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烟草BTB/POZ蛋白家族的鉴定及其在抗马铃薯Y病毒中的作用
1
作者
张劭文
赵天伦
+2 位作者
肖钦之
祝水金
陈进红
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期295-307,共13页
马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)侵染烟草(Nicotiana tabacum)会引起烟草脉带病,造成烟叶品质下降。broad complex,tramtrack,and bric-à-brac/pox virus and zinc finger(BTB/POZ)是动植物体内广泛存在的蛋白质家族,在植物生长...
马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)侵染烟草(Nicotiana tabacum)会引起烟草脉带病,造成烟叶品质下降。broad complex,tramtrack,and bric-à-brac/pox virus and zinc finger(BTB/POZ)是动植物体内广泛存在的蛋白质家族,在植物生长和发育的各个环节都起着非常重要的作用。本研究鉴定到90个烟草BTB/POZ家族蛋白,对应71个基因。在这些蛋白质的序列中,识别到9种保守基序(motif),并根据其出现顺序将BTB/POZ家族成员划分至6个亚家族。结构域分析表明,BTB/POZ同一亚家族成员的结构域具有一致性。对BTB/POZ蛋白的三维构象进行预测发现,所有亚家族成员结构都以α螺旋为主,同一亚家族成员的三维构象相似。烟草品种K326和突变体M867(抗PVY)的BTB/POZ家族基因表达模式分析显示,叶片接种PVY后,NtBTB2M、NtBTB2K、NtBTB2L、NtBTB6E基因的表达丰度显著增加,这可能与烟草M867对PVY的抗性较强有关。顺式作用元件分析显示,NtBTB2K、NtBTB2L、NtBTB2M和NtBTB6E基因的上游2000 bp区域内含有若干逆境响应相关元件,包括水杨酸响应元件、MYB结合位点等,可能和这些基因的上调表达有关。本研究为BTB/POZ蛋白的功能研究提供了理论依据,为烟草抗病育种提供了一定参考。
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关键词
烟草
btb/poz家族
保守基序
顺式作用元件
下载PDF
职称材料
玉米BTB家族基因的鉴定与表达规律分析
被引量:
2
2
作者
刘鹏飞
张康
+6 位作者
李玉琦
周帆
白华
藏金萍
曹宏哲
邢继红
董金皋
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期268-281,共14页
本研究利用生物信息学方法对玉米BTB家族基因进行系统发育、保守结构域、组织特异性以及在玉米抵抗生物和非生物胁迫过程中的表达规律进行分析。发现玉米70个BTB家族蛋白除AC206223.3外均含有保守的BTB结构域,可分为11个亚家族。玉米BT...
本研究利用生物信息学方法对玉米BTB家族基因进行系统发育、保守结构域、组织特异性以及在玉米抵抗生物和非生物胁迫过程中的表达规律进行分析。发现玉米70个BTB家族蛋白除AC206223.3外均含有保守的BTB结构域,可分为11个亚家族。玉米BTB家族基因具有明显的组织表达特性,在高温、低温、紫外、高盐和干旱胁迫下以及拟轮枝镰孢(Fusarium verticillioide)侵染过程中的表达水平呈现出明显的差异。BTB-TAZ亚家族基因在水杨酸、茉莉酸、乙烯处理后表达水平发生明显的变化。结果表明BTB家族基因在玉米抵抗生物和非生物胁迫中发挥重要的作用,为阐明玉米BTB家族基因的功能及其机制奠定了基础。
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关键词
玉米
btb/poz家族
生物胁迫
非生物胁迫
表达分析
原文传递
题名
烟草BTB/POZ蛋白家族的鉴定及其在抗马铃薯Y病毒中的作用
1
作者
张劭文
赵天伦
肖钦之
祝水金
陈进红
机构
浙江大学农业与生物技术学院
浙江大学海南研究院
浙江省作物种质资源重点实验室
湖南省烟草公司永州市公司
出处
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期295-307,共13页
基金
国有企业委托项目(K横20200424)。
文摘
马铃薯Y病毒(potato virus Y,PVY)侵染烟草(Nicotiana tabacum)会引起烟草脉带病,造成烟叶品质下降。broad complex,tramtrack,and bric-à-brac/pox virus and zinc finger(BTB/POZ)是动植物体内广泛存在的蛋白质家族,在植物生长和发育的各个环节都起着非常重要的作用。本研究鉴定到90个烟草BTB/POZ家族蛋白,对应71个基因。在这些蛋白质的序列中,识别到9种保守基序(motif),并根据其出现顺序将BTB/POZ家族成员划分至6个亚家族。结构域分析表明,BTB/POZ同一亚家族成员的结构域具有一致性。对BTB/POZ蛋白的三维构象进行预测发现,所有亚家族成员结构都以α螺旋为主,同一亚家族成员的三维构象相似。烟草品种K326和突变体M867(抗PVY)的BTB/POZ家族基因表达模式分析显示,叶片接种PVY后,NtBTB2M、NtBTB2K、NtBTB2L、NtBTB6E基因的表达丰度显著增加,这可能与烟草M867对PVY的抗性较强有关。顺式作用元件分析显示,NtBTB2K、NtBTB2L、NtBTB2M和NtBTB6E基因的上游2000 bp区域内含有若干逆境响应相关元件,包括水杨酸响应元件、MYB结合位点等,可能和这些基因的上调表达有关。本研究为BTB/POZ蛋白的功能研究提供了理论依据,为烟草抗病育种提供了一定参考。
关键词
烟草
btb/poz家族
保守基序
顺式作用元件
Keywords
Nicotiana tabacum
btb/
poz
family
conserved motif
cis-acting element
分类号
S330 [农业科学—作物遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
玉米BTB家族基因的鉴定与表达规律分析
被引量:
2
2
作者
刘鹏飞
张康
李玉琦
周帆
白华
藏金萍
曹宏哲
邢继红
董金皋
机构
河北省植物生理与分子病理学重点实验室/河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室
出处
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期268-281,共14页
基金
粮食丰产增效科技创新专项(2016YFD0300704)
国家玉米产业技术体系(CARS-02-12)。
文摘
本研究利用生物信息学方法对玉米BTB家族基因进行系统发育、保守结构域、组织特异性以及在玉米抵抗生物和非生物胁迫过程中的表达规律进行分析。发现玉米70个BTB家族蛋白除AC206223.3外均含有保守的BTB结构域,可分为11个亚家族。玉米BTB家族基因具有明显的组织表达特性,在高温、低温、紫外、高盐和干旱胁迫下以及拟轮枝镰孢(Fusarium verticillioide)侵染过程中的表达水平呈现出明显的差异。BTB-TAZ亚家族基因在水杨酸、茉莉酸、乙烯处理后表达水平发生明显的变化。结果表明BTB家族基因在玉米抵抗生物和非生物胁迫中发挥重要的作用,为阐明玉米BTB家族基因的功能及其机制奠定了基础。
关键词
玉米
btb/poz家族
生物胁迫
非生物胁迫
表达分析
Keywords
Zea mays
btb/
poz
family
biotic stress
abiotic stress
expression analysis
分类号
S432.1 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
烟草BTB/POZ蛋白家族的鉴定及其在抗马铃薯Y病毒中的作用
张劭文
赵天伦
肖钦之
祝水金
陈进红
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
玉米BTB家族基因的鉴定与表达规律分析
刘鹏飞
张康
李玉琦
周帆
白华
藏金萍
曹宏哲
邢继红
董金皋
《植物病理学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
2
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