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CACNA1E基因变异致儿童难治性癫痫1例报告 被引量:1
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作者 李洁玲 曹洁 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期269-272,共4页
目的报道CACNA1E基因变异所致难治性癫痫的临床特征。方法回顾分析1例CACNA1E基因变异所致难治性癫痫患儿的临床资料。结果患儿,男,1岁6个月,因难治性癫痫伴智力运动发育落后就诊。患儿四肢肌张力降低,有严重的癫痫脑病表现,基因检测提... 目的报道CACNA1E基因变异所致难治性癫痫的临床特征。方法回顾分析1例CACNA1E基因变异所致难治性癫痫患儿的临床资料。结果患儿,男,1岁6个月,因难治性癫痫伴智力运动发育落后就诊。患儿四肢肌张力降低,有严重的癫痫脑病表现,基因检测提示患儿携带CACNA1E基因c.4258(exon 30)G>A(NM_001205293)新发杂合变异,而其父母该位点均为野生型。根据ACMG(The American College of Medical Genetics and Genomics)标准与指南(2015),该变异为可能致病性变异。结论对难治性癫痫伴有智力运动发育落后、四肢肌张力低下的患儿应尽早完善基因检测,以明确诊断。 展开更多
关键词 cacna1e基因变异 难治性癫痫 智力运动发育落后 癫痫性脑病
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CACNA1E基因变异致发育性癫痫性脑病一例报告并文献复习
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作者 刘春梅 傅桃梅 +2 位作者 张曼 胡卫 曾建武 《中国医师杂志》 CAS 2023年第12期1785-1788,共4页
目的报道1例CACNA1E基因变异所致发育性癫痫性脑病,探讨C.2069G>A(p.Gly690Asp)位点的临床表型和预后。方法总结分析2020年9月湘潭市妇幼保健院收治的1例CACNA1E基因变异相关的发育性癫痫性脑病的临床资料和随访情况。结果患儿男,智... 目的报道1例CACNA1E基因变异所致发育性癫痫性脑病,探讨C.2069G>A(p.Gly690Asp)位点的临床表型和预后。方法总结分析2020年9月湘潭市妇幼保健院收治的1例CACNA1E基因变异相关的发育性癫痫性脑病的临床资料和随访情况。结果患儿男,智力运动发育落后就诊,逐渐出现抽搐发作,基因结果回报:CACNA1E基因c.2069G>A(p.Gly690Asp)为新发变异,父母该位点为野生型,结合临床表现,为致病性变异。结论CACNA1E基因变异导致的发育性癫痫性脑病,智力运动损害可以为首发表现,位点C.2069G>A(p.Gly690Asp)临床表型重,预后差,可出现脑萎缩,丙戊酸联合氯硝西泮抗癫痫可能有效。 展开更多
关键词 突变 cacna1e基因 发育性癫痫性脑病
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E2A-PBX1融合基因阳性的儿童急性淋巴细胞白血病携带变异型融合转录本 被引量:2
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作者 李志刚 赵玮 +1 位作者 吴敏媛 胡亚美 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2006年第3期516-520,共5页
为了研究儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中E2A-PBX1融合基因的表达,采用位于E2A基因不同位置的上游引物与下游PBX1引物,检测了410例儿童ALL,包括362例B细胞ALL和48例T细胞ALL。结果发现:17例患儿携带E2A-PBX1融合基因,检出率4.1%,且全部为... 为了研究儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中E2A-PBX1融合基因的表达,采用位于E2A基因不同位置的上游引物与下游PBX1引物,检测了410例儿童ALL,包括362例B细胞ALL和48例T细胞ALL。结果发现:17例患儿携带E2A-PBX1融合基因,检出率4.1%,且全部为B细胞ALL,而且所有阳性病例均表达一种变异型融合转录本,后者是由E2A基因的第13外显子(159bp)被差异剪切形成的。经BLASTn比对分析,这种转录本保持了原来的开放阅读框,但导致53个氨基酸残基的丢失。这53个氨基酸残基位于活化区2,会导致融合蛋白中部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。结论:携带E2A-PBX1融合基因的儿童ALL表达典型和变异型2种融合转录本,后者是由E2A基因第13外显子被差异剪切而形成的,它将导致融合蛋白中53个氨基酸残基及其所构成的部分环-螺旋结构以及全部七聚体亮氨酸重复序列的丢失。 展开更多
关键词 急性淋巴细胞白血病 e2A-PBX1融合基因 变异型融合转录本 活化区2
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柔嫩艾美耳球虫杨陵株3-1E基因的克隆与序列分析 被引量:2
4
作者 战美娜 林青 +1 位作者 于三科 宋军科 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期11-15,共5页
根据GenBank发表的鸡柔嫩艾美耳球虫(Ei meriatenella)3-1E基因的ORF设计一对引物,用RT-PCR方法从E.tenella杨陵(YL)株总RNA中扩增3-1E基因,并将扩增产物与pMD18-T easy载体进行连接并测序,用DNAstar 5.0软件对测序结果进行分析。结果表... 根据GenBank发表的鸡柔嫩艾美耳球虫(Ei meriatenella)3-1E基因的ORF设计一对引物,用RT-PCR方法从E.tenella杨陵(YL)株总RNA中扩增3-1E基因,并将扩增产物与pMD18-T easy载体进行连接并测序,用DNAstar 5.0软件对测序结果进行分析。结果表明,2009年分离的E.tenellaYL株3-1E基因与其他虫株相比,核苷酸有9个位点发生变化,其中7个位点的变化引起了相应氨基酸位点的改变,其他2个位点的变化未引起氨基酸的改变。对2006年和2009年分离的YL株3-1E基因的核苷酸进行了比对,结果发现,有两个核苷酸位点发生了变化。系统发育树分析表明,E.tenellaYL株3-1E基因同种间与E.tenella甘肃株遗传关系最近,同属间与E.acervulina法国株遗传关系最近。 展开更多
关键词 艾美耳球虫 杨凌株 3-1e基因 遗传变异
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柔嫩艾美耳球虫海南株3-1E基因的克隆与序列分析
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作者 张艳 刘海隆 +2 位作者 曹宗喜 林哲敏 谭树义 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第10期119-121,共3页
为了研究鸡柔嫩艾美耳球虫(E.tenella)海南(HN)株3-1E基因的遗传变异情况,试验根据GenBank发表的鸡堆型艾美耳球虫(E.acervulina)美国株(US)3-1E基因cDNA序列(登录号为AF113613)的开放阅读框(ORF)设计1对引物,采用RT-PCR方法从E.tenella... 为了研究鸡柔嫩艾美耳球虫(E.tenella)海南(HN)株3-1E基因的遗传变异情况,试验根据GenBank发表的鸡堆型艾美耳球虫(E.acervulina)美国株(US)3-1E基因cDNA序列(登录号为AF113613)的开放阅读框(ORF)设计1对引物,采用RT-PCR方法从E.tenella HN株总RNA中扩增3-1E基因,将扩增产物与pMD18-T载体连接后进行测序和序列分析,并与已发表的E.tenella相关序列进行比较。结果表明:E.tenella HN株3-1E基因全长为513 bp,与已发表的国内外虫株的3-1E基因序列相比,核苷酸有5个位点发生变化,其中有4个位点的变化引起氨基酸发生改变,还有1个位点的变化未引起相应氨基酸发生改变。经系统发育树分析发现:同种间比较,E.tenella HN株3-1E基因与E.tenella sporozoite antigen株的遗传关系最近;同属间比较,E.tenella HN株3-1E基因与E.acervulina US株的遗传关系最近。 展开更多
关键词 柔嫩艾美耳球虫 海南株 3-1e基因 遗传变异 克隆 序列分析
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印度尼西亚、苏里南、荷兰的宫颈癌患者中人乳头瘤病毒16型的E6、E7、L1变异型
6
作者 De Boer M.A. Peters L.A.W. +1 位作者 Aziz M.F. 安妮 《世界核心医学期刊文摘(妇产科学分册)》 2005年第1期56-57,共2页
Objective. Human papillomavirus type 16 (HPV 16) has several intratyp ic varian ts, and some are associated with enhanced oncogenic potential. For risk determin ation aswell as for future vaccine development, knowledg... Objective. Human papillomavirus type 16 (HPV 16) has several intratyp ic varian ts, and some are associated with enhanced oncogenic potential. For risk determin ation aswell as for future vaccine development, knowledge about variants is impo rtant. Regarding the geographical distribution of HPV variants and the lack of d ata from Indonesia and Suriname, we studied the prevalence of HPV 16 variants in cervical cancer in these high incidence countries. Data were compared with The Netherlands, a low-risk country. Methods. DNA samples from 74 formalin-fixed p araffin-embedded HPV 16-positive cervical carcinomas from Indonesia (Java, N = 22), Suriname (N = 25), and The Netherlands (N = 27) were amplified using prime rs specific for the E6, E7, and part of the L1 regions. Products were sequenced and analyzed. Results. A specific Javanese variant, with mutations 666A in E7 an d 6826T in L1, was found in 73%of the Indonesian samples, 56%having an additio nal mutation in the E6 open reading frame (ORF; 276G), giving the predicted amin o acid change N58S. This Javanese variant was also found in three Surinamese sam ples, which reflects what could be expected from migration of Javanese people to Surinam. Other non-European variants were identified in Indonesian, Surinamese , and Dutch samples in 14%, 28%, and 19%, respectively. Conclusion. The major ity of the HPV 16-positive cervical cancers in Indonesia are caused by a specif ic intratypic variant that was rarely found before in other countries. 展开更多
关键词 人乳头瘤病毒 e6 e7 L1 变异 荷兰人 基因 变异 特殊型 种特异性
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单基因高血压相关基因变异与子痫前期关联性研究 被引量:1
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作者 马火兰 王欢 +2 位作者 林靓 林晶 陈慧 《创伤与急诊电子杂志》 2021年第2期65-74,共10页
目的探讨单基因高血压相关基因变异与子痫前期(preeclampsia,PE)的相关性。方法收集2016年9月至2018年9月收住福建省立医院妇产科的92例PE患者(PE组)和35例正常妊娠产妇(对照组)的外周血,检测41个单基因高血压相关基因的罕见变异谱;通过... 目的探讨单基因高血压相关基因变异与子痫前期(preeclampsia,PE)的相关性。方法收集2016年9月至2018年9月收住福建省立医院妇产科的92例PE患者(PE组)和35例正常妊娠产妇(对照组)的外周血,检测41个单基因高血压相关基因的罕见变异谱;通过SIFT、PolyPhen、MutationTaster和CADD等多重评分软件评价其致病性。结果在127例入选者中检测出32种基因变异,其中PE组的CACNA1D基因变异频率(9.8%)明显高于千人基因组计划(2.4%)或中国千人高血压项目(2.7%)非妊娠高血压女性(P<0.05),c.920A>G和c.4475G>A为新的变异位点,多重评分软件提示均可能具有致病性,发生CACNA1D变异的9个PE患者均出现不良临床结局。结论CACNA1D变异可能与子痫前期相关。 展开更多
关键词 子痫前期 基因变异 基因高血压 cacna1D外显子变异
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CACNA1E基因突变相关发育性癫痫性脑病 被引量:1
8
作者 苏红婷 吴淼娟 +1 位作者 马洁卉 孙丹 《中华实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期391-393,共3页
发育性癫痫性脑病(DEE)的重要病因之一为离子通道基因变异,其中包括CACNA1E基因突变。CACNA1E相关DEE病例首次报道于2018年,突变类型包含新发错义突变、无义突变及移码突变,但突变位点及类型与表型关系不明确,现对已报道的CACNA1E相关DE... 发育性癫痫性脑病(DEE)的重要病因之一为离子通道基因变异,其中包括CACNA1E基因突变。CACNA1E相关DEE病例首次报道于2018年,突变类型包含新发错义突变、无义突变及移码突变,但突变位点及类型与表型关系不明确,现对已报道的CACNA1E相关DEE病例进行归纳,进一步探索CACNA1E相关DEE临床表型与基因突变位点及突变类型之间的关系,同时回顾CACNA1E相关DEE的可能发病机制及药物干预进展,为DEE的诊断及精准治疗提供帮助。 展开更多
关键词 cacna1e基因 发育性癫痫性脑病 Cav2.3 R型钙通道
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CYP2 E1-1239G>C遗传变异与乳腺癌发病风险相关
9
作者 邵莎莎 王蕊 +4 位作者 林佳 曹蕾 何冰 刘英文 贺宝玲 《中国煤炭工业医学杂志》 2014年第5期765-768,共4页
目的研究细胞色素P450 2E1(CYP2E1)基因-1239G>C变异与乳腺癌发病风险的相关关系。方法采用病例对照研究策略,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,分析309例乳腺癌患者和309例正常对照者的CYP2E1基因-1239G>C位... 目的研究细胞色素P450 2E1(CYP2E1)基因-1239G>C变异与乳腺癌发病风险的相关关系。方法采用病例对照研究策略,以聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,分析309例乳腺癌患者和309例正常对照者的CYP2E1基因-1239G>C位点的基因型。以比值比(OR)及其95%可信区间(95%CI)比较CYP2E1不同基因型与乳腺癌发病风险的相关关系。结果与-1239GG基因型携带者相比,至少携带一个-1239C等位基因的个体发生乳腺癌的风险明显降低(OR=0.22,95%CI=0.11-0.41)。结论 CYP2E1-1239 G>C变异是影响乳腺癌易感性的重要遗传因素。 展开更多
关键词 CYP2e1 基因多态 遗传变异 乳腺癌 易感性
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1b型丙型肝炎病毒基因组不同区域基因变异对干扰素疗效的影响 被引量:2
10
作者 张琳 白菡 +2 位作者 黄芬 赵桂珍 李颖 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期83-84,共2页
本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2/NS1(含HVR1和HVR2)、NSSA区准种异质性进行了检测,对HVR区准种异质性程度与干扰素(IFN)疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区(ISDR)等热点问题进行... 本研究对14例基因型1b型慢性丙型肝炎患者血清HCV基因组中E2/NS1(含HVR1和HVR2)、NSSA区准种异质性进行了检测,对HVR区准种异质性程度与干扰素(IFN)疗效的关系、NS5A2209-2248区是否存在干扰素敏感决定区(ISDR)等热点问题进行了探讨,为1b型慢性丙型肝炎患者应用IFN抗病毒治疗时进行疗效预测提供理论依据。 展开更多
关键词 干扰素敏感决定区 丙型肝炎患者 疗效预测 1b型 病毒基因 基因变异 e2/NS1 HCV基因
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合并感染HIV对1b型HCV E2/NS1包膜区基因影响
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作者 黄璜 李军 张卫东 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期778-780,共3页
目的研究人类免疫缺陷病毒(HIV)感染对1 b型丙型肝炎病毒(HCV)E2/NS1包膜区基因变异的影响,探讨2组间E2/NS1区基因序列同源性差异,为HCV/HIV合并感染者中HCV的治疗提供依据。方法对河南省某有偿献血村进行随访,将得到的所有HCV阳性病例... 目的研究人类免疫缺陷病毒(HIV)感染对1 b型丙型肝炎病毒(HCV)E2/NS1包膜区基因变异的影响,探讨2组间E2/NS1区基因序列同源性差异,为HCV/HIV合并感染者中HCV的治疗提供依据。方法对河南省某有偿献血村进行随访,将得到的所有HCV阳性病例255例根据合并HIV感染的情况分成2组,并对其基因分型,然后进行逆转录(RT)-巢式PCR扩增1 b型HCV E2/NS1包膜区基因,继而进行单链构象多态性分析(SSCP)、纯化后测序。结果 HCV单纯感染组和HIV/HCV合并感染组SSCP平均条带数分别为(3.4±0.55)、(2.6±0.55)条,差异有统计学意义(t=2.32,P=0.049);HCV单纯感染组和HIV/HCV合并感染组HCV E2/NS1包膜区同源性分别为76.7%和87.6%,差异有统计学意义(χ2=20.13,P<0.001);2组第一高变区(HVR-1)同源性分别为59.3%和81.9%,差异有统计学意义(χ2=10.39,P=0.001);2组第3高变区(HVR-3)同源性分别为71.7%和83.9%,差异有统计学意义(χ2=4.60,P=0.03);单纯HCV组中变异性较高的氨基酸位点在HCV/HIV合并感染组中表现出较高的保守性。结论 HIV感染对1b型HCV E2/NS1包膜区基因变异具有抑制作用,且其主要体现在HVR-1和HVR-3区。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 人类免疫缺陷病毒 逆转录聚合酶链反应 e2/NS1包膜区 基因变异
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丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症1例的临床表现与分子诊断 被引量:2
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作者 黄小玲 李思涛 +3 位作者 郝虎 刘汇团 唐玉文 张玉琼 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2019年第8期626-628,共3页
目的分析1例丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症患儿PDHA1基因的变异特点及其相应的临床症状,为临床诊断、遗传咨询和产前诊断提供依据。方法对1例丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症患儿的临床症状、生化检查及治疗效果进行分析;运用高通量测序技术对患儿及... 目的分析1例丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症患儿PDHA1基因的变异特点及其相应的临床症状,为临床诊断、遗传咨询和产前诊断提供依据。方法对1例丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症患儿的临床症状、生化检查及治疗效果进行分析;运用高通量测序技术对患儿及其父母外周血进行基因组DNA检测,运用Sanger测序对患儿姐姐进行阳性位点验证。结果患儿,男,3个月,持续性高乳酸血症,血乳酸9.05~11.04 mmol/L,不会抬头,反应欠灵敏。头颅磁共振成像提示双侧侧脑室略显僵直,胼胝体体部变薄,双侧枕骨发育不对称。3 h脑电图提示睡眠期左侧前中颞区为主尖波、尖慢复合波散发;睡眠期广泛性中-高波幅2.0~3.0 Hz慢波阵发。高通量基因测序结果提示,患儿PDHA1基因c.1243_1257dup15(p.V415-N419dup)半合子变异,结合临床表现确诊为丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症。患儿母亲及姐姐未携带该变异,且排除母亲致病位点嵌合体的可能性。最后患儿因治疗无效于1岁3个月死亡。结论 PDHA1基因c.1243-1257dup15重复变异为新发变异,该变异可导致丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症;丙酮酸脱氢酶E1α缺乏症的确诊需进行分子诊断。 展开更多
关键词 丙酮酸脱氢酶e1α缺乏症 PDHA1基因 新发变异 高乳酸血症
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河南省牛肠道病毒的遗传变异分析 被引量:2
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作者 常晓冉 林倩 +4 位作者 钱明珠 胡俊英 李欣 古丽巴哈尔·图尔荪 王新平 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1982-1987,2000,共7页
为了解河南省不同地区牛肠道病毒(BEV)的遗传变异与病毒株间的分子差异,本研究应用PCR方法从河南省不同地区牛场确定为BEV的阳性样品或病毒分离株中扩增了病毒VP1基因并对其进行了序列测定和分析,结果显示检测出的11株BEV中,8株属于E种... 为了解河南省不同地区牛肠道病毒(BEV)的遗传变异与病毒株间的分子差异,本研究应用PCR方法从河南省不同地区牛场确定为BEV的阳性样品或病毒分离株中扩增了病毒VP1基因并对其进行了序列测定和分析,结果显示检测出的11株BEV中,8株属于E种肠道病毒(EV-E),3株属于F种肠道病毒(EV-F)。VP1基因核苷酸序列的比对分析结果表明,8株不同EV-E毒株间的VP1同源性为70.4%~98.6%,它们与本实验室分离的国内首株EV-E HY12毒株的同源性为69.3%~80.3%;EV-F HeN-A12和HeN-YR91毒株与国内首株EV-F毒株BHM26的同源性为68.6%和70.8%,而与首株山羊EV-F毒株SD-S67的同源性为88.8%和73.7%。进一步分析显示,8株EV-E毒株可以进一步分类为2个基因型EV-E2和EV-E3;而3株EV-F毒株也可进一步分类为2个基因型EV-F1和EV-F4。结果表明,河南省不同地区牛群存在EV-E和EV-F感染和肠道病毒感染的多样性以及病毒株的分子差异,该研究为该病的防控提供流行病学理论依据。 展开更多
关键词 e种肠道病毒 F种肠道病毒 VP1 遗传变异 基因
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广东登革Ⅰ型病毒株变异性的初步研究 被引量:1
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作者 王振果 唐青 赵秀芹 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期160-163,共4页
目的 通过探讨广东部分登革Ⅰ型病毒的变异性 ,初步了解我国毒株的可能来源。方法 对来自广东省不同年代的登革Ⅰ型毒株LD 2 5 (1985年 )、LD 36 (1991年 )和登革Ⅰ型血清 95 142(1995年 ) ,采用RT PCR方法扩增其E/NS1部分基因片段 ... 目的 通过探讨广东部分登革Ⅰ型病毒的变异性 ,初步了解我国毒株的可能来源。方法 对来自广东省不同年代的登革Ⅰ型毒株LD 2 5 (1985年 )、LD 36 (1991年 )和登革Ⅰ型血清 95 142(1995年 ) ,采用RT PCR方法扩增其E/NS1部分基因片段 ,然后克隆测序。将所测序列中的 2 40bp的片段与国际上已知的多个登革Ⅰ型毒株的相应序列进行比较 ,并以 6 %的核苷酸差异 (divergence)作为分亚型的标准。结果 LD 2 5与LD 36、95 142分别属于两个不同的亚型 ,其中LD 2 5与泰国 1980年毒株及中国台湾 1987年、1988年毒株的同源性高达 (97 1~ 98 8) % ,属于一个亚型。LD 36和 95 142则与菲律宾 (1988年 )、澳大利亚 (1981年 )、印度尼西亚 (1978年 )及瑙鲁 (1974年 )等地的毒株同源性高达(97 5~ 10 0 ) % ,同属于另一个亚型。结论 广东登革Ⅰ型病毒可能不仅是从一个地方传入 ,来源比较复杂。 展开更多
关键词 登革病毒 e/NS1基因 核苷酸序列 变异
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