目的对青海省2016-2017年手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）人肠道病毒A组71型（human enterovirus group A type71，EV—A71）的基因特征进行分析。方法对青海省2016-2017年采集的HFMD标本，用荧光定量逆转录-聚合酶链...目的对青海省2016-2017年手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）人肠道病毒A组71型（human enterovirus group A type71，EV—A71）的基因特征进行分析。方法对青海省2016-2017年采集的HFMD标本，用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（reverse transcription．polymerase chain reaction，RT—PCR）方法进行筛查，对EV—A71阳性标本进行病毒分离，对分离到的病毒提取核酸，用RT—PCR方法对VPl编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析，并与EV．A71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果青海省2016-2017年共分离到114株EV-A71，均为C4基因亚型中的C4a进化分支。在亲缘性关系树中显示，又进一步分属2个不同的小分支。2016-2017年青海省流行的不同传播链上EV—A71与我国其他省流行的EV-A71基因亲缘关系较为接近。结论青海省2016-2017年流行的EV—A71以C4a为绝对优势基因亚型，未监测到其他基因型病毒。青海省EV—A71不是独立进化的，而是与我国其他地区流行的EV—A71共同进化。展开更多
目的探讨引起本地区手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型（Enterovirus 71,EV71）的分子特征,为手足口病的综合防治提供科学依据。方法采集501例临床表现为手足口病感染者的标本及其相关临床资料,通过real time RT-PCR方法确定肠道病毒...目的探讨引起本地区手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型（Enterovirus 71,EV71）的分子特征,为手足口病的综合防治提供科学依据。方法采集501例临床表现为手足口病感染者的标本及其相关临床资料,通过real time RT-PCR方法确定肠道病毒型别,对EV71型分离株进行VP1片段测序,测序结果利用DNAStar软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega 5.0软件构建系统发生树。结果通过real time RT-PCR特异性检测发现,EV71、Cox A16和其他肠道病毒的阳性率分别为56.69%（284/501）、10.38%（52/501）、13.17%（66/501）。测序结果表明12株EV71分离株之间的VP1基因核苷酸同源性为97.9%-99.6%,氨基酸同源性为99.3%-100%。构建系统发生树表明,12株病毒基因与C基因型代表株与C4基因亚型最为相近,并且可进一步划分为C4a进化枝。说明本研究的12株病毒皆属于EV71病毒C基因型、C4a亚型。结论 EV71和CoxA16是本地区手足口病的主要病原体,因此加强EV71和Cox A16的监测特别是EV71的检测,有助于更好地预防和控制手足口病。EV71型惠州分离株均属于C4基因亚型的C4a进化分支,与2004年以来的中国大陆EV71病毒流行的基因型完全一致。展开更多
目的研究太原市手足口病（Hand，Foot and Mouth Disease，HFMD）患者中，肠道病毒A71型（Enterovirus Type A71，EVA71）的分子进化特征。方法采集太原市HFMD患者的咽拭子和粪便标本，采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transc...目的研究太原市手足口病（Hand，Foot and Mouth Disease，HFMD）患者中，肠道病毒A71型（Enterovirus Type A71，EVA71）的分子进化特征。方法采集太原市HFMD患者的咽拭子和粪便标本，采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription—Polymerase Chain Reaction，RT—PCR）方法检测EV核酸。然后随机选取11株EVA71阳性标本进行衣壳蛋白（Capsid Protein）VP，编码区基因扩增、核苷酸序列测定和分析，与其他48株各基因型和基因亚型的EV71代表株构建基因亲缘性关系树。结果太原市11株EVA71均属于C4基因亚型C4a进化分支，但11株EVA71在VP1编码区核苷酸和氨基酸的同源性分别为95．7％～100．0％和99．0％～100．0％。在亲缘进化树中显示，这些EVA71处在不同的簇中，表现为11株EVA71至少属于3条病毒传播链。结论太原市流行的EVA71属于C4基因亚型C4a进化分支，并且存在多个传播链。与中国其他地区流行的EVA71在基因亲缘关系和流行时间关系上都很接近，说明太原市EVA71不是独立进化的，而是与中国其他地区流行的EVA71在共同进化。展开更多
目的 对西宁市2017年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)中肠道病毒A组71型(Enterovirus A group 71 type,EV-A71)的基因特征进行分析。方法 采用实时荧光定量RT-PCR(real-time RT-PCR)方法对西宁市2017年HFMD病例的临床标本进...目的 对西宁市2017年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)中肠道病毒A组71型(Enterovirus A group 71 type,EV-A71)的基因特征进行分析。方法 采用实时荧光定量RT-PCR(real-time RT-PCR)方法对西宁市2017年HFMD病例的临床标本进行EV-A71筛查,阳性标本进行病毒分离。利用EV-A71特异性引物对病毒分离到的阳性毒株的VP1编码区进行扩增,并进行核苷酸序列测定和分析,同时将本研究序列与EV-A71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果 西宁市2017年共分离到57株EV-A71,均为C4a基因亚型,亲缘性分析显示,分属2个不同的小分支。2017年西宁市流行的EV-A71序列与我国其他省流行株的基因亲缘关系较为接近。结论 西宁市2017年流行的EV-A71以C4a为绝对优势基因亚型并与我国其他地区流行的EV-A71共同进化。展开更多
文摘目的对青海省2016-2017年手足口病（hand，foot and mouth disease，HFMD）人肠道病毒A组71型（human enterovirus group A type71，EV—A71）的基因特征进行分析。方法对青海省2016-2017年采集的HFMD标本，用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（reverse transcription．polymerase chain reaction，RT—PCR）方法进行筛查，对EV—A71阳性标本进行病毒分离，对分离到的病毒提取核酸，用RT—PCR方法对VPl编码区进行扩增及核苷酸序列测定和分析，并与EV．A71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果青海省2016-2017年共分离到114株EV-A71，均为C4基因亚型中的C4a进化分支。在亲缘性关系树中显示，又进一步分属2个不同的小分支。2016-2017年青海省流行的不同传播链上EV—A71与我国其他省流行的EV-A71基因亲缘关系较为接近。结论青海省2016-2017年流行的EV—A71以C4a为绝对优势基因亚型，未监测到其他基因型病毒。青海省EV—A71不是独立进化的，而是与我国其他地区流行的EV—A71共同进化。
文摘目的探讨引起本地区手足口病病原谱构成及其肠道病毒71型（Enterovirus 71,EV71）的分子特征,为手足口病的综合防治提供科学依据。方法采集501例临床表现为手足口病感染者的标本及其相关临床资料,通过real time RT-PCR方法确定肠道病毒型别,对EV71型分离株进行VP1片段测序,测序结果利用DNAStar软件进行核苷酸、氨基酸序列分析和同源性比较,并用Mega 5.0软件构建系统发生树。结果通过real time RT-PCR特异性检测发现,EV71、Cox A16和其他肠道病毒的阳性率分别为56.69%（284/501）、10.38%（52/501）、13.17%（66/501）。测序结果表明12株EV71分离株之间的VP1基因核苷酸同源性为97.9%-99.6%,氨基酸同源性为99.3%-100%。构建系统发生树表明,12株病毒基因与C基因型代表株与C4基因亚型最为相近,并且可进一步划分为C4a进化枝。说明本研究的12株病毒皆属于EV71病毒C基因型、C4a亚型。结论 EV71和CoxA16是本地区手足口病的主要病原体,因此加强EV71和Cox A16的监测特别是EV71的检测,有助于更好地预防和控制手足口病。EV71型惠州分离株均属于C4基因亚型的C4a进化分支,与2004年以来的中国大陆EV71病毒流行的基因型完全一致。
文摘目的研究太原市手足口病（Hand，Foot and Mouth Disease，HFMD）患者中，肠道病毒A71型（Enterovirus Type A71，EVA71）的分子进化特征。方法采集太原市HFMD患者的咽拭子和粪便标本，采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应（Reverse Transcription—Polymerase Chain Reaction，RT—PCR）方法检测EV核酸。然后随机选取11株EVA71阳性标本进行衣壳蛋白（Capsid Protein）VP，编码区基因扩增、核苷酸序列测定和分析，与其他48株各基因型和基因亚型的EV71代表株构建基因亲缘性关系树。结果太原市11株EVA71均属于C4基因亚型C4a进化分支，但11株EVA71在VP1编码区核苷酸和氨基酸的同源性分别为95．7％～100．0％和99．0％～100．0％。在亲缘进化树中显示，这些EVA71处在不同的簇中，表现为11株EVA71至少属于3条病毒传播链。结论太原市流行的EVA71属于C4基因亚型C4a进化分支，并且存在多个传播链。与中国其他地区流行的EVA71在基因亲缘关系和流行时间关系上都很接近，说明太原市EVA71不是独立进化的，而是与中国其他地区流行的EVA71在共同进化。
文摘目的 对西宁市2017年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)中肠道病毒A组71型(Enterovirus A group 71 type,EV-A71)的基因特征进行分析。方法 采用实时荧光定量RT-PCR(real-time RT-PCR)方法对西宁市2017年HFMD病例的临床标本进行EV-A71筛查,阳性标本进行病毒分离。利用EV-A71特异性引物对病毒分离到的阳性毒株的VP1编码区进行扩增,并进行核苷酸序列测定和分析,同时将本研究序列与EV-A71各基因型和基因亚型的代表株序列构建亲缘关系进化树。结果 西宁市2017年共分离到57株EV-A71,均为C4a基因亚型,亲缘性分析显示,分属2个不同的小分支。2017年西宁市流行的EV-A71序列与我国其他省流行株的基因亲缘关系较为接近。结论 西宁市2017年流行的EV-A71以C4a为绝对优势基因亚型并与我国其他地区流行的EV-A71共同进化。
