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甜菜M14品系BvM14-RIN4基因的克隆及应答盐胁迫分析
1
作者
贾惠旭
李海英
端木慧子
《中国农学通报》
2021年第14期27-33,共7页
为了研究甜菜单体附加系M14品系RIN4基因耐盐功能,本研究以甜菜M14品系为实验材料,通过PCR技术获得BvM14-RIN4基因cDNA全长序列,对BvM14-RIN4基因进行了生物信息学分析、组织特异性和应答盐胁迫分析。BvM14-RIN4基因ORF长度为264 bp,编...
为了研究甜菜单体附加系M14品系RIN4基因耐盐功能,本研究以甜菜M14品系为实验材料,通过PCR技术获得BvM14-RIN4基因cDNA全长序列,对BvM14-RIN4基因进行了生物信息学分析、组织特异性和应答盐胁迫分析。BvM14-RIN4基因ORF长度为264 bp,编码87个氨基酸,蛋白分子量为9.67 kDa,理论等电点为9.64,初步鉴定该蛋白为亲水性蛋白;BvM14-RIN4蛋白质二级结构主要由延伸链和无规卷曲组成;BvM14-RIN4蛋白质三级结构预测出该蛋白的保守结构域和疏水区;系统进化树分析结果表明BvM14-RIN4蛋白与菠菜SoRIN4和藜麦CqRIN4蛋白亲缘关系最近;荧光定量PCR结果显示,BvM14-RIN4基因在根中表达量是叶的2.26倍,说明其具有组织特异性;该基因在200 mmol/L NaCl处理后的根中上调表达,说明它参与甜菜M14品系应答盐胁迫过程。本研究在挖掘甜菜M14品系优质基因和开展甜菜遗传改良工作等方面具有重要意义,为后续该基因的功能研究提供了重要参考。
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关键词
甜菜M
14
品系
bvm14-rin4
基因克隆
生物信息学分析
荧光定量PCR
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职称材料
题名
甜菜M14品系BvM14-RIN4基因的克隆及应答盐胁迫分析
1
作者
贾惠旭
李海英
端木慧子
机构
黑龙江大学农业微生物技术教育部工程研究中心
黑龙江大学生命科学学院/黑龙江省普通高校分子生物学重点实验室
出处
《中国农学通报》
2021年第14期27-33,共7页
基金
国家自然科学基金“转录因子BvGT-1调控乙二醛酶I基因参与甜菜单体附加系耐盐的分子机制”(32072122)
国家自然基金青年项目“甜菜M14品系BvM14-RIN4蛋白盐胁迫响应蛋白互作网络的研究”(31801426)
+2 种基金
黑龙江省省属高等学校基本科研业务费基础研究项目(科技创新类专项重点项目)“甜菜M14品系与二倍体栽培甜菜的比较转录组学研究”(KJCXZD201717)
中国博士后科学基金面上项目“甜菜M14品系BvM14-RIN4基因响应盐胁迫的分子机理研究”(2019M651314)
黑龙江省普通高等学校青年创新人才培养计划“甜菜M14品系BvM14-RIN4基因耐盐功能及其蛋白调控机理研究”(UNPYSCT-2018008)。
文摘
为了研究甜菜单体附加系M14品系RIN4基因耐盐功能,本研究以甜菜M14品系为实验材料,通过PCR技术获得BvM14-RIN4基因cDNA全长序列,对BvM14-RIN4基因进行了生物信息学分析、组织特异性和应答盐胁迫分析。BvM14-RIN4基因ORF长度为264 bp,编码87个氨基酸,蛋白分子量为9.67 kDa,理论等电点为9.64,初步鉴定该蛋白为亲水性蛋白;BvM14-RIN4蛋白质二级结构主要由延伸链和无规卷曲组成;BvM14-RIN4蛋白质三级结构预测出该蛋白的保守结构域和疏水区;系统进化树分析结果表明BvM14-RIN4蛋白与菠菜SoRIN4和藜麦CqRIN4蛋白亲缘关系最近;荧光定量PCR结果显示,BvM14-RIN4基因在根中表达量是叶的2.26倍,说明其具有组织特异性;该基因在200 mmol/L NaCl处理后的根中上调表达,说明它参与甜菜M14品系应答盐胁迫过程。本研究在挖掘甜菜M14品系优质基因和开展甜菜遗传改良工作等方面具有重要意义,为后续该基因的功能研究提供了重要参考。
关键词
甜菜M
14
品系
bvm14-rin4
基因克隆
生物信息学分析
荧光定量PCR
Keywords
sugar beet M
14
line
bvm14-rin4
gene clone
bioinformatics analysis
quantitative RT-PCR
分类号
S566.3 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
甜菜M14品系BvM14-RIN4基因的克隆及应答盐胁迫分析
贾惠旭
李海英
端木慧子
《中国农学通报》
2021
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