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题名甘蓝冷胁迫相关基因BobHLH18克隆与表达分析
被引量:2
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作者
秦文斌
戴忠良
山溪
唐君
王神云
李建斌
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机构
江苏丘陵地区镇江农业科学研究所
江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室/江苏省农业科学院蔬菜研究所
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出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2019年第1期149-156,共8页
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基金
国家重点研发计划项目(2016YFD0101702)
江苏省重点研发计划项目(BE2017379)
+1 种基金
江苏省农业科技自主创新基金项目[CX(15)1016]
宁波市科技计划项目(2015C110008)
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文摘
利用同源克隆方法在耐寒,迟抽薹甘蓝自交系Y923中克隆到一个甘蓝响应冷胁迫b HLH转录因子基因Bob HLH18的DNA和c DNA全长,基因组搜索分析结果表明,该基因位于甘蓝1号染色体上,属于LF1亚基因组编码基因;序列分析结果表明,该基因含有4个外显子和3个内含子,编码338个氨基酸,蛋白质分子量为38 380,等电点为6. 80,其编码蛋白质的N端含有一个b HLH结构域;亚细胞定位分析指出该基因编码蛋白质定位在细胞核上,表明该基因编码蛋白质为核定位蛋白质,与其为转录因子特征相符;序列比对结果显示,Bob HLH18蛋白与白菜和拟南芥中的b HLH蛋白具有较高的同源性,相似度分别为90. 5%和89. 0%;聚类分析指出Bob HLH18及其同源蛋白分别聚类成2个进化分支,且来自十字花科植物的b HLH18同源蛋白质都聚在同一进化分支上; qRT-PCR分析结果表明Bob HLH18基因受冷胁迫诱导,能在叶片中被较高的诱导表达,表明该基因可能在甘蓝叶片应答冷胁迫过程中起重要作用。
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关键词
甘蓝
bobhlh18
转录因子
冷胁迫
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Keywords
cabbage
BoHLH18
transcription factors
cold stress
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分类号
S635
[农业科学—蔬菜学]
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