野生黄唇鱼Bahaba flavolabiata肌肉和鳔营养成分的分析与评价

采用生物化学方法测定和分析了野生黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)肌肉和鳔的营养成分。黄唇鱼肌肉和鳔的营养成分都属于高蛋白、低脂肪类型。肌肉的必需氨基酸模式优于FAO/WHO的理想模式,氨基酸含量、必需氨基酸含量和鲜味氨基酸含量均较高,种类齐全。鳔的氨基酸组成较FAO/WHO的理想模式低,但其蛋白质含量高达35.90%,高于其他已报道的水产品,粗脂肪和粗灰分含量较低;氨基酸种类齐全且含量丰富,富含鲜味氨基酸;在氨基酸测定中发现了牛磺酸、γ-氨基丁酸、鸟氨酸和羟脯氨酸等4种具有重要生理功能的衍生氨基酸。肌肉和鳔的支/芳值均接近正常人的水平,不饱和脂肪酸含量较丰富,与饱和脂肪酸含量的比值分别为1.45和1.51,含有人体所必需的钙、钠、钾、镁、铁、铜、锌等元素。结果表明,黄唇鱼肌肉具有较高的营养价值,肌肉和鳔均属于优质的海产蛋白源。

黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)的全基因组测序和基因组特征研究

黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)为国家二级重点保护野生动物、IUCN(世界自然保护联盟)红色名录的极度濒危物种(CR)。基于其样本数量极其有限,全基因组研究可以提供大量与重要性状相关的功能基因和分子标记,从而揭示其重要生命现象的遗传机制。采用二代测序技术于2018年5月完成了黄唇鱼基因组精细图的测序,分析结果表明,测序得到约202 Gb的高质量数据,总测序深度约为317×;组装得到的基因组大小为637.43 Mb,Contig N50约为88 Kb,Scaffold N50约为4.65 Mb;重复序列约142.72 Mb,占比22.39%,预测得到23743个基因、920个t RNA、85个rRNA、176个假基因;98.46%的基因可以注释到NR、GO等数据库中;有67个基因家族是黄唇鱼所特有的。本研究从单碱基错误率、核心基因完整性及二代Reads比对分析3个方面对黄唇鱼基因组精细图的组装结果进行了评估,结果显示所组装的基因区的完整性较好。黄唇鱼基因组序列图谱的绘制完成,对于黄唇鱼自然资源的保护和种质资源挖掘具有极其重要的科学意义。

4种石首鱼耳石形态特征的比较

比较研究了黄唇鱼Bahaba flavolabiata、大黄鱼Pseudosciaena crocea、丁氏(鱼或)Wak tingi和棘头梅童鱼Collichthyslucidus耳石的形态特征和微结构,总结了4种鱼耳石形态的异同鉴别特征.结果表明:矢耳石呈长圆形或者盾形,基叶、翼叶、后基叶、副基叶以及中央突均不发达,主凹槽明显且贯穿整个耳石,背面具数个圆形晶状突或尖形晶状突或两者兼有.星耳石翼叶较基叶发达,中央突发达,为粗壮突起,四周边缘分布有数量不等的叶形晶状突,为宽叶形或窄叶形.黄唇鱼、大黄鱼和棘头梅童鱼的微耳石略呈纺锤体形,丁氏(鱼或)的微耳石略呈长方形.矢耳石、星耳石和微耳石的平均长高比分别为1.259～1.890、1.332～1.531和0.643～0.716.矢耳石长占体长的比为4%～6%,矢耳石高占体长的比为2%～5%.矢耳石仅有1个中心核和1个原基,星耳石大部分具1个中心核和1个原基,但也有少数具有1个以上的中心核或原基.

黄唇鱼、大黄鱼、丁氏■和棘头梅童鱼的形态差异和判别分析

运用3种多元分析方法，对黄唇鱼Bahaba flavolabiata、大黄鱼Pseudosciaena crocea、丁氏鱼或Wak tingi和棘头梅童鱼Collichthys lucidus 4种鱼的21个形态性状的种间形态差异进行了定量比较研究。结果表明：4种鱼的所有性状差异显著（P〈0．01），头部性状以及臀鳍条数、脊椎骨数、幽门盲囊数是区别4种鱼的主要性状，黄唇鱼与丁氏馘、大黄鱼、棘头梅童鱼的差异逐渐增大；大黄鱼与黄唇鱼、丁氏馘的差异相当，而大黄鱼和棘头梅童鱼形态差异较小。以逐步判别分析方法建立了4种石首鱼的判别函数，判别准确率分别为98．31％～100％（P1）和98．36％～100％（P2），综合判别率为99．46％。

黄唇鱼的生物学初步研究

黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)是中国特有的近海海水鱼类,因受环境因素影响其资源量严重减少,为了保护黄唇鱼资源,在珠江口设立了保护中心进行池塘条件下人工驯化养殖。对黄唇鱼的形态特征、池塘人工驯化养殖生长发育与生态环境的适应性进行研究。结果表明,黄唇鱼体呈长的纺锤形,尾柄细长,体侧扁,体背侧棕灰带橙黄色,腹侧灰白色。体长为体高的3.42倍,为头长的3.3倍,为尾柄长的4.15倍;尾柄长为尾柄高的3.31倍;头长为眼径的5.69倍,为眼间距的7.09倍,为吻长的3.78倍,为口裂长的2.87倍。生活水温为6~33℃,摄食水温为18~33℃。年增体重1500~3500 g,最大个体可达90 kg。以鱼和虾、蟹等大型甲壳类为食的肉食性鱼类,幼鱼则以虾的无节幼体为食。亲鱼成熟年龄雄鱼为6龄,雌鱼为8龄;雌鱼绝对怀卵量为每克体重150~170粒,卵径为1.35~1.49 mm,卵淡黄色、漂浮性。产卵水温为18~26℃。

黄唇鱼的耳石形态和微结构特征

研究了黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)耳石的形态特征和参数。结果表明,黄唇鱼有矢耳石、星耳石和微耳石各1对,矢耳石最大,微耳石最小。矢耳石略呈长方形,前端圆形,后端呈截形,两侧近平行,叶形晶状突多于圆形晶状突和尖形晶状突;星耳石翼叶较基叶发达,中央突粗长,约成扇形,其长度约为星耳石长的0.50倍;微耳石略呈锥形。矢耳石、星耳石长度均大于高度,微耳石长度小于高度。矢耳石长高比平均为1.371,星耳石长高比平均为1.332,微耳石长高比平均为0.647。矢耳石长、高与体长的比值分别为0.0479和0.0350。矢耳石和星耳石各具有1个中心核,矢耳石中心核的直径平均为68.15μm,星耳石中心核的直径平均为46.72μm;矢耳石原基的直径平均为11.42μm。

耳石形态在黄唇鱼、大黄鱼、丁氏(鱼或)和棘头梅童鱼种类识别中的应用

运用耳石传统形态分析方法对黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)、大黄鱼(Pseudosciaena crocea)、丁氏(鱼或)(Wak tingi)和棘头梅童鱼(Collichthys lucidus)识别效果进行了研究。结果表明,耳石形态存在体长效应,矢耳石对4种鱼的判别成功率为94.86%,星耳石对除黄唇鱼以外3种鱼的判别成功率为92.70%;矢耳石和星耳石对除黄唇鱼以外3种鱼的联合判别效果为98.54%。

基于转录组测序技术的黄唇鱼SSR分子标记筛选

【目的】筛选出可用于黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)遗传资源评价及亲缘鉴定的SSR分子标记,为开展其保护遗传学研究打下基础。【方法】利用Illumina HiSeq 4000测序平台对野生黄唇鱼样本进行转录组测序,采用TGICL对转录组数据进行聚类去冗余以获得Unigene,并通过生物信息学方法进行功能注释分类、代谢通路和SSR特征分析等。【结果】黄唇鱼混合组织的转录组测序共获得13.43 Gb数据,经组装并去冗余后获得65047条Unigenes。采用BLAST对组装获得的Unigenes进行七大功能数据库(NR、NT、GO、COG、KEGG、Swissprot和Interpro)注释,结果共有55583条Unigenes被注释(占85.45%)。通过MISA对黄唇鱼的Unigene进行SSR搜索,共检测到29797个SSR位点分布于19664条Unigenes中。SSR位点分布类型及其特征分析结果显示,最主要的重复类型为二核苷酸重复基元(11855个,占39.79%),其次是单核苷酸重复基元(9695个,占32.54%)和三核苷酸重复基元(6663个,22.36%),而四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复基元的数量相对较少。二核苷酸重复基元类型中重复最多的基序是AC/GT(8355条),在三核苷酸重复基元类型中重复最多的基序是AGG/CCT(1866条)。从随机选取的186对SSR引物中,最终筛选出47对扩增稳定性好且具有多态性的SSR引物,以二核苷酸和四核苷酸重复基元的扩增结果居多。【结论】通过转录组测序能有效筛选出具有多样性的黄唇鱼SSR分子标记,可为黄唇鱼的遗传多样性分析、亲缘鉴定和遗传图谱构建等后续研究提供基础资料。

基于微卫星标记的黄唇鱼遗传多样性研究

文章利用微卫星标记对珠江口海域19 个黄唇鱼(Bahaba flavolabiata) DNA 样品进行了遗传多样性研究,以期为黄唇鱼的种质鉴定和保育等研究奠定基础。结果显示,29 个微卫星位点的等位基因数(Na)分别为2~7 个,等位基因总数为121 个,平均等位基因数为4.17 个。有效等位基因数(Ne)介于1.060 6~6.056 1,总和为85.205 0。平均观测杂合度(Ho)和平均期望杂合度(He)分别为0.659 3 和0.597 3。多态性信息含量(PIC)介于0.055 5~0.813 7,平均值为0.542 3,其中19 个位点表现出高度多态性。5 个位点显著偏离Hardy-Weinberg 平衡(校正P≤0.036)。基因丰富度(Rs)介于2~6.976,总和为119.638。基因多样性(GD)介于0.059~0.856。这些数据显示黄唇鱼群体遗传多样性处于较高水平。

黄唇鱼消化系统组织结构及黏液细胞分布特征

利用石蜡切片、HE和阿利新兰高碘酸雪夫试剂[AB-PAS(Alician blue and periodic acidSchiff reagent AB,pH 2.5)]染色技术,研究黄唇鱼(Bahaba flavolabiata)消化系统的组织结构和黏液细胞的分布特征。黄唇鱼食道粗而短,胃呈“卜”形,分为贲门部、盲囊部和幽门部,胃与肠的连接处有8条幽门盲囊,肠道在体腔内迂回2个曲折。光镜下观察到消化管管壁由外至内依次为外膜、肌肉层、黏膜下层和黏膜层。食道肌肉层很厚,黏膜层很薄,未见黏液细胞分布。胃部肌肉层和黏膜层均很厚,黏膜固有层分布胃腺,黏膜上皮为单层柱状上皮。幽门盲囊管腔很大,但肌肉层很薄。肠道肌肉层较厚,黏膜皱褶较细长,黏膜上皮细胞间可见圆形的黏液细胞。肝脏内弥散分布胰腺组织,肝小叶内可见大量糖原空泡。AB-PAS染色检测到胃部分布为红色的Ⅰ型黏液细胞;幽门盲囊黏膜上皮分布大量蓝色的黏液细胞,为Ⅱ型黏液细胞;前肠、中肠和后肠检测到大量Ⅱ型黏液细胞,并有少量Ⅰ型黏液细胞。黄唇鱼消化系统的组织结构以及黏液细胞分布特征体现了食性与结构功能相协调的特点。