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靶向人c-Cbl基因重组干扰慢病毒与过表达腺病毒载体的构建、鉴定以及病毒功效研究
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作者 孙启鑫 吴秉毅 +2 位作者 姚倩倩 黄志伟 朱志刚 《中国实验血液学杂志》 CSCD 北大核心 2024年第1期274-281,共8页
目的:构建可调控c-Cbl基因表达的重组慢病毒与腺病毒并评估其功效。方法:应用基因重组技术,分别构建靶向人c-Cbl基因的干扰慢病毒和过表达腺病毒。采用定量PCR和免疫印迹法检测病毒感染后白血病细胞(HL60、THP1)c-Cbl基因表达与转录本... 目的:构建可调控c-Cbl基因表达的重组慢病毒与腺病毒并评估其功效。方法:应用基因重组技术,分别构建靶向人c-Cbl基因的干扰慢病毒和过表达腺病毒。采用定量PCR和免疫印迹法检测病毒感染后白血病细胞(HL60、THP1)c-Cbl基因表达与转录本的变化。结果:3个靶向人c-Cbl基因的重组干扰慢病毒载体经测序验证构建成功,包装的病毒滴度均大于1×10^(8)TU/ml,其中shRNA-2号慢病毒干扰效率最高,白血病细胞感染后c-Cbl基因的表达约下调95%,CBL蛋白的表达约下调60%;同时,靶向人c-Cbl基因的重组过表达腺病毒载体也经测序验证构建成功,包装的病毒滴度大于1×10^(9)TU/ml,细胞感染腺病毒后,c-Cbl基因表达可瞬时上调约10倍,CBL蛋白表达约上调1.5倍。结论:重组干扰慢病毒和过表达腺病毒均可高效感染白血病细胞,并能分别下调和上调c-Cbl基因与CBL蛋白的表达,为后续研究肿瘤细胞内c-Cbl基因功能打下前期基础。 展开更多
关键词 c-cbl基因 慢病毒载体 腺病毒载体
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基于线粒体COⅠ基因序列的梭鲈野生群体遗传结构
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作者 鲁翠云 孙志鹏 +4 位作者 曹顶臣 耿龙武 那荣滨 吴学工 郑先虎 《水产学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期82-92,共11页
为了解梭鲈种群的遗传结构,实验利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因部分序列分析了中国6个和中亚2个群体的遗传差异,并与欧洲群体的单倍型序列进行了比较。结果在640 bp的COⅠ基因序列中检测到5个变异位点,定义了7种单倍型,发现... 为了解梭鲈种群的遗传结构,实验利用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ)基因部分序列分析了中国6个和中亚2个群体的遗传差异,并与欧洲群体的单倍型序列进行了比较。结果在640 bp的COⅠ基因序列中检测到5个变异位点,定义了7种单倍型,发现Hap1为8个梭鲈群体的共享单倍型,且与欧洲群体的HapA相同,在中国群体所占比例(93.36%)高于中亚群体(72.58%)和欧洲群体(53.85%);Hap2和Hap3是中国群体的特异单倍型,而Hap4~Hap7为中亚群体的特异单倍型。单倍型序列的聚类图和网络图均显示Hap1/A为梭鲈群体的原始单倍型,中国和中亚群体的特异单倍型相对于原始单倍型仅有1~2个位点的变异,属于Hap1/A的亚型,与欧洲群体的特异单倍型具有较大的差异。每个群体检测到1~4种单倍型,斋桑湖(ZS)群体单倍型最多,而中国的腾格里湖(NX)、兴凯湖(XK)和鸭绿江(YJ)群体仅有1个单倍型(Hap1);塔什干(TS)群体的单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(π)最高(Hd=0.514±0.069;π=0.00079±0.00011),其次是ZS群体,而中国梭鲈群体的多样性参数较低。AMOVA分析结果显示,梭鲈群体间遗传变异占20.74%,群体间遗传分化程度较高(0.15≤F_(st)=0.20736<0.25),TS群体与ZS群体和中国群体间的遗传分化极大(F_(st)>0.25),中国群体中仅黑河(HH)群体与其他群体的遗传分化较大,而中国其他5个群体间无遗传分化。基于群体间遗传距离的系统进化树显示,来自中国的6个梭鲈群体与哈萨克斯坦的ZS群体聚为一支,而乌兹别克斯坦的TS群体独立为一支。研究结果为梭鲈群体的繁殖及放流管理提供了参考。 展开更多
关键词 梭鲈 线粒体cOⅠ基因 野生群体 遗传结构
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OCA2基因c.1441G>A(p.Ala481Thr)位点变异的生育遗传咨询探讨
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作者 冯晓琴 袁彩霞 《中国产前诊断杂志(电子版)》 2024年第1期22-28,共7页
目的对OCA2基因c.1441G>A(p.Ala481Thr)位点变异白化病家系的遗传咨询和生育指导。方法丈夫,26岁,轻度白化病表现,毛发偏黄,皮肤白皙,视力正常,无白化病相关系统受累表现。妻子,27岁,G_(0)P_(0),身体良好。夫妇属非近亲婚配。现备孕... 目的对OCA2基因c.1441G>A(p.Ala481Thr)位点变异白化病家系的遗传咨询和生育指导。方法丈夫,26岁,轻度白化病表现,毛发偏黄,皮肤白皙,视力正常,无白化病相关系统受累表现。妻子,27岁,G_(0)P_(0),身体良好。夫妇属非近亲婚配。现备孕咨询,评估生育白化病患儿风险。遗传咨询后,建议其进行遗传性白化病相关基因的测序检测。以“OCA2基因,c.1441G>A位点”为检索词,检索Pubmed、OMIM、Clinvar数据库、中国知网、万方数据库(建库至2023年10月),选取OCA2基因c.1441G>A(p.Ala481Thr)变异相关的白化病病例相关资料文献。结果结果显示,丈夫OCA2基因存在2个变异,分别为NM_000275.3:c.182G>A(p.Trp61*)和NM_000275.3:c.1426A>G(p.Asn476Asp),妻子OCA2基因有1个杂合变异,为NM_000275.3:c.1441G>A(p.Ala481Thr)。Sanger溯源验证,丈夫所携无义变异c.182G>A(p.Trp61*)来源其母亲,所携错义变异c.1426A>G(p.Asn476Asp)变异来源其父亲。妻子所携错义变异c.1441G>A(p.Ala481Thr)并非来源其父亲,其母亲信息不详。使用数据库搜索c.1441G>A变异的表型效应,得知c.1441G>A(p.Ala481Thr)属于一种亚等效变异,Ala481Thr在黑色素形成中有70%的野生型功能,纯合子无表现,表型正常。据c.1441G>A的亚等效作用,遗传咨询后,夫妇知情同意选择自然怀孕方式。随访这对夫妇怀孕并分娩1表型正常女儿。经测序验证,女儿遗传了父亲c.1426A>G(p.Asn476Asp)变异和母亲正常OCA2基因。结论报道一例白化病OCA2基因c.1441G>A变异相关的生育遗传咨询案例,复习文献,总结c.1441G>A(p.Ala481Thr)白化病的亚等效作用所产生的表型特异性,帮助临床医生正确认识合理运用恰当的遗传学检测手段和深刻理解临床决策前充分遗传咨询的重要性,从而提高对该类变异的遗传咨询能力,有效地避免了过度医疗。 展开更多
关键词 白化病 OcA2基因 c.1441G>A位点变异 遗传咨询
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基于drop-off ddPCR方法检测急性髓系白血病C-KIT基因N822位点突变及其临床应用
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作者 李婷 金晔 +7 位作者 袁倩 姚冬明 向鹤麟 肖高飞 于迪 冷加燕 林江 钱军 《江苏大学学报(医学版)》 CAS 2024年第2期151-155,160,共6页
目的:建立急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)患者C-KIT基因N822位点突变的drop-off微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)定量检测方法,并评价其临床应用价值。方法:针对C-KIT基因第17外显子设计一对引物及探针,优化drop... 目的:建立急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)患者C-KIT基因N822位点突变的drop-off微滴式数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)定量检测方法,并评价其临床应用价值。方法:针对C-KIT基因第17外显子设计一对引物及探针,优化drop-off ddPCR反应条件及体系,评价该方法的特异性、灵敏度、重复性,使用所建立的方法对140例已行Sanger测序的AML初诊患者骨髓标本进行检测,并用二代测序(next generation sequencing, NGS)验证结果;用drop-off ddPCR对3例阳性患者化疗后C-KIT突变频率进行动态监测。结果:drop-off ddPCR检测C-KIT基因N822位点突变的最适退火温度为54℃,空白检测限为1.62拷贝数/μL,最低检测下限为10.12拷贝数/μL,线性良好。140例AML初诊患者样本中Sanger测序检出2例阳性(1.4%),而ddPCR共检出突变7例(5.0%),突变频率为0.29%~7.41%;进一步应用常规NGS方法对ddPCR阳性样本进行验证,共检出阳性3例(2.1%),等位基因频率为1.26%~8.00%。动态监测3例阳性患者C-KIT突变频率,结果显示治疗达完全缓解时C-KIT突变频率明显下降甚至降低至0。结论:本研究建立了检测C-KIT基因N822位点突变的drop-off ddPCR技术,具有良好的方法学检测性能,其灵敏度高于Sanger测序和NGS,有望用于阳性患者缓解后的可检测残留疾病监测及治疗指导。 展开更多
关键词 drop-off微滴式数字PcR c-KIT基因 基因突变 微小残留病 急性髓系白血病 预后
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猫CDH1基因在过表达c-MYC成纤维细胞中的表达变化及生物信息学分析
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作者 安洁 杨洁 +4 位作者 窦敏敏 孙楠楠 赵迪鹏 杜荣 秦健 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期443-452,共10页
[目的]试验旨在研究骨髓细胞瘤病毒癌基因同源物(myelocytomatosis viral oncogene homolog, c-MYC)对猫成纤维细胞的影响及其与E-钙黏蛋白(cadherin 1,CDH1)基因表达和分子特性的关系,为将其应用于猫肿瘤疾病防治和组织损伤修复提供依... [目的]试验旨在研究骨髓细胞瘤病毒癌基因同源物(myelocytomatosis viral oncogene homolog, c-MYC)对猫成纤维细胞的影响及其与E-钙黏蛋白(cadherin 1,CDH1)基因表达和分子特性的关系,为将其应用于猫肿瘤疾病防治和组织损伤修复提供依据。[方法]通过组织贴壁法对猫胎儿成纤维细胞进行分离培养,利用电转仪将PB-TRE-c-MYC质粒转染至细胞并观察细胞形态,利用实时荧光定量PCR检测CDH1基因的表达情况,并通过生物信息学软件分析CDH1蛋白的理化性质和结构特征。[结果]过表达c-MYC导致细胞形态发生变化,从间质细胞的长梭型向上皮细胞的鹅卵石状发生转变,且使上皮细胞标志基因CDH1的表达极显著上调(P<0.01)。生物信息学分析显示,猫CDH1蛋白有881个氨基酸,其中含量最多的是亮氨酸,定位于细胞膜,存在4个CA结构域,介导细胞与细胞的接触,属于亲水性的酸性蛋白,主要由无规则卷曲组成,可能存在由Sec易位子转运并被信号肽酶Ⅰ(Sec/SPⅠ)切割的信号肽位点。[结论]猫CDH1基因的表达可被外源性重编程因子c-MYC激活,其编码的钙黏蛋白可促进猫胎儿成纤维细胞的间质-上皮转化,以抑制细胞癌化。 展开更多
关键词 c-MYc基因 cDH1基因 间质-上皮转化
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体外膜氧合联合介入取栓救治蛋白C基因突变所致高危肺栓塞一例
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作者 谢玉华 张安 +1 位作者 曾瀚庆 曹云星 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期293-296,共4页
遗传性蛋白C缺陷症是由蛋白C基因突变引起的一种染色体遗传病,可导致静脉血栓形成,多与外显子4~9和内含子8的突变有关。蛋白C基因突变引起的致死性肺栓塞罕见,治疗面临巨大挑战。本文报道1例由蛋白C基因8号外显子移码突变引起的致死性... 遗传性蛋白C缺陷症是由蛋白C基因突变引起的一种染色体遗传病,可导致静脉血栓形成,多与外显子4~9和内含子8的突变有关。蛋白C基因突变引起的致死性肺栓塞罕见,治疗面临巨大挑战。本文报道1例由蛋白C基因8号外显子移码突变引起的致死性肺栓塞,采用体外膜氧合进行呼吸、循环支持,并成功实行介入取栓的救治经验,为该疾病的诊断及救治提供参考。 展开更多
关键词 蛋白c缺陷症 蛋白c基因 基因检测 肺栓塞 体外膜氧合 介入取栓
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CDKN1C gene mutation causing familial Silver–Russell syndrome:A case report and review of literature
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作者 Jie Li Li-Na Chen Hai-Lan He 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2023年第19期4655-4663,共9页
BACKGROUND Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C(CDKN1C)is a cell proliferation inhibitor that regulates the cell cycle and cell growth through G1 cell cycle arrest.CDKN1C mutations can lead to IMAGe syndrome(CDKN1C al... BACKGROUND Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C(CDKN1C)is a cell proliferation inhibitor that regulates the cell cycle and cell growth through G1 cell cycle arrest.CDKN1C mutations can lead to IMAGe syndrome(CDKN1C allele gain-of-function mutations lead to intrauterine growth restriction,metaphyseal dysplasia,adrenal hypoplasia congenital,and genitourinary malformations).We present a Silver-Russell syndrome(SRS)pedigree that was due to a missense mutation affecting the same amino acid position,279,in the CDKN1C gene,resulting in the amino acid substitution p.Arg279His(c.836G>A).The affected family members had an SRS phenotype but did not have limb asymmetry or adrenal insufficiency.The amino acid changes in this specific region were located in a narrow functional region that contained mutations previously associated with IMAGe syndrome.In familial SRS patients,the PCNA region of CDKN1C should be analysed.Adrenal insufficiency should be excluded in all patients with functional CDKN1C variants.CASE SUMMARY We describe the case of an 8-year-old girl who initially presented with short stature.Her height was 91.6 cm,and her weight was 10.2 kg.Physical examination revealed that she had a relatively large head,an inverted triangular face,a protruding forehead,a low ear position,sunken eye sockets,and irregular cracked teeth but no limb asymmetry.Family history:The girl’s mother,greatgrandmother,and grandmother’s brother also had a prominent forehead,triangular face,and severely proportional dwarfism but no limb asymmetry or adrenal insufficiency.Exome sequencing of the girl revealed a new heterozygous CDKN1C(NM_000076.2)c.836G>A mutation,resulting in a variant with a predicted evolutionarily highly conserved arginine substituted by histidine(p.Arg279His).The same causative mutation was found in both the proband’s mother,great-grandmother,and grandmother’s brother,who had similar phenotypes.Thus far,we found an SRS pedigree,which was due to a missense mutation affecting the same amino acid position,279,in the CDKN1C gene,resulting in the amino acid substitution p.Arg279His(c.836G>A).Although the SRS-related CDKN1C mutation is in the IMAGe-related mutation hotspot region[the proliferating cell nuclear antigen(PCNA)domain],no adrenal insufficiency was reported in this SRS pedigree.The reason may be that the location of the genomic mutation and the type of missense mutation determines the phenotype.The proband was treated with recombinant human growth hormone(rhGH).After 1 year of rhGH treatment,the height standard deviation score of the proband increased by 0.93 standard deviation score,and her growth rate was 8.1 cm/year.No adverse reactions,such as abnormal blood glucose,were found.CONCLUSION Functional mutations in CDKN1C can lead to familial SRS without limb asymmetry,and some patients may have glucose abnormalities.In familial SRS patients,the PCNA region of CDKN1C should be analysed.Adrenal insufficiency should be excluded in all patients with functional CDKN1C variants. 展开更多
关键词 cDKN1c gene Silver-Russell syndrome MUTATION case report
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鸽微RNA病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立
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作者 张靖鹏 陈翠腾 +5 位作者 林琳 付环茹 李兆龙 江斌 黄瑜 万春和 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期860-866,共7页
旨在建立鸽微RNA病毒(pigeon megrivirus,PiMeV)实时荧光定量RT-PCR检测方法。本研究根据GenBank中PiMeVs序列特征设计特异性检测引物,从信鸽粪便中检测到PiMeV阳性(命名为PiMeV-CHN001株),并对其3 C基因进行核苷酸同源性比较和遗传进... 旨在建立鸽微RNA病毒(pigeon megrivirus,PiMeV)实时荧光定量RT-PCR检测方法。本研究根据GenBank中PiMeVs序列特征设计特异性检测引物,从信鸽粪便中检测到PiMeV阳性(命名为PiMeV-CHN001株),并对其3 C基因进行核苷酸同源性比较和遗传进化分析,明确其基因特征后,设计特异性实时荧光定量RT-PCR检测(RT-qPCR)引物组,建立检测PiMeV的RT-qPCR方法。结果显示:PiMeV-CHN001株3 C基因全长为591 bp,编码197个氨基酸,和其他2株野鸽源PiMeV(MeV-B1株和MeV-B2株)核苷酸相似性分别为89.5%和92.0%。建立的检测PiMeV的RT-qPCR方法的标准曲线Y轴截距为37.93,斜率为-3.335,相关系数为1.00,扩增效率为99.4%。特异性强,仅PiMeV出现特异性扩增信号和特异性峰值[Tm值为(81.69±0.22)℃],对鸽源禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)、鸽源禽I型副黏病毒(pigeon paramyxovirus type I,PPMV-1)、鸽输血传播病毒(pigeon torque teno virus,PTTV)、鸽腺病毒(pigeon adenovirus,PiAd)及鸽圆环病毒(pigeon circovirus,PiCV)检测均未见特异性扩增信号;敏感性优,最低检测限为54.0拷贝·μL^(-1);重复性好,批内和批间变异系数均低于1.5%。用建立的检测方法对42份信鸽粪便样品进行检测,发现2份阳性样品(阳性率为4.76%)。本研究首次证实我国大陆地区信鸽中存在PiMeV,丰富了PiMeV宿主谱信息;建立的RT-qPCR方法为后续开展PiMeV流行病学研究提供支撑。 展开更多
关键词 信鸽 鸽微RNA病毒 3 c基因 序列分析 实时荧光定量RT-PcR方法
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鲤多拷贝基因MRC1的全基因组鉴定及表达分析
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作者 常松欢 王嘉利 +3 位作者 许建 张瀚元 张天杨 江炎亮 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2024年第1期85-94,共10页
甘露糖受体C1型基因(mannose receptor C-type 1,MRC1)是C型凝集素超家族的成员之一,其编码的甘露糖受体是一种模式识别受体,在先天免疫反应中发挥关键作用。MRC1基因在哺乳动物免疫反应中的作用被广泛研究,但在鱼类中的研究较少。近年... 甘露糖受体C1型基因(mannose receptor C-type 1,MRC1)是C型凝集素超家族的成员之一,其编码的甘露糖受体是一种模式识别受体,在先天免疫反应中发挥关键作用。MRC1基因在哺乳动物免疫反应中的作用被广泛研究,但在鱼类中的研究较少。近年来,随着高密度集约化养殖模式的发展,由病原微生物引发的疾病频繁暴发,其中,嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)是常见的致病菌之一。本研究首次在鲤(Cyprinus carpio)全基因组范围鉴定MRC1基因,共发现11个基因拷贝,并进行了功能域预测、共线性分析、多序列比对和系统进化分析,结果表明,MRC1基因在物种进化过程中保守程度较高。拷贝数比较分析发现,MRC1基因在不同物种中表现出不同程度的多拷贝现象,在多数鱼类中发现2个拷贝,而在鲤中发现多达11个拷贝。同时,比较了各拷贝在健康鲤脑、肌肉、肝脏和脾脏组织中的表达情况,发现在免疫相关组织脾脏中的表达量相对高于其他组织。进一步对感染嗜水气单胞菌4、12、24 h后在鲤脾脏中的表达进行差异比较分析,发现不同拷贝的表达特征各有差异,其中,HHLG13g0734在感染嗜水气单胞菌4 h后表达显著上调,HHLG13g0734在感染24h后表现出极显著上调,HHLG3g0497在整个感染过程中表达显著下调,表明鲤MRC1基因只有部分拷贝保留了免疫相关功能及参与机体的免疫反应。本研究结果有助于进一步了解鲤MRC1基因在抵抗嗜水气单胞菌感染过程中发挥的免疫功能,并为分子选育抗病新品系提供一定的数据基础。 展开更多
关键词 甘露糖受体c1型 多拷贝基因 系统进化树 嗜水气单胞菌
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CRP水平及其基因多态性与2型糖尿病的相关性
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作者 罗进通 吴丹 张泳仪 《广东医学》 CAS 2024年第5期615-619,共5页
目的探讨C反应蛋白(CRP)水平及其基因多态性、外周血炎症标志物与2型糖尿病(T2DM)的相关性。方法2021年10月1日至2022年9月30日南方医科大学第十附属医院内分泌科100例T2DM患者为T2DM组,100例同期健康人群为对照组,收集两组抗凝血标本,... 目的探讨C反应蛋白(CRP)水平及其基因多态性、外周血炎症标志物与2型糖尿病(T2DM)的相关性。方法2021年10月1日至2022年9月30日南方医科大学第十附属医院内分泌科100例T2DM患者为T2DM组,100例同期健康人群为对照组,收集两组抗凝血标本,采用PCR反应和测序技术确定CRP基因rs2794521(CRP-717A/G)位点基因型分布,通过收集患者临床资料,分析CRP及其基因多态性与中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)、血小板淋巴细胞比值(PLR)、单核细胞/淋巴细胞比值(MLR)、衍生中性粒细胞/淋巴细胞比值(dNLR)、系统免疫炎症指数(SII)与T2DM的相关性。结果T2DM组AA基因频率显著高于对照组(P<0.05)。与A/G+G/G基因型比较,A/A基因型携带者CRP值增高(P<0.05)。不同基因型间其他临床指标比较,差异无统计学意义(P>0.05)。Pearson相关性分析发现,CRP水平与体质指数(BMI)、PLR、MLR和SII呈正相关(P<0.05)。两组受试对象性别、总胆固醇(TCH)、MLR等基本资料比较,差异无统计学意义(P>0.05),两组年龄、BMI、TG、NLR、PLR、dNLR、SII和CRP比较,差异有统计学意义(P<0.05)。多因素logistic回归分析结果显示TG(OR=1.945)、NLR(OR=2.022)、SII(OR=7.312)、PLR(OR=1.512)、dNLR(OR=2.121)、CRP(OR=10.126)、CRP-A/A(OR=2.132)是T2DM的危险因素(P<0.05)。结论CRP基因A/A多态性可能是T2DM的遗传危险因素;此基因型携带者具有较高的CRP水平;TG、NLR、SII、PLR、dNLR、CRP升高是T2DM的危险因素;CRP水平与BMI、NLR、SII、PLR、dNLR呈正相关。 展开更多
关键词 2型糖尿病 c反应蛋白 基因多态性 外周血炎症标志物
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3例CHDFIDD患儿的分子遗传学分析及文献复习
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作者 赵静 宣小燕 +3 位作者 李红英 陈政芳 范晓萱 赵晓科 《新医学》 CAS 2024年第4期292-297,共6页
目的分析先天性心脏缺陷、面部畸形和智力发育障碍[CHDFIDD,细胞周期蛋白依赖性激酶13(CDK13)相关疾病]患儿的临床表型及基因突变情况,探讨其遗传学病因。方法采用芯片捕获高通量测序技术对3例CHDFIDD患儿及其父母的基因组DNA进行全外... 目的分析先天性心脏缺陷、面部畸形和智力发育障碍[CHDFIDD,细胞周期蛋白依赖性激酶13(CDK13)相关疾病]患儿的临床表型及基因突变情况,探讨其遗传学病因。方法采用芯片捕获高通量测序技术对3例CHDFIDD患儿及其父母的基因组DNA进行全外显子组测序,对疑似致病突变进行Sanger测序验证和生物信息分析。以“CDK13基因”“CDK13相关疾病”为检索词,检索中国知网、万方数据库建库至2024年2月的文献;以“CDK13”“CDK13-related disorder”“CHDFIDD”为检索词,检索PubMed数据库建库至2024年2月的文献,对相关文献进行复习。结果全外显子组测序结果均提示3例患儿存在CDK13基因杂合突变,分别为c.2572C>T(p.Leu858Phe)、c.2579G>A(p.Arg860Gln)和c.2602C>T(p.Arg868Trp),Sanger测序也证实了3种突变,结合临床表型,3例患儿均被确诊为CHDFIDD。3例患儿在各自家系中表现为新发突变;但不排除患儿双亲之一为该突变的生殖系嵌合体。根据美国医学遗传学与基因组学学会的指南,3个突变位点均可能致病。文献复习检索到14篇相关文献共108例CHDFIDD病例,其中c.2572C>T突变未见文献报道。结论CDK13基因突变可能是该3例患儿的遗传学病因。本研究丰富了CDK13基因突变谱,为CHDFIDD相关疾病的诊疗提供了参考。 展开更多
关键词 先天性心脏缺陷、面部畸形和智力发育障碍 cDK13基因 cDK13相关疾病 全面性发育迟缓 智力障碍
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HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT两例罕见突变引起血红蛋白H病家系分析
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作者 王秋华 陈杏园 +4 位作者 唐宁 严提珍 黄钧 钟青燕 罗世强 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期520-524,共5页
目的:分别对HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT两种罕见HBA2基因起始密码子突变复合东南亚型α-地贫的血红蛋白H病病例及其家系成员进行致病基因分析,了解HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT突变与临床表型的关系。方法:采集家系成员外周血进行... 目的:分别对HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT两种罕见HBA2基因起始密码子突变复合东南亚型α-地贫的血红蛋白H病病例及其家系成员进行致病基因分析,了解HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT突变与临床表型的关系。方法:采集家系成员外周血进行血细胞分析及毛细管电泳血红蛋白分析,缺口PCR(Gap-PCR)、反向点杂交法(RDB)检测ɑ-地贫基因常见类型突变,Sanger测序法对HBA1和HBA2基因序列进行分析。结果:检测出两个先证者基因型分别为--SEA/αα复合HBA2:c.2T>C和--SEA/αα复合HBA2:c.2delT,家系成员中检出HBA2:c.2T>C/WT和HBA2:c.2delT/WT,均表现为小细胞低色素性贫血。结论:HBA2:c.2T>C和HBA2:c.2delT为杂合突变时机体可出现静止型α-地贫的表型,当其复合轻型α-地贫时可使机体出现血红蛋白H病的临床表现,本研究为遗传咨询提供依据。 展开更多
关键词 α-珠蛋白基因 HBA2:c.2T>c HBA2:c.2delT 血红蛋白H病
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褐飞虱凝集素基因NlCTL4的克隆及功能分析
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作者 王彦丹 邵珠龙 +1 位作者 王正亮 俞晓平 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期337-346,共10页
C型凝集素(C-type lectins,CTLs)是广泛存在于昆虫体内一类含糖识别结构域的蛋白超家族,通常作为模式识别受体,在识别外来病原微生物并启动昆虫先天免疫过程中发挥重要功能。本研究克隆并鉴定了一条褐飞虱CTL编码基因NlCTL4(GenBank登录... C型凝集素(C-type lectins,CTLs)是广泛存在于昆虫体内一类含糖识别结构域的蛋白超家族,通常作为模式识别受体,在识别外来病原微生物并启动昆虫先天免疫过程中发挥重要功能。本研究克隆并鉴定了一条褐飞虱CTL编码基因NlCTL4(GenBank登录号:OQ032531),其c DNA序列全长936 bp,编码311个氨基酸。序列分析显示,Nl CTL4蛋白N端存在一段由21个氨基酸残基组成的信号肽,C端仅具有一个典型的糖识别结构域,属于S型CTLs。系统发育分析表明,Nl CTL4与半翅目其他昆虫的CTLs聚为一支,其中与玻璃翅叶蝉CTL亲缘关系最近。q RT-PCR分析显示,Nl CTL4基因在褐飞虱不同发育阶段和不同组织中均有表达。Nl CTL4在5龄若虫期的表达量最高,且在高龄若虫期(4~5龄)的表达量显著高于低龄若虫(1~3龄),但在雌、雄成虫中其表达量无显著差异。Nl CTL4在褐飞虱雌成虫肠道中表达量最高,脂肪体次之,在血淋巴中表达量最低。大肠杆菌(革兰氏阴性细菌)、金黄色葡萄球菌(革兰氏阳性细菌)和金龟子绿僵菌(丝状病原真菌)均能显著诱导Nl CTL4的表达水平,其中大肠杆菌和金黄色葡萄球菌在诱导36 h时Nl CTL4的表达量达到顶峰,金龟子绿僵菌接种24 h时的诱导水平最高。RNAi分析结果显示,抑制Nl CTL4表达后褐飞虱5龄若虫存活率及对金龟子绿僵菌侵染的抵御能力显著降低。本研究结果初步证实了褐飞虱Nl CTL4在宿主生长发育和免疫防御过程中发挥重要调控作用,且在开发褐飞虱RNAi抗虫和病原真菌防虫技术中具有重要的潜在应用价值。 展开更多
关键词 褐飞虱 c型凝集素 基因克隆 表达模式 RNA干扰
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SREBP-1c基因多态性与非酒精性脂肪性肝病的关系研究 被引量:6
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作者 张海英 高燕翔 +2 位作者 冯晓凡 张乾勇 糜漫天 《西南国防医药》 CAS 2014年第2期117-120,共4页
目的 研究固醇调节元件结合蛋白-1c(SREBP-1c)基因多态性与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的关系.方法 选取152例NAFLD患者和146例未患脂肪肝人员,收集血液样本检测血脂水平,采用聚合酶链反应-限制线片段长度多态性(PCR-RFLP)技术分析... 目的 研究固醇调节元件结合蛋白-1c(SREBP-1c)基因多态性与非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)的关系.方法 选取152例NAFLD患者和146例未患脂肪肝人员,收集血液样本检测血脂水平,采用聚合酶链反应-限制线片段长度多态性(PCR-RFLP)技术分析SREBP-1c基因18号外显子54G/C多态性.结果 NAFLD病例组TC、TG和LDL-C水平均明显高于对照组(P<0.05).两组的SREBP-1c18号外显子54G/C单核苷酸多态性均以GG型的比例最高,两组基因型频率分布有统计学差异(χ2=6.1096,P<0.05),NAFLD病例组中C等位基因频率明显高于对照组(χ2=6.2520,P<0.05).C等位基因携带者患NAFLD的风险是G等位基因的1.6484倍(OR=1.6484,95%CI:1.3233~10.0984).结论 研究对象的血脂水平异常与NAFLD的患病有显著相关性,参与糖代谢、脂代谢的SREBP-1c基因18号外显子54G/C呈现多态性,其C等位基因可能会使个体的NAFLD发病风险增加. 展开更多
关键词 固醇调节元件结合蛋白-1c 非酒精性脂肪性肝病 基因多态性 等位基因
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急性髓系白血病患者骨髓细胞c-Myc基因的表达及其临床意义 被引量:1
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作者 刘洋 丁欢欢 +6 位作者 齐松青 雷婷 王璐 秦玉婷 孙明玲 张振南 王新有 《中国现代医学杂志》 CAS 北大核心 2023年第21期1-8,共8页
目的 研究急性髓系白血病(AML)患者骨髓细胞c-Myc基因的表达及其临床意义。方法 选取2018年9月—2020年9月新疆医科大学第一附属医院143例初治AML患者为研究对象。对照组来自20名志愿者的正常骨髓样本。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qR... 目的 研究急性髓系白血病(AML)患者骨髓细胞c-Myc基因的表达及其临床意义。方法 选取2018年9月—2020年9月新疆医科大学第一附属医院143例初治AML患者为研究对象。对照组来自20名志愿者的正常骨髓样本。采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测AML患者骨髓细胞中c-Myc基因的表达,分析其与临床特征及疗效的关系;采用Sanger测序法检测AML患者C-kit 8/17、NPM1、FLT3-TKD/ITD、CEBPa基因突变情况。影响因素的分析采用单因素Cox和多因素逐步Cox回归模型。结果 初治AML患者的c-Myc基因相对表达量高于对照组(P <0.05)。143例AML患者中基因突变患者98例,检出率为68.5%(98/143)。c-Myc基因表达与CEBPa基因突变呈正相关(r=0.174,P=0.037)。c-Myc基因高表达组2个疗程的完全缓解率为40.0%(36/90),c-Myc基因低表达组为77.4%(41/53)。单因素和多因素逐步Cox回归分析结果显示,c-Myc基因高表达和染色体核型分析异常的AML患者有较差的无事件生存和总生存期。结论 c-Myc基因异常表达在AML发病中可能起重要作用,可作为AML疗效和预后的不良分子标志物。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 c-MYc 基因
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上调c-Ski基因表达对青光眼兔术后瘢痕形成及TGF-β、RhoA/Rock信号通路的影响 被引量:1
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作者 刘莉莉 招志毅 曾招荣 《广西医学》 CAS 2023年第9期1048-1053,1064,共7页
目的探讨上调c-Ski基因表达对青光眼兔术后瘢痕形成及转化生长因子(TGF)-β、Ras同源家族成员A(RhoA)/Rho相关激酶(Rock)信号通路的影响。方法取30只新西兰大白兔建立青光眼模型,并进行青光眼滤过手术。将其随机分为A组(仅造模及手术,... 目的探讨上调c-Ski基因表达对青光眼兔术后瘢痕形成及转化生长因子(TGF)-β、Ras同源家族成员A(RhoA)/Rho相关激酶(Rock)信号通路的影响。方法取30只新西兰大白兔建立青光眼模型,并进行青光眼滤过手术。将其随机分为A组(仅造模及手术,不给药)、B组(结膜下注射400μg空白质粒)、C组(结膜下注射100μg c-Ski质粒)、D组(结膜下注射200μg c-Ski质粒)和E组(结膜下注射400μg c-Ski质粒),每组6只。分别于术后2 d、4 d、7 d、14 d和28 d检测各组兔的眼压、滤过道组织中Ⅰ型和Ⅱ型胶原面积占比。术后28 d采用实时荧光定量PCR检测各组兔滤过道组织中c-Ski、TGF-β1、Rock和RhoA mRNA表达水平,采用Western blot检测各组兔滤过道组织中TGF-β1、Rock及RhoA蛋白表达水平。结果术后2 d、4 d、7 d、14 d、28 d,C组、D组及E组兔眼压均低于A组和B组,D组和E组兔眼压均低于C组(均P<0.05)。术后2 d、4 d、7 d、14 d、28 d,C组、D组及E组Ⅰ型胶原面积占比依次降低且均低于A组和B组(均P<0.05);术后14 d,C组、D组及E组Ⅱ型胶原面积占比依次降低且均低于A组和B组(均P<0.05)。术后28 d,C组、D组、E组兔滤过道组织中c-Ski mRNA表达水平均高于A组和B组,TGF-β1、Rock及RhoA的mRNA和蛋白表达水平均低于A组和B组,且C组、D组、E组c-Ski mRNA表达水平依次升高,TGF-β1、Rock及RhoA的mRNA和蛋白表达水平依次降低(均P<0.05)。结论上调c-Ski基因表达能够降低青光眼兔术后的眼压,减少胶原合成,抑制瘢痕形成,这可能与其抑制TGF-β1及RhoA/Rock信号通路有关。 展开更多
关键词 青光眼 c-Ski基因 术后 瘢痕 转化生长因子β Rho相关激酶 Ras同源家族成员A
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Cloning and expression of core gene cDNA of Chinese hepatitis C virus in cosmid pTM3 被引量:12
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作者 Jiang RL Lu QS Luo KX 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2000年第2期220-222,共3页
AIM To clone core gene cDNA of Chinesehepatitis C virus(HCV)into eukaryoticexpression vector cosmid pTM3 and to expressHCV core antigen in HepG2 cells.METHODS Core gene cDNA of HCV wasintroduced into eukaryotic expres... AIM To clone core gene cDNA of Chinesehepatitis C virus(HCV)into eukaryoticexpression vector cosmid pTM3 and to expressHCV core antigen in HepG2 cells.METHODS Core gene cDNA of HCV wasintroduced into eukaryotic expression vectorcosmid pTM3.Using vaccinia virus/bacteriophage T7 hybrid expression system,HepG2 cells were transfected with therecombinant plasmid pTM3-Q534 by lipofectin.RESULTS From the transfected bacteriaTop10F’,2 pTM3-Q534 clones containing therecombinant plasmid were identified fromrandomly selected 10 ampicillin-resistantcolonies.By reverse transcription PCR andindirect immunofluorescence technique,HCVRNA and core protein was identified in HepG2cells transfected with the recombinant plasmid.CONCLUSION The construction of arecombinant plasmid and the expression of coregene cDNA of HCV in HepG2 was successful. 展开更多
关键词 HEPATITIS c VIRUS gene VIRAL cDNA cosmid vector gene expression
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硫化氢信号对大白菜FLCs时空表达模式的调控作用
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作者 张丽萍 张林林 +6 位作者 曹海艳 郝雪峰 刘纹琪 刘志强 刘旦梅 金竹萍 裴雁曦 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期972-979,共8页
硫化氢(H_(2)S)是一种气体信号分子,可以促进植物的开花,且这一过程与开花的关键因子FLOWERING LOCUS C(FLC)有关。大白菜中已报道的FLC同源基因有4种。本研究对这4种FLC同源基因进行了时空表达模式和功能分化研究,以及H_(2)S对BrFLCs... 硫化氢(H_(2)S)是一种气体信号分子,可以促进植物的开花,且这一过程与开花的关键因子FLOWERING LOCUS C(FLC)有关。大白菜中已报道的FLC同源基因有4种。本研究对这4种FLC同源基因进行了时空表达模式和功能分化研究,以及H_(2)S对BrFLCs的表达模式的调控作用进行了探讨。结果表明:4种BrFLCs同源基因的表达表现出不同的时空特异性。其中,BrFLC 1、2和3的发育时期表达模式与拟南芥AtFLC相似,而BrFLC 5未表现出发育时期特异性。BrFLC 1只在叶中表达,而BrFLC 2在不同组织中均有表达,BrFLC 3在各组织中的表达量最高,但组织特异性差异不明显,BrFLC 5表达量不高且不具有组织特异性。经外源H_(2)S处理,BrFLCs表达略有下调,叶片中的BrFLC 2表达量最低。H_(2)S还能够不同程度地调节BrFLCs下游基因的表达,这可能和BrFLCs的表达模式改变有关。综上所述,H_(2)S可能通过调节大白菜中4个BrFLCs基因的表达模式影响其植株的开花时间。 展开更多
关键词 大白菜 FLc同源基因 硫化氢 时空表达模式 下游基因
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Cloning of the non-structural gene 3 of hepatitis C virus and its inducible expression in cultured cells 被引量:9
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作者 ZHANG Shu Zhong 1, LIANG Jia Jing 1, QI Zhong Tian 2 and HU Yi Ping 1 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1999年第2期37-39,共3页
METHODSThens3genewasobtainedfromplasmidpBns3bypolymerasechainreactionandinsertedintothecloningvectorpGEMT.T... METHODSThens3genewasobtainedfromplasmidpBns3bypolymerasechainreactionandinsertedintothecloningvectorpGEMT.Then,thens3wassubc... 展开更多
关键词 HEPATITIS c virus gene VIRAL gene expression cells cULTURED
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Effect of hepatitis C virus infection on expression of several cancer-associated gene products in hepatocellular carcinoma 被引量:42
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作者 YANG Jian Min, WANG Rong Quan, BU Bao Guo, ZHOU Zi Cheng, FANG Dian Chun and LUO Yuan Hui 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1999年第1期30-32,共3页
NTRODUCTIONOurpreviousstudiesbyseroepidemiological,molecularepidemiologicalandimmunopathologicalmethodshav... NTRODUCTIONOurpreviousstudiesbyseroepidemiological,molecularepidemiologicalandimmunopathologicalmethodshaverevealedthathepa... 展开更多
关键词 cARcINOMA hepatocellular/etiology HEPATITIS c like viruses/pathogenicity oncogenes/genetics genes SUPPRESSOR tumor/genetics immunohistochemistry/methods
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