CANT1基因变异导致Desbuquois发育不良Kim变异型临床特征与遗传学分析

目的通过分析1例手部外观无异常的汉族Desbuquois发育不良(DBQD)患儿的临床与遗传学特征,进一步拓展中国人群DBQD的表型和基因变异谱。方法收集DBQD患儿的临床资料,采用全外显子组家系测序(Trio-WES)检测患儿及其父母的基因变异情况,采用生物信息学分析和晶体结构分析评估变异位点的生物危害性,并采用Sanger测序进行验证。通过文献回顾总结DBQD的临床特征和基因变异谱。结果患儿具有特殊容貌(扁平圆脸、眼球突出、鼻梁低平)、发育迟缓、脊柱侧弯和双足疼痛等临床特征,但手部外观无异常。Trio-WES检测结果显示,患儿CANT1基因发生纯合变异c.494T>C(p.Met165Thr),其父母为该变异位点的杂合携带者。SIFT、Polyphen-2和Mutation Taste在线软件预测c.494T>C变异可对蛋白或蛋白产物造成有害影响。Sanger测序证实变异位点存在。晶体结构预测提示c.494T>C(p.Met165Thr)变异可能会导致蛋白局部结构稳定性降低,进而影响蛋白功能。根据患儿手部特征、临床表型和基因检测结果诊断为DBQD-Kim变异型。通过文献回顾分析41例CANT1基因变异导致的DBQD患者的特征,共发现32个CANT1基因变异,其中错义变异15个、移码变异11个、无义变异3个、非编码区变异3个、拷贝数缺失变异1个;在DBQD 1型患者中,CANT1蛋白第300号精氨酸变异(p.Arg300His或p.Arg300Cys)发生频率最高;而Kim变异型患者主要以第156号丝氨酸变异(p.Ser156Phe)和第226号缬氨酸变异(p.Val226Met)为主。结论DBQD-Kim变异型患儿广泛的骨骼异常表现可能是由CANT1基因纯合变异所致。结合临床表型和基因检测结果可明确诊断DBQD,并进行分型。

一例Desbuquois发育不良1型患儿的CANT1基因变异分析

目的对1例临床表现为脊柱侧弯、先天性髋关节脱位、生长发育迟缓的息儿进行高通量测序分析,以明确其遗传学病因.方法抽取患儿及其父母外周血,提取全基因组DNA,应用高通量测序技术进行相关基因变异检测、生物信息学预测分析及Sanger测序验证.结果测序结果显示患儿CANT1基因发生c.494T>C(p.Met165Thr)和c.848A>G(p.His283Arg)复合杂合变异;父亲携带c.494T>C杂合变异,母亲携带c.848A>G变异.c.494T>C变异为HGMD数据库已报道的致病性变异,c.848A>G变异为未报道过的新变异,依据ACMG指南预测为疑似致病性变异.结论CANT1基因c.494T>C和c.848A>G变异可能为患儿的遗传学病因.