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题名木榄ERF转录因子基因的克隆及功能分析初探
被引量:3
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作者
赵杨敏
庞俊峰
张占路
姬澎
尉亚辉
吴燕民
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机构
西北大学生命科学学院
中国农业科学院生物技术研究所
深圳市农科集团有限公司
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出处
《中国农业科技导报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期66-72,共7页
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基金
国家转基因生物新品种培育重大专项(2009ZX08005-004B
2011ZX08005-004)资助
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文摘
利用RACE-PCR技术,以深圳红树自然保护区的木榄为材料,克隆出一个ERF类转录因子基因的cDNA全长序列,命名为BgERF(GenBank序列号:GU593720)。生物信息学分析表明:该基因全长1 870 bp,完整开放阅读框1 425 bp,具有一个保守的AP2/EREBP结构域,且编码的由475个氨基酸组成的蛋白具有典型的1个α螺旋,3个β转角的三维结构,在AP2/EREBP结构域的第14位为丙氨酸(A),第19位为天冬氨酸(D),属于AP2/EREBPF蛋白家族中的ERF类转录因子;NCBI-BLAST比对结果表明:该基因与胡萝卜、拟南芥、水稻、辣椒、番茄、大豆、马铃薯、陆地棉等植物ERF类转录因子具有较高的同源性;并构建了高效植物表达载体PBI121-35s-BgERF,获得的转基因烟草与野生型相比,表现出明显的耐盐性,为该基因功能的深入分析和耐盐机理的研究奠定了基础。
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关键词
木榄
RACE-PCR技术
AP2/EREBPF蛋白
ERF转录因子
生物信息学
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Keywords
bruguiera gyrnnorhiza
RACE-PCR technology
AP2/EREBPF protein
ERF transcription factor
bioinformatics
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分类号
Q78
[生物学—分子生物学]
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