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白菜BrYUCCA5.1基因表达和生物信息学及功能分析
被引量:
1
1
作者
孙国胜
李瑞
+2 位作者
潘尧铧
侯喜林
张昌伟
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期259-266,共8页
[目的]本文旨在研究白菜YUCCA家族基因BrYUCCA5.1在结球白菜和不结球白菜叶片中的表达模式,并探索其在白菜叶片发育中的作用。[方法]利用生物信息学软件对BrYUCCA5.1基因的进化关系、编码蛋白质的保守结构域、蛋白质的理化性质等特性进...
[目的]本文旨在研究白菜YUCCA家族基因BrYUCCA5.1在结球白菜和不结球白菜叶片中的表达模式,并探索其在白菜叶片发育中的作用。[方法]利用生物信息学软件对BrYUCCA5.1基因的进化关系、编码蛋白质的保守结构域、蛋白质的理化性质等特性进行分析;利用实时荧光定量PCR检测结球白菜W30和不结球白菜082及其F2代植株不同部位BrYUCCA5.1表达量的差异;利用芜菁黄化花叶病毒(TYMV)介导的病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术沉默不结球白菜082植株的BrYUCCA5.1,研究该基因的功能。[结果]结球白菜BrYUCCA5.1所编码的蛋白与拟南芥、野生甘蓝、甘蓝型油菜、萝卜的同源性较高;保守结构域分析结果表明BrYUCCA5.1蛋白属于FMO类超家族。该基因在结球白菜W30叶片基部和中部以及F2代结球单株叶片基部的表达量极显著高于其他不结球单株。利用VIGS技术沉默不结球白菜的BrYUCCA5.1,沉默效率达84%,且与对照组相比,BrYUCCA5.1-pTY发病株叶片出现大面积病毒侵染症状,叶片卷曲皱缩,表现出远轴化的形态。[结论]BrYUCCA5.1基因参与调控白菜的叶片发育,且在结球白菜叶球发育过程中具有重要作用。
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关键词
白菜
bryucca5.1基因
VIGS技术
叶片发育
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职称材料
携带非A5.1型MHC-Ⅰ类相关分子A穿膜区等位基因中晚期食管癌患者对NK细胞免疫治疗的敏感性高
被引量:
1
2
作者
周智锋
王玲
+4 位作者
林万松
陈淑萍
李洁羽
叶韵斌
郑庆丰
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期639-644,共6页
目的:探讨非A5.1型MHC-Ⅰ类相关分子A(MHC classⅠ-related molecules A,MICA)穿膜区等位基因对中晚期食管癌患者术后化疗联合NK细胞免疫治疗疗效的影响。方法:选取福建省肿瘤医院2013年4月至2015年10月收治的中晚期(TNMⅢ-Ⅳa期)食管...
目的:探讨非A5.1型MHC-Ⅰ类相关分子A(MHC classⅠ-related molecules A,MICA)穿膜区等位基因对中晚期食管癌患者术后化疗联合NK细胞免疫治疗疗效的影响。方法:选取福建省肿瘤医院2013年4月至2015年10月收治的中晚期(TNMⅢ-Ⅳa期)食管癌患者152例,均在姑息性手术后行全身化疗,根据患者MICA穿膜区等位基因是否为A5.1分为4组:(1)A5.1化疗+NK细胞治疗(A5.1+NK)组;(2)A5.1单纯化疗(A5.1)组;(3)非A5.1化疗+NK细胞治疗(no A5.1+NK)组;(4)非A5.1单纯化疗(no A5.1)组,观察各组患者临床疗效。构建食管癌组织标本MICA等位基因A5.1的真核表达载体p TE-1A5.1,转染食管癌TE-1细胞株;Western blotting检测p TE-1A5.1转染对TE-1细胞MICA蛋白表达的影响,LDH法检测TE-1细胞转染p TE-1A5.1前后对NK细胞杀伤敏感性的变化,ELISA法检测食管癌患者血清可溶性MICA及转染p TE-1A5.1前后TE-1细胞上清中可溶性MICA含量。结果:经过3年的随防,A5.1+NK组患者中位总生存期(medium overall survival,m OS)为15.0个月,A5.1组为16.0个月,no A5.1+NK组为22.4个月,no A5.1组为16.0个月,no A5.1+NK组m OS明显长于其他3组(P<0.05)。经Cox多因素回归分析发现,患者年龄、性别、ECOG评分及基因型与预后均无明显相关(P>0.05),将基因类型与是否NK细胞治疗进行交叉分析,no A5.1+NK组m OS明显长于其他3组(P<0.01)。转染p TE-1A5.1后TE-1细胞内MICA表达显著升高,培养液上清可溶性MICA分泌明显增加[(256.2±45.3)vs(45.3±11.5)pg/ml,P<0.01];与转染前相比,NK细胞对过表达MICA的TE-1细胞的杀伤率明显降低[(29.5±7.2)%vs(42.5±7.1)%,P<0.05]。结论:相对中晚期食管癌MICA穿膜区A5.1等位基因患者,非A5.1基因患者手术后化疗联合NK细胞的疗效较好,其机制与其不容易产生可溶性MICA密切相关。
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关键词
食管癌
A
5.1
型MHC-Ⅰ类相关分子A
MICA等位
基因
免疫治疗
下载PDF
职称材料
MICA-A5.1基因突变对乙型肝炎相关肝癌患者预后的影响及机制研究
被引量:
2
3
作者
王凤超
俞致贤
徐瑞峰
《热带医学杂志》
CAS
2021年第5期591-595,F0004,共6页
目的探讨MHC-Ⅰ类链相关基因A-A5.1(MICA-A5.1)对乙型肝炎相关肝癌患者预后的影响及相关机制研究。方法选取2013年1月-2015年1月期间在南阳市中心医院住院治疗的196例乙型肝炎相关肝癌患者为研究对象,对所有患者术后进行160个月随访。分...
目的探讨MHC-Ⅰ类链相关基因A-A5.1(MICA-A5.1)对乙型肝炎相关肝癌患者预后的影响及相关机制研究。方法选取2013年1月-2015年1月期间在南阳市中心医院住院治疗的196例乙型肝炎相关肝癌患者为研究对象,对所有患者术后进行160个月随访。分析MICA-A5.1基因与乙型肝炎相关肝癌患者临床病理特征的关系;应用Transwell实验分析乙型肝炎相关肝癌患者肿瘤细胞的侵袭能力;利用流式细胞术检测乙型肝炎相关肝癌患者肿瘤细胞凋亡情况;用Kaplan-Meier法分析携带与未携带MICA-A5.1基因的乙肝肝癌患者生存曲线。结果MICA-A5.1基因与乙型肝炎相关肝癌患者TNM分期、肿瘤大小、病理分化程度有关(χ^(2)=6.716、18.463、5.431,P<0.05)。携带MICA-A5.1基因的乙型肝炎相关肝癌患者的累积生存率显著低于未携带MICA-A5.1基因患者(0%vs.14.3%),差异有统计学意义(χ^(2)=11.800,P<0.05)。与未携带MICA-A5.1基因患者肿瘤细胞相比,携带MICA-A5.1基因的乙型肝炎相关肝癌患者肿瘤细胞侵袭率较高[(17.54±2.63)%vs.(48.23±5.91)%],差异有统计学意义(t=44.390,P<0.05),凋亡率较低[(32.41±2.74)%vs.(18.74±2.16)%],差异有统计学意义(t=39.052,P<0.05)。结论携带MICA-A5.1基因的乙型肝炎相关肝癌患者病情较重,肿瘤细胞恶性程度较高,且预后较差,提示MICA-A5.1基因可能与乙型肝炎相关肝癌患者病情进展及预后密切相关。
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关键词
MHC-Ⅰ类链相关
基因
A-A
5.1
乙肝
肝癌
TNM分期
原文传递
题名
白菜BrYUCCA5.1基因表达和生物信息学及功能分析
被引量:
1
1
作者
孙国胜
李瑞
潘尧铧
侯喜林
张昌伟
机构
南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室
江苏丘陵地区镇江农业科学研究所
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第2期259-266,共8页
基金
江苏省农业科技自主创新资金[CX(19)3038]。
文摘
[目的]本文旨在研究白菜YUCCA家族基因BrYUCCA5.1在结球白菜和不结球白菜叶片中的表达模式,并探索其在白菜叶片发育中的作用。[方法]利用生物信息学软件对BrYUCCA5.1基因的进化关系、编码蛋白质的保守结构域、蛋白质的理化性质等特性进行分析;利用实时荧光定量PCR检测结球白菜W30和不结球白菜082及其F2代植株不同部位BrYUCCA5.1表达量的差异;利用芜菁黄化花叶病毒(TYMV)介导的病毒诱导的基因沉默(VIGS)技术沉默不结球白菜082植株的BrYUCCA5.1,研究该基因的功能。[结果]结球白菜BrYUCCA5.1所编码的蛋白与拟南芥、野生甘蓝、甘蓝型油菜、萝卜的同源性较高;保守结构域分析结果表明BrYUCCA5.1蛋白属于FMO类超家族。该基因在结球白菜W30叶片基部和中部以及F2代结球单株叶片基部的表达量极显著高于其他不结球单株。利用VIGS技术沉默不结球白菜的BrYUCCA5.1,沉默效率达84%,且与对照组相比,BrYUCCA5.1-pTY发病株叶片出现大面积病毒侵染症状,叶片卷曲皱缩,表现出远轴化的形态。[结论]BrYUCCA5.1基因参与调控白菜的叶片发育,且在结球白菜叶球发育过程中具有重要作用。
关键词
白菜
bryucca5.1基因
VIGS技术
叶片发育
Keywords
Chinese cabbage
bryucca
5.1
gene
VIGS technology
leaf development
分类号
S634.3 [农业科学—蔬菜学]
下载PDF
职称材料
题名
携带非A5.1型MHC-Ⅰ类相关分子A穿膜区等位基因中晚期食管癌患者对NK细胞免疫治疗的敏感性高
被引量:
1
2
作者
周智锋
王玲
林万松
陈淑萍
李洁羽
叶韵斌
郑庆丰
机构
福建省肿瘤医院肿瘤免疫学研究室福建医科大学附属肿瘤医院福建省肿瘤转化医学重点实验室
福建省肿瘤医院胸外科
出处
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期639-644,共6页
基金
福建省卫生系统中青年骨干人才培养资助项目(No.2014-ZQN-JC-7)
福建省自然科学基金资助项目(No.2015J01378
No.2015J01433)~~
文摘
目的:探讨非A5.1型MHC-Ⅰ类相关分子A(MHC classⅠ-related molecules A,MICA)穿膜区等位基因对中晚期食管癌患者术后化疗联合NK细胞免疫治疗疗效的影响。方法:选取福建省肿瘤医院2013年4月至2015年10月收治的中晚期(TNMⅢ-Ⅳa期)食管癌患者152例,均在姑息性手术后行全身化疗,根据患者MICA穿膜区等位基因是否为A5.1分为4组:(1)A5.1化疗+NK细胞治疗(A5.1+NK)组;(2)A5.1单纯化疗(A5.1)组;(3)非A5.1化疗+NK细胞治疗(no A5.1+NK)组;(4)非A5.1单纯化疗(no A5.1)组,观察各组患者临床疗效。构建食管癌组织标本MICA等位基因A5.1的真核表达载体p TE-1A5.1,转染食管癌TE-1细胞株;Western blotting检测p TE-1A5.1转染对TE-1细胞MICA蛋白表达的影响,LDH法检测TE-1细胞转染p TE-1A5.1前后对NK细胞杀伤敏感性的变化,ELISA法检测食管癌患者血清可溶性MICA及转染p TE-1A5.1前后TE-1细胞上清中可溶性MICA含量。结果:经过3年的随防,A5.1+NK组患者中位总生存期(medium overall survival,m OS)为15.0个月,A5.1组为16.0个月,no A5.1+NK组为22.4个月,no A5.1组为16.0个月,no A5.1+NK组m OS明显长于其他3组(P<0.05)。经Cox多因素回归分析发现,患者年龄、性别、ECOG评分及基因型与预后均无明显相关(P>0.05),将基因类型与是否NK细胞治疗进行交叉分析,no A5.1+NK组m OS明显长于其他3组(P<0.01)。转染p TE-1A5.1后TE-1细胞内MICA表达显著升高,培养液上清可溶性MICA分泌明显增加[(256.2±45.3)vs(45.3±11.5)pg/ml,P<0.01];与转染前相比,NK细胞对过表达MICA的TE-1细胞的杀伤率明显降低[(29.5±7.2)%vs(42.5±7.1)%,P<0.05]。结论:相对中晚期食管癌MICA穿膜区A5.1等位基因患者,非A5.1基因患者手术后化疗联合NK细胞的疗效较好,其机制与其不容易产生可溶性MICA密切相关。
关键词
食管癌
A
5.1
型MHC-Ⅰ类相关分子A
MICA等位
基因
免疫治疗
Keywords
esophageal cancer
AS. 1 MHC class Ⅰ -related molecules A
MICA allele
immunotherapy
分类号
R735.1 [医药卫生—肿瘤]
R730.51 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
MICA-A5.1基因突变对乙型肝炎相关肝癌患者预后的影响及机制研究
被引量:
2
3
作者
王凤超
俞致贤
徐瑞峰
机构
南阳市中心医院感染性疾病科
出处
《热带医学杂志》
CAS
2021年第5期591-595,F0004,共6页
基金
2019年河南省科技攻关项目(LHGJ20191457)。
文摘
目的探讨MHC-Ⅰ类链相关基因A-A5.1(MICA-A5.1)对乙型肝炎相关肝癌患者预后的影响及相关机制研究。方法选取2013年1月-2015年1月期间在南阳市中心医院住院治疗的196例乙型肝炎相关肝癌患者为研究对象,对所有患者术后进行160个月随访。分析MICA-A5.1基因与乙型肝炎相关肝癌患者临床病理特征的关系;应用Transwell实验分析乙型肝炎相关肝癌患者肿瘤细胞的侵袭能力;利用流式细胞术检测乙型肝炎相关肝癌患者肿瘤细胞凋亡情况;用Kaplan-Meier法分析携带与未携带MICA-A5.1基因的乙肝肝癌患者生存曲线。结果MICA-A5.1基因与乙型肝炎相关肝癌患者TNM分期、肿瘤大小、病理分化程度有关(χ^(2)=6.716、18.463、5.431,P<0.05)。携带MICA-A5.1基因的乙型肝炎相关肝癌患者的累积生存率显著低于未携带MICA-A5.1基因患者(0%vs.14.3%),差异有统计学意义(χ^(2)=11.800,P<0.05)。与未携带MICA-A5.1基因患者肿瘤细胞相比,携带MICA-A5.1基因的乙型肝炎相关肝癌患者肿瘤细胞侵袭率较高[(17.54±2.63)%vs.(48.23±5.91)%],差异有统计学意义(t=44.390,P<0.05),凋亡率较低[(32.41±2.74)%vs.(18.74±2.16)%],差异有统计学意义(t=39.052,P<0.05)。结论携带MICA-A5.1基因的乙型肝炎相关肝癌患者病情较重,肿瘤细胞恶性程度较高,且预后较差,提示MICA-A5.1基因可能与乙型肝炎相关肝癌患者病情进展及预后密切相关。
关键词
MHC-Ⅰ类链相关
基因
A-A
5.1
乙肝
肝癌
TNM分期
Keywords
MICA-A
5.1
Hepatitis B
Liver cancer
TNM stage
分类号
R735.7 [医药卫生—肿瘤]
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作者
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1
白菜BrYUCCA5.1基因表达和生物信息学及功能分析
孙国胜
李瑞
潘尧铧
侯喜林
张昌伟
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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职称材料
2
携带非A5.1型MHC-Ⅰ类相关分子A穿膜区等位基因中晚期食管癌患者对NK细胞免疫治疗的敏感性高
周智锋
王玲
林万松
陈淑萍
李洁羽
叶韵斌
郑庆丰
《中国肿瘤生物治疗杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
下载PDF
职称材料
3
MICA-A5.1基因突变对乙型肝炎相关肝癌患者预后的影响及机制研究
王凤超
俞致贤
徐瑞峰
《热带医学杂志》
CAS
2021
2
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