基化 蛋白表达
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乳腺癌患者BRCA1基因启动子区甲基化模式的初步研究 被引量:11
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作者 李云青 张思仲 +1 位作者 肖翠英 赵扬冰 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第10期1057-1060,共4页
目的:探讨在散发性乳腺癌患者中乳腺癌易感基因1(breastcancer1,BRCA1)启动子区13个CpG二核苷酸甲基化模式与肿瘤发生的关系。方法:用新发展的甲基化敏感单链构象分析法methylationsensitivesinglestrandconformationanalysis,MSSSCA及... 目的:探讨在散发性乳腺癌患者中乳腺癌易感基因1(breastcancer1,BRCA1)启动子区13个CpG二核苷酸甲基化模式与肿瘤发生的关系。方法:用新发展的甲基化敏感单链构象分析法methylationsensitivesinglestrandconformationanalysis,MSSSCA及DNA测序技术,对66例乳腺癌患者的癌组织、癌旁组织、外周血细胞中的BR-CA1基因启动子区甲基化模式进行研究。结果:发现有3种不同的甲基化模式。其中16例(24.2%)为高度甲基化,3例(4.5%)为部分甲基化,其余为未甲基化。结论:在部分散发性乳腺癌中BRCA1基因是高度甲基化的,它可能是BRCA1基因表达下降的机制之一。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 brca1基因 MS-SSCA法 甲基化模式 启动子
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散发性乳腺癌患者血浆BRCA1基因启动子异常甲基化的检测 被引量:14
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作者 冯景 张吉才 +4 位作者 陶建蜀 吕军 付萍 郭建华 周有利 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 2005年第5期442-445,共4页
目的:探讨散发性乳腺癌组织及外周血浆中BRCA1基因启动子异常甲基化状况及其在散发性乳腺癌诊断中的价值。方法:用甲基化特异PCR方法对散发性乳腺癌患者癌组织、癌旁组织及相应血浆进行BRCA1异常甲基化检测。结果:93例散发性乳腺癌组织... 目的:探讨散发性乳腺癌组织及外周血浆中BRCA1基因启动子异常甲基化状况及其在散发性乳腺癌诊断中的价值。方法:用甲基化特异PCR方法对散发性乳腺癌患者癌组织、癌旁组织及相应血浆进行BRCA1异常甲基化检测。结果:93例散发性乳腺癌组织中,BRCA1基因启动子异常甲基化率为29%(27/93),相应血浆中BRCA1的甲基化检出率为24.7%(23/93),而癌旁组织、正常对照血浆未检出甲基化,只检出未甲基化的BRCA1。血浆中甲基化改变与肿瘤组织甲基化状况显著相关(P<0.05);BRCA1异常甲基化与髓样癌和粘液腺癌的组织分型显著相关(P<0.05),也与肿瘤淋巴结转移显著相关(P<0.005);但与散发性乳腺癌患者年龄(绝经与否)及肿瘤分级无显著的相关性(P>0.05)。结论:血浆BRCA1基因异常甲基化改变的检测在散发性乳腺癌的特异诊断、组织分型和淋巴结恶性转移等方面有一定的应用价值。 展开更多
关键词 乳腺癌 DNA甲基化 brca1基因 血浆 PCR
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散发性乳腺癌组织中BRCA1基因启动子甲基化与蛋白表达的相关性 被引量:12
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作者 任婕 魏敏杰 +4 位作者 金锋 杨栋 林哲珠 马文峰 金万宝 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 2007年第3期161-164,共4页
目的:探讨BRCA1基因启动子甲基化对BRCA1蛋白表达的影响,及与散发性乳腺癌发病之间的关系。方法:甲基化特异性PCR(MSP)法检测51例散发性乳腺浸润导管癌和10例乳腺良性组织的BRCAl基因启动子甲基化状态,SP法检测BRCA1蛋白表达水平。结果... 目的:探讨BRCA1基因启动子甲基化对BRCA1蛋白表达的影响,及与散发性乳腺癌发病之间的关系。方法:甲基化特异性PCR(MSP)法检测51例散发性乳腺浸润导管癌和10例乳腺良性组织的BRCAl基因启动子甲基化状态,SP法检测BRCA1蛋白表达水平。结果:10例乳腺良性组织中均未检测到BRCA1启动子的异常甲基化,BRCA1蛋白在细胞核均阳性表达,其中70%(7/10)为强阳性表达。在51例散发性乳腺浸润性导管癌组织中检测到7例(13.73%)BRCA1启动子发生异常甲基化,其余44例(86.27%)未检测到BRCA1启动子甲基化。7例BRCA1启动子甲基化的组织均未见BRCA1蛋白细胞核阳性表达(0/7),仅有1例BRCA1蛋白细胞质表达;44例未检测到BRCA1启动子甲基化的浸润性导管癌中,30例(68.18%)BRCA1蛋白在细胞核阳性表达,14例(31.82%)BRCA1蛋白在细胞核阴性表达。BRCA1启动子甲基化与BRCA1蛋白核低表达密切相关,χ2=11.959 1,P=0.000 5;BRCA1蛋白的表达在乳腺良性组织与癌组织之间差异有统计学意义,χ2=4.587 9,P=0.032。结论:乳腺癌易感基因BRCA1启动子甲基化可抑制BRCA1蛋白表达,并影响其参与散发性乳腺癌的发生发展过程。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 基因 brca1 启动区(遗传学) 甲基化
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散发性乳腺癌及乳腺不典型导管增生组织BRCA1基因启动子区甲基化分析 被引量:8
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作者 杨海捷 王丽 +4 位作者 魏万里 陈玥 江自然 李学锋 杨举伦 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期141-145,153,共6页
目的了解散发性乳腺癌及癌旁增生组织、乳腺不典型导管增生组织BRCA1基因启动子区甲基化状态,探讨其与乳腺癌发生的关系。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)结合巢式PCR技术,研究23例散发性乳腺癌及其癌旁增生组织、6例乳腺不典型导管增生... 目的了解散发性乳腺癌及癌旁增生组织、乳腺不典型导管增生组织BRCA1基因启动子区甲基化状态,探讨其与乳腺癌发生的关系。方法采用甲基化特异性PCR(MSP)结合巢式PCR技术,研究23例散发性乳腺癌及其癌旁增生组织、6例乳腺不典型导管增生组织及5例健康成人女性外周血淋巴细胞中BRCA1基因启动子区甲基化状态。结果5例健康成人女性外周血淋巴细胞均表现BRCA1基因启动子区甲基化阴性;23例原发性乳腺癌组织中,BRCA1基因启动子区CpG岛甲基化率为65.22%(15/23);癌旁增生组织检出CpG岛甲基化者11例,甲基化率为47.83%(11/23),且均为癌组织阳性患者;6例乳腺不典型导管增生组织中,BRCA1基因启动子区CpG岛甲基化阳性者2例,甲基化率为33.33%(2/6);统计学检验结果表明,乳腺癌、癌旁增生组织之间,BRCA1基因启动子区甲基化阳性率无显著差异。结论BRCA1基因启动子区CpG岛甲基化是散发性乳腺癌发生过程中的早期事件,可能在乳腺癌发生中和乳腺增生病癌变过程中起重要生物学作用。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 乳腺不典型导管增生 甲基化 brca1基因
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BRCA1基因启动子异常甲基化与散发性乳腺癌的关系 被引量:3
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作者 冯景 陶建蜀 +2 位作者 郭建华 付萍 周有利 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第11期1342-1344,共3页
目的探讨散发性乳腺癌BRCA1基因启动子异常甲基化状况及其与散发性乳腺癌关系。方法用甲基化特异PCR(MSP)法对散发性乳腺癌病人癌组织、癌旁组织及乳腺纤维腺瘤组织进行BRCA1异常甲基化检测。结果在58例散发性乳腺癌中有17例癌组织检出... 目的探讨散发性乳腺癌BRCA1基因启动子异常甲基化状况及其与散发性乳腺癌关系。方法用甲基化特异PCR(MSP)法对散发性乳腺癌病人癌组织、癌旁组织及乳腺纤维腺瘤组织进行BRCA1异常甲基化检测。结果在58例散发性乳腺癌中有17例癌组织检出了BRCA1基因启动子异常甲基化,甲基化频率为29.3%(17/58),相应的癌旁组织及乳腺纤维腺瘤组织均只检出未甲基化的BRCA1。在组织分型中,浸润性导管癌与浸润性小叶癌无显著差异(P>0.05),二者各自与髓样癌+黏液腺癌有显著差异(P<0.05)。有淋巴结转移的BRCA1基因启动子甲基化率高于无淋巴结转移组(P<0.005)。BRCA1甲基化与散发性乳腺癌的肿瘤分级及病人绝经与否均无显著差异(P>0.05)。结论在散发性乳腺癌中,BRCA1基因启动子具有很高的甲基化率,并与散发性乳腺癌的组织分型、恶性转移等方面有一定的关系。 展开更多
关键词 散发性乳腺癌 DNA甲基化 brca1基因 甲基化特异PCR
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BRCA1基因启动子区甲基化状态抑癌作用研究 被引量:2
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作者 孙勇 李运辉 张鹏 《海南医学》 CAS 2014年第12期1717-1719,共3页
目的研究BRCA1基因启动子区甲基化状态在乳腺癌组织中的抑癌作用。方法甲基化PCR法检测60例乳腺癌患者的癌组织、癌旁组织和20例乳腺良性组织中BRCA1-mRNA表达及启动子区甲基化状态,以及评价其作用。结果癌组织和癌旁组织中BRCA1-mRNA... 目的研究BRCA1基因启动子区甲基化状态在乳腺癌组织中的抑癌作用。方法甲基化PCR法检测60例乳腺癌患者的癌组织、癌旁组织和20例乳腺良性组织中BRCA1-mRNA表达及启动子区甲基化状态,以及评价其作用。结果癌组织和癌旁组织中BRCA1-mRNA的表达水平分别为(0.6122±0.2344)、(0.6875±0.2576),在癌组织、癌旁组织、良性肿瘤组织中BRCA1表达的甲基化率分别为70.0%、48.3%、35.0%。癌组织的甲基化率明显的高于癌旁组织和良性肿瘤组织;经统计学分析显示,淋巴结转移、肿瘤分级在BRCA1-mRNA表达及启动子区甲基化中的差异均具有统计学意义(P<0.05),绝经、组织分型在BRCA1-mRNA表达及启动子区甲基化中的差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 BRCA1-mRNA表达及启动子区甲基化状态在乳腺癌的发生发展中起着重要的作用,并且与组织分期和淋巴结的转移密切相关。 展开更多
关键词 乳腺癌 brca1基因表达 启动子 甲基化
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BRCA1基因启动子甲基化在三阴性乳腺癌中的表达及其临床意义 被引量:4
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作者 张丹峰 王曼 +3 位作者 张华 王耕 王明华 张立军 《现代肿瘤医学》 CAS 2018年第7期1038-1043,共6页
目的:评估三阴性乳腺癌(TNBC)患者中乳腺癌易感基因1(BRCA1)甲基化的表达及与患者预后的关系。方法:收集在我院甲乳科治疗的乳腺癌患者手术切除标本524例,应用联合亚硫酸氢钠限制性内切酶分析法,观察BRCA1启动子甲基化状态。应用定量逆... 目的:评估三阴性乳腺癌(TNBC)患者中乳腺癌易感基因1(BRCA1)甲基化的表达及与患者预后的关系。方法:收集在我院甲乳科治疗的乳腺癌患者手术切除标本524例,应用联合亚硫酸氢钠限制性内切酶分析法,观察BRCA1启动子甲基化状态。应用定量逆转录聚合酶链反应评估BRCA1 mRNA表达,应用免疫组织化学法评估BRCA1蛋白表达。结果:共有157(30.0%)例TNBC患者,有25(4.77%)例存在BRCA1启动子甲基化,所有BRCA1启动子甲基化的肿瘤均为TNBC。TNBC患者中,BRCA1启动子甲基化患者的BRCA1 mRNA水平显著低于BRCA1启动子未甲基化患者[(0.019±0.005)vs(0.095±0.013),P<0.001],免疫组化分析未在BRCA1启动子甲基化患者中检测出BRCA1蛋白表达。BRCA1启动子甲基化患者的总生存率(OS)显著低于非甲基化患者(logrank P=0.038)。BRCA1蛋白低表达患者的OS与RFS均低于高表达组,但差异没有统计学意义(分别logrank P=0.526,P=0.467)。结论:BRCA1启动子甲基化导致了BRCA1表达的下降,并与TNBC患者较差预后相关。BRCA1启动子甲基化是一种促成BRCA1功能丧失的重要机制。 展开更多
关键词 乳腺癌易感基因1 三阴性乳腺癌 启动子甲基化 预后
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维吾尔族和汉族散发性乳腺癌患者BRCA1基因启动子区甲基化的对比研究 被引量:1
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作者 缑文斌 郭媛媛 张巍 《新疆医科大学学报》 CAS 2015年第11期1354-1356,1361,共4页
目的比较维吾尔族和汉族散发性乳腺癌患者乳腺癌1号基因(BRCA1)启动子区域甲基化水平及其与临床病理特征的关系。方法采用甲基化特异性PCR法检测维吾尔族和汉族乳腺癌患者BRCA1基因启动子区域甲基化状态,分析甲基化状态改变与乳腺癌发... 目的比较维吾尔族和汉族散发性乳腺癌患者乳腺癌1号基因(BRCA1)启动子区域甲基化水平及其与临床病理特征的关系。方法采用甲基化特异性PCR法检测维吾尔族和汉族乳腺癌患者BRCA1基因启动子区域甲基化状态,分析甲基化状态改变与乳腺癌发生、发展的关系。结果汉族患者甲基化率为26%,维吾尔族患者甲基化率为30%,汉族与维吾尔族患者甲基化率差异无统计学意义(P=0.65)。BRCA1基因甲基化组与非甲基化组临床病理特征的比较中,汉族患者的年龄及淋巴结状态与BRCA1甲基化有关(P分别为0.021及0.001),维吾尔族患者仅组织学分级与BRCA1甲基化有关(P=0.001)。结论 BRCA1基因表观遗传学改变在肿瘤的发生、发展过程起着重要作用,且与散发性乳腺癌患者的发病年龄及组织学分级和淋巴结状态的发生密切相关。 展开更多
关键词 乳腺癌 brca1基因 甲基化 临床特征 汉族 维吾尔族
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BRCA1基因启动子复杂甲基化模式
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作者 李云青 张思仲 +1 位作者 肖翠英 吴韶清 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2001年第4期343-346,共4页
应用体外甲基化酶M SssI处理和甲基化敏感单链构象分析法 (Methylation sensitivesingle strandconformationanalysis,MS SSCA )及DNA测序技术 ,研究正常人乳腺癌易感基因 1(breastcancer 1,BRCA1)启动子区 5’端CpG岛13个CG二核苷酸位... 应用体外甲基化酶M SssI处理和甲基化敏感单链构象分析法 (Methylation sensitivesingle strandconformationanalysis,MS SSCA )及DNA测序技术 ,研究正常人乳腺癌易感基因 1(breastcancer 1,BRCA1)启动子区 5’端CpG岛13个CG二核苷酸位点的甲基化模式。对甲基化酶处理时间不同得到的 8种有差异MS SSCA迁移带型进行测序 ,证实为 8种不同的甲基化模式。 展开更多
关键词 brca1基因 甲基化酶M-SssI MS-SSCA法 复杂甲基化模式 乳腺癌
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散发性年轻乳腺癌及乳腺不典型导管增生组织BRCA1基因启动子区甲基化分析
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作者 彭德峰 李玉龙 +1 位作者 刘宏升 刁澳利 《中文科技期刊数据库(引文版)医药卫生》 2021年第7期41-41,共1页
探讨散发性幼年乳腺癌和非典型导管增生的易感基因1水平和启动子甲基化状态。方法:选取2018年2月至2021年2月期间在医院确诊的乳腺癌患者20例作为研究组,选取同期接受体检的健康女性20例作为对照组。结果:研究组BRCA1水平低于对照组,启... 探讨散发性幼年乳腺癌和非典型导管增生的易感基因1水平和启动子甲基化状态。方法:选取2018年2月至2021年2月期间在医院确诊的乳腺癌患者20例作为研究组,选取同期接受体检的健康女性20例作为对照组。结果:研究组BRCA1水平低于对照组,启动子甲基化阳性率显著高于对照组(P<0.05)。结论:散发性青少年乳腺癌和非典型导管增生中的BRCA1水平与肿瘤大小相关,启动子区域的甲基化状态与其组织学分级相关。 展开更多
关键词 散发性年轻乳腺癌 乳腺不典型导管增生组织 brca1基因 启动子 甲基化
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耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株中BRCA1基因启动子CpG岛甲基化的研究 被引量:4
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作者 尹红英 王红兵 《实用癌症杂志》 2012年第4期337-338,共2页
目的检测耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株(A549/Taxol)中BRCA1基因启动子CpG岛甲基化状态,探讨A549/Taxol细胞对紫杉醇的耐药机制。方法应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)技术,检测耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株BRCA1基因启动子CpG岛甲基化... 目的检测耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株(A549/Taxol)中BRCA1基因启动子CpG岛甲基化状态,探讨A549/Taxol细胞对紫杉醇的耐药机制。方法应用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)技术,检测耐紫杉醇人肺腺癌A549细胞株BRCA1基因启动子CpG岛甲基化状态。结果 A549/Taxol细胞存在BRCA1基因异常甲基化,呈部分甲基化。结论 A549/Taxol细胞存在BRCA1基因异常甲基化,可能是A549/Taxol细胞对紫杉醇耐药的机制之一。 展开更多
关键词 brca1基因 CPG岛 甲基化 甲基化特异性聚合酶链反应
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山羊NPC1基因核心启动子鉴定与转录调控分析
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作者 李崇瑞 陈思 +7 位作者 翟哲 王雪梅 吴艳茹 刘志勇 蒋俊明 满初日嘎 杜丽 王凤阳 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2024年第3期154-163,共10页
NPC1基因编码的C型尼曼匹克蛋白1(NPC1)参与脂筏形成、病原微生物内吞以及内吞体的胞内转运等过程。本试验旨在阐明海南黑山羊NPC1基因的转录调控机制,为研究病原微生物与宿主细胞互作提供理论参考。首先,以山羊NPC1基因1466 bp启动子... NPC1基因编码的C型尼曼匹克蛋白1(NPC1)参与脂筏形成、病原微生物内吞以及内吞体的胞内转运等过程。本试验旨在阐明海南黑山羊NPC1基因的转录调控机制,为研究病原微生物与宿主细胞互作提供理论参考。首先,以山羊NPC1基因1466 bp启动子序列为模板,构建9个启动子5'端连续缺失的双荧光素酶报告载体,筛选NPC1基因核心启动子区;继而对核心启动子区的关键转录因子进行预测分析,构建转录因子结合位点缺失的双荧光素酶报告载体,筛选NPC1基因的关键转录因子结合位点。结果表明:山羊NPC1基因的核心启动子区位于转录起始位点上游-195 bp至-60 bp,并且该区域存在E2F3(-134/-120 bp)、SREBP-1(-107/-96 bp)、SP1(-68/-62 bp)等多个转录因子结合位点。双荧光素酶报告实验结果表明,缺失E2F3、SREBP-1、SP1三个转录因子结合位点均会使山羊NPC1基因启动子的转录活性显著下降(P<0.01),且缺失SREBP-1结合位点后NPC1基因转录活性下降最显著。提示,SREBP-1转录因子对海南黑山羊NPC1基因转录活性具有重要的调控作用。本试验成功鉴定山羊NPC1基因的核心启动子区(-195/-60 bp)及该区域的关键转录因子结合位点SREBP-1,为进一步研究山羊NPC1基因介导病原微生物与宿主互作分子机制提供理论基础。 展开更多
关键词 海南黑山羊 NPC1基因 转录调控 核心启动子 SREBP-1
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葡萄VvCCD1b基因克隆及与其启动子互作的转录因子筛选
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作者 陈一恒 李少楠 +4 位作者 董天宇 唐美玲 唐雯 卢素文 房经贵 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期2215-2224,共10页
【目的】筛选葡萄类胡萝卜素裂解双加氧酶(CCD)基因VvCCD1b启动子互作的转录因子,挖掘参与调控葡萄类胡萝卜素代谢的潜在因子,为深入探究葡萄类胡萝卜素的代谢调控网络提供理论参考。【方法】克隆VvCCD1b基因的cDNA及其启动子序列,利用... 【目的】筛选葡萄类胡萝卜素裂解双加氧酶(CCD)基因VvCCD1b启动子互作的转录因子,挖掘参与调控葡萄类胡萝卜素代谢的潜在因子,为深入探究葡萄类胡萝卜素的代谢调控网络提供理论参考。【方法】克隆VvCCD1b基因的cDNA及其启动子序列,利用生物信息学软件对VvCCD1b基因的染色体位置、启动子顺式作用元件及其编码蛋白的理化性质、保守结构域等进行预测分析。基于转录组数据分析不同葡萄品种及不同处理下葡萄CCD家族成员表达模式。通过酵母单杂交技术筛选与VvCCD1b基因启动子互作的转录因子,并进行点对点验证。【结果】通过PCR克隆获得VvCCD1b基因序列全长1641 bp,位于13号染色体上,编码546个氨基酸残基,为亲水性蛋白,二级结构由α-螺旋(16.67%)、β-折叠(5.49%)、延伸链(24.54%)和无规则卷曲(53.30%)构成,具有RPE65保守结构域。VvCCD1b基因启动子含有光响应元件(G-box、3-AF1 binding site、GATA-motif、TCT-motif)、水杨酸(SA)响应元件(SARE)、脱落酸(ABA)响应元件(ABRE)及AP2/ERF、WRKY、MADS-box转录因子结合元件。VvCCD1b基因表达水平随果实发育逐渐升高且受光照与逆境胁迫的影响。以VvCCD1b基因启动子为诱饵,初步筛选出VvRAP2-4、VvWRKY4、VvBHLH137转录因子及葡萄液泡加工酶、葡萄糖苷酶等18个功能蛋白,其中VvRAP2-4、VvWRKY4转录因子与VvCCD1b基因启动子间存在互作。【结论】VvCCD1b为亲水性蛋白,基因表达水平随果实发育逐渐升高,且受到干旱、高温、水涝胁迫和光照的影响。通过酵母单杂交技术筛选出与VvCCD1b启动子互作的候选转录因子。 展开更多
关键词 葡萄 VvCCD1b基因 启动子 酵母单杂交 转录因子
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北海地区遗传性乳腺癌和健康遗传高危人群BRCA1和BRCA2基因突变研究 被引量:1
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作者 程学远 高雪原 +1 位作者 陈洁清 刘家麒 《吉林医学》 CAS 2024年第3期528-531,共4页
目的:探讨北海地区遗传性乳腺癌和健康遗传高危人群乳腺癌易感基因(BRCA)1和BRCA2基因突变特征。方法:选取北海市人民医院普通外科收治的50例遗传性乳腺癌患者及150例健康遗传性高危人群,PCR-DNA直接测序法检测BRCA1、BRCA2的全编码外... 目的:探讨北海地区遗传性乳腺癌和健康遗传高危人群乳腺癌易感基因(BRCA)1和BRCA2基因突变特征。方法:选取北海市人民医院普通外科收治的50例遗传性乳腺癌患者及150例健康遗传性高危人群,PCR-DNA直接测序法检测BRCA1、BRCA2的全编码外显子基因序列。结果:50例遗传性乳腺癌患者中共有8例BRCA1/2基因突变,总突变率为16%;其中BRCA1突变占12.0%,BRCA2突变占4.0%。三阴性乳腺癌患者BRCA1/2基因突变率为57.1%(4/7),高于非三阴性乳腺癌患者的9.3%(4/43),差异有统计学意义(P<0.05)。150例健康遗传性高危人群存在2例致病性突变,均位于BRCA1的11外显子,突变率为1.3%(2/150)。结论:北海地区女性遗传性乳腺癌存在BRCA1和BRCA2基因突变,与三阴乳腺癌有关,突变类型以碱基置换突变为主;健康遗传高危人群也存在BRCA1突变。 展开更多
关键词 遗传性乳腺癌 基因突变 brca1 brca2
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人SIRT1基因启动子及蛋白的生物信息学分析 被引量:2
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作者 王道 陈建林 +2 位作者 刘文彬 刘丹 宋甜 《激光生物学报》 CAS 2023年第4期368-384,共17页
为深入分析人SIRT1基因启动子及蛋白的结构和功能,本文采用生物信息学方法分析人SIRT1基因5′端启动子、启动子区Motif、转录因子结合位点、甲基化CpG岛、单核苷酸多态性、进化关系、理化性质、二级和三级结构、保守结构域、突变和翻译... 为深入分析人SIRT1基因启动子及蛋白的结构和功能,本文采用生物信息学方法分析人SIRT1基因5′端启动子、启动子区Motif、转录因子结合位点、甲基化CpG岛、单核苷酸多态性、进化关系、理化性质、二级和三级结构、保守结构域、突变和翻译后修饰位点、互作蛋白及生物学功能。TSSW和Neural Network Promoter Prediction数据库预测其区间分别存在3个、2个启动子。MEME数据库预测启动子区存在3个Motif。EMBOSS、MethPrimer和CpG Finder数据库都发现CpG岛聚集分布于1600~2200 bp区。PROMO和AliBaba2.1数据库预测其启动子区域共同转录因子为22个。JASPAR软件获得6个与正负链相结合的转录因子。SNP Function Prediction数据库还发现不同种族等位基因频率存在差异。人SIRT1基因位于染色体10q21.3上,广泛分布在不同组织中。人SIRT1蛋白由747个氨基酸组成,属于亲水、不稳定的蛋白质,在不同物种间具有较高的保守性。结构域位于第254~489位氨基酸序列,属于SIR2超家族,主要分布在细胞核和线粒体中,二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,相比AlphaFold2,SWISS-MODEL数据库构建的三级模型更可靠。SIRT1蛋白共含有突变位点106个、N-糖基化位点1个、磷酸化位点61个,与EP300、TP53等多种蛋白相互作用,并且参与昼夜节律过程、类固醇激素反应、细胞内受体信号等,涉及寿命调节通路、AMPK信号通路、FoxO信号通路等。本研究为了解SIRT1对炎症反应等疾病的影响及感染机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 人SIRT1基因 启动子 蛋白 生物信息学 炎症
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前列腺导管内癌临床、病理特征及BRCA1/2基因突变状态分析(附15例报告)
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作者 谢汝昊 陈博文 +8 位作者 章宏峰 石玉香 李学超 徐长庚 汪志顺 昌磊 宋正帅 罗刚 舒博 《现代泌尿生殖肿瘤杂志》 2024年第4期203-207,242,共6页
目的探讨前列腺导管内癌(IDC-P)的临床特点及病理特征,分析BRCA1/2基因在IDC-P中的突变状态。方法回顾性分析2017年1月至2022年3月华中科技大学附属同济医学院附属武汉市中心医院泌尿外科137例确诊为前列腺癌患者的临床资料,按照是否合... 目的探讨前列腺导管内癌(IDC-P)的临床特点及病理特征,分析BRCA1/2基因在IDC-P中的突变状态。方法回顾性分析2017年1月至2022年3月华中科技大学附属同济医学院附属武汉市中心医院泌尿外科137例确诊为前列腺癌患者的临床资料,按照是否合并IDC-P分为IDC-P组和非IDC-P组,记录两组患者术前总前列腺特异性抗原(tPSA)水平、有无精囊侵犯、骨转移和淋巴结转移以及多参数磁共振成像分析前列腺成像报告和数据系统结节评分情况、临床T分期、Gleason评分并进行比较,同时统计BRCA1/2基因在IDC-P组中具有临床意义的突变情况。结果合并IDC-P患者15例,IDC-P在前列腺癌中的构成比为10.95%。IDC-P组具有更高的年龄(χ^(2)=29.57,P<0.05)、Gleason评分(χ^(2)=10.17,P<0.05)以及临床T分期(χ^(2)=15.20,P<0.05),更易发生骨转移(χ^(2)=4.20,P<0.05)和精囊侵犯(χ^(2)=12.83,P<0.05)。9例行前列腺根治性切除术的IDC-P患者术后BRCA1/2基因检测显示具有临床意义的突变均为阴性。1例根治术后的IDC-P患者出现了生化复发,并在治疗24个月后出现膀胱、直肠的侵犯;2例初诊时骨转移的患者治疗6个月内进展为转移性去势抵抗性前列腺癌。结论IDC-P通常具有更强的侵袭性以及更差的预后,局限性IDC-P患者积极行根治手术辅以新型内分泌治疗可使患者有更好的临床获益。 展开更多
关键词 前列腺导管内癌 诊断 预后 治疗 brca1/2基因
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BRCA1/2基因胚系变异意义未明位点的重新分析
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作者 方健飞 马政霄 +1 位作者 朱蕊 苏丹 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期1041-1045,共5页
目的BRCA1/2基因胚系变异按照风险等级分为5类,其中3类意义未明位点(variants of the uncertain significance,VUS)需要定期复核。探索变异证据的更新对变异分类的影响并指导携带有害VUS位点的患者进行临床诊疗。方法收集971例进行了BRC... 目的BRCA1/2基因胚系变异按照风险等级分为5类,其中3类意义未明位点(variants of the uncertain significance,VUS)需要定期复核。探索变异证据的更新对变异分类的影响并指导携带有害VUS位点的患者进行临床诊疗。方法收集971例进行了BRCA1/2基因胚系检测的患者(乳腺或卵巢癌),筛选出VUS位点128个。整合人群频率数据库、疾病数据库、计算机软件预测、共分离证据、等位基因证据及人群队列研究等证据,重新分析这些VUS位点,明确变异分类是否发生改变。结果142例肿瘤患者携带BRCA1/2基因VUS位点,占14.6%(142/971),变异位点数为128个,其中错义突变、同义突变、框内非移码突变和非编码区突变的比例分别为70.3%、4.7%、3.1%、21.9%。重新复核分析发现11.7%(15/128)的VUS位点可降级为2类,疑似良性。结论随着胚系变异相关证据的不断更新,VUS位点经再次复核后变异分类可能会有所改变。 展开更多
关键词 brca1/2基因 胚系变异 意义未明位点
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斑马鱼MIB1启动子及互作基因的功能富集分析
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作者 王凡 徐世明 +2 位作者 鄢雯 古同男 王宏娟 《国际检验医学杂志》 CAS 2023年第24期2963-2969,共7页
目的分析斑马鱼E3泛素蛋白连接酶1(MIB1)基因启动子区转录因子结合位点(TFBS),MIB1互作基因和互作蛋白的种类及其在信号通路中的作用,探讨MIB1基因的调控方式及潜在功能。方法利用国家基因组科学数据中心(NGDC)预测非编码RNA(ncRNA),利... 目的分析斑马鱼E3泛素蛋白连接酶1(MIB1)基因启动子区转录因子结合位点(TFBS),MIB1互作基因和互作蛋白的种类及其在信号通路中的作用,探讨MIB1基因的调控方式及潜在功能。方法利用国家基因组科学数据中心(NGDC)预测非编码RNA(ncRNA),利用Alggen与AnimalTFDB在线网站预测MIB1基因TFBS种类,使用GeneMANIA与STRING分析MIB1的互作基因与互作蛋白;通过DAVID网站获取相关数据,进行基因本体(GO)可视化分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)代谢通路分析。结果MIB1基因启动子区及5′非翻译区可转录出ncRNA;通过预测得到121种TFBS,并发现P53转录因子既可以结合到MIB1基因的启动子区又可与MIB1蛋白相互作用;在线预测出6种MIB1的共表达基因,筛选出20种互作基因;通过GO可视化分析发现,MIB1及其互作基因在生物过程方面具有调控细胞、组织、器官生长分化及调节NOTCH信号通路等功能,且主要在细胞质核周区、细胞膜和突触后密集区等部位被富集,具有结合NOTCH蛋白、PDZ结构域蛋白等分子功能;KEGG代谢通路分析发现,MIB1及其互作基因涉及4条代谢途径。结论MIB1包含多种TFBS,并通过与特定转录因子的相互作用,影响细胞癌变、免疫调节等多种生物学过程。MIB1还可能通过其互作基因和互作蛋白的介导,在细胞生长调控、造血干细胞分化、胚胎发育及神经元信息的传递等方面发挥重要作用。 展开更多
关键词 生物信息学 E3泛素蛋白连接酶1 启动子 转录因子结合位点 互作基因
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BRCA1基因与肺腺癌免疫细胞浸润和预后的关系
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作者 骆许静 孙桢 +1 位作者 马耀先 方晓瑞 《实用癌症杂志》 2024年第1期51-55,共5页
目的探讨乳腺癌易感基因(BRCA1)与肺腺癌免疫细胞浸润和预后的关系。方法收集68例手术切除新鲜肺腺癌组织与癌旁肺组织(>癌组织边缘10 cm)标本,qRT-PCR检测BRCA1mRNA水平与免疫组化BRCA1基因表达;采用Oncomine数据库、Kaplan-meier P... 目的探讨乳腺癌易感基因(BRCA1)与肺腺癌免疫细胞浸润和预后的关系。方法收集68例手术切除新鲜肺腺癌组织与癌旁肺组织(>癌组织边缘10 cm)标本,qRT-PCR检测BRCA1mRNA水平与免疫组化BRCA1基因表达;采用Oncomine数据库、Kaplan-meier Plotter数据库、TIMER数据库分析BRCA1基因与肺腺癌免疫细胞浸润和预后的关系。结果采用Oncomine数据库分析显示肺腺癌(LUAD)中BRCA1基因水平高于癌旁组织(P<0.05),qRT-PCR检测结果显示肺腺癌组织中BRCA1 mRNA表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05);TIMER数据库分析,BRCA1表达与中心粒细胞(γ=0.147,P=1.28×10-3)浸润水平具有强相关性,但与B细胞(γ=-0.09,P=4.73×10^(-2))、CD8+T细胞(γ=0.047,P=3.00×10^(-1))、CD4+T细胞(γ=0.039,P=3.91×10^(-1))、巨噬细胞(γ=-0.038,P=4.05×10^(-1))、及树突状细胞(γ=0.039,P=3.85×10^(-1))无相关性;Kaplan-meier Plotter数据库分析,BRCA1基因高表达肺腺癌患者总生存期、无病生存率低于低表达肺腺癌患者,差异有统计学意义(P<0.05)。结论BRCA1基因及mRNA在肺腺癌组织中呈高表达;BRCA1基因与患者不良预后及中性粒细胞免疫浸润密切相关。 展开更多
关键词 肺腺癌 brca1基因 免疫细胞浸润 预后
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