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3个白桦细胞色素P450基因生物信息学及表达分析
被引量:
5
1
作者
杨杰
孙璐
+5 位作者
王思瑶
李影
翟睿
林香雨
詹亚光
尹静
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期27-34,共8页
【目的】研究白桦细胞色素P450基因表达的组织特异性,以及在茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)、赤霉素(GA3)、脱落酸(ABA)、乙烯利和伤害处理下的基因表达模式。【方法】筛选白桦转录组,获得3个BpCYP450基因,分别命名为BpCYP4、BpCYP5、BpC...
【目的】研究白桦细胞色素P450基因表达的组织特异性,以及在茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)、赤霉素(GA3)、脱落酸(ABA)、乙烯利和伤害处理下的基因表达模式。【方法】筛选白桦转录组,获得3个BpCYP450基因,分别命名为BpCYP4、BpCYP5、BpCYP14,利用生物信息学分析BpCYP450蛋白的分子结构特征及其与其他物种CYP450蛋白的亲缘关系。采用QRT-PCR技术,对白桦BpCYP450组织特异性、激素信号及伤害诱导下的表达特征进行分析。【结果】生物信息学结果表明BpCYP4、BpCYP5、BpCYP14 cDNA序列长度分别为1 569、1 584和1 530 bp,具有完整的开放阅读框(ORF),分别编码522、527和509个氨基酸,均为亲水性跨膜蛋白,主要定位于叶绿体。白桦BpCYP450与百脉根、扁豆及豌豆等豆科植物CYP450蛋白亲缘性较高。组织特异性分析结果显示,3个BpCYP450基因在叶和根中表达较高,茎中较低。激素信号及伤害诱导结果表明,3个BpCYP450基因不同程度地响应Me JA、SA、GA3、ABA、乙烯利激素信号及伤害诱导。【结论】3个BpCYP450基因均为CYP450基因家族的新成员,具有组织特异性及激素诱导表达特性,可能在白桦生长发育、抵御胁迫及代谢物合成中发挥重要作用。
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关键词
白桦
bpcyp450
表达模式分析
生物信息学分析
原文传递
题名
3个白桦细胞色素P450基因生物信息学及表达分析
被引量:
5
1
作者
杨杰
孙璐
王思瑶
李影
翟睿
林香雨
詹亚光
尹静
机构
东北林业大学生命科学学院
林木遗传育种与生物技术国家重点实验室
出处
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第6期27-34,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31570589)
中央高校基本科研业务费专项资金项目(257-2017DY02)
东北林业大学创新创业训练项目(201710225109)
文摘
【目的】研究白桦细胞色素P450基因表达的组织特异性,以及在茉莉酸甲酯(MeJA)、水杨酸(SA)、赤霉素(GA3)、脱落酸(ABA)、乙烯利和伤害处理下的基因表达模式。【方法】筛选白桦转录组,获得3个BpCYP450基因,分别命名为BpCYP4、BpCYP5、BpCYP14,利用生物信息学分析BpCYP450蛋白的分子结构特征及其与其他物种CYP450蛋白的亲缘关系。采用QRT-PCR技术,对白桦BpCYP450组织特异性、激素信号及伤害诱导下的表达特征进行分析。【结果】生物信息学结果表明BpCYP4、BpCYP5、BpCYP14 cDNA序列长度分别为1 569、1 584和1 530 bp,具有完整的开放阅读框(ORF),分别编码522、527和509个氨基酸,均为亲水性跨膜蛋白,主要定位于叶绿体。白桦BpCYP450与百脉根、扁豆及豌豆等豆科植物CYP450蛋白亲缘性较高。组织特异性分析结果显示,3个BpCYP450基因在叶和根中表达较高,茎中较低。激素信号及伤害诱导结果表明,3个BpCYP450基因不同程度地响应Me JA、SA、GA3、ABA、乙烯利激素信号及伤害诱导。【结论】3个BpCYP450基因均为CYP450基因家族的新成员,具有组织特异性及激素诱导表达特性,可能在白桦生长发育、抵御胁迫及代谢物合成中发挥重要作用。
关键词
白桦
bpcyp450
表达模式分析
生物信息学分析
Keywords
Betula platyphylla Suk.
bpcyp450
genes
expression patterns
bioinformatics analysis
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
S792.153 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
3个白桦细胞色素P450基因生物信息学及表达分析
杨杰
孙璐
王思瑶
李影
翟睿
林香雨
詹亚光
尹静
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2018
5
原文传递
已选择
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条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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