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Polycyclic Aromatic Hydrocarbons in Water: A Review of the Sources, Properties, Exposure Pathways, Bionetwork and Strategies for Remediation
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作者 I. O. Alaekwe O. Abba 《Journal of Geoscience and Environment Protection》 2022年第8期137-144,共8页
Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are by-products arising from incomplete combustion. These organic chemicals substances are found almost everywhere and pose a risk to human health because of their potentially h... Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are by-products arising from incomplete combustion. These organic chemicals substances are found almost everywhere and pose a risk to human health because of their potentially hazardous nature and bioavailability in the environment as determined by several regulatory agencies such as US Environmental Protection Agency (US-EPA), US Department of Health and Human Services (DHHS), International Agency for Research on Cancer (IARC) and the National Agency for Food and Drug Administration and Control (NAFDAC). The paper is aimed at studying polycyclic aromatic hydrocarbons in water. The possible sources, chemistry, risk and remediation strategies for polycyclic aromatic hydrocarbons in water have been considered. Studies have shown that exposure to PAHs at levels above the maximum contaminant level for relatively short periods will cause damage to the red blood cells leading to anaemia;suppressed immune system. Long-term exposure to Benzo(a)pyrene at levels above the maximum contaminant level has the potential to cause developmental and reproductive defects as well as cancer. US-EPA, IARC and DHHS has sets a maximum contaminant level (MCL) for benzo(a)pyrene, the most carcinogenic PAH, at 0.0002 mg/L, 0.0001 mg/L for benz(a)anthracene, 0.0002 mg/L for benzo(b)fluoranthene, benzo(k)fluoranthene, and chrysene. 0.0003 mg/L and 0.0004 mg/L have been set for dibenz(a,h)anthracene and indeno (1,2,3-c,d)pyrene respectively. Sustained barn on smoking in public places and burning of word, use of concretes in road construction as against the traditional surfacing of roads using coal tar as well as cars running on compressed natural gas (CNG) or liquefied petroleum gas (LPG) can form part of the preventive strategies. 展开更多
关键词 Aromatic Hydrocarbon bionetwork REMEDIATION Compressed Natural Gas Environmental Protection
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Global view of bionetwork dynamics:adaptive landscape 被引量:5
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作者 Ping Ao 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 2009年第2期63-73,共11页
Based on recent work, I will give a nontechnical brief review of a powerful quantitative concept in biology, adaptive landscape, ini- tially proposed by S. Wright over 70 years ago, reintroduced by one of the founders... Based on recent work, I will give a nontechnical brief review of a powerful quantitative concept in biology, adaptive landscape, ini- tially proposed by S. Wright over 70 years ago, reintroduced by one of the founders of molecular biology and by others in different bio- logical contexts, but apparently forgotten by modem biologists for many years. Nevertheless, this concept finds an increasingly important role in the development of systems biology and bionetwork dynamics modeling, from phage lambda genetic switch to endogenous net- work for cancer genesis and progression. It is an ideal quantification to describe the robustness and stability of bionetworks. Here, I will first introduce five landmark proposals in biology on this concept, to demonstrate an important common thread in theoretical biology. Then I will discuss a few recent results, focusing on the studies showing theoretical consistency of adaptive landscape. From the perspec- tive of a working scientist and of what is needed logically for a dynamical theory when confronting empirical data, the adaptive landscape is useful both metaphorically and quantitatively, and has captured an essential aspect of biological dynamical processes. Though at the theoretical level the adaptive landscape must exist and it can be used across hierarchical boundaries in biology, many associated issues are indeed vague in their initial formulations and their quantitative realizations are not easy, and are good research topics for quantitative biologists. I will discuss three types of open problems associated with the adaptive landscape in a broader perspective. 展开更多
关键词 adaptive landscape stochastic dynamics bionetworks systems biology
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肝、肾移植受者外周血基因表达差异分析 被引量:3
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作者 徐洪来 肖敏 +4 位作者 杨超 高义 雒真龙 周鸿敏 陈忠华 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期166-171,共6页
目的探讨肝移植与肾移植受者外周血免疫细胞基因表达差异。方法从GEO数据库获取27个肝移植受者及25个肾移植受者外周血的基因芯片表达谱数据。应用GSEA软件进行基因集富集分析,应用Cytoscape软件对差异基因进行生物网络分析,获得肝、肾... 目的探讨肝移植与肾移植受者外周血免疫细胞基因表达差异。方法从GEO数据库获取27个肝移植受者及25个肾移植受者外周血的基因芯片表达谱数据。应用GSEA软件进行基因集富集分析,应用Cytoscape软件对差异基因进行生物网络分析,获得肝、肾移植相关核心基因。结果 GSEA分析筛选出肝、肾移植领头亚群高重叠基因各20个。差异基因生物网络分析,筛选出肝、肾移植相关中心蛋白质(基因)数目分别为14及13;结合GSEA及生物网络分析结果,获得核心基因各5个。结论外周血免疫细胞的转录、翻译调节机制在肝移植免疫调节中发挥了更重要的作用,而在肾移植信号蛋白质的相互作用网络发挥了主要的免疫调控功能;免疫细胞的能量代谢与免疫调控存在密切关系;外周血肝、肾移植核心基因发挥了重要的免疫调节功能。 展开更多
关键词 肝移植 肾移植 基因表达谱 基因集富集分析 生物网络
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计算智能的新框架:生物网络结构 被引量:12
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作者 丁永生 《智能系统学报》 2007年第2期26-30,共5页
由神经、内分泌和免疫这3个生物系统可分别引发人工神经网络(ANN)、人工内分泌系统(AES)和人工免疫系统(AIS).它们三者所组成的“神经内分泌免疫网络”在生物系统中扮演着维持动态平衡的重要角色.为此,提出一种将ANN、AES和AIS进行集成... 由神经、内分泌和免疫这3个生物系统可分别引发人工神经网络(ANN)、人工内分泌系统(AES)和人工免疫系统(AIS).它们三者所组成的“神经内分泌免疫网络”在生物系统中扮演着维持动态平衡的重要角色.为此,提出一种将ANN、AES和AIS进行集成的计算智能的新框架,称之为“生物网络结构”,并讨论了其中应着重关注的研究方向和思路,从而使人们在此框架的基础上研究其理论和应用技术,更好地满足复杂系统对计算智能的应用需求. 展开更多
关键词 计算智能 生物网络结构 神经网络 免疫系统 内分泌系统 神经内分泌免疫网络
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基于拓扑结构的生物网络关键节点识别研究进展 被引量:2
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作者 黄海滨 邵平 《玉林师范学院学报》 2009年第3期6-10,共5页
与生物学实验方法及其它方法相比,基于拓扑结构的生物信息学方法在生物网络关键节点识别上有独特优势.本文从节点的中心性测度、网络的拓扑参数及层次结构等几方面总结了生物网络的主要拓扑特征;比较了蛋白质网络、代谢网络及基因调控... 与生物学实验方法及其它方法相比,基于拓扑结构的生物信息学方法在生物网络关键节点识别上有独特优势.本文从节点的中心性测度、网络的拓扑参数及层次结构等几方面总结了生物网络的主要拓扑特征;比较了蛋白质网络、代谢网络及基因调控网络关键节点识别的主要方法;分析了相关的一些算法.最后指出存在的一些主要问题,并提出解决的思路及进一步研究的方向. 展开更多
关键词 关键节点 生物网络 识别 拓扑结构 复杂网络
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结肠癌淋巴结转移基因谱表达差异分析
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作者 赵志丹 刘建华 +5 位作者 钟白云 王恝歆 谢婷彦 张秋焕 冯斯斯 邓辉 《临床检验杂志》 CAS CSCD 2017年第5期381-385,共5页
目的探讨人结肠癌细胞系SW480、SW620基因谱的表达差异。方法针对NCBI的GEO数据库中编号为GDS756的基因芯片表达数据,用GSEA软件进行基因集富集分析及领头亚群分析,利用FunRich分析软件针对SW480、SW620细胞领头亚群基因进行验证性功能... 目的探讨人结肠癌细胞系SW480、SW620基因谱的表达差异。方法针对NCBI的GEO数据库中编号为GDS756的基因芯片表达数据,用GSEA软件进行基因集富集分析及领头亚群分析,利用FunRich分析软件针对SW480、SW620细胞领头亚群基因进行验证性功能注释,STRING在线分析系统对显著性富集基因集领头亚群基因进行生物网络分析,获得SW480、SW620细胞中心节点基因,并将中心节点基因与高重叠领头亚群基因进行联合分析,以获得参与多功能的中心节点基因。结果GSEA软件分析筛选出SW480细胞显著性富集基因集12个,领头亚群基因491个,高重叠基因7个;SW620细胞显著性富集基因集80个,领头亚群基因870个,高重叠基因6个。对显著性富集基因集领头亚群基因进行生物网络分析筛选出SW480、SW620细胞相关中心基因数目分别为5个及8个;结合GSEA及生物网络分析结果,获得SW620细胞2个参与多功能调控的核心基因TOP2A、CDK1。结论遗传背景相同的结肠癌SW620细胞与SW480细胞具有不同的基因功能分布特点,SW620细胞多功能中心节点基因TOP2A、CDK1与结肠癌发展相关信号通路高度相关。 展开更多
关键词 SW480 SW620 基因表达谱 基因集富集分析 生物网络
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一年生农作物与多年生沙生植物混播网格的固沙作用 被引量:2
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作者 乔春林 陈有君 +2 位作者 红梅 李绍良 刘爱业 《内蒙古农业大学学报(自然科学版)》 CAS 2004年第3期98-101,共4页
 传统的治沙措施用于治理风蚀沙地或效果较差,或成本较大。用1年生农作物与多年生沙生植物的种子混播做固沙网格,当年便可以起到固沙作用,保证了多年生植物的幼苗成活与生长,使风蚀沙地可以1次治理,长期有效;而且成本低。对于落沙坡及...  传统的治沙措施用于治理风蚀沙地或效果较差,或成本较大。用1年生农作物与多年生沙生植物的种子混播做固沙网格,当年便可以起到固沙作用,保证了多年生植物的幼苗成活与生长,使风蚀沙地可以1次治理,长期有效;而且成本低。对于落沙坡及自然环境条件较好的起沙坑,用农作物单播做网格,在网格中间穴播、移栽或插条多年生植物,可以进一步减少多年生植物种子的用量。仅用农作物做网格,成本低,可维持两年左右的时间,后续利用灵活。 展开更多
关键词 一年生农作物 多年生沙生植物 混播 固沙网格 固沙作用
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