芥菜BjuBBX基因家族全基因组鉴定与分析

BBX蛋白质是植物中广泛存在的锌指转录因子,参与种子萌发、下胚轴生长、开花、昼夜节律和逆境响应等发育过程,利用芥菜(Brassica juncea)基因组数据,通过TBTools等软件筛选鉴定出82个芥菜BjuBBX家族基因,可分为5个亚家族,具有较高的群体特异性。染色体分布和共线性分析表明,基因重复事件对芥菜基因组中BjuBBX基因的扩增至关重要,群类间的进化速率和氨基酸性质的变化很可能会导致其功能分化。顺式作用元件分析表明:BjuBBX家族成员的启动子大多富集了光信号、激素响应和胁迫应答等途径的顺式元件。同时,基于芥菜茎膨大、高温和干旱胁迫的转录组数据分析表明,GroupⅠ中BjuBBX基因在茎膨大过程中呈较高表达,且在不同阶段具有表达的时空特异性;BjuBBX8-3、BjuBBX11、BjuBBX24-4等基因的表达会积极响应高温和干旱胁迫,暗示其在逆境应答中具重要功能。这为进一步解析BjuBBX家族在芥菜中的生物学功能奠定基础,为芥菜等十字花科作物的生物育种提供了借鉴。