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Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶结构域位移对脂肽合成的影响
1
作者
张平
陈美容
+5 位作者
马文杰
陆兆新
吕紫岩
吕凤霞
赵海珍
别小妹
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期169-178,共10页
[目的]本文旨在研究解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系非核糖体肽合成酶(NRPS)硫酯酶TE结构域位移对脂肽合成的影响。[方法]通过温敏型质粒pKS2介导的同源重组将fmbJ菌株中Bacillomycin D合...
[目的]本文旨在研究解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系非核糖体肽合成酶(NRPS)硫酯酶TE结构域位移对脂肽合成的影响。[方法]通过温敏型质粒pKS2介导的同源重组将fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶TE结构域分别前移至模块5和模块6末端,然后对fmbJ突变菌株的发酵产物进行高效液相色谱(HPLC)、液相质谱(LC-MS)以及黄曲霉菌抑菌试验分析,并且使用AlphaFold蛋白结构数据库预测NRPS合成酶系末端PCP-TE双结构域的三维结构,以及分析双结构与两者之间的相互作用关系。[结果]在突变菌株fmbJ-M5-TELong的发酵液中检测出线性脂五肽(C14-15β-NH2FA-Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu)和环状脂五肽[C14-15β-NH2FA(Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu)],在突变菌株fmbJ-M6-TELong的发酵液中检测出线性脂六肽(C14-17β-NH2FA-Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu-Ser)和环状脂六肽[C12-14,16-17β-NH2FA(Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu-Ser)]等新型脂肽。此外,NRPS硫酯酶TE结构域易位前移后,PCP-TE双结构域蛋白的构象和相对作用力发生变化,疏水相互作用界面缩小。[结论]fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶TE结构域位移导致发酵产物提前环化和水解,合成了截短的新型线性脂五肽、环状脂五肽、线性脂六肽和环状脂六肽等脂肽,为新型脂肽的开发提供了思路。
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关键词
bacilomycin
d
硫酯酶
同源重组
液相质谱(LC-MS)
蛋白三维结构
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职称材料
题名
Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶结构域位移对脂肽合成的影响
1
作者
张平
陈美容
马文杰
陆兆新
吕紫岩
吕凤霞
赵海珍
别小妹
机构
南京农业大学食品科学与技术学院
中国药科大学药学院
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期169-178,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31972174)。
文摘
[目的]本文旨在研究解淀粉芽胞杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系非核糖体肽合成酶(NRPS)硫酯酶TE结构域位移对脂肽合成的影响。[方法]通过温敏型质粒pKS2介导的同源重组将fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶TE结构域分别前移至模块5和模块6末端,然后对fmbJ突变菌株的发酵产物进行高效液相色谱(HPLC)、液相质谱(LC-MS)以及黄曲霉菌抑菌试验分析,并且使用AlphaFold蛋白结构数据库预测NRPS合成酶系末端PCP-TE双结构域的三维结构,以及分析双结构与两者之间的相互作用关系。[结果]在突变菌株fmbJ-M5-TELong的发酵液中检测出线性脂五肽(C14-15β-NH2FA-Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu)和环状脂五肽[C14-15β-NH2FA(Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu)],在突变菌株fmbJ-M6-TELong的发酵液中检测出线性脂六肽(C14-17β-NH2FA-Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu-Ser)和环状脂六肽[C12-14,16-17β-NH2FA(Asn-Tyr-Asn-Pro-Glu-Ser)]等新型脂肽。此外,NRPS硫酯酶TE结构域易位前移后,PCP-TE双结构域蛋白的构象和相对作用力发生变化,疏水相互作用界面缩小。[结论]fmbJ菌株中Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶TE结构域位移导致发酵产物提前环化和水解,合成了截短的新型线性脂五肽、环状脂五肽、线性脂六肽和环状脂六肽等脂肽,为新型脂肽的开发提供了思路。
关键词
bacilomycin
d
硫酯酶
同源重组
液相质谱(LC-MS)
蛋白三维结构
Keywords
bacilomycin d
thioesterase
homologous recombination
liqui
d
chromatography-mass spectrometry(LC-MS)
three-
d
imensional structure
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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出处
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1
Bacillomycin D合成酶系NRPS硫酯酶结构域位移对脂肽合成的影响
张平
陈美容
马文杰
陆兆新
吕紫岩
吕凤霞
赵海珍
别小妹
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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