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免疫调节分子 BTN2A2结构及其在肺癌表达的分析
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作者 杨文江 何雪萍 +2 位作者 黄佑娇 胡蓉 苏敏 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期1550-1566,共17页
本研究旨在通过生物信息学方法,结合对人体的肿瘤组织切片进行免疫组织化学检测,分析免疫调节分子BTN2A2(butyrophilin subfamily 2 member A2)结构及其在肿瘤组织中的表达,为研究BTN2A2分子的免疫调节功能提供理论和实验支撑。序列分... 本研究旨在通过生物信息学方法,结合对人体的肿瘤组织切片进行免疫组织化学检测,分析免疫调节分子BTN2A2(butyrophilin subfamily 2 member A2)结构及其在肿瘤组织中的表达,为研究BTN2A2分子的免疫调节功能提供理论和实验支撑。序列分析表明,BTN2A2具有IgV样结构域,与B7家族分子具有序列同源性和结构相似性。系统发育树分析表明,BTN2A2和已知B7家族分子之间具有亲缘性。通过I-TASSER成功构建BTN2A2蛋白三维晶体结构模型,hBTN2A2配体为Cys,配体结合位点相应氨基酸残基分别为Arg-54、His-56、Ser-111、Val-112和Ala-113。蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)方法表明,存在10个与BTN2A2相关的分子,其中CD4和CD8与T细胞免疫相关。ZDOCK分析表明,BTN2A2确实可以与T细胞表面CD4和CD8分子结合。ClusterProfiler分析表明,BTN2A2和相关分子主要集中在原发性免疫缺陷、抗原加工和呈递、T细胞受体信号通路等免疫调节方面。流式细胞术(flow cytometry,FCM)分析进一步表明,BTN2A2蛋白与T细胞表面CD4和CD8分子间存在相互作用,且BTN2A2蛋白可抑制CD4^(+)和CD8^(+)T细胞增殖和活化(P<0.001)。免疫组织化学染色显示,hBTN2A2在人肺癌、肝癌、肾癌和食管癌组织中的表达高于正常组织,而在卵巢癌组织未见表达(P<0.05);PrognoScan数据库和Kaplan-Meier曲线进行肺癌患者生存分析表明,hBTN2A2高表达的患者预后良好(P<0.001);TIMER数据库分析表明,肺癌中hBTN2A2表达水平与免疫细胞浸润呈正相关关系;GEPIA数据库分析显示,肺癌中hBTN2A2表达主要与CD8^(+)T细胞、CD3^(+)T细胞、树突状细胞(dendritic cell,DC)、辅助性T细胞(helper T cell,Th)1等免疫细胞浸润有关(P<0.001)。研究结果为免疫调节分子BTN2A2结构和功能性表达的深入研究提供了理论基础。 展开更多
关键词 生物信息学 btn2a2 肺癌
原文传递
嗜乳脂蛋白基因在肺腺癌中的功能及预后作用:多组学融合与生存分析 被引量:2
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作者 齐鑫 陈圣伦 +2 位作者 左嘉晨 闫东辉 陈佳佳 《电子科技大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第6期828-836,共9页
肺腺癌是最常见的肺癌类型,具有侵袭性强、进展速度快和致命性强的特点,已成为世界范围内亟待解决的公共卫生问题。最新的研究显示,嗜乳脂蛋白(BTNs)基因家族在免疫调节过程中发挥着关键的作用,但其在肺腺癌中的功能尚未明确。该研究采... 肺腺癌是最常见的肺癌类型,具有侵袭性强、进展速度快和致命性强的特点,已成为世界范围内亟待解决的公共卫生问题。最新的研究显示,嗜乳脂蛋白(BTNs)基因家族在免疫调节过程中发挥着关键的作用,但其在肺腺癌中的功能尚未明确。该研究采用多组学融合与生存分析方法,对BTNs家族基因作为肺腺癌预后生物标志物的潜能进行了分析。研究结果显示,该基因家族中的BTN2A2和BTNL9在肺腺癌癌症组织中的表达水平均显著降低(P <0.05),且分别与患者的总体生存时间显著相关(P<0.05)。另外,BTN2A2和BTNL9的表达水平分别与B细胞、巨噬细胞和调节性T细胞的浸润水平显著正相关(P<0.05),与BTN2A2共表达的基因在T细胞激活、细胞因子结合、MHC蛋白复合体结合等条目中显著富集,与BTNL9共表达的基因在细胞周期、DNA复制相关的条目中显著富集(adjust.P<0.05)。因此,BTN2A2和BTNL9的低表达分别与肺腺癌患者的总体生存率低密切相关,是肺腺癌患者潜在的预后生物标志物。 展开更多
关键词 btn2a2 BTNL9 嗜乳脂蛋白 免疫浸润 肺腺癌 预后
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