油菜GDSL脂肪酶基因BnGLIP的生物信息学分析

GDSL脂肪酶能催化酯类水解,在植物生理代谢及胁迫抵抗方面发挥着重要作用。通过生物信息学方法对油菜GDSL脂肪酶基因BnGLIP进行分析,分析了其序列特点及理化性质等,并对其生物学功能进行了预测。结果表明,BnGLIP是一个亲水性蛋白,具有跨膜区域同时含有信号肽,有糖基化位点和磷酸化位点,有4个保守结构框,α-螺旋和无规则卷曲是主要二级结构,进化树分析推断BnGLIP可能在油菜抵抗逆境途径中发挥作用。

甘蓝型油菜脂肪酶基因BnGLIP1的克隆与分析

植物GDSL脂肪酶是一个重要的脂肪酶家族,具有水解酶活性,在植物体内参与众多的生理活动。从甘蓝型油菜中克隆到1个GDSL类型脂肪酶基因,将其命名为BnGLIP1。该脂肪酶基因编码的蛋白有360个氨基酸,含有20种氨基酸,分子质量为39 545.35 u,理论等电点为4.95。生物信息学分析表明,该蛋白属于稳定性蛋白,可能为亲水性蛋白;编码蛋白的N端具有信号肽序列,推测可能为外分泌蛋白;蛋白质二级和三级结构显示α螺旋和无规则卷曲所占比例较高。组织特异性表达分析表明,BnGLIP1在甘蓝型油菜的根、茎、茎尖、叶、花、角果、种子等中均有表达,其中角果中的表达量最高,茎中最低。干旱、高盐等胁迫处理均能诱导BnGLIP1的表达,表明BnGLIP1脂肪酶基因在植物的胁迫响应中发挥作用。