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A rare missense PAX6 mutation causes atypical aniridia in a three-generation Chinese family 被引量:1
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作者 Zhi-Bo Lin Chun-Yun Feng +4 位作者 Jin Li An-Peng Pan Hai-Sen Sun A-Yong Yu Shi-Hao Chen 《International Journal of Ophthalmology(English edition)》 SCIE CAS 2024年第3期466-472,共7页
●AIM:To investigate the molecular diagnosis of a threegeneration Chinese family affected with aniridia,and further to identify clinically a PAX6 missense mutation in members with atypical aniridia.●METHODS:Eleven fa... ●AIM:To investigate the molecular diagnosis of a threegeneration Chinese family affected with aniridia,and further to identify clinically a PAX6 missense mutation in members with atypical aniridia.●METHODS:Eleven family members with and without atypical aniridia were recruited.All family members underwent comprehensive ophthalmic examinations.A combination of whole exome sequencing(WES)and direct Sanger sequencing were performed to uncover the causative mutation.●RESULTS:Among the 11 family members,8 were clinically diagnosed with congenital aniridia(atypical aniridia phenotype).A rare heterozygous mutation c.622C>T(p.Arg208Trp)in exon 8 of PAX6 was identified in all affected family members but not in the unaffected members or in healthy control subjects.●CONCLUSION:A rare missense mutation in the PAX6 gene is found in members of a three-generation Chinese family with congenital atypical aniridia.This result contributes to an increase in the phenotypic spectrum caused by PAX6 missense heterozygous variants and provides useful information for the clinical diagnosis of atypical aniridia,which may also contribute to genetic counselling and family planning. 展开更多
关键词 PAX6 gene atypical aniridia missense mutation MUTATION
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Inhibition of Bcl-6 Expression Ameliorates Asthmatic Characteristics in Mice
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作者 Chang-zhi ZHOU Xiong XIONG +8 位作者 Wei-jun TAN Ya-fei WANG Zhen YANG Xue-ying LI Xiu-wen YANG Xiao-fan LIU Sun-feng YU Liang-chao WANG Shuang GENG 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2024年第1期110-120,共11页
Objective The function of Bcl-6 in T follicular helper(Tfh)cell maturation is indispensable,and Tfh cells play a pivotal role in asthma.This study investigated the impact of Bcl-6 on asthmatic traits.Methods The micro... Objective The function of Bcl-6 in T follicular helper(Tfh)cell maturation is indispensable,and Tfh cells play a pivotal role in asthma.This study investigated the impact of Bcl-6 on asthmatic traits.Methods The microscopic pathological alterations,airway resistance(AR),and lung compliance(LC)were determined in asthmatic mice and Bcl-6 interference mice.The surface molecular markers of Tfh cells and the Bcl-6 mRNA and protein expression were determined by flow cytometry,RT-qPCR,and Western blotting,respectively.The relationships between the Tfh cell ratio and the IgE and IgG1 concentrations in peripheral blood mononuclear cells(PBMCs)and bronchoalveolar lavage fluid(BALF)were determined.Results Asthmatic inflammatory changes were observed in the lung tissue and were attenuated by Bcl-6 siRNA and dexamethasone(DXM).Asthmatic mice exhibited an increased AR and a decreased LC,while Bcl-6 siRNA or DXM mitigated these changes.The percentages of Tfh cells and eosinophils were significantly increased in the asthmatic mice,and they significantly decreased after Bcl-6 inhibition or DXM treatment.RT-qPCR and Western blotting analyses revealed that the Bcl-6 expression level in PBMCs was significantly higher in asthmatic mice,and it decreased following Bcl-6 inhibition or DXM treatment.The IgE expression in the serum and BALF and the B cell expression in PBMCs exhibited a similar trend.In asthmatic mice,the ratio of Tfh cells in the peripheral blood showed a strong positive correlation with the IgE levels in the serum and BALF,but not with the IgG1 levels.Conclusion The amelioration of airway inflammation and airway hyper-responsiveness is achieved through Bcl-6 suppression,which effectively hinders Tfh cell differentiation,ultimately resulting in a concurrent reduction in IgE production. 展开更多
关键词 bcl-6 TFH ASTHMA airway hyper-responsiveness mouse model
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Identification of marker genes associated with N6-methyladenosine and autophagy in ulcerative colitis
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作者 Xiao-Yan Liu Dan Qiao +5 位作者 Ya-Li Zhang Zi-Xuan Liu You-Lan Chen Ren-Ye Que Hong-Yan Cao Yan-Cheng Dai 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2024年第10期1750-1765,共16页
BACKGROUND Both N6-methyladenosine(m6A)methylation and autophagy are considered relevant to the pathogenesis of ulcerative colitis(UC).However,a systematic exploration of the role of the com-bination of m6A methylatio... BACKGROUND Both N6-methyladenosine(m6A)methylation and autophagy are considered relevant to the pathogenesis of ulcerative colitis(UC).However,a systematic exploration of the role of the com-bination of m6A methylation and autophagy in UC remains to be performed.AIM To elucidate the autophagy-related genes of m6A with a diagnostic value for UC.METHODS The correlation between m6A-related genes and autophagy-related genes(ARGs)was analyzed.Finally,gene set enrichment analysis(GSEA)was performed on the characteristic genes.Additionally,the expression levels of four characteristic genes were verified in dextran sulfate sodium(DSS)-induced colitis in mice.RESULTS GSEA indicated that BAG3,P4HB and TP53INP2 were involved in the inflammatory response and TNF-αsignalling via nuclear factor kappa-B.Furthermore,polymerase chain reaction results showed significantly higher mRNA levels of BAG3 and P4HB and lower mRNA levels of FMR1 and TP53INP2 in the DSS group compared to the control group.CONCLUSION This study identified four m6A-ARGs that predict the occurrence of UC,thus providing a scientific reference for further studies on the pathogenesis of UC. 展开更多
关键词 Ulcerative colitis m6A AUTOPHAGY Characteristic genes Immune infiltration
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宫颈癌组织中EMC6、C-myc及BCL-2的表达和预后
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作者 苗春霞 王一娜 张云霞 《昆明医科大学学报》 CAS 2024年第7期62-68,共7页
目的通过生信分析,评估EMC6基因在泛癌及宫颈癌中的表达、免疫相关性及诊断价值,并探究EMC6、C-myc、BCL-2蛋白与宫颈癌的相关性及预后。方法分析TCGA和GTEx数据库中EMC6在泛癌和宫颈癌的表达,并利用SangerBox和Timer数据库评估EMC6与... 目的通过生信分析,评估EMC6基因在泛癌及宫颈癌中的表达、免疫相关性及诊断价值,并探究EMC6、C-myc、BCL-2蛋白与宫颈癌的相关性及预后。方法分析TCGA和GTEx数据库中EMC6在泛癌和宫颈癌的表达,并利用SangerBox和Timer数据库评估EMC6与免疫相关性,以及ROC评估诊断潜力。通过免疫组化在68例宫颈癌及癌旁组织中检测EMC6、C-myc、BCL-2蛋白表达,分析其与临床病理特征的联系。使用Phi系数法分析相关性,并利用Kaplan-Meier法评估这些蛋白对预后的影响。结果宫颈癌中EMC6表达降低,对免疫浸润有显著影响,且诊断准确性较高(AUC=0.819)。免疫组化显示,与宫颈癌旁组织相比,EMC6蛋白表达下降、而C-myc和BCL-2蛋白表达上调,差异均有统计学意义(P<0.05)。EMC6表达与临床病理特征无相关性(P>0.05),而C-myc与病理类型相关(P<0.05),BCL-2与年龄、病理类型、肿瘤大小、分化程度相关(P<0.05)。EMC6与C-myc、BCL-2表达在宫颈癌中呈负相关(Phi=-0.367,P=0.002;Phi=-0.284,P=0.019),且三者与患者总生存期显著相关(P<0.05)。结论宫颈癌中EMC6蛋白表达下降,与C-myc、BCL-2蛋白表达呈负相关,且这些蛋白的表达水平与患者的总生存期之间存在显著的相关性,提示它们可能作为宫颈癌治疗和预后评估的潜在生物标志物。 展开更多
关键词 EMC6 C-MYC bcl-2 宫颈癌 细胞凋亡
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AAV2-PDE6B restores retinal structure and function in the retinal degeneration 10 mouse model of retinitis pigmentosa by promoting phototransduction and inhibiting apoptosis
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作者 Ruiqi Qiu Mingzhu Yang +5 位作者 Xiuxiu Jin Jingyang Liu Weiping Wang Xiaoli Zhang Jinfeng Han Bo Lei 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第8期2408-2419,共12页
Retinitis pigmentosa is a group of inherited diseases that lead to retinal degeneration and photoreceptor cell death.However,there is no effective treatment for retinitis pigmentosa caused by PDE6B mutation.Adeno-asso... Retinitis pigmentosa is a group of inherited diseases that lead to retinal degeneration and photoreceptor cell death.However,there is no effective treatment for retinitis pigmentosa caused by PDE6B mutation.Adeno-associated virus(AAV)-mediated gene therapy is a promising strategy for treating retinitis pigmentosa.The aim of this study was to explore the molecular mechanisms by which AAV2-PDE6B rescues retinal function.To do this,we injected retinal degeneration 10(rd10)mice subretinally with AAV2-PDE6B and assessed the therapeutic effects on retinal function and structure using dark-and light-adapted electroretinogram,optical coherence tomography,and immunofluorescence.Data-independent acquisition-mass spectrometry-based proteomic analysis was conducted to investigate protein expression levels and pathway enrichment,and the results from this analysis were verified by real-time polymerase chain reaction and western blotting.AAV2-PDE6B injection significantly upregulated PDE6βexpression,preserved electroretinogram responses,and preserved outer nuclear layer thickness in rd10 mice.Differentially expressed proteins between wild-type and rd10 mice were closely related to visual perception,and treating rd10 mice with AAV2-PDE6B restored differentially expressed protein expression to levels similar to those seen in wild-type mice.Kyoto Encyclopedia of Genes and Genome analysis showed that the differentially expressed proteins whose expression was most significantly altered by AAV2-PDE6B injection were enriched in phototransduction pathways.Furthermore,the phototransductionrelated proteins Pde6α,Rom1,Rho,Aldh1a1,and Rbp1 exhibited opposite expression patterns in rd10 mice with or without AAV2-PDE6B treatment.Finally,Bax/Bcl-2,p-ERK/ERK,and p-c-Fos/c-Fos expression levels decreased in rd10 mice following AAV2-PDE6B treatment.Our data suggest that AAV2-PDE6B-mediated gene therapy promotes phototransduction and inhibits apoptosis by inhibiting the ERK signaling pathway and upregulating Bcl-2/Bax expression in retinitis pigmentosa. 展开更多
关键词 APOPTOSIS AAV2-PDE6B ERK1/2 gene therapy PHOTOTRANSDUCTION PROTEOMICS rd10 retinitis pigmentosa
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间充质干细胞外泌体调节哺乳动物雷帕霉素靶点/p70核糖体蛋白S6激酶/盘卷肌球蛋白样Bcl-2-相互作用蛋白通路改善糖尿病肾病大鼠肾损伤的机制研究
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作者 吴莉莉 林景涛 +3 位作者 张远成 钟佩敏 唐劲松 王海波 《实用临床医药杂志》 CAS 2024年第10期51-57,共7页
目的探讨间充质干细胞外泌体(MSC-EVs)通过调节哺乳动物雷帕霉素靶点(mTOR)/p70核糖体蛋白S6激酶(S6K1)/盘卷肌球蛋白样Bcl-2-相互作用蛋白(Beclin 1)通路改善糖尿病肾病(DN)大鼠肾损伤的机制。方法采用高脂饮食联合腹腔链脲佐菌素(STZ... 目的探讨间充质干细胞外泌体(MSC-EVs)通过调节哺乳动物雷帕霉素靶点(mTOR)/p70核糖体蛋白S6激酶(S6K1)/盘卷肌球蛋白样Bcl-2-相互作用蛋白(Beclin 1)通路改善糖尿病肾病(DN)大鼠肾损伤的机制。方法采用高脂饮食联合腹腔链脲佐菌素(STZ)注射的方法建立SD大鼠DN模型,随机分为模型组、MSC-EVs组、MSC-EVs+MHY1485(mTOR激活剂)组,每组12只。另取12只SD大鼠以正常饲料喂养6周后,腹腔注射同等剂量柠檬酸钠溶液作为对照。以MSC-EVs和MHY1485分组处理后,检测大鼠血糖及肾功能指标[血尿素氮(BUN)、血清肌酐(Scr)、尿微量白蛋白(UmALB)]水平。采用苏木精-伊红(HE)染色检测各组大鼠肾组织病理形态;采用免疫组化检测各组大鼠肾组织mTOR/S6K1/Beclin 1通路相关蛋白表达;采用蛋白免疫印迹法检测各组大鼠肾组织mTOR/S6K1/Beclin 1通路及自噬相关蛋白表达。结果与对照组相比,模型组大鼠肾组织形态发生损伤,血糖、BUN、Scr、UmALB、p-mTOR及p-S6K1相对阳性表达、p-mTOR/mTOR、p-S6K1/S6K1显著升高(P<0.05),微管相关蛋白1A/1B轻链3(LC3)Ⅱ/LC3Ⅰ、Beclin 1蛋白表达、Beclin 1相对阳性表达显著降低(P<0.05);与模型组相比,MSC-EVs组大鼠肾组织形态损伤减轻,血糖、BUN、Scr、UmALB、p-mTOR及p-S6K1相对阳性表达、p-mTOR/mTOR、p-S6K1/S6K1显著降低(P<0.05),LC3Ⅱ/LC3Ⅰ、Beclin 1蛋白表达、Beclin 1相对阳性表达显著升高(P<0.05);与MSC-EVs组相比,MSC-EVs+MHY1485组大鼠肾组织形态损伤加重,血糖、BUN、Scr、UmALB、p-mTOR及p-S6K1相对阳性表达、p-mTOR/mTOR、p-S6K1/S6K1显著升高(P<0.05),LC3Ⅱ/LC3Ⅰ、Beclin 1蛋白表达、Beclin 1相对阳性表达显著降低(P<0.05)。结论MSC-EVs可增强自噬,降低DN大鼠血糖、SCr、BUN和尿蛋白水平,减轻肾组织损伤,其机制可能与抑制mTOR/S6K1/Beclin 1通路激活有关。 展开更多
关键词 间充质干细胞外泌体 哺乳动物雷帕霉素靶点 p70核糖体蛋白S6激酶 盘卷肌球蛋白样bcl-2-相互作用蛋白 糖尿病肾病 肾损伤
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Point mutation of 5' noncoding region of BCL-6gene in primary gastric lymphomas
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作者 Da-LiuMin Xiao-YanZhou Wen-TaoYang Hong-FenLu Tai-MingZhang Ai-HuaZhen Pei-ZhengCao Da-RenShi 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第1期51-55,共5页
AIM: To investigate the mutations of the 5' noncoding region of BCL-6 gene in Chinese patients with primary gastric lymphomas. METHODS: PCR and direct DNA sequencing were used to identify BCL-6 gene mutations in t... AIM: To investigate the mutations of the 5' noncoding region of BCL-6 gene in Chinese patients with primary gastric lymphomas. METHODS: PCR and direct DNA sequencing were used to identify BCL-6 gene mutations in the 5' noncoding region in 29 cases of gastric diffuse large B-cell lymphoma (DLBCL) and 18 cases of gastric mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma as well as 10 cases of reactive hyperplasia of lymph node (LRH). RESULTS: Six of 29 gastric DLBCLs (20.7%), 4 of 18 gastric MALT lymphomas (22.2%) and 1 of 10 LRHs(10%) were found to have mutations. All mutations were single-base substitutions and the frequency of single-base changes was 0.20×1O^(-2)-1.02×1O^(-2)per bp. CONCLUSION: Point mutations in the 5' noncoding region of BCL-6 gene are found in Chinese patients with primary gastric DLBCLs and MALT lymphomas, suggesting that they may, in some extent, participate in the pathogenesis of primary gastric DLBCLs and MALT lymphomas. 展开更多
关键词 Gastric lymphomas bcl-6 gene 5' noncoding region Point mutation
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老年舒张性心力衰竭合并肌少症患者可溶性生长刺激表达基因2蛋白、肌红蛋白、白细胞介素-6水平与心功能的相关性
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作者 朱琪 季梅丽 庄世虹 《实用临床医药杂志》 CAS 2024年第9期57-61,共5页
目的 探讨老年舒张性心力衰竭(DHF)合并肌少症患者外周血可溶性生长刺激表达基因2蛋白(sST2)、肌红蛋白(Myo)、白细胞介素-6(IL-6)水平与心功能的相关性。方法 将122例DHF患者根据有无肌少症分为DHF合并肌少症组60例和DHF组62例,另将健... 目的 探讨老年舒张性心力衰竭(DHF)合并肌少症患者外周血可溶性生长刺激表达基因2蛋白(sST2)、肌红蛋白(Myo)、白细胞介素-6(IL-6)水平与心功能的相关性。方法 将122例DHF患者根据有无肌少症分为DHF合并肌少症组60例和DHF组62例,另将健康体检者58例、单纯肌少症患者60例分别纳入对照组、单纯肌少症组,检测各组外周血sST2、Myo、IL-6水平和心功能指标[左室射血分数(LVEF)、心排血量(CO)、心率(HR)、每搏输出量(SV)和心脏指数(CI)]。采用Pearson相关分析法分析sST2、Myo、IL-6与各心功能指标的相关性。绘制受试者工作特征(ROC)曲线,分析sST2、Myo、IL-6单独及联合诊断DHF合并肌少症的效能。结果 与对照组、单纯肌少症组相比,DHF组、DHF合并肌少症组sST2、Myo、IL-6水平和HR均升高,LVEF、CO、SV和CI均降低,差异有统计学意义(P<0.05);与DHF组相比,DHF合并肌少症组sST2、Myo、IL-6水平和HR均升高,LVEF、CO、SV和CI均降低,差异有统计学意义(P<0.05)。sST2、Myo、IL-6均分别与LVEF、CO、SV、CI呈负相关(P<0.001),均与HR呈正相关(P<0.001);sST2、Myo、IL-6、LVEF、SV是DHF合并肌少症的独立影响因素(P<0.05);sST2、Myo、IL-6联合诊断DHF合并肌少症的曲线下面积为0.936,诊断效能优于三者单独检测。结论 老年DHF合并肌少症患者外周血sST2、Myo、IL-6水平显著升高,且sST2、Myo、IL-6均与心功能指标显著相关,三者联合检测对DHF合并肌少症的诊断效能较高。 展开更多
关键词 可溶性生长刺激表达基因2蛋白 肌红蛋白 白细胞介素-6 舒张性心力衰竭 肌少症 心功能
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白介素1β及白介素6基因单核苷酸多态性与食管癌放疗后肺部感染的关联
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作者 杨静 陈璐 +2 位作者 刘燕子 祝金冉 王胜根 《西南医科大学学报》 2024年第3期236-240,250,共6页
目的分析人白介素1β(interleukin 1β,IL-1β)、白介素6(interleukin 6,IL-6)基因单核苷酸多态性与食管癌放疗后肺部感染的关联,并探讨其生理病理的调控作用。方法选取新乡医学院第三附属医院2019年1月~2022年7月收治的115例食管癌患... 目的分析人白介素1β(interleukin 1β,IL-1β)、白介素6(interleukin 6,IL-6)基因单核苷酸多态性与食管癌放疗后肺部感染的关联,并探讨其生理病理的调控作用。方法选取新乡医学院第三附属医院2019年1月~2022年7月收治的115例食管癌患者为研究对象,根据放疗后是否出现感染分为感染组(n=28)和非感染组(n=87),检测IL-1β基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点-511C/T(rs16944)、-31C/T(rs1143627)和IL-6基因单核苷酸多态性位点IL-6-572C/G(rs1800796)、IL-6-174G/C(rs1800795)的多态性,采用Spearman相关检验分析IL-1β、IL-6基因单核苷酸多态性与食管癌放疗后肺部感染的关系,多因素Logistic回归分析影响食管癌放疗后肺部感染的相关因素。结果两组患者性别、年龄、BMI、临床分期等基线资料比较,差异无统计学意义(P>0.05);放疗时间、肿瘤长度、肿瘤位置比较差异有统计学意义(P<0.05);IL-1β基因的rs16944、rs1143627位点,IL-6基因的rs1800796、rs1800795位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律(P>0.05);两组IL-1β基因rs16944位点基因型频率,CC、CT、TT基因型频率,C、T等位基因频率,差异均无统计学意义(P>0.05);rs1143627位点CC、CT、TT基因型频率,C、T等位基因频率差异均有统计学意义(P<0.05);IL-6基因rs1800796位点CC、CG、GG基因型频率,C、G等位基因频率差异均有统计学意义(P<0.05),rs1800795位点CC、CG、GG基因型频率,C、G等位基因频率差异均无统计学意义(P>0.05);Spearman相关检验分析显示,IL-1βrs1143627(C/T)位点、IL-6 rs1800796(C/T)位点基因多态性与食管癌放疗后肺部感染具有显著相关性(P<0.05);多因素Logistic回归分析显示,放疗时间、肿瘤长度、肿瘤位置、IL-1βrs1143627位点、IL-6 rs1800796位点单核苷酸多态性是影响食管癌患者放疗后肺部感染的多因素(P<0.05)。结论IL-1β基因rs1143627(C/T)位点多态性及IL-6基因rs1800796(C/G)位点多态性与食管癌放疗后肺部感染有关,其中rs1143627位点T等位基因、rs1800796位点G等位基因可能是易感基因。 展开更多
关键词 白介素1Β 白介素6 基因多态性 食管癌 放疗 肺部感染
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贵州地区急性淋巴细胞白血病儿童TPMT、NUDT15基因多态性与6-MP耐受性分析
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作者 王彩丽 方常莹 《贵州医药》 2024年第1期27-29,共3页
目的观察贵州地区ALL儿童TPMT、NUDT15基因多态性,探讨其与6-MP耐受性的关系。方法收集贵阳市儿童医院血液科住院的贵州地区ALL儿童。Sanger法检测患者NUDT15c.415C>T和TPMT*2、TPMT*3A、TPMT*3B、TPMT*3C基因型。所有ALL儿童均按CCL... 目的观察贵州地区ALL儿童TPMT、NUDT15基因多态性,探讨其与6-MP耐受性的关系。方法收集贵阳市儿童医院血液科住院的贵州地区ALL儿童。Sanger法检测患者NUDT15c.415C>T和TPMT*2、TPMT*3A、TPMT*3B、TPMT*3C基因型。所有ALL儿童均按CCLG-2008方案化疗,每周1次监测血常规及肝肾功能。根据2016新编WHO化疗药物毒性反应分度标准,出现Ⅲ~Ⅳ度与6-MP相关的毒性反应,称为6-MP不耐受(除外感染、其他药物影响)。分析TPMT、NUDT15基因多态性与6-MP不耐受的相关性。结果共纳入患者60例,检测到TPMT突变(中间代谢型)3例(5%),正常代谢型57例(95%)。NUDT15基因CT型12例(20%),TT型1例(1.7%),CC型(野生型)47例(78.3%)。NUDT15基因突变率21.7%(13/60)显著高于TPMT基因突变率5%(3/60),差异有统计学意义(P=0.007)。TPMT突变型3例均发生6-MP不耐受(100%),NUDT15突变型13例中11例发生6-MP不耐受(84.6%)。结论TPMT、NUDT15基因突变与6-MP不耐受相关(P<0.05),联合检测TPMT、NUDT15基因对调整6-MP使用,减少6-MP不良反应提供依据。 展开更多
关键词 6-MP TPMT NUDT15 基因多态性 贵州地区 急性淋巴细胞白血病 儿童
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Ki-67、Bcl-6、Bcl-2及TEFM在弥漫大B细胞淋巴瘤中的表达及预后意义 被引量:3
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作者 孙晓梅 梅雯 +4 位作者 何冰 罗中贵 孙如丽 熊伟 赵一 《大理大学学报》 2023年第2期62-69,共8页
目的:探讨Ki-67、Bcl-6、Bcl-2及TEFM在弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的表达及其与患者临床特征和预后的关系。方法:选取DLBCL组织样本41例和反应性增生淋巴组织样本42例,比较不同组织中Ki-67、Bcl-6、Bcl-2及TEFM的表达情况;分析Ki-67、B... 目的:探讨Ki-67、Bcl-6、Bcl-2及TEFM在弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)中的表达及其与患者临床特征和预后的关系。方法:选取DLBCL组织样本41例和反应性增生淋巴组织样本42例,比较不同组织中Ki-67、Bcl-6、Bcl-2及TEFM的表达情况;分析Ki-67、Bcl-6、Bcl-2和TEFM蛋白表达水平与DLBCL临床病理的相关性,筛选DLBCL患者预后影响因素。结果:DLBCL组织中Ki-67、Bcl-2和Bcl-6表达水平明显高于非生发中心部位反应性增生淋巴组织,差异有统计学意义(P<0.05);Ki-67及TEFM蛋白表达水平与原发部位相关(P<0.05);DLBCL患者3年生存率与患者年龄相关,年龄≥60岁的患者3年生存率仅为28.57%。结论:Ki-67、Bcl-6、Bcl-2在DLBCL组织中高表达,TEFM与Ki-67、Bcl-6、Bcl-2在DLBCL进展过程中可能具有协同作用,Ki-67、Bcl-6、Bcl-2可作为DLBCL预后不良的重要指标。 展开更多
关键词 弥漫大B细胞淋巴瘤 KI-67表达 bcl-6表达 bcl-2表达 TEFM表达
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Bcl-6、Bim、PUMA、BNIP3及BNIP3L在银屑病患者及正常人皮肤中的表达
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作者 李颖 张晓艳 《实用皮肤病学杂志》 2023年第6期327-330,共4页
目的探讨FOXO下游凋亡相关因子Bcl-6、Bim、PUMA、BNIP3及BNIP3L表达在寻常性银屑病发病中的意义。方法31例寻常性银屑病患者及30例正常对照为研究对象,采用免疫组化方法检测Bcl-6、Bim、PUMA、BNIP3及BNIP3L的表达,并利用计算机图像采... 目的探讨FOXO下游凋亡相关因子Bcl-6、Bim、PUMA、BNIP3及BNIP3L表达在寻常性银屑病发病中的意义。方法31例寻常性银屑病患者及30例正常对照为研究对象,采用免疫组化方法检测Bcl-6、Bim、PUMA、BNIP3及BNIP3L的表达,并利用计算机图像采集与分析系统对免疫组化染色结果进行平均光密度测定。结果免疫组化检测显示,寻常性银屑病患者皮损中Bcl-6、BNIP3的表达明显高于正常皮肤,差异具有统计学意义(P<0.001);Bim的表达明显低于正常皮肤,差异具有统计学意义(P<0.001);PUMA、BNIP3L的正常皮肤表达差异无统计学意义(P>0.05)。结论Bcl-6、BNIP3的表达升高及Bim的表达降低可能参与寻常性银屑病发病中表皮角质形成细胞的凋亡异常。 展开更多
关键词 银屑病 寻常性 细胞凋亡 bcl-6 BIM PUMA BNIP3 BNIP3L
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m^(6)A相关基因在激素性股骨头坏死中的生物信息学分析 被引量:2
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作者 令狐熙涛 桂佳琦 +2 位作者 梁卓智 瓦庆德 黄帅 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第36期5811-5816,共6页
背景:m^(6)A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚。目的:基于GEO数据库,采用生物信息学方法分析激素性股骨头坏死中表达差异的m^(6)A基因及互作miRNAs,探寻其潜在发病机制。方法:在GEO数据库中检索并... 背景:m^(6)A修饰与股骨头坏死的发生发展相关,但在激素性股骨头坏死中的作用尚不清楚。目的:基于GEO数据库,采用生物信息学方法分析激素性股骨头坏死中表达差异的m^(6)A基因及互作miRNAs,探寻其潜在发病机制。方法:在GEO数据库中检索并下载与激素性股骨头坏死相关的mRNA表达谱数据集(GSE123568),通过R软件对数据集进行差异基因筛选及GO功能、KEGG通路富集分析。识别差异基因中的m^(6)A差异表达基因(m^(6)A-DEGs)并对其进行GO功能与KEGG通路富集分析,比较m^(6)A-DEGs的表达量并分析它们之间的相关性。最后通过Cytoscape构建m^(6)A-DEGs的PPI互作网络及筛选核心基因。使用TargetScan,miRTarBase和miRBD数据库预测m^(6)A-DEGs相关的潜在miRNAs,同时使用ChIPBase及hTFtarget数据库预测7个核心基因潜在转录因子,然后分别构建m^(6)A-miRNA与转录因子m^(6)A调控网络。最后使用数据集GSE74089验证7个核心m^(6)A-DEGs的表达水平。结果与结论:①从数据集中共筛选出2460个差异表达的基因,其中1455个上调,1005个下调。②从数据集中筛选出了14个m^(6)A-DEGs,包括3个下调和11个上调基因,m^(6)A-DEGs在激素性股骨头坏死中的表达具有显著差异(P<0.05),Spearman分析表明它们之间具有一定相关性。③m^(6)A-DEGs的GO和KEGG富集分析主要集中在骨髓细胞分化与发育、免疫受体与细胞因子受体活性、破骨细胞分化、AMPK与白细胞介素17信号通路。④m^(6)A-DEGs前7个核心基因包括YTHDF3,YTHDF1,YTHDF2,ALKBH5,METTL3,HNRNPA2B1及HNRNPC,它们在miRTarBase,miRDB和TargetScan数据库中共有44个miRNA重叠,在ChIPBase及hTFtarget数据库中共有79个重叠转录因子。⑤在GSE74089数据集中有6个核心m^(6)A-DEGs的表达水平与GSE123568数据集一致。⑥结果证实,根据生物信息学方法筛选的7个m^(6)A-DEGs可能通过调控多个miRNA、转录因子和AMPK及白细胞介素17信号通路表达,进而影响激素性股骨头坏死中骨髓细胞分化发育与破骨细胞分化,为进一步深入研究激素性股骨头坏死的发病机制和靶向治疗提供了数据支持和研究方向。 展开更多
关键词 激素性股骨头坏死 m^(6)A甲基化 微小RNA 转录因子 生物信息学 差异基因 基因调控网络 核心基因
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急性淋巴细胞白血病患儿维持治疗期间6-巯基嘌呤使用剂量与TPMT和NUDT15基因多态性的关系
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作者 吴新蕊 刘玉峰 +2 位作者 李白 刘莹 刘姗姗 《中国循证儿科杂志》 CSCD 北大核心 2024年第1期52-56,共5页
背景6-巯基嘌呤(6-MP)是急性淋巴细胞白血病(ALL)维持治疗最主要的药物之一,代谢酶基因多态性与药物的骨髓抑制程度有关。目的探讨ALL患儿维持治疗期间6-MP使用剂量与TPMT和NUDT15基因多态性的关系。设计回顾性队列研究。方法纳入2020年... 背景6-巯基嘌呤(6-MP)是急性淋巴细胞白血病(ALL)维持治疗最主要的药物之一,代谢酶基因多态性与药物的骨髓抑制程度有关。目的探讨ALL患儿维持治疗期间6-MP使用剂量与TPMT和NUDT15基因多态性的关系。设计回顾性队列研究。方法纳入2020年1月至2021年12月于郑州大学第一附属医院明确诊断为ALL、经前期化疗骨髓达完全缓解、进入维持治疗阶段且口服6-MP治疗的患儿。口服6-MP前患儿行TPMT和NUDT15基因型检测,分析TPMT、NUDT15不同基因型患儿应用6-MP治疗的使用剂量和骨髓抑制情况。主要结局指标6-MP使用剂量。结果61例维持治疗的ALL患儿纳入本文分析。纳入TPMT基因多态性统计分析的ALL患儿48例(除外NUDT15基因突变13例),野生型45例,突变型3例;纳入NUDT15基因多态性统计分析的ALL患儿58例(除外TPMT基因突变3例),CC型45例,CT型9例,TT型4例。在6-MP维持治疗阶段,TPMT和NUDT15不同基因型患儿的WBC、Hb、PLT计数差异均有统计学意义(均P<0.05)。患儿用药后出现不同程度的中性粒细胞减少,包括TPMT野生型15例,突变型3例;NUDT15基因CC型15例,CT型5例,TT型4例;TPMT和NUDT15不同基因型患儿骨髓抑制情况差异均有统计学意义(均P<0.05)。TPMT和NUDT15不同基因型患儿6-MP使用剂量差异有统计学意义(均P<0.05),TPMT野生型和突变型ALL患儿维持治疗期6-MP使用剂量分别为(40.81±6.02)和(16.25±4.42)mg·m^(-2)·d^(-1);NUDT15基因CC型、CT型和TT型6-MP使用剂量分别为(40.81±6.02)、(34.28±4.53)和(10.00±1.28)mg·m^(-2)·d^(-1)。结论TPMT和NUDT15突变型患儿的骨髓抑制程度均较野生型严重。ALL患儿维持治疗期间6-MP使用剂量与TPMT和NUDT15基因多态性相关。 展开更多
关键词 急性淋巴细胞白血病 6-巯基嘌呤 TPMT NUDT15 基因多态性 药物使用剂量
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鸡FGF6基因生物学特性及其多态性与经济性状的关联分析
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作者 曹玉珠 邢雨欣 +7 位作者 马乘霖 管宏波 贾其辉 康相涛 田亚东 李转见 刘小军 李红 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期1536-1550,共15页
旨在探究鸡成纤维细胞生长因子6(fibroblast growth factor 6,FGF6)基因的生物学特性,挖掘FGF6基因单核苷酸多态性(SNP)位点并分析其与经济性状的相关性,为后续研究鸡FGF6基因对生长性状的影响提供参考。本研究对FGF6蛋白序列进行生物... 旨在探究鸡成纤维细胞生长因子6(fibroblast growth factor 6,FGF6)基因的生物学特性,挖掘FGF6基因单核苷酸多态性(SNP)位点并分析其与经济性状的相关性,为后续研究鸡FGF6基因对生长性状的影响提供参考。本研究对FGF6蛋白序列进行生物信息学分析;基于768只固始鸡-安卡鸡F_2资源群的GBS数据及相关经济性状表型数据对FGF6基因包含启动子2 kb区域SNP位点进行筛选,并进行连锁不平衡和关联分析,探究FGF6基因SNP和单倍型与鸡经济性状的相关性。生物信息学分析结果显示,鸡FGF6氨基酸序列与火鸡同源性为91.26%;系统进化分析表明,鸡FGF6与火鸡亲缘关系最近,其次是绿海龟,与斑马鱼遗传距离最远;保守性分析显示不同物种间FGF6保守性较高。鸡FGF6蛋白为亲水性蛋白、存在1个跨膜区,主要定位于细胞质;其二级、三级结构相符。鸡FGF6蛋白被22个磷酸化位点和1个N-糖基化位点修饰;与其受体家族FGFR1~4和EGF存在互作关系。鸡FGF6基因启动子区域筛选到6个SNPs位点,均位于1号内含子上;多态性分析显示6个SNPs位点存在高多态性,其中5个处于哈代-温伯格平衡,呈强连锁状态(D′=1,r^(2)=1)。关联分析结果显示,rs73399071位点与F_2资源群不同阶段体重(BW)、胫长(SL)、胫围(SG)、体斜长(BSL)等17个生长性状指标显著相关(P<0.05),与全净膛重(EW)、半净膛重(SEW)、屠体重(CW)、胸肌重(BMW)等10个屠体性状指标显著相关(P<0.05),与肉质性状的关联未达到显著水平(P>0.05),与高密度脂蛋白(HDL)和胆碱酯酶(ChE)显著相关(P<0.05),CC基因型个体的大部分性状表型均值高于GG基因型个体;单倍型组合分析显示不同阶段CCTTCCTTCC组合个体的体重均高于其他单倍型组合个体。本研究结果为进一步探究鸡FGF6基因的功能提供理论参考,筛选到FGF6基因存在5个与固始鸡-安卡鸡F_2资源群体重、体尺、屠体性状和血液生化指标显著关联的SNPs位点,为鸡育种提供候选的分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。 展开更多
关键词 FGF6基因 生物信息学分析 连锁不平衡分析 单倍型 经济性状 关联分析
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杨树桑黄6-磷酸海藻糖合成酶基因克隆鉴定与表达分析
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作者 徐丛涛 李子豪 +5 位作者 潘晋龙 李海康 胡清秀 邹亚杰 陈晓华 弥春霞 《食用菌学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期45-52,共8页
对杨树桑黄(Sanghuangporus vaninii)6-磷酸海藻糖合成酶基因(SvTPS)进行克隆和生物信息学分析,并进行原核表达;采用荧光定量PCR方法研究SvTPS在杨树桑黄菌丝体和不同年份子实体中的表达情况,测定菌丝体和不同年份子实体中SvTPS活性。... 对杨树桑黄(Sanghuangporus vaninii)6-磷酸海藻糖合成酶基因(SvTPS)进行克隆和生物信息学分析,并进行原核表达;采用荧光定量PCR方法研究SvTPS在杨树桑黄菌丝体和不同年份子实体中的表达情况,测定菌丝体和不同年份子实体中SvTPS活性。结果表明:SvTPS DNA序列长度为1894 bp,编码576个氨基酸。SvTPS相对分子质量为65130,等电点为6.21,脂肪系数为88.14,平均亲水系数为-0.281,不稳定系数为42.41。SvTPS氨基酸序列与暴马桑黄(S.baumii)的相似性最高,仅有一个TPS单结构域;SvTPS二级结构中α-螺旋、β-折叠、延伸链、无规卷曲占比分别为48.61%、5.56%、15.62%、30.21%。三年生子实体SvTPS的表达量最高,菌丝体的表达量最低。菌丝体的SvTPS活性最低;随着栽培时间增加,SvTPS活性增加,三年生子实体的最高。研究结果为进一步探讨SvTPS在杨树桑黄生长发育过程中的功能提供参考。 展开更多
关键词 杨树桑黄 6-磷酸海藻糖合成酶 基因克隆 蛋白表达
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大豆海藻糖-6-磷酸磷酸酶基因GmTPP的鉴定及其在生长发育和非生物胁迫响应中的表达分析
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作者 欧晋稳 张古文 +6 位作者 冯志娟 王斌 卜远鹏 徐钰 茹磊 刘娜 龚亚明 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2024年第9期2031-2041,共11页
海藻糖在植物代谢、生长发育和抗逆性中起着重要作用。海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)基因对海藻糖的生物合成至关重要。大豆是重要豆类作物,种子含有丰富的蛋白质和油脂,其TPP基因家族少有报道。为分析TPP基因在大豆中的结构和功能,利用生... 海藻糖在植物代谢、生长发育和抗逆性中起着重要作用。海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)基因对海藻糖的生物合成至关重要。大豆是重要豆类作物,种子含有丰富的蛋白质和油脂,其TPP基因家族少有报道。为分析TPP基因在大豆中的结构和功能,利用生物信息学方法在大豆全基因组中筛选得到15个GmTPP基因。系统发育分析表明,这15个GmTPP可分为3个亚家族,每个GmTPP含有9~11个内含子,同一亚家族的GmTPP基因的内含子数目相同。顺式作用元件分析表明,GmTPP基因参与植物激素和环境胁迫反应。此外,还利用转录组数据研究这些GmTPP在不同组织中的表达模式以及对不同的非生物胁迫的表达特征。结果显示,GmTPP在大豆各个组织器官中均有特定的表达模式,在盐胁迫、干旱胁迫处理下表达不同。该研究不仅为揭示GmTPP基因家族在大豆海藻糖调控中的作用奠定了基础,也为利用TPP基因家族提高大豆抗逆性提供一定的参考价值。 展开更多
关键词 海藻糖-6-磷酸磷酸酶基因GmTPP 大豆 非生物胁迫 表达分析
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一例手足裂畸形6型家系的致病变异鉴定及胚胎植入前遗传学检测
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作者 梅利斌 张译元 +5 位作者 黄娴静 纪红 邱乒乒 丁露 何雪梅 李萍 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期750-756,共7页
手足裂畸形(split-hand/split-foot malformation,SHFM)是一种严重的先天性肢端畸形,主要临床特征为并指(趾)畸形、指(趾)骨及掌(跖)骨发育不全。本研究报道了一例手足裂畸形胎儿,利用全外显子组测序技术结合Sanger测序的方法筛选候选... 手足裂畸形(split-hand/split-foot malformation,SHFM)是一种严重的先天性肢端畸形,主要临床特征为并指(趾)畸形、指(趾)骨及掌(跖)骨发育不全。本研究报道了一例手足裂畸形胎儿,利用全外显子组测序技术结合Sanger测序的方法筛选候选基因变异位点,并为其家庭成员提供了胚胎植入前遗传学检测(preimplantation genetic testing,PGT)。基因检测结果显示胎儿WNT10B基因存在c.786G>A(p.Trp262*)纯合变异,其父母均为杂合突变携带者;PGT检测结果显示家系的2枚囊胚中,1枚基因型为突变杂合子,1枚基因型为突变纯合子,所有胚胎染色体均为二倍体,移植突变杂合子胚胎后成功达到单胎妊娠。本研究表明WNT10B基因纯合突变可能是导致该家系患手足裂畸形的原因,对于单基因病家系,在明确其致病突变后,通过胚胎植入前遗传学检测可有效避免患儿出生。 展开更多
关键词 手足裂畸形6 WNT10B基因 基因突变 胚胎植入前遗传学检测 囊胚
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Analysis of hypermutation of the 5' noncoding region in the BCL-6 gene
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作者 王林 刘建湘 +9 位作者 黄薇 王辉东 王建民 顾柏炜 陈竺 陈赛娟 许良中 杨文涛 金晓龙 柳红 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2001年第3期62-66,107,共6页
ObjectiveTo investigate BCL 6 gene mutations in Chinese populations with B cell non Hodgkin's lymphoma Methods Polymerase chain reaction (PCR), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and direct D... ObjectiveTo investigate BCL 6 gene mutations in Chinese populations with B cell non Hodgkin's lymphoma Methods Polymerase chain reaction (PCR), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and direct DNA sequencing were used to identify mutations in the 5' noncoding region of the BCL 6 gene in a total of 40 cases of diffuse large cell lymphoma (DLCL) and follicular lymphoma (FL) Results Nine cases were found to have base substitutions The incidence of BCL 6 gene mutation and the frequency of single base changes were approximately 25 7% and (0 56-1 10)×10 2 /bp, respectively Conclusions The 5' regulatory region of the BCL 6 gene undergoes frequent somatic hypermutation during lymphomagenesis and the identification of BCL 6 gene hypermutations provides a molecular marker for confirmatory diagnosis of B NHL 展开更多
关键词 BCL 6 gene · 5' noncoding region · hypermutation · diffuse large cell lymphoma · follicular lymphoma
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Maternal TMPRSS6 Gene Polymorphism rs855791SNP in Women with Preeclampsia
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作者 Yasir I. B. Ahmed Hind S. Yagoub Mohamed A. Hassan 《Journal of Biosciences and Medicines》 CAS 2023年第1期70-81,共12页
Introduction: Preeclampsia can lead to several maternal and perinatal adverse effects. There are few published data on the association between transmembrane serine protease 6 (TMPRSS6) gene polymorphism and preeclamps... Introduction: Preeclampsia can lead to several maternal and perinatal adverse effects. There are few published data on the association between transmembrane serine protease 6 (TMPRSS6) gene polymorphism and preeclampsia. Objective: To assess the association between TMPRSS6 gene polymorphism rs855791SNP in women with preeclampsia compared with healthy pregnant women. Method: A case-control study (60 women in each arm) was conducted at Saad Abuaela Maternity Hospital in Khartoum, Sudan. Sociodemographic and clinical data were gathered through a questionnaire. The participant was genotype for TMPRSS6 gene rs855791SNP using Polymerase Chain Reaction and Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). The results were confirmed by DNA sequencing. Result: There was no significant difference in the median of age, parity, and body mass index. The distribution of the genotypes and alleles of TMPRSS6 rs855791 was consistent with the HWE. The overall TMPRSS6 rs855791 polymorphism was not significantly associated with preeclampsia. However, the proportion of heterozygotes (TC) was considerably higher in the women with preeclampsia (46.7%) than in the control group (23.3%) (p = 0.001;OR = 2.71;95% CI = 1.21 - 6.07). The proportion of homozygotes (TT) and T alleles was not significantly different between women with preeclampsia and the control group. Conclusion: The overall TMPRSS6 rs855791 polymorphism was not significantly associated with preeclampsia and healthy control. 展开更多
关键词 PREECLAMPSIA TMPRSS6 gene Polymorphism rs855791SNP
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