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甘蓝型油菜MAP70基因家族全基因组鉴定与表达分析
1
作者
黄郢
翟璐
+3 位作者
谢伶俐
徐劲松
张学昆
许本波
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期647-656,共10页
采用生物信息学方法,从甘蓝型油菜(Brassica napus L.)基因组数据库中筛选鉴定MAP70s基因家族成员,对鉴定得到的BnaMAP70s基因家族成员的序列特征进行生物信息学分析,同时利用qRT-PCR方法分析该基因家族成员在不耐渍和强耐渍甘蓝型油菜...
采用生物信息学方法,从甘蓝型油菜(Brassica napus L.)基因组数据库中筛选鉴定MAP70s基因家族成员,对鉴定得到的BnaMAP70s基因家族成员的序列特征进行生物信息学分析,同时利用qRT-PCR方法分析该基因家族成员在不耐渍和强耐渍甘蓝型油菜品种幼苗中的基因表达水平。结果显示,本研究共鉴定得到19个BnaMAP70基因家族成员,分布在11条染色体上,可分为5个亚家族。BnaMAP70s启动子的上游存在厌氧胁迫、响应植物激素等相关元件,表明BnaMAP70s可能参与植株生长发育和渍水胁迫调控;转录水平存在品种特异性、植株部位特异性、时间特异性。q RT-PCR分析结果表明,BnaMAP70-1和BnaMAP70-4在渍水胁迫下出现表达差异,说明这两个基因受渍水胁迫的调控。
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关键词
甘蓝型油菜
bnamap70s基因家族
耐渍
生物信息学
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题名
甘蓝型油菜MAP70基因家族全基因组鉴定与表达分析
1
作者
黄郢
翟璐
谢伶俐
徐劲松
张学昆
许本波
机构
长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心
长江大学农学院
出处
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期647-656,共10页
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0101703)
湖北省农业厅项目(鄂农油[2021]9号)。
文摘
采用生物信息学方法,从甘蓝型油菜(Brassica napus L.)基因组数据库中筛选鉴定MAP70s基因家族成员,对鉴定得到的BnaMAP70s基因家族成员的序列特征进行生物信息学分析,同时利用qRT-PCR方法分析该基因家族成员在不耐渍和强耐渍甘蓝型油菜品种幼苗中的基因表达水平。结果显示,本研究共鉴定得到19个BnaMAP70基因家族成员,分布在11条染色体上,可分为5个亚家族。BnaMAP70s启动子的上游存在厌氧胁迫、响应植物激素等相关元件,表明BnaMAP70s可能参与植株生长发育和渍水胁迫调控;转录水平存在品种特异性、植株部位特异性、时间特异性。q RT-PCR分析结果表明,BnaMAP70-1和BnaMAP70-4在渍水胁迫下出现表达差异,说明这两个基因受渍水胁迫的调控。
关键词
甘蓝型油菜
bnamap70s基因家族
耐渍
生物信息学
Keywords
Bra
s
s
ica napu
s
bnamap
70
gene family
Waterlogging tolerance
Bioinformatic
s
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甘蓝型油菜MAP70基因家族全基因组鉴定与表达分析
黄郢
翟璐
谢伶俐
徐劲松
张学昆
许本波
《植物科学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
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