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橡胶树AtCAB1同源基因的克隆及其在稳定与衰老期叶片中的差异分析
被引量:
15
1
作者
邹智
杨礼富
+3 位作者
安峰
王真辉
袁坤
庄美露
《热带农业科学》
2013年第4期30-35,共6页
以一编码蛋白与拟南芥的CAB1高度相似的EST序列作为探针,通过同源搜索从橡胶树的转录组数据中电子克隆到一条长1 415 bp的cDNA,该序列包含一798 bp的ORF及47 bp的5′UTR和570 bp的3′UTR,命名为HbCAB1;在此基础上,采用PCR技术成功扩增...
以一编码蛋白与拟南芥的CAB1高度相似的EST序列作为探针,通过同源搜索从橡胶树的转录组数据中电子克隆到一条长1 415 bp的cDNA,该序列包含一798 bp的ORF及47 bp的5′UTR和570 bp的3′UTR,命名为HbCAB1;在此基础上,采用PCR技术成功扩增了包括该ORF在内的915 bp的cDNA序列。序列分析表明,该基因预测编码265个氨基酸,理论分子量为28.15 ku,等电点为5.25;蛋白含有1个保守的捕光叶绿素a/b结合蛋白结构域,3个跨膜螺旋和1个C端螺旋,1个三聚化基序,以及多个叶绿素和类胡萝卜素结合位点;蛋白与蓖麻(Ricinus communis)、杨树(Populus trichocarpa)、橄榄(Canarium album)中同源蛋白的相似性都在95%以上,显示出基因进化的保守性。半定量RT-PCR分析显示,与稳定期叶片相比,HbCAB1在衰老期叶片中的转录水平显著下调。
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关键词
巴西橡胶树
拟南芥
cab1基因
稳定期叶片
衰老期叶片
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职称材料
题名
橡胶树AtCAB1同源基因的克隆及其在稳定与衰老期叶片中的差异分析
被引量:
15
1
作者
邹智
杨礼富
安峰
王真辉
袁坤
庄美露
机构
中国热带农业科学院橡胶研究所/农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室
出处
《热带农业科学》
2013年第4期30-35,共6页
基金
国家自然科学资金(No.31100460)
海南省重点科技项目(No.90107)
+1 种基金
海南省自然科学基金(No.312026)
中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项(No.1630022011014)
文摘
以一编码蛋白与拟南芥的CAB1高度相似的EST序列作为探针,通过同源搜索从橡胶树的转录组数据中电子克隆到一条长1 415 bp的cDNA,该序列包含一798 bp的ORF及47 bp的5′UTR和570 bp的3′UTR,命名为HbCAB1;在此基础上,采用PCR技术成功扩增了包括该ORF在内的915 bp的cDNA序列。序列分析表明,该基因预测编码265个氨基酸,理论分子量为28.15 ku,等电点为5.25;蛋白含有1个保守的捕光叶绿素a/b结合蛋白结构域,3个跨膜螺旋和1个C端螺旋,1个三聚化基序,以及多个叶绿素和类胡萝卜素结合位点;蛋白与蓖麻(Ricinus communis)、杨树(Populus trichocarpa)、橄榄(Canarium album)中同源蛋白的相似性都在95%以上,显示出基因进化的保守性。半定量RT-PCR分析显示,与稳定期叶片相比,HbCAB1在衰老期叶片中的转录水平显著下调。
关键词
巴西橡胶树
拟南芥
cab1基因
稳定期叶片
衰老期叶片
Keywords
Hevea brasiliensis Muell.Arg.
Arabidopsis thaliana
cab
1
mature leaf
senescent leaf
分类号
S794.1 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
橡胶树AtCAB1同源基因的克隆及其在稳定与衰老期叶片中的差异分析
邹智
杨礼富
安峰
王真辉
袁坤
庄美露
《热带农业科学》
2013
15
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职称材料
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参考文献
引证文献
统计分析
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