兴义矮脚鸡肠道微生物与其体质量的关联性

【目的】探究不同体质量分组兴义矮脚鸡肠道菌群及其网络结构特征,鉴定出与鸡体质量相关的潜在生物标志物,为养鸡业促生长益生菌的发掘提供理论依据。【方法】从同批次的110羽兴义矮脚母鸡群体(16周龄)中选取体质量最高的20羽组成HWC组(1.12±0.05 kg),体质量最低的20羽组成LWC组(0.74±0.05 kg),采集肛门粪便样品检测16SrRNA序列V3~V4可变区,利用Mothur进行肠道菌群Alpha多样性,采用基于未加权UniFrac距离的主坐标分析(PCoA)评估肠道菌群Beta多样性,通过SparCC算法构建肠道菌群互作网络,并应用LEfSe分析鉴定与兴义矮脚鸡体质量相关的肠道微生物。【结果】从40份兴义矮脚鸡粪便样品中共获得3145511条Clean reads,经DADA2聚类分析得到22297个扩增子序列变异体(ASVs)。在门分类水平上,兴义矮脚鸡肠道菌群中相对丰度排名前5的菌门包括厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和热脱硫杆菌门,对应的相对丰度分别为67.54%、12.24%、11.28%、2.39%和1.26%;在属分类水平上,相对丰度排名前5的菌属分别为乳酸杆菌属、罗斯氏菌属、利吉拉杆菌属、拟杆菌属和志贺杆菌属,对应的相对丰度分别为23.35%、14.86%、5.44%、4.63%和2.77%。LWC组兴义矮脚鸡肠道菌群稳定性指数为3.95%,HWC组的为12.22%,且LWC组的网络复杂性(5.57%)也低于HWC组(7.70%),推测低体质量兴义矮脚鸡肠道菌群复杂性和稳定性的下降与其体质量较低有关。兴义矮脚鸡肠道菌群互作网络中重要性评分排名前5的枢纽菌群分别是植物乳杆菌、乳球菌、瘤胃球菌属扭链群、粪杆菌属和理研菌科_RC9_菌群。LEfSe分析发现,有18个ASVs的相对丰度在HWC组和LWC组间呈显著差异(LDA>2,P<0.05),其中,12个ASVs表现为在LWC组的相对丰度高于HWC组,6个ASVs表现为在HWC组的相对丰度高于LWC组。【结论】肠杆菌科、支原体属等有害菌相对丰度的上升会降低鸡肠道菌群互作网络稳定性和复杂性,且与兴义矮脚鸡的低体质量有关。乳酸杆菌、理研菌科_RC9_菌群、梭状芽孢杆菌等是影响兴义矮脚鸡体质量的潜在关键菌群,可作为兴义矮脚鸡体质量关联的候选生物标志物。

贵州兴义矮脚鸡与矮脚黄鸡早期生长及屠宰性能的比较

试验对贵州兴义矮脚鸡与矮脚黄鸡的早期生长发育规律及屠宰性能进行了比较研究。结果表明 :兴义矮脚鸡初生及 2周龄时体重显著低于矮脚黄鸡 (p <0 .0 5 ) ,而在 10～ 12周龄后显著高于矮脚黄鸡 (p <0 .0 5 ) ;胫长在初生到 2周龄时极显著低于矮脚黄鸡 (p<0 .0 1) ,在 10、12周龄时极显著高于矮脚黄鸡 (p <0 .0 1) ,12周龄胫长分别为 6 .5 1cm和 5 .79cm。兴义矮脚鸡的屠宰率显著高于矮脚黄鸡 (p <0 .0 5 ) ,但它的胸肌率极显著低于矮脚黄鸡 (p <0 .0 1) ,表明兴义矮脚鸡产肉性能不及矮脚黄鸡。兴义矮脚鸡和矮脚黄鸡 0～ 12周龄全期的料肉比分别为 3.34与 3.71,表明前者具有较高的饲料报酬 ,值得进一步开发和利用。

兴义矮脚鸡生长激素受体基因内含子2的多态性

为合理利用兴义矮脚鸡的遗传资源,利用PCR-RFLP技术对兴义矮脚鸡生长激素受体(GHR)基因内含子2的多态性进行了研究。结果表明,兴义矮脚鸡GHR基因内含子2 Hind-Ⅲ位点表现出多态性,具有B、C 2个等位基因。公鸡中检测到BB、CC和BC 3种基因型,在母鸡群中仅检测到BB、CC 2种基因型,未检测到杂合型BC。

两种贵州地方鸡线粒体DNA控制区全序列分析

采用PCR和直接测序的方法测定兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列,分析比较两者mtDNA D-loop序列3个区的变异。结果表明,兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列长分别为1 231和1 230 bp,其中兴义矮脚鸡mtDNA控制区的碱基摩尔分数分别为A 26.92%、T33.41%、G 13.39%、C 26.29%,长顺绿壳蛋鸡的分别是A 27.13%、T 33.58%、G 13.20%、C 26.09%。t检验显示两种贵州地方鸡种间线粒体DNA控制区碱基A与C的含量差异显著,说明A与C之间的颠换较多。兴义矮脚鸡和长顺绿壳蛋鸡的遗传距离是0.038 6,根据分子钟计算,二者大约在193万年前分歧进化。

百宜黑鸡与兴义矮脚鸡线粒体DNA控制区遗传多样性分析

采用PCR和直接测序的方法测定百宜黑鸡和兴义矮脚鸡线粒体DNA控制区全序列,比较分析两种贵州地方鸡种的遗传变异。结果表明,百宜黑鸡、兴义矮脚鸡mtDNA控制区全序列长均为1231 bp;共发现26个变异位点(不包含种内变异位点),占分析位点总数的2.11%,其中12个转换,14个颠换;百宜黑鸡mtDNA控制区的A、T、G、C碱基含量分别为27.096%、33.628%、13.117%、26.159%,矮脚鸡的A、T、G、C碱基含量分别是A26.916%、T33.409%、G13.387%、C26.288%,t检验结果显示,两种鸡mtDNA控制区的A和T含量差异显著。百宜黑鸡和兴义矮脚鸡的遗传距离是0.0379,根据分子钟计算,二者约在190万年前分歧进化。

兴义矮脚鸡群体内遗传变异分析

[目的]从分子水平上分析兴义矮脚鸡的选育效果,为矮小型鸡的品种资源保护和开发利用提供理论依据。[方法]采用10个微卫星座位对3个品系贵州兴义矮脚鸡(100日龄),即黄羽(xy)、麻羽(xs)和黑羽(xb)(各50只)的遗传多样性进行研究。[结果]3品系矮脚鸡在10个微卫星座位上共检测到68个等位基因,各座位上等位基因数为5～10个,平均为6.800个,平均有效等位基因数4.3002。10个微卫星座位的期望杂合度在0.5238～0.8816,平均为0.7326。多态信息含量(PIC)的范围在0.4981～0.8656,平均为0.6973。3品系间的遗传分化系数(Fst)为0.0129～0.0664,平均值为0.0289。各座位的基因流都大于1,平均Nm值为8.4109。3品系矮脚鸡两两之间的遗传距离在0.0464～0.1474之间,xy和xs品系间的遗传距离最小,但两者与xb品系之间的遗传距离均较远。[结论]兴义矮脚鸡各品系间遗传分化较小,均有丰富的遗传多样性,仍有较大的选育空间。

蛋氨酸水平对兴义矮脚鸡生长性能及养分表观代谢率的影响

【目的】探讨蛋氨酸水平对龄兴义矮脚鸡生长及养分消化代谢的影响,为兴义矮脚鸡可消化蛋氨酸需要量的研究和生产提供科学依据。【方法】选取0日龄健康兴义矮脚进行0~28和29~49 d两个阶段不同蛋氨酸水平的饲养和代谢试验,0~28 d蛋氨酸水平分别为0.24%、0.32%、0.40%、0.48%,第29~49天分别为0.20%、0.30%、0.40%、0.50%,测定试验鸡的日均增重、日均采食量、料重比和养分表观代谢率。【结果】随着蛋氨酸水平的提高,矮脚鸡0~28和29~49 d的采食量和日增重均极显著增加(P<0.01),蛋氨酸水平分别增至0.40%和0.50%时,日增重和采食量均极显著降低(P<0.01);饲料转化效率则以0.30%水平(0~28 d)和0.32%水平(29~49 d)最低;蛋氨酸水平对养分消化代谢呈无规律变化。【结论】以日增重和日均采食量为指标,0~28和29~49 d兴义矮脚鸡适宜蛋氨酸水平均为0.40%。