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希尔斯山羊草1S^(s)S和3S^(s)S染色体特异dCAPS标记的建立
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作者 倪佳俊 韩冉 +8 位作者 徐文竞 王开 祁广 曾小雪 訾妍 李豪圣 刘建军 汪晓璐 刘成 《山东农业科学》 北大核心 2023年第5期15-21,共7页
希尔斯山羊草是小麦的近缘种,具有抗病、抗逆、抗虫等优异性状,是小麦遗传改良的珍贵基因源。当前,我们创制了一批小麦-希尔斯山羊草杂交种质。然而,由于缺乏分子标记,上述种质无法被有效筛选和鉴定。为了建立希尔斯山羊草染色体特异分... 希尔斯山羊草是小麦的近缘种,具有抗病、抗逆、抗虫等优异性状,是小麦遗传改良的珍贵基因源。当前,我们创制了一批小麦-希尔斯山羊草杂交种质。然而,由于缺乏分子标记,上述种质无法被有效筛选和鉴定。为了建立希尔斯山羊草染色体特异分子标记,本研究通过对希尔斯山羊草基因组重测序,发掘希尔斯山羊草和小麦间单核苷酸多态性(SNP),选择150个多态性位点开发dCAPS标记,结果发现,相比中国春等小麦对照,利用引物AESD23和AESD105经PCR和酶切电泳后分别能在希尔斯山羊草中获得长度不同的多态性条带。利用一套中国春-希尔斯山羊草二体附加系和端体附加系对这些多态性条带进行定位,结果发现,AESD23能在中国春-希尔斯山羊草1S^(s)二体附加系和1S^(s)S端体附加系中扩增出长度为1800 bp的多态性条带,而AESD105能在中国春-希尔斯山羊草3S^(s)二体附加系和3S^(s)S端体附加系中扩增出长度为200 bp和300 bp的多态性条带。对小麦-希尔斯山羊草杂交种质检测发现,AESD23和AESD105均能对小麦-希尔斯山羊草杂交种质进行有效筛选和鉴定。因此,上述3个多态性片段可以作为dCAPS标记用于检测含希尔斯山羊草1S^(s)S或3S^(s)S染色质的材料,为检测和追踪小麦背景中希尔斯山羊草染色质提供了新的检测手段。 展开更多
关键词 小麦 希尔斯山羊草 基因组重测序 SNP分析 dcaps标记
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dCAPS markers developed for nitrate transporter genes TaNRT2L12s associating with 1000-grain weight in wheat 被引量:2
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作者 HUANG Jun-fang LI Long +4 位作者 MAO Xin-guo WANG Jing-yi LIU Hui-min LI Chao-nan JING Rui-lian 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2020年第6期1543-1553,共11页
Nitrate transporters(NRTs)are regulators of nitrate assimilation and transport.The genome sequences of TaNRT2L12-A,-B and-D were cloned from wheat(Triticum aestivum L.),and polymorphisms were analyzed by sequencing.Ta... Nitrate transporters(NRTs)are regulators of nitrate assimilation and transport.The genome sequences of TaNRT2L12-A,-B and-D were cloned from wheat(Triticum aestivum L.),and polymorphisms were analyzed by sequencing.TaNRT2L12-D in a germplasm population was highly conserved.However,38 single nucleotide polymorphisms(SNPs)in TaNRT2L12-A coding region and 11 SNPs in TaNRT2L12-B coding region were detected.Two derived cleaved amplified polymorphic sequences(dCAPS)markers A-CSNP1 and A-CSNP2 were developed for TaNRT2L12-A based on SNP-351 and SNP-729,and three haplotypes were identified in the germplasm population.B-CSNP1 and B-CSNP2 were developed for TaNRT2L12-B based on SNP-237 and SNP-1227,and three haplotypes were detected in the germplasm population.Association analyses between the markers and agronomic traits in 30 environments and phenotypic comparisons revealed that A-CSNP2-A is a superior allele of shorter plant height(PH),length of penultimate internode(LPI)and peduncle length(PL),B-CSNP2-G is a superior allele of higher grain number per spike(GNS).Hap-6B-1 containing both superior alleles B-CSNP1-C and B-CSNP2-A is a superior haplotype of 1 OOO-grain weight(TGW).Expression analysis showed that TaNRT2L12-B is mainly expressed in the root base and regulated by nitrate.Therefore,TaNRT2L12 may be involved in nitrate transport and signaling to regulate TGW in wheat.The superior alleles and dCAPS markers of TaNRT2L12-A/B are beneficial to genetic improvement and germplasm enhancement with molecular markers-assisted selection. 展开更多
关键词 TRITICUM AESTIVUM L. TaNRT2L12 association analysis single NUCLEOTIDE POLYMORPHISM dcaps marker haplotypes
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小麦中基于转录组测序SNP的dCAPS标记的高通量开发及验证 被引量:5
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作者 李磊 贡豪 +1 位作者 顾世梁 李韬 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2018年第4期86-90,共5页
结合六倍体小麦品系P7001与P216杂交F5代群体中1对相对性状池的二代转录组测序的单核苷酸多态性(SNP)分析结果,应用最近开发的CAPS/dCAPS Designer工具进行批量的CAPS/dCAPS(衍生/限制性内切酶多态性)标记开发,最终筛选20个CAPS/dCAPS... 结合六倍体小麦品系P7001与P216杂交F5代群体中1对相对性状池的二代转录组测序的单核苷酸多态性(SNP)分析结果,应用最近开发的CAPS/dCAPS Designer工具进行批量的CAPS/dCAPS(衍生/限制性内切酶多态性)标记开发,最终筛选20个CAPS/dCAPS标记进行亲本间的多态性验证。结果表明,将二代转录组测序的SNP分析结果和高通量的CAPS/dCAPS标记设计软件相结合能高效地进行多态性分子标记的开发。 展开更多
关键词 小麦 单核苷酸多态性 caps/dcaps标记 高通量开发
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茶树春梢萌发早晚关联基因CsAL1的CAPS分子标记开发
4
作者 黄梦迪 陈兰 +5 位作者 苏芹 胡锦瑜 刘桂芝 谭月萍 刘硕谦 田娜 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期207-218,共12页
茶树(Camelliasinensis)作为一种叶用型经济植物,春梢萌发时间是关系茶叶经济价值的重要生物学性状。因此,选育茶树早生品种,对提升茶叶品质和经济效益具有重要的现实意义。以铁观音为参考基因组,通过全基因组关联分析,筛选到一个与茶... 茶树(Camelliasinensis)作为一种叶用型经济植物,春梢萌发时间是关系茶叶经济价值的重要生物学性状。因此,选育茶树早生品种,对提升茶叶品质和经济效益具有重要的现实意义。以铁观音为参考基因组,通过全基因组关联分析,筛选到一个与茶树春梢萌发早晚高度相关的基因CsAL1(Auxilin-like 1,TGY040711)。运用SNP calling获得CsAL1各样本的SNPs,将SNPs与其春梢萌发表型进行关联分析,获得与早生性状显著相关的SNP位点。分析各SNPs的酶切位点,选择合适位点开发茶树早生性状相关CAPS分子标记。利用标记对12份茶树材料基因组DNA进行PCR扩增和酶切检测,随后在72份茶树材料中进一步验证,以期借助CAPS分子标记技术为探究CsAL1中单碱基位点突变与茶树早生性状的联系提供参考,为茶树早生品种的选育提供理论支撑。 展开更多
关键词 茶树 SNP caps分子标记 早生 分子标记育种
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大豆胞囊线虫主效抗病基因Rhg4(GmSHMT)的CAPS/dCAPS标记开发和利用 被引量:10
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作者 史学晖 李英慧 +3 位作者 于佰双 郭勇 王家军 邱丽娟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期1463-1471,共9页
大豆胞囊线虫(soybean cyst nematode,SCN)严重危害世界大豆生产,Rhg4(resistance to Heterodera glycines 4)是控制大豆SCN抗性的2个主效位点之一。本研究针对Rhg4(Gm SHMT)上的2个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP... 大豆胞囊线虫(soybean cyst nematode,SCN)严重危害世界大豆生产,Rhg4(resistance to Heterodera glycines 4)是控制大豆SCN抗性的2个主效位点之一。本研究针对Rhg4(Gm SHMT)上的2个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点开发了快速、经济、简便易行的CAPS(Rhg4-389)和d CAPS标记(Rhg4-1165),并用开发的2个标记鉴定了以大豆胞囊线虫应用核心种质为主的193份代表性抗感种质。结果表明,Rhg4-389和Rhg4-1165位点间存在显著连锁不平衡(P=0.0001,r2=0.87),可形成4种单倍型。Rhg4-389-G/Rhg4-1165-T和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-A为优势单倍型,稀有单倍型Rhg4-389-G/Rhg4-1165-A和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-T是在中国抗源中新发现的单倍型。结合193份种质对SCN 3号小种抗性鉴定分析发现,Rhg4-389-G和Rhg4-1165-T主要存在于抗病种质,它们形成的单倍型对抗病种质鉴定效率可达94.1%。本研究开发了可用于辅助大豆SCN抗性鉴定且方便育种家利用的CAPS/d CAPS标记,且用其摸清了应用核心种质等重要抗源在Rhg4位点的"本底",为育种家有效利用这些优异抗源提供了重要信息。 展开更多
关键词 大豆胞囊线虫 Rhg4 caps/dcaps标记 单倍型 分子标记辅助选择 Rhg4
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番茄粉红色果实相关基因的dCAPS和InDel标记开发与应用 被引量:9
6
作者 董淑芳 王孝宣 +3 位作者 高建昌 国艳梅 黄泽军 杜永臣 《中国蔬菜》 北大核心 2016年第1期24-29,共6页
采用SuperBSA方法分别构建100份粉红色番茄材料和100份红色番茄材料的DNA混合池,对测序结果的SNP位点进行分析。结果表明:在1号染色体上的127个SNP位点中,有6个与番茄果实颜色高度相关,其中1个位点与粉红色果实高度相关。利用该SNP位点... 采用SuperBSA方法分别构建100份粉红色番茄材料和100份红色番茄材料的DNA混合池,对测序结果的SNP位点进行分析。结果表明:在1号染色体上的127个SNP位点中,有6个与番茄果实颜色高度相关,其中1个位点与粉红色果实高度相关。利用该SNP位点开发了1个共显性d CAPS标记,在红色、粉红色和杂合F_13种基因型之间的多态性较好。同时,利用番茄重测序数据分析番茄起源时发现,在粉红色番茄中SIMYB12基因的上游存在1个603bp的缺失,利用该缺失突变位点开发了1个共显性In Del标记,在红色、粉红色和杂合F_13种基因型之间也表现出较好的多态性。利用新开发的2个标记对F_2群体进行遗传分析,鉴定结果与田间表型观察结果符合度均达到95%以上,表明这2个标记可以用于番茄苗期分子标记辅助选择。 展开更多
关键词 番茄 粉红色果实 dcaps INDEL 分子标记
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桃花型性状dCAPs标记的开发与应用
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作者 高帆 冯贝贝 +6 位作者 宋聪豪 连晓东 郑先波 张海朋 王小贝 谭彬 冯建灿 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2022年第5期770-778,815,共10页
【目的】为准确、快速地鉴别桃铃型花和蔷薇型花,开发与桃花型性状相关的dCAPs标记。【方法】根据花型性状基因定位结果,其关联度最高的SNP位点位于PpB3-1基因启动子区域,基于SNP位点开发含有内切酶SalI-HF的dCAPs标记,在1个桃杂交群体... 【目的】为准确、快速地鉴别桃铃型花和蔷薇型花,开发与桃花型性状相关的dCAPs标记。【方法】根据花型性状基因定位结果,其关联度最高的SNP位点位于PpB3-1基因启动子区域,基于SNP位点开发含有内切酶SalI-HF的dCAPs标记,在1个桃杂交群体(73个杂种单株)和1个桃自然群体(102份种质资源)中扩增,用SalI-HF限制性内切酶对特异扩增片段进行酶切,用聚丙烯酰胺凝胶电泳的方式对酶切产物进行检测分析。【结果】铃型花DNA扩增出来的条带可以被酶切,产生两种类型特异片段:308和282 bp两条特异片段(杂合显性,A/C)和282 bp一条特异片段(纯合显性,C/C);蔷薇型花DNA扩增出来的条带不能被酶切,产生一条308 bp特异片段(纯合隐性,A/A)。该标记在桃杂交群体和自然群体中的检测符合率均为100%。【结论】桃花型性状的dCAPs标记B3-1可用于桃花型性状分子标记辅助选择育种。 展开更多
关键词 花型 dcaps标记
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结球甘蓝无蜡粉亮叶性状dCAPS标记引物优化
8
作者 王超 付天姿 +1 位作者 张晓烜 李秀乐 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期33-39,共7页
研究以野生型结球甘蓝98-1030和无蜡粉亮叶突变型98-1030作为父母本材料,杂交得到F_(1)代,将父母本作全基因组测序,根据所得区间内非同义SNP位点,共设计20对dCAPS引物,命名为DC01~DC20,利用亲本及F1代筛选引物。PCR扩增结果表明,有10对d... 研究以野生型结球甘蓝98-1030和无蜡粉亮叶突变型98-1030作为父母本材料,杂交得到F_(1)代,将父母本作全基因组测序,根据所得区间内非同义SNP位点,共设计20对dCAPS引物,命名为DC01~DC20,利用亲本及F1代筛选引物。PCR扩增结果表明,有10对dCAPS引物扩增出条带,限制性内切酶鉴定表明,其中有8对引物PCR产物可酶切产生特异性片段。 展开更多
关键词 结球甘蓝 dcaps分子标记 SNP 引物
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Green Rice Leafhopper Resistance Gene Transferring Through Backcrossing and CAPS Marker Assisted Selection 被引量:1
9
作者 WANGChun-ming HideshiYasui +2 位作者 AtsushiYoshimura SUChang-chao ZHAIH 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2003年第1期8-12,共5页
Grh2, a green rice leafhopper resistant gene from an indica cultivar DV85, was located on chromosome 11, and two RFLP markers C189 and G1465 were found to be linked to this gene. In order to transfer Grh2 into Taichun... Grh2, a green rice leafhopper resistant gene from an indica cultivar DV85, was located on chromosome 11, and two RFLP markers C189 and G1465 were found to be linked to this gene. In order to transfer Grh2 into Taichung65, a japonica cultivar with elite characters, backcross method with Taichung65 as the recurrent parent was used and the two RFLP markers were converted into CAPS markers for marker assisted selection (MAS). In the BC6F3 population, both phenotypic evaluation and MAS were conducted to screen the resistant plants with Taichung65 background. The linkage distance between CAPS markers and Grh2 was calculated and the efficiency of MAS was analyzed. 展开更多
关键词 Oryza sativa Nephotettix virescens Uhler Insect resistance caps marker assisted selection
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Introgression of High Yield Genes from Lycopersicon hirsutum acc.LA1777 Using CAPS Marker
10
作者 LI Hong WANG Xiao-xuan +5 位作者 SONG Ming GAO Jian-chang GUO Yan-mei ZHU De-wei DAI Shan-shu DU Yong-chen 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2007年第5期552-558,共7页
The idea behind this study is to show that using high yield genes from a wild tomato can enrich tomato breeding resources and accelerate tomato breeding programs. In this study, the near-isogenic line TA1229 containin... The idea behind this study is to show that using high yield genes from a wild tomato can enrich tomato breeding resources and accelerate tomato breeding programs. In this study, the near-isogenic line TA1229 containing a 24-cM introgression at the bottom of chromosome 1 from Lycopersicon acc. LA1777, affects several higher yield traits. The TA1229×9706 BC1 population was analyzed by marker-assisted selection and the traits of the population were evaluated. Twenty-three recombinant individuals that carried a shorter segment than TA1229 were obtained. Among them, 16 lines with the chromosome 1 recombinant segment can increase tomato yield and a QTL affecting yield was found between TG53 and TG158. Sixteen recombinant lines are useful to improve the tomato variety. 展开更多
关键词 caps QTL marker-assisted selection high yield TOMATO
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Mapping of putative sucking inhibitory gene to whitebacked planthopper by linkage analysis with CAPS markers
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作者 K Sogawa H Fujimoto 《Chinese Rice Research Newsletter》 2002年第3期4-4,共1页
Resistance to whitebacked planthopper(WBPH)in Chinese japonica riceChunjiang 06(CJ-06)was mediated by sucking inhibitory and ovicidal mecha-nism.The ovicidal reponse was a common self-defense mechanism againstWBPH in ... Resistance to whitebacked planthopper(WBPH)in Chinese japonica riceChunjiang 06(CJ-06)was mediated by sucking inhibitory and ovicidal mecha-nism.The ovicidal reponse was a common self-defense mechanism againstWBPH in japonica.The ovicidal gene and its chromosomal position had alreadybeen identified.The sucking inhibitory nature of CJ-06 caused a definenon-preference behavior of WBPH in fields.A single dominant gene governed 展开更多
关键词 Mapping of putative sucking inhibitory gene to whitebacked planthopper by linkage analysis with caps markers GENE
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水稻叶蝉抗性基因回交转育和CAPS标记辅助选择 被引量:19
12
作者 王春明 安井秀 +3 位作者 吉村醇 苏昌潮 翟虎渠 万建民 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期237-241,共5页
以综合性状好但对黑尾叶蝉 (NephotettixcincticepsUhler)敏感的品种台中 6 5作为轮回亲本 ,与抗性品种DV85连续回交 ,得到回交高代BC6F2 群体 ,进行抗叶蝉性状的回交转育。将抗黑尾叶蝉基因Grh2两侧的RFLP标记C189和G14 6 5成功地转换... 以综合性状好但对黑尾叶蝉 (NephotettixcincticepsUhler)敏感的品种台中 6 5作为轮回亲本 ,与抗性品种DV85连续回交 ,得到回交高代BC6F2 群体 ,进行抗叶蝉性状的回交转育。将抗黑尾叶蝉基因Grh2两侧的RFLP标记C189和G14 6 5成功地转换为在亲本间具有多态的CAPS标记。在进行表型选择的同时 ,利用CAPS标记对BC6F2 进行了标记辅助选择 ,分析了CAPS标记与Grh2间的遗传距离和标记辅助选择的效果。所选出的个体具有台中 6 5的遗传背景且携带纯合Grh2基因 ,可作为聚合抗叶蝉基因培育新品种的重要中间材料。 展开更多
关键词 水稻 黑尾叶蝉 抗虫性 caps 标记辅助选择 抗性基因 回交 转育
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利用CAPS标记推测花生品种(系)FAD2位点基因型的研究 被引量:8
13
作者 陈静 白鑫 +3 位作者 胡晓辉 苗华荣 崔凤高 禹山林 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期28-32,共5页
以5个高油酸含量花生品种(系)和2个普通油酸含量花生品种为试材,利用CAPS标记对这些品种(系)的FAD2位点基因型进行分析。结果表明:5个高油酸含量花生品种(系)的油酸含量均在80%以上,普通油酸含量品种花育22号和花育28号油酸含量分别为51... 以5个高油酸含量花生品种(系)和2个普通油酸含量花生品种为试材,利用CAPS标记对这些品种(系)的FAD2位点基因型进行分析。结果表明:5个高油酸含量花生品种(系)的油酸含量均在80%以上,普通油酸含量品种花育22号和花育28号油酸含量分别为51.62%和41.38%。基于CAPS标记在7个品种(系)中的扩增产物及酶切带型分析推测,AhFAD2A位点花育28号为野生型,其他6个品种(系)符合448 G>A突变类型;AhFAD2B位点花育28号和花育22号为野生型,开农H03-3、花育32号、P76和F18符合441-442insA突变类型,而06B16在该位点不符合441-442insA突变类型。 展开更多
关键词 花生 高油酸 caps标记
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基于基因重测序信息的大豆基因靶向CAPS标记开发 被引量:7
14
作者 束永俊 李勇 +3 位作者 柏锡 才华 纪巍 朱延明 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期2015-2021,共7页
为了开发大豆基因靶向的功能分子标记,本研究采用生物信息学方法分析了大豆基因重测序数据,筛选出酶切位点突变的SNP位点,设计PCR引物163对,选用东北地区主栽品种绥农14的DNA为模板进行PCR扩增,其中139对引物获得大小为400~1200bp的特... 为了开发大豆基因靶向的功能分子标记,本研究采用生物信息学方法分析了大豆基因重测序数据,筛选出酶切位点突变的SNP位点,设计PCR引物163对,选用东北地区主栽品种绥农14的DNA为模板进行PCR扩增,其中139对引物获得大小为400~1200bp的特异片段。以大豆绥农14、合丰25、Acher、Evans、Peking、PI209332、固新野生大豆、科丰1号和南农1138-2的DNA为模板,采用筛选的139对引物进行PCR扩增,对扩增产物进行酶切分析,发现73对引物的PCR产物具有酶切多态性,开发出CAPS标记73个。通过功能注释分析发现,这73个CAPS标记靶向的基因主要参与细胞内亚细胞定位过程、蛋白质的结合与催化以及代谢过程等,与大豆重要农艺性状的形成相关,可以用于大豆品种的鉴定和分子系统进化的研究。 展开更多
关键词 大豆 重测序数据 单核苷酸多态性 酶切扩增多态性序列 基因靶向功能标记
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番茄叶霉病高抗基因Cf-9的CAPS标记创建 被引量:4
15
作者 陈丽静 李天来 +4 位作者 李君明 宋燕 王玉昆 王孝宣 徐合金 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期21-24,共4页
根据番茄叶霉病高抗基因Cf-9的基因序列设计3对特异扩增引物,以近等基因系和本组的多重PCR检测材料为试材,扩增Cf-9基因1~2867 bp之间的单拷贝片段,3对引物分别扩增出560 bp,1 000 bp,1 080 bp的特异片段.分别用限制性内切酶TaqⅠ,Hind... 根据番茄叶霉病高抗基因Cf-9的基因序列设计3对特异扩增引物,以近等基因系和本组的多重PCR检测材料为试材,扩增Cf-9基因1~2867 bp之间的单拷贝片段,3对引物分别扩增出560 bp,1 000 bp,1 080 bp的特异片段.分别用限制性内切酶TaqⅠ,Hind Ⅲ,HinfⅠ,EcorⅠ酶切,限制性内切酶TaqⅠ酶切特异引物SCAR1扩增的560特异片段具有酶切多态性,抗病品种酶切出450 bp,330 bp,290 bp的特异片段,感病品种酶切出450 bp,290 bp的特异片段.初步建成番茄叶霉病高抗基因Cf-9的CAPS标记,经近等基因系及其杂交种检验,结果稳定可靠,可用于番茄Cf-9抗病基因辅助选育. 展开更多
关键词 番茄 叶霉病 Cf-9基因 caps标记
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粗穗披碱草1H^tS染色体的蛋白质二硫键异构酶基因CAPS标记 被引量:4
16
作者 宫文萍 刘成 +2 位作者 李光蓉 周建平 杨足君 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期409-415,共7页
中国春-粗穗披碱草罗伯逊1Ht S.1BL易位系高抗小麦条锈病、叶锈病和白粉病。为了获得抗病小片段易位系,用中国春ph1b基因缺失突变体对1Ht S.1BL进行了诱导,获得了大量诱导后代。本研究用位于小麦1DS染色体的87个EST-STS标记对中国春、... 中国春-粗穗披碱草罗伯逊1Ht S.1BL易位系高抗小麦条锈病、叶锈病和白粉病。为了获得抗病小片段易位系,用中国春ph1b基因缺失突变体对1Ht S.1BL进行了诱导,获得了大量诱导后代。本研究用位于小麦1DS染色体的87个EST-STS标记对中国春、粗穗披碱草和1Ht S.1BL易位系进行分析,未发现多态性标记。对其中扩增较好的引物BE444859的PCR产物进行随机克隆测序,获得了14个序列,与已发表的小麦蛋白质二硫键异构酶基因序列具有97%以上的同源性,14个序列均包含3个外显子和2个内含子。限制性酶切位点分析表明,仅2个序列含有HaeIII酶切位点。验证实验结果表明,BE444859/HaeIII组合可以在供试材料中获得多态性。进而用BE444859/HaeIII对一套中国春-粗穗披碱草附加系和151株诱导后代材料进行分析,结果显示,特异多态性条带仅出现在含1Ht S的材料中;68株后代材料均可扩增出多态性带。因此,BE444859/HaeIII可以作为粗穗披碱草蛋白质二硫键异构酶基因CAPS标记,用于检测小麦背景中的1Ht S染色体。本研究揭示当杂交亲本间无直接PCR多态性而又需要建立标记时,发展CAPS标记是行之有效的方法。 展开更多
关键词 粗穗披碱草 分子标记 蛋白质二硫键异构酶基因
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稻瘟病抗性基因Pi25特异性CAPS标记的开发与验证(英文) 被引量:30
17
作者 王惠梅 陈洁 +3 位作者 施勇烽 潘刚 沈海超 吴建利 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期1960-1968,共9页
为在水稻育种中快速与高效利用稻瘟病抗性基因Pi25,本文利用该基因不同等位基因编码区序列差异开发了4套CAPS标记(CAP1/HincII、CAP3/BglII、CAP3/NdeI和CAP3/Hpy99I),并利用169份稻种资源、98个重组自交系(RIL)以及217个水稻转基因后代... 为在水稻育种中快速与高效利用稻瘟病抗性基因Pi25,本文利用该基因不同等位基因编码区序列差异开发了4套CAPS标记(CAP1/HincII、CAP3/BglII、CAP3/NdeI和CAP3/Hpy99I),并利用169份稻种资源、98个重组自交系(RIL)以及217个水稻转基因后代,对4套标记的准确性和选择效果进行了验证。结果表明,4套标记均能准确地检测Pi25/pi25座位。其中,标记CAP1/HincII和CAP3/Hpy99I特异性识别并酶切显性等位基因,而标记CAP3/BglII和CAP3/NdeI特异性识别并酶切隐性等位基因。利用稻瘟病菌株JS001-20接种RIL与转基因材料,抗性表现与标记检测的结果完全一致,表明该CAPS标记准确可靠。分析稻种资源后发现,Pi25基因频率较低(1.2%),说明该基因在我国水稻稻瘟病抗性育种中还没有被充分利用。本文的研究结果特别是开发的2对识别并酶切显性等位基因的CAPS标记可用于分子标记辅助选择,改良我国早籼稻的稻瘟病抗性。 展开更多
关键词 水稻 稻瘟病抗性 酶切扩增多态性序列 标记辅助选择 单核苷酸多态性
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Rf-1位点CAPS标记对水稻不同胞质雄性不育育性恢复系的关系分析 被引量:6
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作者 谭亚玲 王石华 +5 位作者 洪汝科 文建成 郭艾 寇淑燕 金寿林 谭学林 《分子植物育种》 CAS CSCD 2009年第3期461-464,共4页
水稻育性恢复基因Rf-1是目前水稻上克隆的唯一恢复基因。通过位于Rf-1位点的两个特异性CAPS(cleavable amplified polymorphic sequences)标记对滇Ⅰ型、野败型、红莲型及BT型恢复系基因型分析,发现这四种不同胞质的恢复系在Rf-1位点具... 水稻育性恢复基因Rf-1是目前水稻上克隆的唯一恢复基因。通过位于Rf-1位点的两个特异性CAPS(cleavable amplified polymorphic sequences)标记对滇Ⅰ型、野败型、红莲型及BT型恢复系基因型分析,发现这四种不同胞质的恢复系在Rf-1位点具有相同的带型,滇Ⅰ型的两个保持系具有不同的带型。结果表明这四种不同胞质系统的恢复系均具有Rf-1基因。该结论与从恢复系选育的系谱分析的结果相一致的。 展开更多
关键词 水稻 育性恢复基因 细胞质雄性不育系 Rf-1位点 caps标记
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大麦1H特异性CAPs标记和ASA标记的创制 被引量:2
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作者 余波澜 黄朝峰 +1 位作者 周文娟 张文俊 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第6期550-555,F003,共7页
选取大麦1H染色体的STS标记MWG913特异性扩增小麦,把得到的片段进行克隆。用TaqI酶切分类并测序,把得到的序列同大麦的序列进行比较。依据比较结果,选取对大麦特异的内切酶,用该酶来酶切大麦、小麦、黑麦、长穗倡麦... 选取大麦1H染色体的STS标记MWG913特异性扩增小麦,把得到的片段进行克隆。用TaqI酶切分类并测序,把得到的序列同大麦的序列进行比较。依据比较结果,选取对大麦特异的内切酶,用该酶来酶切大麦、小麦、黑麦、长穗倡麦草、中间偃麦草、簇毛麦的MWG913扩增产物,获得对大麦1H染色体特异的CAPs标记。同时,依据酶切位点碱基的差异设计引物对扩增的产物进行第二次扩增,得到该位点的一对染色体特异性ASA标记。 展开更多
关键词 大麦 1H染色体特异性 STS标记 ASA标记 caps标记
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利用CAPS标记转育野生番茄的高产基因 被引量:4
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作者 李红 杜永臣 +5 位作者 王孝宣 宋明 高建昌 国艳梅 朱德蔚 戴善书 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期1738-1745,共8页
【目的】将野生多毛番茄中的高产基因渗入到普通番茄骨干亲本以创造高产番茄育种材料。【方法】TA1229是野生多毛番茄(Lycopersicon hirsutum acc.)LA1777的一个近等基因系,带有来源于LA1777的高产基因(QTL)。通过杂交、回交和分子标记... 【目的】将野生多毛番茄中的高产基因渗入到普通番茄骨干亲本以创造高产番茄育种材料。【方法】TA1229是野生多毛番茄(Lycopersicon hirsutum acc.)LA1777的一个近等基因系,带有来源于LA1777的高产基因(QTL)。通过杂交、回交和分子标记辅助选择方法对TA1229×9706的BC1群体进行遗传分析。【结果】获得23个比TA1229含有的外源染色体片段更短的渐渗系,其中16个渐渗系为高产番茄材料,并检测到了一个影响番茄成熟果实平均重量的QTL,将其定位于标记TG53和TG158之间。【结论】16份渐参系可用作为高产番茄新种质。 展开更多
关键词 caps QTL 分子标记辅助选择 高产 番茄
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