SYBR Green荧光定量PCR法对BCL11B基因座位相互作用位点的验证分析

目的:研究在不同类型细胞核中,位于不同染色体上的BCL11B与ARHGAP6基因座位间的相互作用关系。方法:通过SYBR Green荧光实时定量PCR法,分别对MCF-7和Jurkat细胞的3C(染色体构象捕获)样品进行定量分析,分析分别位于不同染色体上的BCL11B与ARHGAP6基因座位间的相互作用频率。结果:与TaqMan探针法相比较,基于SYBR Green荧光实时定量PCR法对3C样品的分析同样具有良好的特异性。在MCF-7和Jurkat细胞中,BCL11B与ARHGAP6基因座位间的相互作用频率存在很大的差异。结论:SYBR Green荧光实时定量PCR法在染色体构象捕获技术中具有很好的特异性;BCL11B与ARHGAP6基因座位间的相互作用具有细胞类型特异性。

利用环形染色体构象捕获技术对Bcl11b基因座位在细胞核内空间组织的研究

环形染色体构象捕获(4C)技术实现了在全基因组范围内捕获与4C靶位点发生相互作用的基因座位,因而通过4C相关技术可以进一步研究靶基因座位在细胞核内的空间组织形式。该文以Bcl11b基因座位作为4C分析的靶位点,通过优化4C分析的反向巢式PCR扩增条件,实现4C分析PCR的高效扩增;并通过有限克隆筛选与普通测序分析相结合的方法,在全基因组范围内捕获到一些与Bcl11b基因座位发生潜在相互作用的基因座位。这些基因座位与靶位点间的相互作用既有发生在相同染色体内的,也有发生在不同染色体之间的。这些基因座位间的相互作用表明了Bcl11b基因座位在细胞核内复杂的空间组织形式。

实时定量PCR检测B细胞恶性肿瘤中BCL11A基因的表达水平

目的:建立B细胞淋巴瘤/白血病BCL11A基因的定量检测方法,并分析其在B细胞恶性肿瘤中的表达水平。方法:利用实时定量RT-PCR分析B细胞淋巴瘤(18例)、B细胞性慢性淋巴细胞白血病(B-CLL,8例)、T细胞性急性淋巴细胞白血病(T-ALL,8例)和正常对照(15例)外周血单个核细胞(PBMC)中BCL11A基因的表达水平,以甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)基因作为内对照。结果:B-CLL组和B细胞淋巴瘤组患者PBMC中BCL11A表达水平均明显高于正常对照(P=0.000)和T-ALL组(P=0.000);T-ALL组和正常对照组BCL11A表达水平无显著差别(P=0.084);B-CLL组和B细胞淋巴瘤组BCL11A表达水平无显著差别(P=0.776)。在B细胞淋巴瘤不同的病例中,BCL11A表达水平有较大差异,其中最小值为0.04,最大值为9.70,中位值为1.00。结论:成功建立BCL11A基因的定量检测方法。

实时定量PCR检测白血病中BCL11B基因的表达水平

目的建立BCL11B基因的定量检测方法,并分析其在白血病中的表达水平。方法利用实时定量RTPCR分析TALL(12例)、BALL(8例)、BCLL(6例)、AML(7例)和正常对照(10例)外周血单个核细胞(PBMC)中BCL11B基因的表达水平,以β2微球蛋白(β2M)基因表达水平作为内对照。结果TALL患者PBMC中BCL11B表达水平(553.84±564.01拷贝105β2M拷贝)明显高于正常对照和其他白血病患者(P=0.006,P=0.013,P=0.031,P=0.020);而AML组BCL11B表达水平(0.02±0.04拷贝105β2M拷贝)则明显低于正常对照组(P=0.000)、BALL组(P=0.006)和TALL组(P=0.020);BALL(1.99±1.59拷贝105β2M拷贝)和BCLL(2.26±3.57拷贝105β2M拷贝)中BCL11B表达水平与正常对照(2.20±1.01拷贝105β2M拷贝)无显著差别。结论建立了实时定量RTPCR检测BCL11B方法,TALL中BCL11B高表达可能与其发病有一定关系。

RNA干扰下调bcl11b基因表达对Molt-4细胞增殖和凋亡的影响

目的分析下调bcl11b基因表达对人T淋巴细胞白血病细胞株Molt-4细胞增殖和凋亡的影响。方法通过核转技术将bcl11b-siRNA转染Molt-4细胞;在不同时间点分别采用荧光实时定量PCR观察其对bcl11b基因表达的影响;MTT法观察对Molt-4细胞体外增殖的抑制作用;流式细胞术及刘氏染色检测siRNA的诱导凋亡作用。结果转染后24小时开始细胞生存率均显著降低(P<0.01),细胞发生凋亡,bcl11b基因表达下调。结论bcl11b-siRNA可抑制Molt-4细胞中bcl11b基因表达,使肿瘤细胞增殖抑制和发生凋亡。

BCL11基因与恶性肿瘤的关系

B细胞淋巴瘤/白血病(B-cell lymphoma/leukemia,BCL)家族蛋白在细胞的增殖和抗凋亡等方面起重要作用。BCL11基因是BCL家族的成员之一,分为BCL11A和BCL11B基因。其中BCL11A基因是一种原癌基因,而BCL11B被认为是一种抑癌基因,近年来人们逐渐认识到了它们的结构与特点。越来越多的研究发现,它们不仅与血液系统淋巴细胞肿瘤的关系密切,还与很多其它系统的恶性肿瘤有着一定关系。本文主要介绍BCL11基因特点、功能,并结合最新的资料将其与人类各系统恶性肿瘤关系的研究做一综述。

T-ALL/淋巴瘤中BCL11B基因转录本的分析

目的:分析T-ALL/淋巴瘤中BCL11B基因转录本的特点。方法:利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)和实时定量聚合酶链式反应(RQ-PCR)方法分析12例T-ALL/淋巴瘤外周血单个核细胞(PBMC)中BCL11B基因的表达情况;限制性内切酶消化确定PCR产物的特异性。结果:3例T-ALL/淋巴瘤患者中出现2种BCL11B转录本:野生型和第3外显子缺失型,其余9例均表达第3外显子缺失型的转录本。两组病人PBMC中BCL11B表达水平无显著差别(P=0.301)。结论:3例T-ALL/淋巴瘤病人中存在2种BCL11B基因转录本,但在表达水平上无明显差别。

转录因子BCL11B通过TGF-β_1调控支气管哮喘患者IL-17A的表达

目的探讨转录因子BCL11B在支气管哮喘患者中的变化情况,并分析其是否可以通过TGF-β1调控哮喘患者IL-17A的表达。方法 25例慢性持续期哮喘患者为哮喘组,10例非哮喘志愿者为正常对照组。分别通过实时定量PCR(Taqman法)检测两组外周血单个核细胞中BCL11B的表达水平,通过ELISA方法检测两组血浆中TGF-β1和IL-17A的表达情况。结果哮喘组患者BCL11B的表达明显低于正常对照组,而TGF-β1和IL-17A表达明显高于正常对照组。哮喘患者BCL11B的表达与TGF-β1和IL-17A均呈负相关,而TGF-β1和IL-17A的表达呈正相关。结论哮喘患者低表达的BCL11B可能会通过TGF-β1上调IL-17A的表达,从而参与哮喘炎症反应的发生。

pIRES2-EGFP-BCL11B真核表达载体体外表达的动态分析

目的:研究真核表达载体pIRES2-EGFP-BCL11B(B细胞白血病/淋巴瘤11B基因)在K293(人胚肾细胞株)和Raji(人Burkitt淋巴瘤细胞株)细胞中的表达情况。方法:分别利用脂质体和核转染技术将真核表达载体pIRES2-EGFP-BCL11B(pBCL11B)转染至K293和Raji细胞中,并设立空质粒组(pI2)和空转染组(MOCK)作为对照。通过荧光显微镜和流式细胞仪检测转染后48 h各组EGFP的表达,确定转染效率。通过荧光实时定量PCR(Taqman)技术检测转染后24 h各组BCL11B mRNA的表达情况,通过Western blotting技术检测转染后48 h各组BCL11B蛋白的表达情况。高分辨率活细胞成像系统动态观察转染后36-72 h重组质粒在Raji细胞增殖过程中的表达。结果:K293细胞pBCL11B、pI2和MOCK组的转染效率分别为(71.23±4.62)%、(70.45±3.58)%和(0.30±0.10)%,而Raji细胞各组的转染效率分别为(23.12±5.94)%、(22.48±6.25)%和(0.30±0.10)%。实时定量PCR和Western blotting结果显示转染后pBCL11B组在mRNA和蛋白水平均能检测到BCL11B基因的有效表达,BCL11B的表达量均明显高于pI2组和MOCK组(P<0.05)。活细胞追踪显示转染后36-72 h重组质粒在细胞中可稳定表达且转染后的细胞可以正常分裂增殖。结论:系统分析了真核表达载体pIRES2-EGFP-BCL11B转染至K293和Raji细胞的表达变化特点,转染后可以检测到该基因的有效上调,研究结果为下一步转染正常人T细胞奠定了基础。

抑制MDA-MB-231乳腺癌细胞BCL11A的表达可促进其凋亡

目的探讨B细胞慢性淋巴细胞性白血病/淋巴瘤基因11A(BCL11A)在乳腺癌组织中的表达分布情况及沉默BCL11A后对MDA-MB-231乳腺癌细胞凋亡的影响。方法利用免疫组织化学法检测62例乳腺癌及8例癌旁组织中BCL11A的表达,分析BCL11A表达与乳腺癌临床病理特征的关系;利用化学合成的针对BCL11A的小干涉RNA(siRNA),转染MDA-MB-231细胞48 h后,反转录PCR和Western blot法检测BCL11A沉默效率,流式细胞术检测细胞的凋亡水平。结果BCL11A主要定位在细胞质,且在乳腺癌组织中的表达量明显高于癌旁组织,BCL11A的表达量和临床分期相关,与患者的年龄、肿瘤大小无关;合成的BCL11A-siRNA能有效沉默BCL11A在MDA-MB-231细胞中的表达,BCL11A基因沉默后MDA-MB-231细胞凋亡明显增加。结论 BCL11A在乳腺癌组织中高表达,沉默BCL11A后可促进乳腺癌细胞凋亡。

Ficoll分离和MACs分选对T细胞BCL11b表达水平的影响

目的了解Ficoll分离和MACs分选过程对T细胞中BCL11b基因表达水平的影响情况。方法利用Ficoll分离3例正常人外周血单个核细胞(PBMC),进一步经MACs负性分选CD3+T细胞。分别收集培养0、6和20h的PBMC和CD3+T细胞,利用实时定量PCR方法检测各组样本中BCL11b基因的表达水平。结果经Ficoll分离的PBMC和MACs分选后CD3+T细胞在3个时间点BCL11b的表达水平无显著性差异(p>0.05),根据CD3+T细胞%标化后,各组BCL11b表达水平也均无显著性差异。结论Ficoll分离和MACs负性分选过程不影响T细胞中BCL11b表达水平,提示其不会影响T细胞的活化。

Nucleofection转染过程对Jurkat细胞BCL11b水平的影响

目的了解核转染(Nucleofection)过程对Jurkat细胞中BCL11b基因表达水平的影响情况。方法利用实时定量PCR方法检测分析经不同程序Nucleofection过程和不同时间培养的Jurkat细胞的BCL11b基因的表达水平。结果经Nucleofector的C-16、S-18和G-10+siRNA程序处理后,C-16与S-18组细胞培养2h的BCL11b水平明显升高(p<0.05),C-16、S-18和G-10+siRNA三组细胞培养10h后BCL11b水平均高于对照组(p<0.05)。对照组、C-16和S-18组细胞随着培养时间延长(在2～24h之间),BCL11b水平降低(p<0.05),而在G-10+siRNA处理组,直到培养48hBCL11b水平才有所下降。结论Nucleofection处理过程对Jurkat细胞BCL11b表达有一定的影响,但有一定的时效性。