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Close Association between 4685 Loci on CAPN1 Gene and Meat Tenderness 被引量:2
1
作者 姜成国 全世元 +4 位作者 曹阳 张国梁 董宝池 金海国 张立春 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2012年第12期2480-2483,共4页
[Objective] The paper was to explore the impact of 4685 loci on CAPN1 gene of Yanbian yellow cattle and red steppe cattle on meat tenderness. [Method] The 4685 loci in 14th intron region of CAPN1 gene of Yanbian yello... [Objective] The paper was to explore the impact of 4685 loci on CAPN1 gene of Yanbian yellow cattle and red steppe cattle on meat tenderness. [Method] The 4685 loci in 14th intron region of CAPN1 gene of Yanbian yellow cattle and red steppe cattle was conducted analysis of gene polymorphism and meat tenderness by PCR-RFLP technology, and the effect of the loci on Jilin local cattle breeds was verified. [Result] The loci had close relationship with related detection indices of meat tenderness (cooking loss, muscle fibre diameter, shear force and drip loss), and the existence of T allele could significantly increase the tenderness level of in- dividuals, but the loci was not associated to pH value. 4685 loci was not associated to carcass traits (carcass weight, net meat weight and carcass yield ratio), which only had certain correlation with eye muscle area. [Conclusion] The 4685 loci on CAPN1 gene of Yanbian yellow cattle and red steppe cattle had close association with meat tenderness. 展开更多
关键词 Yanbian yellow cattle Red steppe cattle capn1 gene TENDERNESS
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藜麦对芦花鸡肉质相关基因表达的影响
2
作者 江小帆 吴涛 +6 位作者 杨发荣 魏玉明 陈国顺 蔡原 焦婷 顾玲荣 赵生国 《中国饲料》 北大核心 2024年第21期19-25,共7页
为研究藜麦籽实对芦花鸡肉品质及肉质相关基因表达水平的影响,试验选用49日龄体重为(1476.21±101.39)g且健康状况良好的雌性芦花鸡120只,将其随机分成4个处理组,每个处理3个重复,每个重复包含10只鸡。对照组(CK组)饲喂藜麦籽实添... 为研究藜麦籽实对芦花鸡肉品质及肉质相关基因表达水平的影响,试验选用49日龄体重为(1476.21±101.39)g且健康状况良好的雌性芦花鸡120只,将其随机分成4个处理组,每个处理3个重复,每个重复包含10只鸡。对照组(CK组)饲喂藜麦籽实添加量为0的基础饲粮,各试验组(Q4、Q8、Q12组)饲喂藜麦籽实添加量为4%、8%、12%的试验饲粮,整个试验期为75 d,包括3 d预试期和72 d正试期。饲喂结束后屠宰并测定肉品质及肉质相关基因的表达量。结果表明:(1)与CK组相比,Q4、Q12组胸肌组织中CAPN1基因mRNA相对表达量显著提高(P <0.05);各试验组CAST基因及Q4组LRP1基因m RNA在胸肌中的相对表达量显著降低(P <0.05)。(2)与CK组相比,Q4、Q8组腿肌组织中CAPN1基因、Q4组CAST基因及Q8、Q12组LRP1基因m RNA的相对表达量显著提高(P <0.05)。(3)在胸肌组织中,LRP1基因表达水平与肌肉剪切力呈显著正相关(P <0.05),CAPN1基因的表达水平与滴水损失呈显著负相关(P <0.05)。(4)在腿肌组织中,LRP1基因的表达水平与蒸煮损失、剪切力呈显著正相关(P <0.05);CAPN1基因表达水平与熟肉率呈显著正相关(P <0.05)。由此可见,饲粮中添加藜麦籽实(原粮)对肌肉组织中CAST、LRP1、CAPN1基因的表达量有一定影响,且LRP1、CAST、CAPN1基因与嫩度相关肉品质指标存在显著相关性。 展开更多
关键词 肉质相关基因 CAST基因 capn1基因 LRP1基因 关联性分析 藜麦
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中国西门塔尔牛CAPN1基因SNPs及其与经济性状关联分析 被引量:12
3
作者 田璐 岳文斌 +4 位作者 李姣 袁峥嵘 高雪 李俊雅 许尚忠 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期785-789,共5页
本研究旨在分析CAPN1基因部分SNPs与中国西门塔尔牛经济性状的关联性。试验选取同龄、同场的135头中国西门塔尔牛为材料,利用PCR-RFLP方法检测CAPN1 316和CAPN1 4751 2个SNPs位点的多态性,并进行方差分析。结果发现,CAPN1 316SNP位点与... 本研究旨在分析CAPN1基因部分SNPs与中国西门塔尔牛经济性状的关联性。试验选取同龄、同场的135头中国西门塔尔牛为材料,利用PCR-RFLP方法检测CAPN1 316和CAPN1 4751 2个SNPs位点的多态性,并进行方差分析。结果发现,CAPN1 316SNP位点与大理石花纹显著相关(P<0.05),杂合子AB基因型个体的大理石纹评分显著高于AA和BB基因型个体(P<0.05);CAPN1 4751位点与大理石花纹和剪切力显著相关(P<0.05),大理石花纹性状中杂合子AB基因型个体评分显著高于AA基因型个体,剪切力性状中BB基因型个体显著高于AA基因型个体。结果表明,CAPN1 316和CAPN1 4751位点适合用于中国西门塔尔牛眼肌、肌肉大理石花纹的分子标记选择。 展开更多
关键词 中国西门塔尔牛 capn1基因 SNPS 经济性状 关联分析
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CAPN1基因遗传变异及其对牛肉质性状的效应分析 被引量:7
4
作者 武秀香 施雪奎 +4 位作者 吴海涛 毛永江 杨章平 李俊雅 高会江 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期1466-1473,共8页
【目的】探索钙蛋白酶1(CAPN1)基因在中国黄牛不同群体中的变异,以及CAPN1基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,寻找与牛肉质性状相关的分子标记。【方法】采用PCR-SSCP技术对雷琼牛、云南高峰牛、BMY牛与中国西门塔尔牛共367个个体... 【目的】探索钙蛋白酶1(CAPN1)基因在中国黄牛不同群体中的变异,以及CAPN1基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,寻找与牛肉质性状相关的分子标记。【方法】采用PCR-SSCP技术对雷琼牛、云南高峰牛、BMY牛与中国西门塔尔牛共367个个体CAPN1基因Exon11-Exon16与Intron21遗传变异检测,运用SPSS17.0软件中的GLM模型分析检测到的遗传变异与中国西门塔尔牛部分肉质性状的关联性。【结果】发现了CAPN1基因DNA序列中的两个突变位点A4558G和C4684T,分别检测到AA/AG/GG和CC/CT/TT 3种基因型。相关分析表明,A4558G位点GG基因型个体剪切力和大理石花纹评分显著低于AG和AA型个体(P<0.05);C4684T位点TT基因型个体剪切力显著低于CT型个体(P<0.05)。组合基因型分析表明,GGTT组合剪切力显著低于CCAA、CTAG和CTAA(P<0.05),大理石花纹评分显著低于其它基因型组合(P<0.05),脂肪颜色评分显著高于AGTT(P<0.05),其余指标间无显著差异(P<0.05)。【结论】初步推测CAPN1基因A4558G和C4684T的位点,可以作为牛肉嫩度和大理石花纹评分的遗传标记。 展开更多
关键词 钙蛋白酶1基因 群体遗传分析 肉质性状 SNP
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鸡肉嫩度候选基因CAPN1多态性的检测研究 被引量:5
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作者 束婧婷 李慧芳 +5 位作者 张莹 陈宽维 苏一军 邝智祥 朱文奇 韩威 《家畜生态学报》 2010年第2期16-20,共5页
建立基于聚合酶链反应-连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶I(CAPN1)基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种-清远麻鸡和快大型隐性白羽鸡中的分布差异。用PCR-LDR方法检测CAPN1 2546、CAPN1 3535和CAPN... 建立基于聚合酶链反应-连接酶检测反应的基因多态性并行检测系统,探讨鸡肉嫩度候选基因钙蛋白酶I(CAPN1)基因的多态性,并分析其在优良地方鸡种-清远麻鸡和快大型隐性白羽鸡中的分布差异。用PCR-LDR方法检测CAPN1 2546、CAPN1 3535和CAPN19950的基因型作单倍型分析,进行各组间基因型分布和等位基因频率x2检验。结果CAPN12546位点未检测到多态,其他两个位点的结果同直接测序分型结果一致,其基因型分布在不同品种中均存在差异,并且在CAPN1 3535位点上达到显著水平,两个位点的单倍型分布在不同品种间也存在较大差异。 展开更多
关键词 连接酶检测反应 capn1基因 基因多态性 肌肉嫩度
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猪CAPN1基因部分外显子及3′UTR区的SNPs检测 被引量:2
6
作者 杨秀芹 刘慧 +3 位作者 郭丽娟 关庆芝 许尧 刘娣 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期741-746,共6页
以野猪、民猪和大白猪为研究对象,根据网上公布的序列设计了7对引物,采用测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP方法对CAPN1基因的部分外显子和3′UTR区进行了单核苷酸多态性检测和基因型分析,探讨CAPN1基因多态性与瘦肉率和嫩度的关系。研究发现11... 以野猪、民猪和大白猪为研究对象,根据网上公布的序列设计了7对引物,采用测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP方法对CAPN1基因的部分外显子和3′UTR区进行了单核苷酸多态性检测和基因型分析,探讨CAPN1基因多态性与瘦肉率和嫩度的关系。研究发现11个SNPs,其中5个位于外显子,4个位于内含子,2个位于3′UTR区,外显子中的突变有一处是错义突变,导致了蛋白质多肽链第260位氨基酸发生了M/V的替代。群体遗传学分析表明,在所检测的各多态位点上,野猪、民猪、大白猪3个品种间不同基因型的分布都存在着极显著的差异(P<0.01),而野猪和民猪之间各基因型的分布差异不显著(P>0.05),民猪和大白猪之间各基因型的分布存在着极显著的差异(P<0.01)。结合品种特性分析表明,P4、P6引物和3′UTR区HinfⅠ位点所检测的不同基因型和瘦肉率具有一定的相关性。 展开更多
关键词 capn1基因 瘦肉率 嫩度 PCR-SSCP PCR-RFLP
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鸡钙蛋白酶I基因(CAPN1)多态性与鸡肉嫩度性状的相关性 被引量:2
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作者 章明 邹剑敏 +3 位作者 束婧婷 张莹 高海军 李慧芳 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2011年第2期337-341,共5页
为了探讨钙蛋白酶I基因(CAPN1)的多态性,并分析其对优良地方鸡种清远麻鸡和国外引进的隐性白羽鸡肌肉剪切力和系水力等性状的遗传效应,采用PCR-SSCP及测序的方法对CAPN1基因的编码区进行单核苷酸多态性(SNPs)扫描,并使用SAS软件进行最... 为了探讨钙蛋白酶I基因(CAPN1)的多态性,并分析其对优良地方鸡种清远麻鸡和国外引进的隐性白羽鸡肌肉剪切力和系水力等性状的遗传效应,采用PCR-SSCP及测序的方法对CAPN1基因的编码区进行单核苷酸多态性(SNPs)扫描,并使用SAS软件进行最小二乘分析。发现了3个SNPs,分别为外显子5中的T2507C突变和C2546T突变,以及外显子6中的G3535A突变。各基因型与嫩度性状的方差分析结果表明:虽然各基因型在不同品种中表现出的效应存在差异,但趋势一致。结合CAPN1基因的生理功能和已有的研究结果来看,可在特定的群体中将其作为影响鸡肉嫩度性状的候选基因。 展开更多
关键词 钙蛋白酶I基因 基因多态性 嫩度性状
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皖东牛CAPN1、CAST基因多态性与肉质性状相关性 被引量:7
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作者 华金玲 郁冯艳 +1 位作者 郭亮 付佳伟 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第8期24-31,共8页
选用135头体重(493±33)kg,年龄相近皖东育肥牛,颈静脉采血,利用DNA直接测序法测定CAPN1、CAST基因多态性;试验结束屠宰试验育肥牛,取肉样分析皖东牛肉质性状,分析肉质性状与基因多态性相关性。结果表明,皖东牛CAPN1基因存在AA型和B... 选用135头体重(493±33)kg,年龄相近皖东育肥牛,颈静脉采血,利用DNA直接测序法测定CAPN1、CAST基因多态性;试验结束屠宰试验育肥牛,取肉样分析皖东牛肉质性状,分析肉质性状与基因多态性相关性。结果表明,皖东牛CAPN1基因存在AA型和BB型2种基因型,4个单核苷酸多态性位点(SNPs),其中内含子8的C429G和G437A位置各1个突变位点,内含子9的C572T位置1个突变位点,外显子9的G458C位置1个突变位点;CAPN1基因中度多态且极显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。皖东牛CAST基因有CT基因型和CC基因型,5个SNPs位点,其中内含子8的A220G、A223G和G239A位置各1个突变位点,外显子9的C369T和G375A位置各1个突变位点;CAST基因中度多态并处于Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。BB基因型皖东牛肌肉剪切力肉质性状显著高于AA基因型(P<0.05),CT基因型皖东牛肌肉剪切力肉质性状显著高于CC基因型(P<0.05),基因型对其他肉质性状影响差异不显著(P>0.05)。CAPN1和CAST基因多态位点与肌肉嫩度密切相关,可作为皖东牛肉质性状提升候选基因。 展开更多
关键词 皖东牛 capn1基因 CAST基因 基因多态性 肉质性状
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鸡CAPN1基因3′-UTR多态性及其与肉质性状的关联分析 被引量:3
9
作者 郭彦 周国利 +1 位作者 吕鑫 吴玉厚 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第12期104-107,共4页
试验利用PCR-SSCP技术对寿光鸡CAPN1基因3′-UTR的多态性进行了检测,并进一步分析了其与肉质性状的相关性。结果显示,在寿光鸡群体中检测到AA、AB 2种基因型,基因型频率分别为0.43、0.57,AB为优势基因型;A、B等位基因频率分别为0.715、0... 试验利用PCR-SSCP技术对寿光鸡CAPN1基因3′-UTR的多态性进行了检测,并进一步分析了其与肉质性状的相关性。结果显示,在寿光鸡群体中检测到AA、AB 2种基因型,基因型频率分别为0.43、0.57,AB为优势基因型;A、B等位基因频率分别为0.715、0.285,A为优势等位基因;群体中未检测到BB基因型个体。经χ2检验,群体处于Hardy-Weinberg非平衡状态(P<0.05)。CAPN1基因3′-UTR的多态性对胸肌pHu、腿肌pHu、肌内脂肪含量和胸肌剪切力有显著性影响(P<0.05);对腿肌剪切力、失水率、胸肌蒸煮损失和腿肌蒸煮损失无显著性影响(P>0.05)。 展开更多
关键词 寿光鸡 capn1基因 PCR-SSCP 肉质性状
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CAPN1基因在寿光鸡群体中的遗传变异分析 被引量:2
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作者 郭彦 周国利 +1 位作者 吕鑫 刘霞 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2011年第1期154-156,共3页
采用PCR-SSCP方法对寿光鸡CAPN1基因进行多态性检测,并分析它们的多态性与部分肉质性状的关系。结果表明,含有CAPN1基因外显子5的引物CE5扩增的座位在群体中检测到3种基因型AA、AB和BB,基因型频率分别为0.266、0.520和0.214;等位基因A和... 采用PCR-SSCP方法对寿光鸡CAPN1基因进行多态性检测,并分析它们的多态性与部分肉质性状的关系。结果表明,含有CAPN1基因外显子5的引物CE5扩增的座位在群体中检测到3种基因型AA、AB和BB,基因型频率分别为0.266、0.520和0.214;等位基因A和B的频率分别为0.524和0.476。CE8引物扩增的座位在群体中也检测到3种基因型AA、AB和BB,基因型频率分别为0.378、0.510和0.112;等位基因A和B的频率分别为0.633和0.367。关联分析结果表明:含有CAPN1基因外显子5的引物CE5座位对肌内脂肪含量和腿肌蒸煮损失存在显著性影响(P<0.05),CE8座位对胸肌蒸煮损失存在显著性影响(P<0.05)。 展开更多
关键词 capn1基因 寿光鸡 肉质性状 遗传变异 多态性
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牛CAPN1基因遗传变异及其对胴体性状的效应分析 被引量:2
11
作者 武秀香 杨章平 +3 位作者 毛永江 施雪奎 黄必志 王安奎 《安徽农业科学》 CAS 2015年第29期54-56,共3页
[目的]探讨钙蛋白酶1(CAPN1)基因在中国黄牛不同群体中的变异以及CAPN1基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,寻找与牛肉质性状相关的分子标记。[方法]采用PCR-SSCP对雷琼牛、云南高峰牛、BMY牛与中国西门塔尔牛共367个个体CAPN1基因... [目的]探讨钙蛋白酶1(CAPN1)基因在中国黄牛不同群体中的变异以及CAPN1基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,寻找与牛肉质性状相关的分子标记。[方法]采用PCR-SSCP对雷琼牛、云南高峰牛、BMY牛与中国西门塔尔牛共367个个体CAPN1基因Exon11-Exon16与Intron21遗传变异检测,运用GLM模型分析检测到的遗传变异与中国西门塔尔牛部分肉质性状的关联性。[结果]发现CAPN1基因DNA序列中的2个突变位点A4558G和C4684T,分别检测到AA/AG/GG和CC/CT/TT 3种基因型,优势基因分别为A和G。效应分析结果表明,A4558G多态对骨重、胴体产肉率及肉骨比性状效应显著(P<0.05),C4684T多态对宰前活重、净肉重、胴体重、头重、骨重、前蹄重、网膜油重及肠系膜油重性状效应显著(P<0.05)。[结论]CAPN1基因可以作为肉牛胴体性状的主效基因或与主效基因相连锁的一个标记。 展开更多
关键词 钙蛋白酶1基因 群体遗传分析 胴体性状 SNP
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鸡CAPN1基因多态性及其与肉质性状的关联分析 被引量:1
12
作者 周国利 郭彦 +1 位作者 方翔 吴玉厚 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第5期207-210,共4页
采用聚合酶链式反应-单链构象多态(PCR-SSCP)方法对147只寿光鸡CAPN1基因第4外显子进行多态性检测,分析其与部分肉质性状的关系。在CAPN1基因第4外显子上共检测到3种基因型AA、AB和BB,它们的基因型频率分别为0.286、0.510和0.204。方差... 采用聚合酶链式反应-单链构象多态(PCR-SSCP)方法对147只寿光鸡CAPN1基因第4外显子进行多态性检测,分析其与部分肉质性状的关系。在CAPN1基因第4外显子上共检测到3种基因型AA、AB和BB,它们的基因型频率分别为0.286、0.510和0.204。方差分析结果表明:在寿光鸡群体中,BB基因型个体的胸肌pHu值显著高于AA基因型个体(P<0.05);AA基因型个体的肌内脂肪含量显著高于BB基因型个体(P<0.05)。 展开更多
关键词 寿光鸡 聚合酶链式反应-单链构象多态(PCR-SSCP) capn1基因 肉质性状
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早胜牛钙蛋白酶Ⅰ基因(CAPN1)多态性分析 被引量:2
13
作者 石福岳 容维中 +4 位作者 高博 徐建峰 王燕燕 董和 张艳丽 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第1期15-19,共5页
试验旨在研究CAPN1基因在早胜牛群体中的遗传变异,为进一步寻找与早胜牛肉质性状相关的分子标记奠定基础。采用DNA混合池测序法对早胜牛320个样本CAPN1基因所有外显子的SNPs位点进行筛选,同时进行序列分析,并利用测序图中SNP位点等位基... 试验旨在研究CAPN1基因在早胜牛群体中的遗传变异,为进一步寻找与早胜牛肉质性状相关的分子标记奠定基础。采用DNA混合池测序法对早胜牛320个样本CAPN1基因所有外显子的SNPs位点进行筛选,同时进行序列分析,并利用测序图中SNP位点等位基因峰高的比值估算各等位基因的频率。结果表明:在早胜牛CAPN1基因外显子区共筛选到7个多态性位点G3717A、A3854G、C5709G、C6004T、G11058A、G15299A和G15682A,其中G3717A和G15299A为同义突变,其余5个SNPs位点为错义突变。该研究结果将为进一步研究早胜牛肉质性状相关候选基因提供理论依据。 展开更多
关键词 早胜牛 钙蛋白酶Ⅰ基因 多态性
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应用nested和touch down PCR技术分离牦牛CAPN1大亚基基因EST 被引量:6
14
作者 蔡欣 吴建平 +3 位作者 徐明旭 张利平 汪虹英 刘雅楠 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2005年第2期14-18,共5页
 钙激活中性蛋白酶1(CAPN1)基因是影响肉嫩度的侯选基因。根据GeneBank中已公布的CAPN1基因cDNA序列设计同源PCR引物,通过RT,nested和touch-downPCR技术从牦牛肌肉组织总RNA中分离目的序列,与pGEM-T-easy载体连接后转化DH5α感受态菌株...  钙激活中性蛋白酶1(CAPN1)基因是影响肉嫩度的侯选基因。根据GeneBank中已公布的CAPN1基因cDNA序列设计同源PCR引物,通过RT,nested和touch-downPCR技术从牦牛肌肉组织总RNA中分离目的序列,与pGEM-T-easy载体连接后转化DH5α感受态菌株,通过PCR扩增、限制性酶切和测序分析鉴定阳性克隆。分离到的基因片段为牦牛CAPN1大亚基的部分编码序列,在GeneBank中的注册号为AY197555,与奶牛、人、食蟹猴、小鼠、绵羊以及大鼠相应序列的同源性分别为98%,89%,89%,83%,96%和81%,在不同物种之间具有较强的保守性。CAPN1基因EST的分离为进一步研究牦牛CAPN1基因奠定了基础。此研究表明,在总RNA质量不理想的情况下,同时采用这2种技术可以较大限度地获取目的序列。 展开更多
关键词 nested和touch-down PCR EST分离 capn1大亚基基因 牦牛
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猪CAPN1基因mRNA表达特性分析 被引量:1
15
作者 杨秀芹 刘娣 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第3期5-6,共2页
为了进一步揭示CAPN1的功能,研究以野猪、大白猪及野家杂交猪为研究对象,利用相对定量RT-PCR方法研究其编码基因的表达特性。结果表明:CAPN1基因在组织中普遍表达,但表达量存在差异,并且野猪和大白猪具有不同的表达模式;在大白猪肌肉组... 为了进一步揭示CAPN1的功能,研究以野猪、大白猪及野家杂交猪为研究对象,利用相对定量RT-PCR方法研究其编码基因的表达特性。结果表明:CAPN1基因在组织中普遍表达,但表达量存在差异,并且野猪和大白猪具有不同的表达模式;在大白猪肌肉组织中表达的发育性变化为波浪型;在360日龄大白猪和野家杂交猪肌肉组织中的表达量存在显著差异。 展开更多
关键词 capn1基因 表达特性
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CAPN1基因的多态性与鸡肉质性状的关系研究
16
作者 周国利 郭彦 +1 位作者 吕鑫 吴玉厚 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2013年第7期121-124,共4页
采用PCR-SSCP方法对寿光鸡CAPN1基因的外显子14、外显子20及其侧翼区序列进行多态性检测,并分析它们的多态性与部分肉质性状的关系。CE14引物扩增的座位在群体发现3个单核苷酸多态性(SNPs)位点:g.13715409 A>G、g.13715387 T>C位... 采用PCR-SSCP方法对寿光鸡CAPN1基因的外显子14、外显子20及其侧翼区序列进行多态性检测,并分析它们的多态性与部分肉质性状的关系。CE14引物扩增的座位在群体发现3个单核苷酸多态性(SNPs)位点:g.13715409 A>G、g.13715387 T>C位于外显子14中,g.13715467C>T位于内含子13中;共检测到AA、AB、AC、BB、BC及CC 6种不同基因型,基因型频率分别为0.238、0.273、0.197、0.095、0.102、0.095,等位基因A、B、C的频率分别为0.473、0.282、0.245。CE20引物扩增的座位在群体发现6个SNPs位点:g.13713224C>A位于外显子20中,g.13713320A>T、g.13713289G>A、g.13713277T>C位于内含子19中,g.13713185T>C、g.13713184G>A位于内含子20中;共检测到AA、AB、AC、BC、AD、BB、CD及DD 8种不同基因型,基因型频率分别为0.122、0.354、0.197、0.143、0.061、0.034、0.048、0.041,等位基因A、B、C、D的频率分别为0.429、0.282、0.194、0.095。最小二乘统计分析结果表明,CE14座位对胸肌pHu、腿肌pHu、肌内脂肪含量、腿肌剪切力及胸肌蒸煮损失存在显著性影响(P<0.05),CE20座位对胸肌pHu及胸肌蒸煮损失存在显著性影响(P<0.05)。 展开更多
关键词 capn1基因 多态性 肉质性状 关联分析
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‘黑羽番鸭’肌肉发育中A-FABP、CAPN1基因的mRNA表达规律
17
作者 王丽华 段修军 +1 位作者 董飚 孙国波 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期1-6,共6页
采用实时荧光定量PCR技术检测了A-FABP 和CAPN 1基因在‘黑羽番鸭’肌肉生长发育过程中 mR-N A表达规律。结果显示:在胸肌中,A-FABP 基因在2周龄时表达最高;在腿肌中,A-FABP 基因在8周龄时表达量最高。在胸肌、腿肌组织中A-FABP 基因m... 采用实时荧光定量PCR技术检测了A-FABP 和CAPN 1基因在‘黑羽番鸭’肌肉生长发育过程中 mR-N A表达规律。结果显示:在胸肌中,A-FABP 基因在2周龄时表达最高;在腿肌中,A-FABP 基因在8周龄时表达量最高。在胸肌、腿肌组织中A-FABP 基因mRNA的表达量大致为2~4周龄下降,4~8周龄上升,8~13周龄再次出现下降,公母鸭的变化趋势一致。在胸肌、腿肌中,CAPN 1基因在2周龄时表达量最高。在胸肌组织中, CAPN1基因mRNA的表达量在2~10周龄之间下降,10~13周龄上升。在腿肌组织中,CAPN1基因 mRNA 的表达量先下降,后上升,最后再次下降。 展开更多
关键词 '黑羽番鸭’ A-FABP基因 capn1基因 MRNA表达 肌肉
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黑羽番鸭CAPN1基因的克隆及生物信息学分析
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作者 李浩 胡志刚 +2 位作者 陈强 张慧林 刘小林 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2020年第8期177-183,共7页
本实验旨在对黑羽番鸭CAPN1基因进行克隆和生物信息学分析,以期为改善番鸭肌肉嫩度提供参考。选取黑羽番鸭为研究对象,采集腿肌组织,提取RNA,反转录为cDNA,通过同源重组方法克隆CAPN1基因的编码区序列并进行生物信息学分析。结果显示:... 本实验旨在对黑羽番鸭CAPN1基因进行克隆和生物信息学分析,以期为改善番鸭肌肉嫩度提供参考。选取黑羽番鸭为研究对象,采集腿肌组织,提取RNA,反转录为cDNA,通过同源重组方法克隆CAPN1基因的编码区序列并进行生物信息学分析。结果显示:黑羽番鸭CAPN1基因编码区序列长度为2 148 bp,编码715个氨基酸;与鸭、鸡、雉鸡、人、猪、牛、绵羊、马的序列进行同源性比较,显示核苷酸序列的同源性分别为98.70%、87.29%、86.11%、81.89%、81.62%、81.18%、81.04%、81.27%,氨基酸序列的同源性分别为99.30%、91.47%、90.63%、83.22%、83.64%、83.10%、82.96%、83.36%。系统进化分析结果与传统分类学结果一致。理化性质分析表明CAPN1蛋白相对分子质量为81 368.72 ku,理论等电点为5.82,亮氨酸使用频率最高,组氨酸使用频率最低,属于稳定性、亲水性蛋白;存在2个跨膜螺旋区,无信号肽剪切位点,主要分布于细胞质中。修饰结构分析表明,该蛋白存在59个潜在的磷酸化位点,9个O-糖基化位点和3个N-糖基化位点;二级结构中α-螺旋占比最高,β-转角占比最低;包含3个结构域;最后对CAPN1蛋白的三级结构进行了建模,模型可信度较高。 展开更多
关键词 黑羽番鸭 capn1基因 克隆 生物信息学分析
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饲喂生物发酵饲料对延边黄牛背最长肌FABP4、CAPN1基因表达的影响
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作者 冯健 李英花 +1 位作者 耿春银 严昌国 《饲料工业》 北大核心 2017年第8期45-50,共6页
试验旨在研究育肥后期饲粮中添加生物发酵饲料对延边黄牛背最长肌组织中FABP4、CAPN1基因表达量的影响。选择12头平均体重(545.55±27.00)kg的体健无病延边黄牛阉牛,随机分成试验组和对照组,每组6头。试验组每头牛饲喂生物发酵饲料2... 试验旨在研究育肥后期饲粮中添加生物发酵饲料对延边黄牛背最长肌组织中FABP4、CAPN1基因表达量的影响。选择12头平均体重(545.55±27.00)kg的体健无病延边黄牛阉牛,随机分成试验组和对照组,每组6头。试验组每头牛饲喂生物发酵饲料2 kg/d,对照组不饲喂生物发酵饲料,试验组和对照组的基础日粮营养水平基本相同。预饲期10 d,正式期90 d。试验结束后,分别从试验组与对照组各随机选取3头牛,在第14肋骨处采取背最长肌一小块,采用荧光定量聚合酶链式反应(RT-PCR)技术检测样品中FABP4、CAPN1基因表达量。结果表明:试验组中FABP4 mRNA的表达量是对照组的2.27倍,FABP4基因mRNA的表达量极显著高于对照组(P<0.01)。CAPN1 mRNA的表达量试验组高于对照组,差异显著(P<0.05)。综上所述,在育肥后期饲粮中添加生物发酵饲料可显著提高FABP4、CAPN1基因在延边黄牛背最长肌中的表达量。 展开更多
关键词 生物发酵饲料 延边黄牛 FABP4基因 capn1基因
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部分肉牛类群CAPN1基因第9外显子多态性及其与肉质性状的相关性 被引量:4
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作者 张彩霞 吴建平 +4 位作者 赵生国 蔡原 李天科 张娟 雷赵民 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期14-19,共6页
通过研究部分肉牛类群CAPN1基因第9外显子多态性及其与肉质性状的相关性,发现与肉牛生产性状相关的分子标记,为加快肉牛选育进程,提高肉牛生产性能提供参考。采用PCR-SSCP技术对早胜牛(庆阳类群、平凉类群)、南杂牛(南德温牛×早胜... 通过研究部分肉牛类群CAPN1基因第9外显子多态性及其与肉质性状的相关性,发现与肉牛生产性状相关的分子标记,为加快肉牛选育进程,提高肉牛生产性能提供参考。采用PCR-SSCP技术对早胜牛(庆阳类群、平凉类群)、南杂牛(南德温牛×早胜牛庆阳类群)、秦杂牛(秦川牛×早胜牛平凉类群)、西杂牛(西门塔尔牛×早胜牛平凉类群)、荷斯坦奶公牛和澳洲黑牛共391头个体的CAPN1基因外显子9进行遗传变异检测,运用SPSS17.0软件分析早胜牛平凉类群遗传变异与肉质性状的关联性。结果表明,CAPN1基因第9外显子存在突变位点G458C,并检测到GG、GC和CC 3种基因型。相关性分析表明,CAPN1的G458C位点与pH、剪切力和滴水损失差异显著相关(P<0.05),CC基因型剪切力和滴水损失显著低于GG和GC型(P<0.05),其他性状在各基因型间差异不显著。因此,推测CAPN1基因的突变位点G458C可以作为牛肉嫩度的遗传标记。 展开更多
关键词 肉牛 capn1基因 SNP 群体遗传分析 肉质性状
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