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苏尼特绵羊垂体季节性发情关键miRNA及其靶基因验证
被引量:
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作者
范业锴
狄冉
+4 位作者
刘子嶷
李文韬
张伟峰
储明星
刘玉芳
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2022年第12期109-115,共7页
为研究绵羊季节性发情性状相关分子调控机制,基于实验室前期不同光照下苏尼特绵羊垂体的转录组测序结果分析,筛选出与季节性发情相关的重要候选基因及其调控元件ARHGEF9-Novel_307、CACNB3-Novel_181、PBX1-Novel_387,为了进一步明确这...
为研究绵羊季节性发情性状相关分子调控机制,基于实验室前期不同光照下苏尼特绵羊垂体的转录组测序结果分析,筛选出与季节性发情相关的重要候选基因及其调控元件ARHGEF9-Novel_307、CACNB3-Novel_181、PBX1-Novel_387,为了进一步明确这些候选基因及其元件的功能,本研究通过荧光定量PCR(RT-qPCR)和生物信息学分析探讨其与绵羊季节性发情的关系。以饲养于不同光照羊舍中经双侧卵巢切除+雌二醇皮下注射(OVX+E2)处理的苏尼特绵羊为研究对象,采集垂体、下丘脑、子宫、心、肝、脾、肺和肾等组织进行研究。结果显示,ARHGEF9、CACNB3、PBX1和Novel_307、Novel_181、Novel_387均在垂体中表达。CACNB3、PBX1和Novel_307在短光照处理21 d(SP21)垂体组织中的表达显著高于长光照处理21 d(LP21),ARHGEF9、Novel_181、Novel_387在SP21垂体组织中的表达显著低于LP21,和转录组测序结果趋势相同。ARHGEF9-Novel_307、CACNB3-Novel_181、PBX1-Novel_387之间存在表达负相关性,与miRNA-mRNA整合分析结果一致;蛋白互作网络分析(PPI)表明,ARHGEF9、CACNB3、PBX1蛋白与DIO2、DIO3、TSHB等季节性发情标志蛋白存在关联性。综上所述,ARHGEF9、CACNB3、PBX1可能参与苏尼特羊季节性发情性状的形成,且Novel_307、Novel_181、Novel_387与候选基因之间存在负相关,可能调控候选基因的表达。
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关键词
苏尼特羊
MIRNA
ARHGEF9
cacnb3
PBX1
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职称材料
题名
苏尼特绵羊垂体季节性发情关键miRNA及其靶基因验证
被引量:
3
1
作者
范业锴
狄冉
刘子嶷
李文韬
张伟峰
储明星
刘玉芳
机构
河北工程大学生命科学与食品工程学院
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2022年第12期109-115,共7页
基金
河北省自然科学基金青年项目(C2019402261)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-38)
中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ZDRW202106和ASTIP-IAS13)。
文摘
为研究绵羊季节性发情性状相关分子调控机制,基于实验室前期不同光照下苏尼特绵羊垂体的转录组测序结果分析,筛选出与季节性发情相关的重要候选基因及其调控元件ARHGEF9-Novel_307、CACNB3-Novel_181、PBX1-Novel_387,为了进一步明确这些候选基因及其元件的功能,本研究通过荧光定量PCR(RT-qPCR)和生物信息学分析探讨其与绵羊季节性发情的关系。以饲养于不同光照羊舍中经双侧卵巢切除+雌二醇皮下注射(OVX+E2)处理的苏尼特绵羊为研究对象,采集垂体、下丘脑、子宫、心、肝、脾、肺和肾等组织进行研究。结果显示,ARHGEF9、CACNB3、PBX1和Novel_307、Novel_181、Novel_387均在垂体中表达。CACNB3、PBX1和Novel_307在短光照处理21 d(SP21)垂体组织中的表达显著高于长光照处理21 d(LP21),ARHGEF9、Novel_181、Novel_387在SP21垂体组织中的表达显著低于LP21,和转录组测序结果趋势相同。ARHGEF9-Novel_307、CACNB3-Novel_181、PBX1-Novel_387之间存在表达负相关性,与miRNA-mRNA整合分析结果一致;蛋白互作网络分析(PPI)表明,ARHGEF9、CACNB3、PBX1蛋白与DIO2、DIO3、TSHB等季节性发情标志蛋白存在关联性。综上所述,ARHGEF9、CACNB3、PBX1可能参与苏尼特羊季节性发情性状的形成,且Novel_307、Novel_181、Novel_387与候选基因之间存在负相关,可能调控候选基因的表达。
关键词
苏尼特羊
MIRNA
ARHGEF9
cacnb3
PBX1
分类号
S826.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
苏尼特绵羊垂体季节性发情关键miRNA及其靶基因验证
范业锴
狄冉
刘子嶷
李文韬
张伟峰
储明星
刘玉芳
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2022
3
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职称材料
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引证文献
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