四川白鹅Calm1结构特征及其差异表达的研究

为阐明鹅Calm1基因结构特征及其表达规律。克隆四川白鹅Calm1基因编码区序列并进行生物信息学分析,应用实时荧光定量PCR技术检测鹅不同等级卵泡和不同组织中Calm1基因的相对表达量。鹅Calm1基因编码区序列全长为450 bp,编码149个氨基酸,其氨基酸序列与原鸡相似性为99%。鹅大脑中Calm1表达量显著高于其他组织(P<0.05)。Calm1在不同等级卵泡组织中均有表达,F2级卵泡中Calm1表达量是小白卵泡(Small white follicles,SWF)的1.76倍(P<0.05),且显著高于F5、F4、F3和F1级卵泡(P<0.05);在排卵后卵泡(Postovulatory follicle,POF)组织中,POF1级卵泡组织中Calm1表达量显著高于POF2、POF3和POF4级卵泡(P<0.05);卵巢组织中Calm1的表达量,是小白卵泡的1.75倍(P<0.05)。Calm1是高度保守、广泛表达的蛋白质,Calm1可能通过影响卵泡细胞增殖和类固醇激素合成来参与调控动物繁殖。

广西麻鸡CALM1基因的克隆、序列分析和组织表达谱研究

为分析广西麻鸡CALM1基因的编码区序列及其表达规律,克隆了广西麻鸡CALM1基因编码区序列并进行生物信息学分析,应用实时荧光定量PCR技术检测产蛋期麻鸡在不同组织中CALM1基因的相对表达量。结果表明:广西麻鸡CALM1基因的编码区长度为450 bp,共编码149个氨基酸。与参考序列相比,起始密码子和终止密码子略有差异,不影响表达,另外存在2处错义突变(组氨酸突变为精氨酸,苏氨酸突变成为丙氨酸);物种间的同源性分析显示,广西麻鸡基因与原鸡(Gallus gallus)、普通猪(Susscrofa)、奶牛(Bos taurus)、裸鼹鼠(Heterocephalus glaber)、人类(Homo sapiens)、小鼠(Mus musculus)、黑猩猩(Pan troglodytes)、苏门答腊猩猩(Pongo abelii)、褐家鼠(Rattus norvegicus)的序列同源性分别为98.7%、89.4%、84.3%、89.8%、90.0%、86.7%、89.8%、90.0%、86.7%;进化树分析显示,广西麻鸡与原鸡亲缘关系最近,与奶牛和小鼠的亲缘关系最远。产蛋期CALM1的表达谱显示,CALM1基因在脑、胸肌、脾脏中高表达,在输卵管漏斗部和膨大部、心脏、腿肌、肺、肠中中度表达,而在皮肤、肝脏、卵巢、输卵管的峡部、子宫、肾脏低表达。研究结果为进一步研究鸡CALM1基因调控广西麻鸡繁殖功能奠定理论基础。

三穗鸭蛋壳品质关联基因CALM1突变位点SNPs的鉴定与分析

钙调蛋白(calmodulin,CaM)是钙信号的主要介质,可以调节许多与神经功能相关的过程,能介导Ca2+与细胞功能的外部信号的关键信使。本文以114只三穗鸭DNA为模板,通过PCR直接测序法,分析基因突变对三穗鸭蛋壳品质的影响。结果表明:从三穗鸭CALM1基因6对特异性引物中共发现3个突变SNPs位点,分别位于第2内含子g.21554634A>G、第3内含子g.21554954T>C和第4内含子g.21558072A>T,多态性分析均属于中度多态(0.50>P>0.25),卡方(χ^2)检验结果显示各位点基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡。在关联性分析中3个位点对蛋壳厚度、蛋壳强度和蛋重都达到了一定的影响,对蛋壳强度达到了极显著的影响。因此,可通过筛选3个位点的AA、TT和AA基因型来提高蛋壳的强度,减少在运输过程的损失。