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题名C型乙型肝炎病毒的全基因组序列分析
被引量:2
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作者
董庆鸣
何忠平
庄辉
宋淑静
戴旺苏
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机构
北京地坛医院病毒研究室
北京大学医学部病原生物学系
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出处
《中国公共卫生》
CAS
CSCD
北大核心
2003年第11期1324-1325,共2页
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文摘
目的 探索乙型肝炎病毒 (HBV)全基因组的结构特点。方法 应用直接PCR基因分型法确定HBV基因型 ,然后随机选择 1例单纯HBVC基因型感染的患者血清 ,分 3个相互重叠片段扩增HBV基因并分别克隆测序。利用VectorNTISuite 7 0软件包、GeneDoc 2 6和TreeView 1 5,将该 3个基因片段拼接为全基因组序列 ,命名为BD HB1,并进行基因进化树分析和同源性比较。结果 HBVC基因型序列全长为 3 2 15bp ,其中A占 2 2 2 % ,G占2 2 4% ,C占 2 6 8% ,T占 2 8 6% ;有S、C、P和X区 4个开放读码框架 (ORFs) ;HBsAg亚型为adr ;HBVRT区 549~552aa为YMDD ,未发生变异 ;未发现前C区nt1896G变异 :BCP区nt1762、1764发生双突变。对HBV分段序列及全基因组序列进行基因进化树分析显示 ,BDHB1与HBVVC基因型的同源性最高。结论 BDHB1基因组符合HBVC基因型结构特点 ,在BCP区存在双突变。
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关键词
c型乙型肝炎病毒
HBV
基因型
基本核心启动子
变异
全基因组序列分析
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Keywords
hepatitis B virus (HBV)
genotype
basic core pr omoter(BcP)
mutation
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分类号
R373.21
[医药卫生—病原生物学]
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题名乙型肝炎病毒C基因型可增加肝细胞癌的风险
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出处
《基础医学与临床》
CSCD
北大核心
2004年第5期536-536,共1页
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文摘
据10月《肠》杂志(Gut,2004;53:1494-1498)上的一项报告,感染了乙型肝炎病毒(HBV)C基因型的病人发展为肝细胞癌(HCC)的风险比感染了HBVB基因型的病人更大。
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关键词
乙型肝炎病毒c基因型
肝细胞癌
风险
HBEAG
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分类号
R735.7
[医药卫生—肿瘤]
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