BUB1B与胰腺癌的发生、免疫浸润细胞及预后的相关性分析

目的:利用在线数据库和生物信息学的方法,研究BUB1B在胰腺腺癌(pancreatic adenocarcinoma,PAAD)组织中的表达水平及与预后和免疫细胞浸润的相关性。方法:利用GEPIA数据库分析BUB1B在各种癌症中的表达情况;GEPIA、Kaplan-Meier Plotter数据库检索BUB1B的表达与PAAD患者预后的相关性;随后利用String数据库构建BUB1B共表达基因的蛋白互作网络,并用David数据库分析其GO生物学功能及KEGG信号通路;最后使用TIMER数据库分析BUB1B基因的表达与免疫浸润细胞之间的相关性。结果:在PADD组织中,BUB1B表达水平高于正常组织(P<0.01);BUB1B的高转录水平与性别、年龄、种族、肥胖状况、饮酒习惯、慢性胰腺炎、淋巴转移和癌症阶段密切相关(P<0.05);BUB1B mRNA表达水平与PAAD预后和免疫细胞浸润相关(P<0.05)。结论:BUB1B在PADD中高表达,与PAAD预后、免疫浸润相关,可作为胰腺癌诊断、预后、药物治疗的潜在标志物。

肺腺癌患者血清BUB1B表达水平与其临床病理特征和预后的相关性

目的探讨肺腺癌患者血清BUB1B的表达水平与其临床病理特征和预后的相关性。方法选取2012年1月至2015年12月泰州市人民医院内科收治的100例肺腺癌患者作为肺腺癌组,同期选择100例健康体检者作为对照组,采用酶联免疫吸附测定法检测两组血清BUB1B水平并进行比较,分析导致BUB1B表达差异的影响因素;评估BUB1B预测肺腺癌患者预后的最佳临界值以及不同BUB1B水平肺腺癌患者的化疗疗效及预后。结果治疗前,肺腺癌组血清BUB1B水平明显高于对照组[(145.8±11.8)μg/L比(21.0±3.3)μg/L](P<0.01)。利用受试者工作特征(ROC)曲线分析预测效果显示,曲线下面积为0.804(95%CI 0.757~0.851,P<0.001),最佳临界值为148.05μg/L,特异度为91.00%(91/100),灵敏度为81.00%(81/100)。根据ROC曲线将肺腺癌组患者分为高表达组(BUB1B≥148.05μg/L,43例)和低表达组(BUB1B<148.05μg/L,57例),结果显示,低表达组患者治疗总有效率明显高于高表达组[63.16%(36/57)比18.60%(8/43)](P<0.01)。治疗后BUBIB高表达组患者中位生存时间明显低于低表达组(3.475个月比5.904个月)(P<0.01)。Logistic回归分析显示,TNM分期及肿瘤大小是BUB1B高低表达的影响因素(P<0.05)。结论晚期肺腺癌患者血清BUB1B表达水平明显升高,且血清BUB1B水平可用于肺腺癌化疗效果和预后的评估。

BUB1B在肺鳞状细胞癌中的表达及其意义

目的:探究纺锤体装配检查点蛋白家族成员BUB1B在肺鳞状细胞癌(LUSC)中的表达及其意义。方法:收集基因表达综合数据库(GEO)、癌症基因组图谱(TCGA)数据库中BUB1B在LUSC中的表达值,通过计算标准化均数差(SMD)及绘制综合受试者工作特征曲线(sROC),综合分析BUB1B mRNA在公共数据集中的表达情况,用实时荧光定量聚合酶链式反应(RTqPCR)验证BUB1B在LUSC细胞系(NCI-H2170)与人正常肺上皮细胞系(BEAS-2B)中BUB1B mRNA的表达,免疫组化技术(IHC)验证61例LUSC组织和对应54例癌旁/正常肺组织中BUB1B蛋白的表达情况,搜索癌症中的增强子RNA(eRic)数据库在LUSC中与BUB1B表达相关增强子RNA(eRNA),RT-qPCR验证eRNA在NCI-H2170和BEAS-2B中mRNA的表达。结果:BUB1B mRNA在公共数据集中均呈现出在LUSC组织中的高表达趋势(P<0.05)。BUB1B在LUSC细胞系中的表达高于人正常肺上皮细胞系(P<0.05)。BUB1B蛋白在LUSC组织中高表达(P<0.05),且在原发肿瘤大小、临床分期中的差异表达具有统计学意义(P<0.05),在性别、年龄、淋巴结转移、远处转移、分化程度、吸烟史中的差异表达无统计学意义(P>0.05)。ENSR00000075512在LUSC组织中与BUB1B表达相关,且ENSR00000075512 RNA在LUSC细胞系中的表达高于人正常肺上皮细胞系(P<0.05)。结论:BUB1B在LUSC中高表达,可能通过与ENSR00000075512相互作用参与LUSC的发生发展。

BUB1B在原发性肝癌中的表达及对肝癌细胞增殖和侵袭的影响

目的探究纺锤体检测蛋白BUB1B在原发性肝癌(HCC)患者中的表达及临床意义,并研究其在体外对肝癌细胞增殖和侵袭的影响。方法收集GEO数据库中HCC患者(GSE121248)的临床以及基因表达信息,通过生物信息学分析筛选差异表达基因,设计针对BUB1B基因的小干扰RNA载体,通过沉默BUB1B基因表达验证其在肝癌细胞增殖以及侵袭中的影响。利用实时荧光定量PCR检测沉默效率,通过细胞增殖实验以及划痕实验分别检测该基因在肝癌细胞增殖以及侵袭中的作用。利用KM-plotter数据库分析BUB1B基因表达高低对HCC患者预后的影响。结果沉默序列1和2能够有效地沉默BUB1B基因的mRNA水平表达(t=8.41,P=0.001;t=10.43, P <0.001),沉默BUB1B表达的肝癌细胞系HepG2的增殖能力减弱(t=13.94,P <0.001),肝癌细胞8 h的侵袭能力同样减小(t=14.94,P <0.001)。高表达BUB1B基因的HCC患者(n=127)生存率差于低表达BUB1B基因的HCC患者(n=237)[HR=2.01(1.42～2.86),P=6.6×10^(-5)],进一步分析发现,在有肝炎病毒感染史的HCC患者(n=150)中,BUB1B基因表达高低对预后没有影响[HR=1.88(0.89～3.99), P=0.093],只有在未感染肝炎病毒的HCC患者(n=167)中可以作为预测预后的分子标志物[HR=2.84(1.75～4.61), P=1.1×10^(-5)]。结论BUB1B基因在HCC患者中高表达,促进肝癌细胞增殖以及侵袭,在未感染肝炎病毒的HCC患者中,可以作为预测预后的潜在分子标志物。

纺锤体检测点蛋白BUB1B在胃癌组织中的表达及意义

目的检测胃癌组织中纺锤体检测点蛋白BUB1B的表达,探究BUB1B在胃癌发生中的重要意义。方法采用荧光实时定量PCR检测30例胃癌组织及17例癌旁正常组织中BUB1B mRNA水平表达;免疫组织化学检测BUB1B在胃癌组织及癌旁组织中BUB1B蛋白的表达情况。结果在mRNA水平,BUB1B在胃癌组织中的表达明显高于癌旁正常组织,近(8.875±1.08)倍;免疫组织化学结果显示,胃癌组织中BUB1B的表达明显高于癌旁正常组织。按照评分标准统计显示,癌旁组织BUB1B表达均值为(92.12±12.99),胃癌组织表达均值为(133.39±8.49),两者之间存在明显差异(P<0.05)。且BUB1B表达与TNM分期相关,但与淋巴结转移,年龄,肿瘤大小及有无家族史无明显相关。结论 BUB1B的过表达在胃癌发生发展中起重要作用,为探索肿瘤发生机制及寻找更为有效的治疗提供新的思路。

BUB1B在肾透明细胞癌免疫细胞和预后中的作用

目的研究纺锤体装配检查点蛋白家族成员BUB1B在肾透明细胞癌(KIRC)患者中的预后价值、潜在的生物学功能和对免疫浸润细胞的影响。方法用基因表达谱交互(GEPIA)分析BUB1B在KIRC中的表达水平以及对患者生存的影响。用R软件分析癌症基因组图谱(TCGA)中KIRC的数据,采用单因素Cox和多因素Cox分析比较其临床特征和总生存期的关联。通过CIBERSORT计算分析在KIRC中BUB1B和22种免疫浸润细胞之间的关系,使用TIMER数据库研究BUB1B与几种免疫细胞含量的相关性。另外,对BUB1B进行基因功能富集分析(GSEA)。使用GEO和UALCAN数据库进行外部验证。结果GEPIA分析结果表明,BUB1B在KIRC患者中显著高表达且具有更差的预后;临床相关性分析显示,BUB1B表达升高与年龄、分期显著相关,且可作为独立预后因子;TIMER分析结果表明,在KIRC中,BUB1B表达水平与6种免疫细胞浸润水平均呈显著正相关,通过CIBERSORT计算分析发现,KIRC中有多种免疫细胞存在显著差异;通过基因功能富集分析发现,BUB1B与免疫和癌症中的多条通路密切相关。由GEO外部数据集和UALCAN数据库分析得出,BUB1B在KIRC患者中显著高表达并有更差的预后生存曲线,与之前GEPIA数据库的结论一致。结论BUB1B可作为KIRC新的预后生物标志物和免疫治疗靶点。

一例镶嵌非整倍杂色体综合征患儿临床特征及基因变异分析

目的 分析1例镶嵌非整倍杂色体综合征(mosaic variegated aneuploidy syndrome,MVA)患儿的临床特征、基因变异特点,探讨其分子遗传学发病机制.方法 对1例MVA患儿进行染色体核型分析及全外显子测序.结果 外周血淋巴细胞核型分析显示患儿的非整倍染色体细胞占54.5%(6/11);测序结果显示患儿BUB1B基因编码区存在c.826delG(p.Asp276Metfs?21)、c.2441G>A(p.Arg814His)复合杂合变异;患儿父亲携带c.826delG(p.Asp276 Metfs?21)杂合变异,母亲携带c.2441G>A(p.Arg814His)杂合变异,患儿的变异分别源自其父亲和母亲.经检索HGMD专业版数据库c.826delG(p.Asp276Metfs?21)变异为未报道过的新变异,c.2441G>A(p.R814H)变异为已报道与MVA相关的变异.结论 BUB1B基因c.826delG和c.2441G>A变异是该患儿的致病原因.