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题名合浦珠母贝C-型凝集素基因的序列特征和功能分析
被引量:11
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作者
胡钰婷
张殿昌
崔淑歌
郭华阳
陈明强
江世贵
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机构
上海海洋大学水产与生命学院
中国水产科学研究院南海水产研究所
暨南大学生命科学技术学院
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出处
《水产学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期1327-1336,共10页
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基金
中央级公益性科研院所基础科研业务费专项资金项目(2009TS23)
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文摘
通过EST筛选结合重测序法获得合浦珠母贝一种C-型凝集素cDNA的全长序列(命名为PoLEC1)。PoLEC1全长988 bp,5'-UTR为33 bp,3'-UTR为101 bp,开放阅读框为864 bp,编码287个氨基酸,分子量为31.68 ku,理论等电点约5.83。预测的氨基酸序列中含有信号肽(Met1-Ser19)和糖结合位点。同源性分析结果表明,PoLEC1与其它物种C-型凝集素的的糖识别结构域序列的同源性在18.8%~28.6%,相似性在28.9%~50.0%之间。进化树分析结果表明,PoLEC1与栉孔扇贝聚为一支。组织表达分析表明,PoLEC1 mRNA在消化腺、外套膜、性腺、闭壳肌、肠、鳃和血淋巴组织均有表达,在消化腺中的表达分析表明,经溶藻弧菌刺激后2 h表达显著下调,而在4和24 h后表达显著上调。利用PoLEC1成熟肽构建原核表达载体,在大肠杆菌中进行重组表达。制备包涵体后,用IDA HisBind树脂纯化得到单一的重组蛋白,凝菌试验表明该蛋白对大肠杆菌有明显的凝集作用。
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关键词
合浦珠母贝
c-型凝集素基因
RT-PCR
原核表达
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Keywords
Pinctada fucata
c-type lectin
RT-PCR
prokaryotic expression
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分类号
Q753
[生物学—分子生物学]
S917.4
[农业科学—水产科学]
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题名马氏珠母贝PmLec-8基因的克隆与表达分析
被引量:7
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作者
吴羽媛
郭志颖
梁海鹰
王庆恒
邓岳文
杜晓东
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机构
广东海洋大学水产学院
广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心
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出处
《广东海洋大学学报》
CAS
2017年第4期1-7,共7页
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基金
国家自然科学基金(31472306)
广东省科技计划项目(2012A031100010)
+2 种基金
广东省海港建设与渔业产业发展专项(A201608B15)
国家级大学生创新创业训练项目(201410566005)
广东海洋大学大学生创新创业训练项目(CXXL2014012)
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文摘
Lec-8(C-type lectin 8)属于C-型凝集素超家族,在机体抵抗微生物的感染过程起重要的作用。本研究采用RACE技术克隆出了PmLec-8基因cDNA全长序列,并且运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测了PmLec-8基因在马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)不同组织中的表达模式。结果显示:PmLec-8基因序列全长737 bp,其中5′UTR长为36 bp,3′UTR长为113 bp,开放阅读框(ORF)为588 bp,编码195个氨基酸,预测其分子质量约为22.90 ku,等电点为5.17;PmLec-8具在一个糖类识别结构域(Carbonhydrate-recognition domain,CRD),符合典型的C型凝集素(C-type lectin)家族特征;多序列比对结果表明物种间Lec-8的同源性较低,4个半胱氨基酸残基高度保守;qRT-PCR数据分析表明,PmLec-8在马氏珠母贝肝胰腺、性腺、闭壳肌、鳃、血细胞和外套膜中均有表达,其中肝胰腺中表达量最高,其次是鳃,差异具统计学意义(P<0.05)。
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关键词
马氏珠母贝
c-型凝集素
基因克隆
实时荧光定量PCR
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Keywords
Pinctada fucata martensii
c-type lectin
gene cloning
real-time PCR
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分类号
S931.4
[农业科学—渔业资源]
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