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基于生物信息学筛查CLEC3B蛋白及其在脓毒症诊断中的作用
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作者 张雨婷 罗福龙 +2 位作者 胡迎春 陈睦虎 钟武 《中国医学装备》 2024年第1期119-122,129,共5页
目的:研究正常人与脓毒症患者血清差异表达蛋白中C-型凝集素域家族3成员B(CLEC3B)蛋白,探讨目标CLEC3B蛋白作为脓毒症分子标志物的可能性。方法:收集10名健康志愿者(健康组)和18例脓毒症患者(脓毒症组)外周血,利用数据独立采集法对外周... 目的:研究正常人与脓毒症患者血清差异表达蛋白中C-型凝集素域家族3成员B(CLEC3B)蛋白,探讨目标CLEC3B蛋白作为脓毒症分子标志物的可能性。方法:收集10名健康志愿者(健康组)和18例脓毒症患者(脓毒症组)外周血,利用数据独立采集法对外周血清蛋白数据进行采集,数据上传至i DEP在线平台分析脓毒症患者外周血中差异表达蛋白。并对这些差异蛋白进行生物信息学分析,筛选出脓毒症关键蛋白。酶联免疫吸附法(ELISA)验证并绘制关键蛋白受试者工作特征(ROC)曲线。结果:蛋白质组学分析筛选出138个差异表达蛋白(DEPs),其中34个蛋白显著下调,104个蛋白显著上调。DEPs主要富集在细胞过程、生物调节、生物过程调节、参与绑定、催化活化、分子功能监管、免疫系统、信号转导等。DEPs构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI)筛选出感兴趣的关键蛋白CLEC3B。ELISA实验表明脓毒症组患者CLEC3B蛋白浓度(297.73±22.00)ng/ml显著低于健康组(452.42±191.72)ng/ml,差异具有统计学意义(t=13.13,P=0.000)。CLEC3B蛋白的ROC曲线下面积为0.998,灵敏度为97.73%,特异度为100.0%。结论:CLEC3B蛋白在脓毒症组中显著降低,其灵敏度高,特异度高,可以作为脓毒症潜在的生物学诊断标志物。临床试验注册号中国临床试验注册中心,ChiCTR1900021261。 展开更多
关键词 脓毒症 生物信息学分析 蛋白质组学 C-型凝集素域家族3成员B(CLEC3B)蛋白
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Ⅳ型胶原蛋白NC1片段在精子发生及血睾屏障中作用的研究进展
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作者 蒋术一 宿文辉 《基础医学与临床》 2023年第4期532-537,共6页
在哺乳动物睾丸中,位于生精上皮基底膜附近的血睾屏障(blood-testis barrier,BTB)对精子发生至关重要。BTB由相邻的支持细胞(Sertoli细胞)连接而成,将生精上皮分为靠近基底膜的“基底室”和靠近生精小管管腔的“近腔室”,为精子发生提... 在哺乳动物睾丸中,位于生精上皮基底膜附近的血睾屏障(blood-testis barrier,BTB)对精子发生至关重要。BTB由相邻的支持细胞(Sertoli细胞)连接而成,将生精上皮分为靠近基底膜的“基底室”和靠近生精小管管腔的“近腔室”,为精子发生提供了免疫屏障。Ⅳ型胶原蛋白是基底膜的重要组成成分,啮齿类动物的睾丸中Ⅳ型胶原蛋白主要是由3条α3链组成的三螺旋结构。大鼠睾丸的Ⅳ型胶原蛋白α3链C端可以水解成大小为28 ku的蛋白片段,称为C端非胶原结构域(noncollagenous domain-peptide,NC1片段)。NC1片段作为一种基底膜源性多肽在参与精子发生与维系BTB功能方面发挥了重要作用。本文通过分析、总结近期研究结果,概述Ⅳ型胶原蛋白NC1片段在睾丸中的作用及其机制,尤其是其在精子发生与BTB中作用的研究进展。 展开更多
关键词 精子发生 血睾屏障(BTB) Ⅳ型胶原蛋白 NC1片段
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N端非催化结构域对微泡菌ALW1褐藻胶裂解酶AlgL7酶学性质的影响 被引量:1
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作者 黄小艺 李鹤宾 +4 位作者 陈艳红 姜泽东 倪辉 李清彪 朱艳冰 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2023年第16期169-176,共8页
为了明确非催化结构域碳水化合物结合模块(carbohydrate-binding module,CBM)和F5/8 C型结构域对褐藻胶裂解酶AlgL7酶学性质的影响,构建并表征了全长酶AlgL7和两个截短酶CD1(催化结构域)和CD2(包含F5/8 C型结构域和催化结构域)。结果表... 为了明确非催化结构域碳水化合物结合模块(carbohydrate-binding module,CBM)和F5/8 C型结构域对褐藻胶裂解酶AlgL7酶学性质的影响,构建并表征了全长酶AlgL7和两个截短酶CD1(催化结构域)和CD2(包含F5/8 C型结构域和催化结构域)。结果表明,与全长AlgL7相比,截短酶CD2表现出更高的比活力、热稳定性和K_(m)值,以及更高的最大反应速率(V_(max)值),表明CBM结构域在保持酶与底物的亲和力方面具有重要作用,但降低了酶的催化活性、热稳定性和V_(max)值。与截短酶CD1相比,CD2表现出更高的比活力、最适反应温度、热稳定性、最大反应速率和Km值,表明F5/8 C型结构域有利于提高酶的催化活性、最适反应温度、热稳定性和最大反应速率,但降低了酶与底物的亲和力。以海藻酸钠为底物,截短酶CD2的比活力为183.9 U/mg,最适反应温度和最适反应pH值分别为40℃和7.0,K_(m)值和V_(max)值分别为39.80 mg/mL和2000 U/mg,酶解产物主要为褐藻胶寡糖二糖和三糖。本研究促进了非催化结构域与褐藻胶裂解酶性质的构效关系研究,为利用非催化结构域改善褐藻胶裂解酶的催化性质提供了一定理论基础。 展开更多
关键词 褐藻胶裂解酶 碳水化合物结合模块 F5/8 C型结构域 酶学性质 酶解产物
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ACEC-结构域选择性抑制二肽与ACE结构域的结合模式 被引量:5
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作者 管骁 洪延涵 +3 位作者 刘静 李景军 孙注 韩飞 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第5期160-166,共7页
IW(Ile-Trp)、VW(Val-Trp)是两种对人体体细胞ACE(somatic ACE,s ACE)中的C-结构域(C-domain)具有选择抑制性活性的食源性二肽,但其与ACE两个结构域(包括C-domain和N-domain)的结合模式与分子机制尚不明确。本实验采用分子柔性对接技术... IW(Ile-Trp)、VW(Val-Trp)是两种对人体体细胞ACE(somatic ACE,s ACE)中的C-结构域(C-domain)具有选择抑制性活性的食源性二肽,但其与ACE两个结构域(包括C-domain和N-domain)的结合模式与分子机制尚不明确。本实验采用分子柔性对接技术分别对上述两种肽与靶标的作用位点、结合能及作用力类型等进行研究。对接结果表明,IW、VW与ACE C-domain的活性位点存在氢键、亲水、疏水相互作用力及配位键,与N-domain作用模式相似,但生成氢键数目较少,且与Zn^(2+)不产生静电相互作用。通过比较IW、VW分别与两个结构域结合的能量差异,证明IW、VW针对两个结构域有不同的抑制强度,可为指导开发ACE C-domain选择性抑制肽提供理论参考。 展开更多
关键词 ACE c-domain选择性抑制肽 柔性对接 结合模式
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环索奈德通过靶向HIV-1衣壳蛋白六聚体调节其体外装配
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作者 张莉 张大为 包小峰 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期19-24,共6页
多肽CAI在HIV-1衣壳蛋白(CA)C末端的结合口袋可用来筛选CA蛋白装配调节剂。采用均相时间分辨荧光技术(HTRF)筛选399个化合物,发现1个小分子化合物环索奈德(ciclesonide)能够竞争性抑制十二肽CAI与CA蛋白C末端的结合,其半数抑制浓度IC_(... 多肽CAI在HIV-1衣壳蛋白(CA)C末端的结合口袋可用来筛选CA蛋白装配调节剂。采用均相时间分辨荧光技术(HTRF)筛选399个化合物,发现1个小分子化合物环索奈德(ciclesonide)能够竞争性抑制十二肽CAI与CA蛋白C末端的结合,其半数抑制浓度IC_(50)值为6.06μmol/L。生物膜干涉技术(BLI)测量环索奈德与CA蛋白(单体和六聚体)的结合,环索奈德与CA六聚体的亲和力为159 nmol/L,远远大于其与CA单体的亲和力(K_(D)=1.68 mmol/L)。衣壳蛋白体外装配实验表明,环索奈德能促进CA蛋白的装配,且具有浓度依赖性。分子模拟分析环索奈德与CA蛋白的结合模式,显示环索奈德与CA六聚体的相互作用发生在六聚体相邻亚基N末端-C末端的界面上,并与H67和L211两个残基形成氢键。研究表明,环索奈德是一种潜在的HIV-1衣壳装配调节剂。 展开更多
关键词 环索奈德 衣壳装配 C端结构域 人类免疫缺陷病毒1型 均相时间分辨荧光技术
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m6Am修饰酶PCIF1调控靶基因ACOT8参与胃癌进展的机制研究
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作者 彭进 王伟宁 +2 位作者 谭智 叶冠男 周震 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期368-376,共9页
背景与目的:最新证据显示N6, 2’-O-二甲基腺苷(N6, 2’-O-dimethyladenosine,m6Am)修饰酶磷酸化C末端结构域相互作用因子1(phosphorylated c-terminal domain-interacting factor 1,PCIF1)可能是胃癌的重要生物标志物及治疗靶点。然而... 背景与目的:最新证据显示N6, 2’-O-二甲基腺苷(N6, 2’-O-dimethyladenosine,m6Am)修饰酶磷酸化C末端结构域相互作用因子1(phosphorylated c-terminal domain-interacting factor 1,PCIF1)可能是胃癌的重要生物标志物及治疗靶点。然而,这种新的PCIF1分子机制与胃癌进展的关系仍有待进一步探索。本研究分析PCIF1对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的调控作用及其调控靶基因酰基辅酶A硫代酯酶8(acyl-CoA thioesterase 8,ACOT8)在胃癌进展中的机制。方法:使用基因表达谱交互分析(gene expression profiling interactive analysis,GEPIA)分析胃癌患者的胃癌组织和非胃癌组织中的PCIF1表达,并分析了PCIF1表达与胃癌患者总生存率的相关性。收集2019年——2021年长沙市第一医院消化内科就诊患者的89对胃癌组织和匹配的癌旁组织。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)和蛋白质印迹法(Western blot)分析PCIF1表达。在体外实验中,将SNU5细胞分为PCIF1敲低(shPCIF1)组和相应对照(sh-NC)组,将AGS细胞分为载体对照组(normal control,NC)组和PCIF1过表达(PCIF1)组。使用细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)、5-乙炔基-2’-脱氧尿苷(5-ethynyl-2’-deoxyuridine,EdU)和transwell法分析了PCIF1对胃癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响。此外,在PCIF1过表达的AGS细胞中敲低ACOT8并进行了拯救实验。采用皮下异种移植瘤模型来测定PCIF1在胃癌中的生物学效应。结果:PCIF1在胃癌组织和细胞系中呈高表达,并且PCIF1高表达胃癌患者的预后较差。与sh-NC组相比,sh-PCIF1组的细胞活力、EdU阳性细胞、迁移和侵袭细胞数均显著降低(P<0.05)。与NC组相比,PCIF1组的细胞活力、EdU阳性细胞、迁移和侵袭细胞数均显著增加(P<0.05)。在PCIF1过表达的AGS细胞中,敲低ACOT8的表达可降低细胞活力、EdU阳性细胞、迁移和侵袭细胞数。在体内实验中,与NC组相比,PCIF1过表达组裸鼠的移植瘤体积和重量均显著增加(P<0.05)。结论:PCIF1在胃癌细胞系和组织中上调。此外,PCIF1/ACOT8轴参与介导胃癌细胞的恶性行为产生。 展开更多
关键词 N6 2’-O-二甲基腺苷 磷酸化C末端结构域相互作用因子1 酰基辅酶A硫代酯酶8 胃癌 增殖 转移
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血清CLEC2、SERPINA3、hs-CRP/ALB与STEMI患者PCI后MACE的关系及其预测效能分析 被引量:1
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作者 冯建程 田野 《检验医学与临床》 CAS 2023年第11期1544-1549,共6页
目的探讨血清C型凝集素域家族成员2(CLEC2)、丝氨酸蛋白酶抑制剂家族A成员3(SERPINA3)、超敏C反应蛋白/清蛋白(hs-CRP/ALB)与急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者经皮冠状动脉介入治疗(PCI)后主要心血管不良事件(MACE)的关系及其预测效... 目的探讨血清C型凝集素域家族成员2(CLEC2)、丝氨酸蛋白酶抑制剂家族A成员3(SERPINA3)、超敏C反应蛋白/清蛋白(hs-CRP/ALB)与急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者经皮冠状动脉介入治疗(PCI)后主要心血管不良事件(MACE)的关系及其预测效能。方法选择2020年1月至2021年9月该院收治的STEMI患者132例作为STEMI组,随访1年,根据PCI后是否发生MACE分为MACE组和非MACE组,另选择同期该院健康体检者68例作为对照组。采用酶联免疫吸附试验检测所有研究对象血清CLEC2、SERPINA3、hs-CRP、ALB水平,并计算hs-CRP/ALB。采用多因素Logistic回归分析STEMI患者PCI后发生MACE的影响因素,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析血清CLEC2、SERPINA3、hs-CRP/ALB单项及联合检测对STEMI患者PCI后发生MACE的预测价值。结果132例STEMI患者PCI后MACE发生率为31.06%(41/132)。STEMI组患者血清CLEC2、SERPINA3水平及hs-CRP/ALB均高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。年龄≥62岁、Killip分级≥Ⅲ级、心肌肌钙蛋白I水平≥1.7 ng/mL、CLEC2水平≥155 pg/mL、SERPINA3水平≥350 ng/L、hs-CRP/ALB≥0.50是STEMI患者PCI后发生MACE的独立危险因素(P<0.05),左室射血分数≥50%是独立保护因素(P<0.05)。血清CLEC2、SERPINA3、hs-CRP/ALB联合检测预测STEMI患者PCI后发生MACE的ROC曲线下面积(0.856)大于各项指标单独检测。结论血清CLEC2水平≥155 pg/mL、SERPINA3水平≥350 ng/L、hs-CRP/ALB≥0.50与STEMI患者PCI后发生MACE密切相关,可作为STEMI患者PCI后发生MACE的辅助预测指标。 展开更多
关键词 急性ST段抬高型心肌梗死 经皮冠状动脉介入治疗 C型凝集素域家族成员2 丝氨酸蛋白酶抑制剂家族A成员3 超敏C反应蛋白/清蛋白
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CLEC12B在肺腺癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系
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作者 孙玲玲 汪巧 李光耀 《临床与病理杂志》 CAS 2023年第12期2071-2079,共9页
目的:C型凝集素受体(C-type lectin receptors,CLRs)家族参与发育、炎症调节、肿瘤、心血管疾病等许多病理和生理过程。C型凝集素结构域家族成员12B(C-type lectin domain family 12 member B,CLEC12B)能够抑制黑色素瘤增殖,但其与肺腺... 目的:C型凝集素受体(C-type lectin receptors,CLRs)家族参与发育、炎症调节、肿瘤、心血管疾病等许多病理和生理过程。C型凝集素结构域家族成员12B(C-type lectin domain family 12 member B,CLEC12B)能够抑制黑色素瘤增殖,但其与肺腺癌的关系尚不清楚。因此,本研究利用生物信息学方法探讨CLEC12B在肺腺癌中的表达水平及其与肿瘤分期、预后、免疫浸润的关系。方法:使用基因型-组织表达(genotype-tissue expression,GTEx)、癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库及免疫组织化学法探讨CLEC12B在肺腺癌中的表达及其与不同肿瘤分期的相关性,使用Kaplan-Meier Plotter在线分析网站、仙桃学术网页工具探讨CLEC12B与肺腺癌预后的相关性,并使用肿瘤免疫估算工具(tumor immune estimation resourse,TIMER)探究CLEC12B与免疫细胞浸润之间的相关性,再用基因表达谱互动分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库获取肺腺癌中表达相关的前100个与CLEC12B共表达的基因,进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。结果:与正常组织相比,肺腺癌CLEC12B mRNA和蛋白表达水平下调。CLEC12B高表达与较早的肿瘤分期和较好的预后相关,并且B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞等细胞浸润及免疫检查点基因的表达在CLEC12B高、低表达之间差异均有统计学意义(均P<0.05)。富集分析显示CLEC12B表达与中性粒细胞介导免疫、中性粒细胞脱颗粒等过程密切相关。结论:CLEC12B在肺腺癌中呈低表达,与中性粒细胞浸润、免疫检查点基因表达及中性粒细胞介导免疫、中性粒细胞脱颗粒等过程呈正相关,且CLEC12B低表达与较差的肺腺癌预后相关。 展开更多
关键词 肺腺癌 预后标志物 免疫浸润 C型凝集素结构域家族成员12B
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浅析美妆产品私域精准营销及其实现路径——以“完美日记”为例
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作者 陈倩婷 何练 《中国商论》 2023年第2期65-67,共3页
随着互联网和大数据的发展,企业管理与发展已经进入营销4.0阶段,与目前的市场营销模式已经发生了转变,转变成为以消费者为中心的私域营销方式,更加注重倾听消费者的真实声音来完成品牌升级与改造。完美日记是私域流量运营的领头羊,短短... 随着互联网和大数据的发展,企业管理与发展已经进入营销4.0阶段,与目前的市场营销模式已经发生了转变,转变成为以消费者为中心的私域营销方式,更加注重倾听消费者的真实声音来完成品牌升级与改造。完美日记是私域流量运营的领头羊,短短几年时间,通过私域营销方式的不断升级改造和运用,频繁抢占天猫彩妆第一名的榜单,针对完美日记的运营方法进行研究分析与经验总结,希望能为更多不同企业提供全新的营销和运营思路。 展开更多
关键词 私域流量 精准营销 互动 品牌 多样化
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基于时频域反射法的核电站仪控电缆缺陷检测 被引量:1
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作者 王志武 涂画 +1 位作者 李力行 邓红雷 《电力工程技术》 北大核心 2023年第5期240-249,共10页
为确保核电站中仪控电缆的安全运行,时频域反射法(time-frequency domain reflectometry,TFDR)被广泛用于识别和定位仪控电缆中的缺陷。文中对比魏格纳-维利分布(Wigner-Ville distribution,WVD)、伪魏格纳-维利分布(pseudo Wigner-Vill... 为确保核电站中仪控电缆的安全运行,时频域反射法(time-frequency domain reflectometry,TFDR)被广泛用于识别和定位仪控电缆中的缺陷。文中对比魏格纳-维利分布(Wigner-Ville distribution,WVD)、伪魏格纳-维利分布(pseudo Wigner-Ville distribution,PWVD)、平滑伪魏格纳-维利分布(smooth pseudo Wigner-Ville distribution,SPWVD)算法的优势,并提出时频域互相关曲线(time-frequency cross-correlation,TFCC)的能量区间放缩法。分别对50 m和148 m的多芯交联聚烯烃仪控电缆进行短路、断路、绝缘屏蔽层破损和局部热老化的缺陷模拟,并基于TFDR,采用3种时频分布算法进行实验处理。随后,基于局部热老化的检测,采用能量区间放缩法,对TFCC定位峰主瓣较宽的问题进行改善。实验结果表明:经过SPWVD处理后,TFCC的主瓣较宽;在正常电缆检测时,PWVD对交叉项有更好的抑制作用;但在单缺陷检测中,SPWVD具有更好的缺陷识别能力;通过采用能量区间放缩法,可分离相近的定位峰,加强对微弱反射信号的判别。 展开更多
关键词 仪控电缆 缺陷检测 故障定位 时频域反射法(TFDR) 时频分析 时频互相关曲线(TFCC)
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基于液芯柱透镜测量随浓度变化的液相扩散系数:方法综述
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作者 王瑞仙 孟伟东 +3 位作者 魏利 孙丽存 李强 普小云 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期356-368,共13页
液相扩散系数是溶液浓度的函数D(c),通常采用浓度配对法、Boltzmann-Matano(BM)图解法、Hall解析法和多项式数值逼近等方法测量D(c)关联式.文章在综述以上几种测量方法的基础上,重点介绍了测量D(c)关联式的一种新方法,即BM半解析法.BM... 液相扩散系数是溶液浓度的函数D(c),通常采用浓度配对法、Boltzmann-Matano(BM)图解法、Hall解析法和多项式数值逼近等方法测量D(c)关联式.文章在综述以上几种测量方法的基础上,重点介绍了测量D(c)关联式的一种新方法,即BM半解析法.BM半解析法基于液芯柱透镜测量扩散过程中溶液浓度的空时分布函数c_(expt)(x,t)s,结合Hall解析法以及BM图解法,能够快速、准确、稳定地测量D(c)关联式.用BM半解析法测量了葡萄糖水溶液在室温下的D(c)关联式,采用时域有限差分法(FDTD)求解Fick扩散方程,计算了不同D(c)关联式下扩散浓度的空时分布函数,计算结果与实验浓度分布函数c_(expt)(x,t)s进行了分析比较.结果表明,采用FDTD计算并比较实验扩散浓度空时分布的方法,为实测D(c)关联式的正确性提供了一种有效的判断手段. 展开更多
关键词 液相扩散系数 液芯柱透镜 时域有限差分法 Boltzmann-Matano法 D(c)关联式验证
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猪瘟病毒E2基因抗原结构域A、B、C、D区在大肠杆菌中的表达 被引量:9
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作者 张永国 刘湘涛 +3 位作者 韩雪清 胡建和 张彦明 谢庆阁 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期182-185,共4页
采用PCR技术扩增出猪瘟病毒E2基因抗原结构域A、B、C、D区并克隆于PGEM Teasy载体上,测序结果表明插入的为猪瘟病毒E2基因抗原结构域,切出目的基因,将目的基因克隆到表达质粒pProEX HTb中,获得重组质粒经PCR、酶切和序列分析鉴定E2基因... 采用PCR技术扩增出猪瘟病毒E2基因抗原结构域A、B、C、D区并克隆于PGEM Teasy载体上,测序结果表明插入的为猪瘟病毒E2基因抗原结构域,切出目的基因,将目的基因克隆到表达质粒pProEX HTb中,获得重组质粒经PCR、酶切和序列分析鉴定E2基因抗原结构域插入的位置、大小和读码框均正确,SDS PAGE检测表明受体菌经IPTG诱导后能表达E2基因抗原结构域蛋白,Westernblot检测表明受体菌诱导表达E2基因抗原结构域蛋白可与猪瘟阳性血清发生特异性反应。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 E2基因抗原结构域 A区 B区 C区 D区 大肠杆菌 基因表达
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海藻糖合酶的分子生物学研究进展 被引量:10
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作者 朱玥明 张峻 +1 位作者 邢来君 李明春 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期6-12,共7页
海藻糖合酶能够将麦芽糖转化为海藻糖,在海藻糖的工业生产中具有十分重要的意义。本文从海藻糖合酶的基因克隆、基因工程应用、结构和催化机制的研究以及其在微生物体内的功能等方面讨论了海藻糖合酶的研究进展。
关键词 海藻糖 海藻糖合酶 α-淀粉酶家族 催化机制 C端结构域 代谢途径
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基于领域类别信息C-value的多词串自动抽取 被引量:7
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作者 李超 王会珍 +2 位作者 朱慕华 张俐 朱靖波 《中文信息学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期94-98,共5页
该本的多词串抽取是自然语言处理领域一项重要的研究内容。该文提出了一种多类别C-value(Multi-Class C-value)方法,利用多词串在不同领域的分布信息改善领域相关的多词串抽取的性能。在汽车、科技和旅行三个领域的数据上进行实验,评价... 该本的多词串抽取是自然语言处理领域一项重要的研究内容。该文提出了一种多类别C-value(Multi-Class C-value)方法,利用多词串在不同领域的分布信息改善领域相关的多词串抽取的性能。在汽车、科技和旅行三个领域的数据上进行实验,评价多词串的准确率,在top-100级别上,较传统的C-value方法在三个领域中分别提高了12、12和13个百分点。实验结果验证了方法的有效性。 展开更多
关键词 计算机应用 中文信息处理 多词串抽取 多类别C-value 领域信息
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PADI3 induces cell cycle arrest via the Sirt2/AKT/p21 pathway and acts as a tumor suppressor gene in colon cancer 被引量:4
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作者 Xiaotian Chang Zhengbin Chai +5 位作者 Jiaorui Zou Hongxing Wang Yao Wang Yabing Zheng Hui Wu Chunyan Liu 《Cancer Biology & Medicine》 SCIE CAS CSCD 2019年第4期729-742,共14页
Objective:As a member of the peptidyl arginine deiminase(PAD)family,PADI3 is weakly expressed in colon cancer tissues and highly expressed in adjacent colon cancer tissues.However,the role of PADI3 in colon cancer is ... Objective:As a member of the peptidyl arginine deiminase(PAD)family,PADI3 is weakly expressed in colon cancer tissues and highly expressed in adjacent colon cancer tissues.However,the role of PADI3 in colon cancer is unclear.In this study,we investigated the function and molecular mechanism of PADI3 in colon cancer tumorigenesis.Methods:Western blot and real-time PCR were used to detect the expression levels of several genes.CCK-8,flow cytometry(FCM)and colony formation assays were used to examine cell proliferation,the cell cycle and colony formation ability.RNAsequencing analysis was used to study the molecular mechanism of PADI3 in tumorigenesis.A truncation mutation experiment was performed to determine the key functional domain of PADI3.Results:PADI3 overexpression inhibited cell proliferation and colony formation and led to G1 phase arrest in both HCT116(originating from primary colon cancer)and LoVo(originating from metastatic tumor nodules of colon cancer)cells.PADI3-expressing HCT116 cells had a lower tumor formation rate and produced smaller tumors than control cells.PADI3 significantly decreased Sirtuin2(Sirt2)and Snail expression and AKT phosphorylation and increased p21 expression,and Sirt2 overexpression partly reversed the effects induced by PADI3 overexpression.Immunocytochemistry showed that PADI3 is mainly localized in the cytoplasm.Truncation mutation experiments showed that the C-domain is the key domain involved in the antitumor activity of PADI3.Conclusions:PADI3 suppresses Snail expression and AKT phosphorylation and promotes p21 expression by downregulating Sirt2 expression in the cytoplasm,and the C-domain is the key domain for its antitumor activity. 展开更多
关键词 PADI3 Sirt2 colon cancer cell cycle c-domain
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艰难梭菌细胞毒素B功能区的克隆及序列分析 被引量:3
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作者 刘红升 张清华 蒋知新 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2007年第1期9-10,13,共3页
目的克隆艰难梭菌(Clostridium difficile,C.d)细胞毒素B羧基末端功能区(CDB3)基因,并对其进行测序及生物信息学分析。方法利用PCR技术扩增CDB3基因,并将其定向插入pET-22b(+)载体中,以DNA自动分析仪进行序列测定,并以生物信息学软件分... 目的克隆艰难梭菌(Clostridium difficile,C.d)细胞毒素B羧基末端功能区(CDB3)基因,并对其进行测序及生物信息学分析。方法利用PCR技术扩增CDB3基因,并将其定向插入pET-22b(+)载体中,以DNA自动分析仪进行序列测定,并以生物信息学软件分析其生物学特性。结果成功克隆了艰难梭菌CDB3基因,经测序表明与GenBank中分布的Clostridium difficile VPI10463的ToxinB3基因序列完全一致。DNAstar软件预测其蛋白质的相对分子量(Mr)约为71.3 kD,并显示出良好的抗原性。结论研究获得了序列正确的CDB3基因,为其重组表达及其相关研究奠定了良好基础。 展开更多
关键词 艰难梭菌 细胞毒素B功能区蛋白 序列分析 生物信息学分析
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噬菌体裂解酶研究进展 被引量:2
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作者 李晓静 方宏清 +1 位作者 付学奇 陈惠鹏 《生物技术通讯》 CAS 2005年第3期326-329,共4页
噬菌体裂解酶是双链DNA噬菌体所特有的细胞壁水解酶。研究表明,所有噬菌体裂解酶在结构上具有相似性,即含有2个结构域:比较保守的N端催化区和差异较大的C端特异性结合区。裂解酶的高亲和性与种属特异的细胞壁糖基有关,而后者常常是细菌... 噬菌体裂解酶是双链DNA噬菌体所特有的细胞壁水解酶。研究表明,所有噬菌体裂解酶在结构上具有相似性,即含有2个结构域:比较保守的N端催化区和差异较大的C端特异性结合区。裂解酶的高亲和性与种属特异的细胞壁糖基有关,而后者常常是细菌存活的必要成分。所以,细菌难以产生对裂解酶的抗性。本文简要综述噬菌体裂解酶的研究进展。 展开更多
关键词 研究进展 裂解酶 噬菌体 细胞壁水解酶 双链DNA 相似性 结合区 特异性 催化区 结构域 亲和性 细菌 C端 N端
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C1q蛋白家族的结构、分布、分类和功能 被引量:16
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作者 刘阁 逄越 +1 位作者 刘欣 李庆伟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期1072-1080,共9页
C1q蛋白家族由众多含C1q结构域的蛋白组成,从细菌到高等哺乳动物中都有分布。这类蛋白由一条信号肽、胶原样区(Collage-like region,CLR)和C1q球状结构域(Globular C1q domain,gC1q)组成。C1q蛋白家族根据其结构特点,可分为三大类分子:... C1q蛋白家族由众多含C1q结构域的蛋白组成,从细菌到高等哺乳动物中都有分布。这类蛋白由一条信号肽、胶原样区(Collage-like region,CLR)和C1q球状结构域(Globular C1q domain,gC1q)组成。C1q蛋白家族根据其结构特点,可分为三大类分子:C1q、C1q-like和ghC1q。C1q是补体经典途径的起始分子,能够识别免疫复合物,启动补体系统经典途径;此外,作为一种模式识别受体分子(Pattern recognition receptor,PRR),它可以结合种类繁多的配体。C1q-like蛋白的结构类似于C1q分子,含有CLR和gC1q结构域,在水蛭中参与神经系统的修复,在脊椎动物中实现从凝集素到免疫球蛋白结合分子的功能转变,参与补体系统的激活。ghC1q蛋白只具有gC1q结构域和一段短的N末端序列,包括分泌型蛋白(sghC1q)和非分泌型蛋白(cghC1q)。sghC1q在无脊椎动物固有免疫系统中发挥重要作用;脊椎动物中的sghC1q可作为一类新型跨神经元调节因子,在大脑的许多区域调节突触发育和突触可塑性。cghC1q基因最早可追溯至芽孢杆菌属的细菌中,具有典型的gC1q果冻卷结构,说明gC1q结构域有着非常悠久的进化历程且结构高度保守。文章对C1q蛋白家族的结构、分布、分类以及功能进行综述,以期为从事该领域研究的科研人员提供有益参考。 展开更多
关键词 胶原样区 C1q球状结构域 补体系统 模式识别受体
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f-x域经验模式分解与多道奇异谱分析相结合去除随机噪声 被引量:14
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作者 刘婷婷 陈阳康 《石油物探》 EI CSCD 北大核心 2016年第1期67-75,共9页
近年来,经验模式分解法(EMD)因其处理非稳态地震信号的能力和易于实现而备受关注。总结了EMD在地震去噪中的应用情况,提出了一种基于f-x域EMD和多道奇异谱分析(MSSA)相结合的去噪新方法。该方法不同于f-x域EMD分别与f-x域预测滤波、小... 近年来,经验模式分解法(EMD)因其处理非稳态地震信号的能力和易于实现而备受关注。总结了EMD在地震去噪中的应用情况,提出了一种基于f-x域EMD和多道奇异谱分析(MSSA)相结合的去噪新方法。该方法不同于f-x域EMD分别与f-x域预测滤波、小波阈值、曲波变换等相结合的各种去噪方法,它可以得到比f-x域MSSA更高的信噪比并能预测f-x域EMD中损失掉的线性能量。该方法的实现过程为:首先,对地震剖面应用f-x域EMD,保留所有相对水平的同相轴,这样在噪声剖面中留下很少的倾斜信号和随机噪声,然后在差异剖面中应用f-x域MSSA恢复倾斜信号,最后将水平信号和倾斜信号相加得到去噪剖面。理论测试和实际数据的处理结果验证了该方法的优越性。 展开更多
关键词 去除随机噪声 经验模式分解法 多道奇异谱分析法 F-X域 恢复倾斜同相轴
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国际丙肝研究领域的文献计量分析 被引量:7
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作者 唐小利 杜建 +1 位作者 孙涛涛 张燕舞 《情报杂志》 CSSCI 北大核心 2011年第6期76-81,共6页
基于SCI和SSCI数据,采用文献计量方法,分析和讨论国际丙肝领域研究主题的发展演化以及热点、前沿领域,应用科学知识图谱、共词分析和突变词检测方法分析丙肝领域研究的知识发展进程和结构关系,为相关领域科研人员提供医学情报服务。
关键词 丙型肝炎 HCV 文献计量 科学知识图谱
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