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短链蝎毒素BmK38的1^H—NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象
1
作者
蔡征
许琛琦
+3 位作者
吴季辉
徐应祺
戚正武
施蕴渝
《中国科学技术大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第7期685-694,共10页
BmK38是最近从东亚钳蝎(Buthus martensi Karsch,BmK)中分离纯化得到的一种短链蝎毒素.应用2D-NMR技术研究BmK38的溶液构象,通过分析其在水溶液中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY等1^H—NMR谱,识别了BmK38全部40个氨基酸残基的自旋体系...
BmK38是最近从东亚钳蝎(Buthus martensi Karsch,BmK)中分离纯化得到的一种短链蝎毒素.应用2D-NMR技术研究BmK38的溶液构象,通过分析其在水溶液中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY等1^H—NMR谱,识别了BmK38全部40个氨基酸残基的自旋体系,并通过分析NOESY谱图中dαN、dNN、dβN的联系,完成了序列专一性谱峰归属,标定了全部主链质子和绝大部分侧链质子的化学位移.根据谱峰归属的结果和NMR数据分析了BmK38的二级结构组成并且计算出BmK38的溶液构象.结构计算的结果与前述二级结构的分析是一致的.结果表明,肽段Gln8-Arg17形成α螺旋,而肽段Gly22-Glu29以及Leu32-CYS39构成反平行的口折叠,属于典型的短链蝎毒素的折叠形式.通过与其他OUKTx短链蝎毒素的结构比较,讨论了BmK38的结构特异性以及结构功能的相互关系.
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关键词
短链蝎毒素
二维核磁共振
序列专一性归属
二级结构
溶液构象
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职称材料
题名
短链蝎毒素BmK38的1^H—NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象
1
作者
蔡征
许琛琦
吴季辉
徐应祺
戚正武
施蕴渝
机构
中国科学技术大学生命科学学院结构生物学开放实验室
中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所
出处
《中国科学技术大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第7期685-694,共10页
基金
国家重大基础研究发展计划(G1999075605
2002CB713806)
+4 种基金
国家自然科学基金(30270293
30170210)
国家自然科学基金创新研究群体(30121001)
国家科技攻关计划("863"重点)(2002BA711A13)
中国科学院知识创新重大项目(KSCX1-SW-17)资助
文摘
BmK38是最近从东亚钳蝎(Buthus martensi Karsch,BmK)中分离纯化得到的一种短链蝎毒素.应用2D-NMR技术研究BmK38的溶液构象,通过分析其在水溶液中的DQF-COSY、TOCSY和NOESY等1^H—NMR谱,识别了BmK38全部40个氨基酸残基的自旋体系,并通过分析NOESY谱图中dαN、dNN、dβN的联系,完成了序列专一性谱峰归属,标定了全部主链质子和绝大部分侧链质子的化学位移.根据谱峰归属的结果和NMR数据分析了BmK38的二级结构组成并且计算出BmK38的溶液构象.结构计算的结果与前述二级结构的分析是一致的.结果表明,肽段Gln8-Arg17形成α螺旋,而肽段Gly22-Glu29以及Leu32-CYS39构成反平行的口折叠,属于典型的短链蝎毒素的折叠形式.通过与其他OUKTx短链蝎毒素的结构比较,讨论了BmK38的结构特异性以及结构功能的相互关系.
关键词
短链蝎毒素
二维核磁共振
序列专一性归属
二级结构
溶液构象
Keywords
bmk38
short-chain scorpion toxin
2D-NMR
sequence-specific assignment
secondary structural elements
solution structure
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
短链蝎毒素BmK38的1^H—NMR谱峰归属、二级结构分析及溶液构象
蔡征
许琛琦
吴季辉
徐应祺
戚正武
施蕴渝
《中国科学技术大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
0
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