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Identification of a LMNA (c.646C>T) variant by whole-exome sequencing in combination with a dilated cardiomyopathy (DCM) related gene filter in a family with familiar DCM 被引量:2
1
作者 Liang Chen Zhongyin Zhou +4 位作者 Huihe Lu Ye Xie Gang Li Jianfei Huang Dongsheng Zhao 《The Journal of Biomedical Research》 CAS CSCD 2018年第4期314-316,共3页
Dilated cardiomyopathy(DCM)is characterized by the dilated heart chambers and reduced systolic function in the absence of specific aetiology[1].Approximately one third of DCM cases are hereditary.In recent years,DCM... Dilated cardiomyopathy(DCM)is characterized by the dilated heart chambers and reduced systolic function in the absence of specific aetiology[1].Approximately one third of DCM cases are hereditary.In recent years,DCM concomitant with arrhythmias and sudden death resulting from gene mutation has been widely 展开更多
关键词 related gene filter in a family with familiar DcM AVB Identification of a LMNA c.646c T variant by whole-exome sequencing in combination with a dilated cardiomyopathy
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HP8: The cDNA clone of a novel member of C/EBP gene family
2
作者 徐砺新 万大方 +4 位作者 刘彦仿 李宏年 张萍萍 隋延仿 顾健人 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 1996年第4期285-289,293,共6页
HP8:ThecDNAcloneofanovelmemberofC/EBPgenefamily¥(徐砺新)(万大方)(刘彦仿)(李宏年)(张萍萍)(隋延仿)(顾健人)XuLixin,WanDafang,LiuYanf... HP8:ThecDNAcloneofanovelmemberofC/EBPgenefamily¥(徐砺新)(万大方)(刘彦仿)(李宏年)(张萍萍)(隋延仿)(顾健人)XuLixin,WanDafang,LiuYanfang,LiHongnian,Zh... 展开更多
关键词 c/ebp family geneS LEUcINE ZIPPER cDNA
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Detection of ATP2C1 Gene Mutation in Familial Benign Chronic Pemphigus 被引量:1
3
作者 陈思远 黄长征 李家文 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2005年第5期585-586,589,共3页
Summary: The ATP2C1 gene mutation in one ease of familial benign chronic pemphigus was investigated.One patient was diagnosed as familial benign chronic pemphigus by pathology, ultrastructral examination and clinical... Summary: The ATP2C1 gene mutation in one ease of familial benign chronic pemphigus was investigated.One patient was diagnosed as familial benign chronic pemphigus by pathology, ultrastructral examination and clinical features. Genomic DNA was extracted from blood samples. Mutation of ATP2CI gene was detected by polymerase chain reaction (PCR) and DNA sequencing. The results showed that deletion mutation was detected in ATP2C1 gene in this patient, which was 2374delTTTG. No mutation was found in the family members and normal individuals. It was coneluded that the 2374delTTTG mutation in ATP2C1 gene was the specific mutation for the clinical phenotype for this patient and was a de novo mutation. 展开更多
关键词 familial benign chronic pemphigus ATP2c1 gene gene mutation
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上调c-Ski基因表达对青光眼兔术后瘢痕形成及TGF-β、RhoA/Rock信号通路的影响 被引量:1
4
作者 刘莉莉 招志毅 曾招荣 《广西医学》 CAS 2023年第9期1048-1053,1064,共7页
目的探讨上调c-Ski基因表达对青光眼兔术后瘢痕形成及转化生长因子(TGF)-β、Ras同源家族成员A(RhoA)/Rho相关激酶(Rock)信号通路的影响。方法取30只新西兰大白兔建立青光眼模型,并进行青光眼滤过手术。将其随机分为A组(仅造模及手术,... 目的探讨上调c-Ski基因表达对青光眼兔术后瘢痕形成及转化生长因子(TGF)-β、Ras同源家族成员A(RhoA)/Rho相关激酶(Rock)信号通路的影响。方法取30只新西兰大白兔建立青光眼模型,并进行青光眼滤过手术。将其随机分为A组(仅造模及手术,不给药)、B组(结膜下注射400μg空白质粒)、C组(结膜下注射100μg c-Ski质粒)、D组(结膜下注射200μg c-Ski质粒)和E组(结膜下注射400μg c-Ski质粒),每组6只。分别于术后2 d、4 d、7 d、14 d和28 d检测各组兔的眼压、滤过道组织中Ⅰ型和Ⅱ型胶原面积占比。术后28 d采用实时荧光定量PCR检测各组兔滤过道组织中c-Ski、TGF-β1、Rock和RhoA mRNA表达水平,采用Western blot检测各组兔滤过道组织中TGF-β1、Rock及RhoA蛋白表达水平。结果术后2 d、4 d、7 d、14 d、28 d,C组、D组及E组兔眼压均低于A组和B组,D组和E组兔眼压均低于C组(均P<0.05)。术后2 d、4 d、7 d、14 d、28 d,C组、D组及E组Ⅰ型胶原面积占比依次降低且均低于A组和B组(均P<0.05);术后14 d,C组、D组及E组Ⅱ型胶原面积占比依次降低且均低于A组和B组(均P<0.05)。术后28 d,C组、D组、E组兔滤过道组织中c-Ski mRNA表达水平均高于A组和B组,TGF-β1、Rock及RhoA的mRNA和蛋白表达水平均低于A组和B组,且C组、D组、E组c-Ski mRNA表达水平依次升高,TGF-β1、Rock及RhoA的mRNA和蛋白表达水平依次降低(均P<0.05)。结论上调c-Ski基因表达能够降低青光眼兔术后的眼压,减少胶原合成,抑制瘢痕形成,这可能与其抑制TGF-β1及RhoA/Rock信号通路有关。 展开更多
关键词 青光眼 c-Ski基因 术后 瘢痕 转化生长因子β Rho相关激酶 Ras同源家族成员A
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绿豆C3H和NBS转录因子家族成员鉴定及盐胁迫响应分析 被引量:1
5
作者 刘金洋 林云 +5 位作者 陈景斌 闫强 薛晨晨 吴然然 陈新 袁星星 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第5期1097-1109,共13页
NBS和C_(3)H是植物体内2个重要的转录因子家族,在调控植物抗病与耐盐方面不可或缺。本研究通过转录组数据分析、qRT-PCR分析,分别鉴定出30个和289个绿豆C_(3)H和NBS家族成员,2个基因家族各有13个基因受到纯化选择,并且C_(3)H和NBS基因... NBS和C_(3)H是植物体内2个重要的转录因子家族,在调控植物抗病与耐盐方面不可或缺。本研究通过转录组数据分析、qRT-PCR分析,分别鉴定出30个和289个绿豆C_(3)H和NBS家族成员,2个基因家族各有13个基因受到纯化选择,并且C_(3)H和NBS基因家族种内共线性关系均为片段重复。耐盐材料的转录组数据分析结果表明,VrC_(3)H5、VrC_(3)H7、VrC_(3)H10和VrC_(3)H13等4个基因的表达量在盐胁迫后发生显著改变。VrC_(3)H5,VrC_(3)H7和VrC_(3)H133个基因对脱落酸(ABA)处理、氯化钠(NaCl)处理、干旱胁迫都有不同程度的响应,VrC_(3)H5在ABA处理后基因表达量上调超过了10倍。在NBS基因中,有85个基因在盐胁迫10 d和15 d后出现显著差异表达,其中9个NBS基因表达变化值|log_(2)FC|(FC为表达倍数变化)大于2。VrNBS20转录因子通过调控EVM0022385参与绿豆的耐盐功能,VrNBS20可能是绿豆抗病与耐盐调控网络中的交叉点。本研究结果为绿豆耐盐与抗病研究提供了丰富的基因资源。 展开更多
关键词 绿豆 NBS基因家族 c_(3)H基因家族 盐胁迫 VrNBS20转录因子
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Nonsense variant of ATP8B1 gene in heterozygosis and benign recurrent intrahepatic cholestasis: A case report and review of literature 被引量:3
6
作者 Mariano Piazzolla Nicola Castellaneta +7 位作者 Antonio Novelli Emanuele Agolini Dario Cocciadiferro Leonardo Resta Loren Duda Michele Barone Enzo Ierardi Alfredo Di Leo 《World Journal of Hepatology》 2020年第2期64-71,共8页
BACKGROUND Benign recurrent intrahepatic cholestasis is a genetic disorder with recurrent cholestatic jaundice due to ATP8B1 and ABCB11 gene mutations encoding for hepato-canalicular transporters.Herein,we firstly pro... BACKGROUND Benign recurrent intrahepatic cholestasis is a genetic disorder with recurrent cholestatic jaundice due to ATP8B1 and ABCB11 gene mutations encoding for hepato-canalicular transporters.Herein,we firstly provide the evidence that a nonsense variant of ATP8B1 gene(c.1558A>T)in heterozygous form is involved in BRIC pathogenesis.CASE SUMMARY A 29-year-old male showed severe jaundice and laboratory tests consistent with intrahepatic cholestasis despite normal gamma-glutamyltranspeptidase.Acute and chronic liver diseases with viral,metabolic and autoimmune etiology were excluded.Normal intra/extra-hepatic bile ducts were demonstrated by magnetic resonance.Liver biopsy showed:Cholestasis in the centrilobular and intermediate zones with bile plugs and intra-hepatocyte pigment,Kupffer’s cell activation/hyperplasia and preserved biliary ducts.Being satisfied benign recurrent intrahepatic cholestasis diagnostic criteria,ATP8B1 and ABCB11 gene analysis was performed.Surprisingly,we found a novel nonsense variant of ATP8B1 gene(c.1558A>T)in heterozygosis.The variant was confirmed by Sanger sequencing following a standard protocol and tested for familial segregation,showing a maternal inheritance.Immunohistochemistry confirmed a significant reduction of mutated gene related protein(familial intrahepatic cholestasis 1).The patient was treated with ursodeoxycholic acid 15 mg/kg per day and colestyramine 8 g daily with total bilirubin decrease and normalization at the 6th and 12th mo.CONCLUSION A genetic abnormality,different from those already known,could be involved in familial intrahepatic cholestatic disorders and/or pro-cholestatic genetic predisposition,thus encouraging further mutation detection in this field. 展开更多
关键词 Benign recurrent intrahepatic cholestasis ATP8B1/ABcB11 genes Jaundice Heterozygous variant of ATP8B1 gene(c.1558A>T) Familial inheritance case report
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核转录因子CHOP研究进展 被引量:9
7
作者 袁小青 马向华 沈捷 《医学研究杂志》 2008年第8期15-18,共4页
关键词 核转录因子 cHOP damage c/ebp gene 相关蛋白 细胞应激 家族成员
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胃癌高系家族成员胃蛋白酶原C基因多态性及其诊断意义的探讨 被引量:3
8
作者 袁媛 董明 +8 位作者 何安光 张荫昌 张宝庚 金春莲 路平 邢承忠 王选杰 刘言厚 吕芳 《中国医科大学学报》 CAS CSCD 1995年第4期356-357,共2页
采用限制性酶切片段长度多态性分析法,检测在胃癌高发区庄河检出的19例胃癌高系家族成员胃蛋白酶原C基因多态性,发现三种常见片段及一种稀有片段。对其中4例携带稀有片段的受检者进行了胃镜追踪观察,2.5年后发现1例早期胃癌... 采用限制性酶切片段长度多态性分析法,检测在胃癌高发区庄河检出的19例胃癌高系家族成员胃蛋白酶原C基因多态性,发现三种常见片段及一种稀有片段。对其中4例携带稀有片段的受检者进行了胃镜追踪观察,2.5年后发现1例早期胃癌。本文对此作了初步探讨。 展开更多
关键词 胃肿瘤 胃蛋白酶原c 基因多态性 高系家族
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HP8:增强子结合蛋白家族的一个新基因的cDNA克隆 被引量:1
9
作者 徐砺新 万大方 +4 位作者 刘彦仿 李宏年 张萍萍 隋延仿 顾健人 《第四军医大学学报》 1995年第6期423-428,共6页
以大鼠增强子结合蛋白(C/EBP)cDNA为探针,筛选人胎肝cDNA文库,得到一个含有2480碱基命名为HP8的cDNA克隆,其中84~1109位碱基属编码区,经基因数据库(EMBL,95.6版本)查对未发现同源基因... 以大鼠增强子结合蛋白(C/EBP)cDNA为探针,筛选人胎肝cDNA文库,得到一个含有2480碱基命名为HP8的cDNA克隆,其中84~1109位碱基属编码区,经基因数据库(EMBL,95.6版本)查对未发现同源基因。该基因编码的蛋白C-末端含有亮氨酸拉链结构(leucinezipperstructure),和C/EBP功能区(C-末端60个氨基酸)同源性高达97%,而上游编码区则与C/EBP及其已知家族同源性很低,表明该基因属C/EBP基因家族新成员。基因组Southern杂交证实该基因为单拷贝基因,在14种胎儿组织中显示小肠、皮肤高表达,肾上腺中度表达,肝、肺、肾、甲状腺、胆囊低表达。在5例正常成人肝组织中仅2例低表达,而在13对肝癌及癌旁肝组织中显示9例癌组织及7例癌旁组织高表达。以上结果提示该基因可能与细胞增殖有关。它的详尽功能的研究正在进行中。 展开更多
关键词 c/ebp 亮氨酸拉链 cDNA 基因克隆
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c-erbB癌基因家族基因扩增与乳腺癌临床病理分期的相关性研究 被引量:2
10
作者 张克兰 李云青 +3 位作者 张思仲 夏庆杰 章晓梅 朱宝生 《中国优生与遗传杂志》 2002年第6期24-26,共3页
为探讨c -erbB癌基因家族 4基因扩增与乳腺癌病人临床病理分期的关系及该家族 4基因间的相互作用 ,应用差异聚合酶链反应技术检测 70例乳腺癌组织和癌旁正常乳腺组织中c -erbB家族 4基因扩增情况。结果  70例乳腺癌组织中c-erbB - 1基... 为探讨c -erbB癌基因家族 4基因扩增与乳腺癌病人临床病理分期的关系及该家族 4基因间的相互作用 ,应用差异聚合酶链反应技术检测 70例乳腺癌组织和癌旁正常乳腺组织中c -erbB家族 4基因扩增情况。结果  70例乳腺癌组织中c-erbB - 1基因和c -erbB - 4基因在癌组织中无扩增 (P >0 0 5) ,而c-erbB - 2基因和c -erbB - 3基因存在明显扩增(P <0 0 5) ,扩增阳性率分别为 33 %和 37%。c -erbB - 2基因扩增阳性率与病理分期正相关 (P <0 0 5) ,c -erbB - 3基因扩增阳性率在乳腺癌病理I至III期中有上升的趋势。同时 ,c -erbB - 2基因扩增与c -erbB - 3基因扩增具有一致性 (P <0 0 0 1 ) ,表明c -erbB - 3基因可能也是乳腺癌发展进程中有用的分子预后指标。对乳腺癌病人检测c -erbB - 2基因与c -erbB - 3基因扩增 。 展开更多
关键词 c-erbB癌基因家族 基因扩增 乳腺癌 病理分期 差异PcR
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C型凝集素结构域家族1成员B在肝细胞癌中的表达及临床意义
11
作者 汪慧 胡亮 +3 位作者 邹珊珊 刘文迪 周华邦 胡和平 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期547-553,共7页
目的 探讨C型凝集素结构域家族1成员B(CLEC1B)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及其与HCC患者临床病理特征和预后的关系。方法 利用基因表达汇编(GEO)数据库检索HCC组织芯片数据(GSE49515、GSE115018)对癌组织及正常对照样本中的基因进行差... 目的 探讨C型凝集素结构域家族1成员B(CLEC1B)在肝细胞癌(HCC)组织中的表达及其与HCC患者临床病理特征和预后的关系。方法 利用基因表达汇编(GEO)数据库检索HCC组织芯片数据(GSE49515、GSE115018)对癌组织及正常对照样本中的基因进行差异表达分析。在肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库筛选HCC转录组数据集,分析CLEC1B在HCC中的差异表达。采用基因集富集分析(GSEA)探寻HCC中与CLEC1B相关的信号通路。收集37例HCC患者的癌组织和相应的癌旁组织,采用实时荧光定量PCR法检测CLEC1B mRNA表达,蛋白质印迹分析法检测CLEC1B蛋白表达,并采用χ^2检验分析CLEC1B表达与患者临床病理特征的关系,通过Kaplan-Meier法和log-rank检验分析CLEC1B mRNA表达与HCC患者预后的关系;留取37例HCC患者和37名健康志愿者血液标本,用酶联免疫吸附试验检测血浆中CLEC1B水平,通过受试者工作特征(ROC)曲线评估CLEC1B对HCC的诊断价值。结果 CLEC1B在HCC癌组织中低表达,CLEC1B的低表达与HCC患者的肿瘤出血有关(P<0.01)。血浆中CLEC1B水平可作为诊断HCC的生物标志物,以62.44 ng/mL作为截断值时,CLEC1B的诊断效能最佳(ROC曲线下面积为0.966,灵敏度为92.7%,特异度为91.3%)。高表达CLEC1B的HCC患者总生存期长于低表达CLEC1B的患者,差异有统计学意义(P<0.01)。在HCC中,CLEC1B基因与ATR通路(ATM and Rad3-related pathway)、细胞周期通路、DNA修复通路、myc信号通路呈现出一致的表达差异趋势。结论 CLEC1B在HCC中低表达并与肿瘤出血有关,CLEC1B低表达的患者预后较差。 展开更多
关键词 c型凝集素结构域家族1成员B 肝细胞癌 诊断 预后 基因富集
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Rho同源基因家族成员C在恶性肿瘤中的研究进展
12
作者 张博 杨光 +1 位作者 刘震东 高延征 《河南医学研究》 CAS 2021年第25期4799-4800,F0003,F0004,共4页
癌症的发生发展机制一直被广大研究者探讨,其发生发展通常是由调节细胞基本过程的基因功能失常引起的。Rho同源基因家族成员C(RHOC)近年来已经成为研究热点。目前RHOC已经被广泛报道存在于众多恶性肿瘤细胞中,并发挥着重要作用,本文就R... 癌症的发生发展机制一直被广大研究者探讨,其发生发展通常是由调节细胞基本过程的基因功能失常引起的。Rho同源基因家族成员C(RHOC)近年来已经成为研究热点。目前RHOC已经被广泛报道存在于众多恶性肿瘤细胞中,并发挥着重要作用,本文就RHOC在众多肿瘤细胞中的研究发展做一综述。 展开更多
关键词 Rho同源基因家族成员c 恶性肿瘤 肿瘤标志物
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基于转录组的非洲菊PLC基因家族鉴定与进化分析
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作者 王秀美 倪珊珊 +6 位作者 李乾玉 李小芳 林争春 陈裕坤 林玉玲 赖钟雄 杜迎刚 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第5期1267-1273,共7页
磷脂酶C(phospholipase C,PLC)广泛参与植物的生命活动和代谢过程,在抵御真菌感染的过程中发挥重要作用。本研究基于非洲菊转录组测序数据,鉴定出13个非洲菊PLC基因家族成员,其中NPC有3个,PI-PLC有10个。非洲菊PLC的蛋白序列长度在98~59... 磷脂酶C(phospholipase C,PLC)广泛参与植物的生命活动和代谢过程,在抵御真菌感染的过程中发挥重要作用。本研究基于非洲菊转录组测序数据,鉴定出13个非洲菊PLC基因家族成员,其中NPC有3个,PI-PLC有10个。非洲菊PLC的蛋白序列长度在98~594 aa之间,蛋白理论分子量为11410.25~67998.85 kDa,等电点为4.74~9.59,均为不稳定亲水蛋白。亚细胞定位预测结果显示,13个成员分别定位于细胞壁、细胞膜、细胞质、叶绿体和细胞核中,表明不同成员功能上可能存在多样性。进化树分析表明,13个非洲菊PLC蛋白可分为2个亚组,进化关系较近的蛋白结构组成相似。非洲菊PLC家族成员在拟南芥中的同源蛋白PLC2、PLC4、AT2G40116可相互作用。非洲菊转录组的FPKM值分析表明,GjPLC2、GjPLC3、GjPLC8、GjPLC10在非洲菊中表达量高,感病植株中变化大,可能在抵御真菌感染过程中发挥重要作用。研究结果可为进一步研究非洲菊PLC基因的生物学功能提供依据。 展开更多
关键词 非洲菊 磷脂酶c 基因家族 进化分析
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石榴低温响应因子CBF基因家族鉴定及其表达分析 被引量:6
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作者 刘龙博 郑树轩 郑洁 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1154-1167,共14页
CBF(C-repeat binding factor)是AP2家族的一类转录激活因子,在植物响应低温胁迫和提高植物耐寒性方面具有重要作用。虽然多个石榴品种的基因组已经发布,但仍缺乏对其CBF基因家族的全面研究。为全面分析石榴(Punica granatum L.)CBF基... CBF(C-repeat binding factor)是AP2家族的一类转录激活因子,在植物响应低温胁迫和提高植物耐寒性方面具有重要作用。虽然多个石榴品种的基因组已经发布,但仍缺乏对其CBF基因家族的全面研究。为全面分析石榴(Punica granatum L.)CBF基因家族分子生物学特性,本文对鉴定到的PgCBFs成员进行了生物信息和表达分析。结果表明,石榴全基因组中有7个CBF基因家族成员,蛋白序列中除包含AP2结构域外,还具有CBF特征序列PKKPAGRxKFxETRHP和DSAWR;7个成员集中分布在染色体1和4上,编码蛋白质氨基酸长度为201~267aa,分子质量为21.69~29.81ku;进化分析显示PgCBFs基因家族成员分布在GroupⅡ~Ⅳ亚组中,与水稻CBF成员组成的GroupⅠ存在明显区分;除PgCBF2、PgCBF4、PgCBF5基因结构中含有1~2个内含子外,其余与其他物种类似,属内含子缺失型;编码的蛋白序列均含有保守基序Motif1~7;蛋白二级结构主要为不规则卷曲和α-螺旋,三级结构较为相似。PgCBFs基因家族扩增主要来源于串联重复,并与拟南芥、苹果、桃分别存在2对、5对和4对共线性关系;GO注释显示PgCBFs多与转录调控、低温胁迫或激素诱导相关;启动子区含有多种顺势作用元件,主要为胁迫刺激、激素诱导和光响应元件;基因表达分析发现除PgCBF6外,其余成员在根中高度表达,在低温胁迫处理下PgCBF在根和韧皮部表达量显著上调,其中PgCBF7能够快速响应并持续应答低温诱导。结合进化树、共线性、启动子以及表达分析,推测PgCBF7可能与石榴幼苗低温胁迫调控相关。本研究可为深入研究石榴CBF基因家族生物学功能提供理论基础。 展开更多
关键词 石榴(Punica granatum L.) cBF(c-repeat binding factor)基因家族 生物信息学 基因表达分析 低温胁迫 PgcBF7
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The Apoptotic Effect of the Methanol Extract of <i>Polygonum cuspidatum</i>through Up-Regulation Death Receptor 5 and CHOP in HSC-2 Human Oral Cancer Cells
15
作者 Hyun-Ju Yu Ji-Ae Shin +3 位作者 Eun-Sun Choi Jae-Gyu Jeon Nam-Pyo Cho Sung-Dae Cho 《Journal of Cancer Therapy》 2012年第1期1-6,共6页
Polygonum cuspidatum is used as a traditional medicinal herb for the therapy of various diseases including several types of cancers. In the present study, we focused on addressing the anti-cancer activity and molecula... Polygonum cuspidatum is used as a traditional medicinal herb for the therapy of various diseases including several types of cancers. In the present study, we focused on addressing the anti-cancer activity and molecular mechanism of methanol extract of Polygonum cuspidatum (MEPC) in HSC-2 human oral cancer cells. The effect of MEPC on oral cancer cells was estimated by 3-(4,5-dimethylthiazol-20yl)-(3-carboxymethoxyphenyl)-2-(4-sulphophenyl)-2H-tetrazolium (MTS) assay, 4’-6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) staining and Western blot analysis. MEPC inhibited the cell viability and induced apoptosis through the induction of death receptor (DR) 5. MEPC also increased the expression of C/EBP homologous protein/growth arrest and the DNA damage-inducible gene 153 (CHOP), a transcription factor induced by ER stress. Thus, we concluded that the induction of CHOP leading to DR5 up-regulation is required for the anti-cancer activity of MEPC in HSC-2 cells and MEPC may be a promising drug candidate for oral cancer. 展开更多
关键词 POLYGONUM cuspidatum Endoplasmic Reticulum Stress c/ebp Homologous Protein/Growth Arrest and the DNA Damage-Inducible gene 153 (cHOP) Death Receptor 5 (DR5) Apoptosis HUMAN Oral cancer cell
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FOXM1 and UBE2C Are Distinct Biomarkers for Non-Small Cell Lung Cancer Survival Prediction: Data-Mining Based on ONCOMINE
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作者 Ya Wang Jiang Zhu 《Journal of Advances in Medicine Science》 2019年第2期18-24,共7页
Non-small cell lung cancer (NSCLC) remains to be primary reason of tumor deaths in the past few decades. The mortality of this malignancy could be reduced by developing new prognostic biomarkers and discovering novel ... Non-small cell lung cancer (NSCLC) remains to be primary reason of tumor deaths in the past few decades. The mortality of this malignancy could be reduced by developing new prognostic biomarkers and discovering novel therapeutic biological target. Here, we studied the mRNA expression of FOX gene family and UBE2C in different types of cancer compared with normal tissue through ONCOMINE differential analysis. CCLE analysis was mined to explore the expression profiles of target genes in different tumor cells. GEPIA was used to discover the expression of target genes in different subtypes and the correlations with lung cancer stage. The prognostic values of FOXM1 and UBE2C were further investigated through Kaplan-Meier plotter analysis. It showed that FOXA1, FOXD1 and FOXM1 were dramatically high expressed in NSCLC comparing with normal lung tissues. Besides, the expression of FOXM1 was significantly associated with UBE2C. Furthermore, the overexpression of FOXM1 and UBE2C were correlated to shorter survival in lung adenocarcinoma (LAC) instead of lung squamous cell carcinoma (LSCC). Hence, we could draw a conclusion that FOXM1 and UBE2C are distinguished biomarkers and crucial prognostic indicators for lung adenocarcinoma patients. 展开更多
关键词 FOXM1 FOX gene family UBE2c Biomarkers NON-SMALL cell LUNG cANcER LUNG cANcER Prognosis
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普通牛CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPs)家族基因的生物信息学分析 被引量:1
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作者 周子航 张娟 +10 位作者 封元 黄增文 马正旭 王瑜 蒋秋斐 郭菊 冯小芳 王影 母童 虎红红 顾亚玲 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期2944-2958,共15页
CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPs)家族是具有碱性一亮氨酸拉链结构的一类蛋白家族。为对普通牛CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPs)家族基因编码蛋白的结构和功能进行生物信息学探析,本研究运用多个生物信息学分析软件分别对普通牛C/EBPs蛋白的理... CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPs)家族是具有碱性一亮氨酸拉链结构的一类蛋白家族。为对普通牛CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPs)家族基因编码蛋白的结构和功能进行生物信息学探析,本研究运用多个生物信息学分析软件分别对普通牛C/EBPs蛋白的理化性质、亲疏水性、基因结构、保守基序、亚细胞定位、染色体定位等进行了具体分析,构建了不同物种C/EBPs基因家族编码蛋白的系统发育树,并比对多种软件寻找准确的预测工具。通过分析研究发现,普通牛C/EBPs基因家族不同基因所编码蛋白质为亲水性不稳定蛋白,无跨膜结构和信号肽,均为非分泌型蛋白,家族中6个成员都是丝氨酸(Ser)磷酸化位点占比最大;但是普通牛C/EBPs基因家族不同基因所编码的氨基酸数、理论等电点、二级结构、染色体定位、保守基序等却存在一定差异;普通牛C/EBPs基因与牦牛、水牛、瘤牛亲缘关系较近,与鸡的遗传距离最远。这些研究结果为后续对牛C/EBPs家族基因功能的深入研究提供了重要的科学依据和参考,为其他使用软件对基因进行生物信息学分析的研究者提供了借鉴。 展开更多
关键词 c/ebps基因家族 增强子结合蛋白 生物信息学 系统发育树
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Analysis of cardiac troponin C gene TNNC1 c. G175C mutation in a Chinese pedigree with familial hypertrophic cardiomyopathy and the correlation between genotype and phenotype
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作者 邢晓博 《China Medical Abstracts(Internal Medicine)》 2017年第1期30-31,共2页
Objective To investigate the genotype-phenotype correlation in Chinese familial hypertrophic cardiomyopathy(HCM)focusing on the cardiac troponic C gene TNNC1 c.G175C mutation.Methods All family members of a Chinese pe... Objective To investigate the genotype-phenotype correlation in Chinese familial hypertrophic cardiomyopathy(HCM)focusing on the cardiac troponic C gene TNNC1 c.G175C mutation.Methods All family members of a Chinese pedigree with hypertrophic cardiomyopathy admitted in Third People’s Hospital of Qingdao 展开更多
关键词 HcM Analysis of cardiac troponin c gene TNNc1 c G175c mutation in a chinese pedigree with familial hypertrophic cardiomyopathy and the correlation between genotype and phenotype gene
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维吾尔族宫颈鳞癌C/EBP β基因甲基化与HPV16感染关系 被引量:5
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作者 蒋旭鹏 潘晓琳 +2 位作者 潘泽民 张东辉 张鑫芝 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1409-1410,共2页
目的通过对新疆维吾尔族妇女宫颈鳞癌组织C/EBPβ基因甲基化与HPV16感染关系的研究,探讨该基因在宫颈癌发生发展过程中的作用。方法提取26份子宫颈癌组织和16份子宫颈正常组织DNA,用PCR方法对样本进行HPV16检测,再利用基质辅助激光解析... 目的通过对新疆维吾尔族妇女宫颈鳞癌组织C/EBPβ基因甲基化与HPV16感染关系的研究,探讨该基因在宫颈癌发生发展过程中的作用。方法提取26份子宫颈癌组织和16份子宫颈正常组织DNA,用PCR方法对样本进行HPV16检测,再利用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱方法进行C/EBPβ基因甲基化分析。结果子宫颈鳞癌组织HPV16感染率为69.32%(18/26),2份正常子宫颈组织感染HPV16,差异有统计学意义(χ2=12.780,P<0.05);子宫颈鳞癌与子宫颈正常组织中C/EBPβ基因CpG10/11和CpG17/18 2个CpG岛甲基化差异有统计学意义(t=2.221、2.278,P均<0.05);C/EBPβ基因在以上2个CpG岛位点上的甲基化率与HPV16感染偏相关系数分别为1.323和-4.36,差异无统计学意义(P>0.05)。结论新疆维吾尔族妇女宫颈鳞癌发生与HPV16感染相关;C/EBPβ基因2个CpG岛位点甲基化与维吾尔族子宫颈鳞癌发生相关,而与HPV16感染无相关性。 展开更多
关键词 c/ebpβ基因 子宫颈鳞癌 HPV16感染 基因甲基化 维吾尔族妇女
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胰岛素诱导牛成肌细胞成脂分化的研究 被引量:2
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作者 皇甫一凡 昝林森 +5 位作者 王洪宝 成功 刘扬 高建斌 李耀坤 杨宁 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2014年第3期1-9,16,共10页
【目的】建立稳定成熟的牛成肌细胞胰岛素诱导成脂分化体系,为肉牛肉脂品质的改良提供参考。【方法】取1日龄荷斯坦公牛犊后腿肌肉,用Ⅳ型胶原酶消化法分离成肌细胞,用胰岛素诱导成肌细胞成脂分化,以未添加胰岛素的培养基为对照组,检测... 【目的】建立稳定成熟的牛成肌细胞胰岛素诱导成脂分化体系,为肉牛肉脂品质的改良提供参考。【方法】取1日龄荷斯坦公牛犊后腿肌肉,用Ⅳ型胶原酶消化法分离成肌细胞,用胰岛素诱导成肌细胞成脂分化,以未添加胰岛素的培养基为对照组,检测成肌细胞成脂分化过程中细胞形态的变化,并分析与成肌细胞和脂肪细胞分化相关基因(C/EBPα、C/EBPβ、C/EBPδ、PPARγ、Myf5、MyoD)分别诱导第3,6,9,12,15天相对表达量的变化,分析牛成肌细胞的诱导分化情况。【结果】成功分离培养了牛原代成肌细胞。胰岛素处理组细胞中脂滴的油红O染色明显,C/EBPβ、C/EBPδ、PPARγ和MyoD相对表达量明显增高,C/EBPα和Myf5基因相对表达量则下降;用DMEM高糖培养基+体积分数10%胎牛血清(FBS)培养时,C/EBPs基因相对表达量总体高于DMEM高糖培养基+体积分数20%FBS+体积分数10%马血清(HS)。【结论】成功分离并鉴定了牛成肌细胞,建立了适于牛成肌细胞的体外培养体系,用胰岛素诱导成肌细胞成脂分化效果好。 展开更多
关键词 成肌细胞 成脂分化 胰岛素 c ebps基因 PPARΓ基因
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