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2017-2019年贵州省BV系流感病毒的分子特征分析
1
作者
万永虎
任丽娟
+6 位作者
郑勤妮
庄丽
蒋维佳
雷明玉
李世军
牟鸿江
郭华
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期366-373,共8页
目的了解贵州省BV系流感暴发疫情和重症病例毒株的分子特征,探讨其特异性分子靶标,为流感的防控提供依据。方法选取贵州省2017-2019年BV系流感暴发疫情、重症病例和普通流行毒株,经基因组的提取、HA和NA基因的扩增与测序,与参考株一起...
目的了解贵州省BV系流感暴发疫情和重症病例毒株的分子特征,探讨其特异性分子靶标,为流感的防控提供依据。方法选取贵州省2017-2019年BV系流感暴发疫情、重症病例和普通流行毒株,经基因组的提取、HA和NA基因的扩增与测序,与参考株一起进行分子特征分析。结果贵州省所有毒株HA和NA基因进化树拓扑结构类似,整体上毒株处于3个分支,2017年的毒株聚集为一簇,2018年的分散存在,2019年的处于两个分支且相对较远,绝大部分暴发疫情毒株和重症病例毒株均处于分支1。贵州省所有毒株同疫苗株B/Colorado/06/2017 HA和NA基因同源性最高,分别为98.6%~99.3%和98.9%~99.4%;2017年BV系毒株间HA和NA基因同源性分别为99.9%和99.9%~100%,2018年分别为98.4%~99.3%和98.7%~99.1%,2019年分别为97.7%~100%和98.4%~99.9%,其中2019年分支2中的毒株间同源性分别为99.4%~100%和99.6%~99.9%,分支1中的分别为99.5%~100%和99.3%~99.9%,所有暴发疫情、重症病例毒株同当年度普通流行毒株之间同源性均高于99.4%;与疫苗株B/Colorado/06/2017相比所有毒株HA基因均存在S14N、G144D、V195I、K513R的突变,NA基因均存在Q371K、D490N的突变;2019年分支1中的毒株HA基因存在G148R、K151E和T563A以及NA基因存在A395T的特异性位点突变;分支2中的毒株HA基因存在V394I和NA基因存在V71A、K343E、A395V和V401I的特异性位点突变。同时,分支1中的毒株HA基因与疫苗株B/Brisbane/60/2008相比存在179-181KND的特异性缺失突变,与B/Colorado/06/2017相比存在181D的特异性缺失突变和150环的抗原位点突变。结论贵州省BV系暴发疫情毒株之间存在一定的差距,但暴发疫情毒株与普通流行毒株之间亲缘关系和同源性较高,2019年存在两个分支群系毒株的流行,且暴发疫情、重症病例毒株主要以分支1中的毒株流行为主;贵州省暴发疫情、重症病例毒株存在多个位点的特异性突变和缺失突变,应进一步加强分子特征的实时监测和致病力相关的特异性分子靶标研究。
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关键词
bv系流感
暴发疫情
HA和NA基因
分子特征
下载PDF
职称材料
一起学校聚集性感染乙型Victoria系流感病毒的全基因组测序分析
2
作者
张涛
张亮
+1 位作者
谢运清
龙琳
《中国卫生检验杂志》
CAS
2023年第3期316-319,共4页
目的 对枣庄市1起学校乙型Victoria系(BV系)流感聚集性疫情的病原学和遗传特征进行分析,为BV系流感的防控提供参考依据。方法 收集13例患者的咽拭子标本进行核酸检测和病毒分离,对毒株进行全基因组测序,利用生物信息学软件构建进化树并...
目的 对枣庄市1起学校乙型Victoria系(BV系)流感聚集性疫情的病原学和遗传特征进行分析,为BV系流感的防控提供参考依据。方法 收集13例患者的咽拭子标本进行核酸检测和病毒分离,对毒株进行全基因组测序,利用生物信息学软件构建进化树并分析分子进化特征。结果 引起本次学校聚集性感染的病原体为BV系流感病毒,核酸阳性率为76.92%(10/13),分离毒株5株。与疫苗株B/Washington/02/2019相比,核苷酸同源性为98.4%~99.6%。血凝素(HA)进化树中5株BV系毒株与疫苗株B/Washington/02/2019共同归属于1A分支。HA蛋白9个氨基酸位点发生置换,其中6个位点发生在抗原决定簇,未发现神经氨酸酶(NA)抑制剂耐药位点和酸性聚合酶(PA)抑制剂耐药位点发生变异。HA均发生N197D置换,M1均发生T15I置换,多个蛋白的磷酸化位点发生改变。结论 引起枣庄市学校聚集性疫情的病原体是BV系流感病毒,应加强学校疫情监测并督促防控措施落实。
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关键词
bv系流感
病毒
血凝素
全基因组分析
原文传递
题名
2017-2019年贵州省BV系流感病毒的分子特征分析
1
作者
万永虎
任丽娟
郑勤妮
庄丽
蒋维佳
雷明玉
李世军
牟鸿江
郭华
机构
贵州省疾病预防控制中心
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第4期366-373,共8页
基金
贵州省科技计划基金项目(No.黔科合基础[2020]1Y360)
贵州省卫生健康委科学技术基金项目(No.gzwjkj2019-2-002)
贵州省菌(毒)种和生物样本保藏研究及其资源应用(No.黔科合支撑[2020]4Y216)联合资助。
文摘
目的了解贵州省BV系流感暴发疫情和重症病例毒株的分子特征,探讨其特异性分子靶标,为流感的防控提供依据。方法选取贵州省2017-2019年BV系流感暴发疫情、重症病例和普通流行毒株,经基因组的提取、HA和NA基因的扩增与测序,与参考株一起进行分子特征分析。结果贵州省所有毒株HA和NA基因进化树拓扑结构类似,整体上毒株处于3个分支,2017年的毒株聚集为一簇,2018年的分散存在,2019年的处于两个分支且相对较远,绝大部分暴发疫情毒株和重症病例毒株均处于分支1。贵州省所有毒株同疫苗株B/Colorado/06/2017 HA和NA基因同源性最高,分别为98.6%~99.3%和98.9%~99.4%;2017年BV系毒株间HA和NA基因同源性分别为99.9%和99.9%~100%,2018年分别为98.4%~99.3%和98.7%~99.1%,2019年分别为97.7%~100%和98.4%~99.9%,其中2019年分支2中的毒株间同源性分别为99.4%~100%和99.6%~99.9%,分支1中的分别为99.5%~100%和99.3%~99.9%,所有暴发疫情、重症病例毒株同当年度普通流行毒株之间同源性均高于99.4%;与疫苗株B/Colorado/06/2017相比所有毒株HA基因均存在S14N、G144D、V195I、K513R的突变,NA基因均存在Q371K、D490N的突变;2019年分支1中的毒株HA基因存在G148R、K151E和T563A以及NA基因存在A395T的特异性位点突变;分支2中的毒株HA基因存在V394I和NA基因存在V71A、K343E、A395V和V401I的特异性位点突变。同时,分支1中的毒株HA基因与疫苗株B/Brisbane/60/2008相比存在179-181KND的特异性缺失突变,与B/Colorado/06/2017相比存在181D的特异性缺失突变和150环的抗原位点突变。结论贵州省BV系暴发疫情毒株之间存在一定的差距,但暴发疫情毒株与普通流行毒株之间亲缘关系和同源性较高,2019年存在两个分支群系毒株的流行,且暴发疫情、重症病例毒株主要以分支1中的毒株流行为主;贵州省暴发疫情、重症病例毒株存在多个位点的特异性突变和缺失突变,应进一步加强分子特征的实时监测和致病力相关的特异性分子靶标研究。
关键词
bv系流感
暴发疫情
HA和NA基因
分子特征
Keywords
influenza
bv
lineage virus
outbreak
HA and NA genes
molecular characteristics
分类号
S855.2 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
一起学校聚集性感染乙型Victoria系流感病毒的全基因组测序分析
2
作者
张涛
张亮
谢运清
龙琳
机构
枣庄市疾病预防控制中心
出处
《中国卫生检验杂志》
CAS
2023年第3期316-319,共4页
基金
枣庄市科技发展计划项目(2021NS57)。
文摘
目的 对枣庄市1起学校乙型Victoria系(BV系)流感聚集性疫情的病原学和遗传特征进行分析,为BV系流感的防控提供参考依据。方法 收集13例患者的咽拭子标本进行核酸检测和病毒分离,对毒株进行全基因组测序,利用生物信息学软件构建进化树并分析分子进化特征。结果 引起本次学校聚集性感染的病原体为BV系流感病毒,核酸阳性率为76.92%(10/13),分离毒株5株。与疫苗株B/Washington/02/2019相比,核苷酸同源性为98.4%~99.6%。血凝素(HA)进化树中5株BV系毒株与疫苗株B/Washington/02/2019共同归属于1A分支。HA蛋白9个氨基酸位点发生置换,其中6个位点发生在抗原决定簇,未发现神经氨酸酶(NA)抑制剂耐药位点和酸性聚合酶(PA)抑制剂耐药位点发生变异。HA均发生N197D置换,M1均发生T15I置换,多个蛋白的磷酸化位点发生改变。结论 引起枣庄市学校聚集性疫情的病原体是BV系流感病毒,应加强学校疫情监测并督促防控措施落实。
关键词
bv系流感
病毒
血凝素
全基因组分析
Keywords
Influenza virus of the
bv
lineage
Hemagglutinin
Genome-wide analysis
分类号
R373.1 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2017-2019年贵州省BV系流感病毒的分子特征分析
万永虎
任丽娟
郑勤妮
庄丽
蒋维佳
雷明玉
李世军
牟鸿江
郭华
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
2
一起学校聚集性感染乙型Victoria系流感病毒的全基因组测序分析
张涛
张亮
谢运清
龙琳
《中国卫生检验杂志》
CAS
2023
0
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已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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