绵羊PRLR和CARTPT基因多态性与产羔数的关联分析

试验旨在研究绵羊催乳素受体(Prolactin receptor,PRLR)基因g.38976954C>A位点多态性和可卡因-苯丙胺调控转录肽(CART prepropeptide,CARTPT)基因g.9856267C>A、g.9854141G>C位点多态性与绵羊产羔数之间的关系,为绵羊多羔新品系的选育和高繁殖力机理研究提供参考。采用重测序和Sequenom MassARRAY?誖SNP技术对常年发情(小尾寒羊、湖羊、策勒黑羊)和季节性发情(草原型藏羊、苏尼特羊、滩羊、萨福克羊)的不同绵羊品种PRLR、CARTPT基因进行检测分型,然后与小尾寒羊产羔数关联分析。结果表明:g.38976954C>A位点有CC、CA和AA三种基因型,该位点基因型频率和等位基因频率在常年发情、季节性发情绵羊品种间差异不显著(P>0.05);g.9856267C>A位点存在CC、CA和AA三种基因型,g.9854141G>C位点存在GG、GC和CC三种基因型,这2个位点的基因型频率和等位基因频率在常年发情、季节性发情绵羊品种间差异均极显著(P<0.01)。群体遗传学分析结果表明,g.38976954C>A位点在小尾寒羊、草原型藏羊、滩羊和策勒黑羊中均表现为低度多态(PIC<0.25),在苏尼特羊、湖羊和萨福克羊中均表现为中度多态(0.25<PIC<0.5);g.9856267C>A位点在7个绵羊品种中均表现为低度多态(PIC<0.25);g.9854141G>C位点在小尾寒羊、苏尼特羊、草原型藏羊、滩羊、湖羊和策勒黑羊中均表现为低度多态(PIC<0.25),在萨福克羊中表现为中度多态(0.25<PIC<0.5)。卡方适合性检验结果表明,g.38976954C>A位点在7个绵羊品种中均处于哈代-温伯格不平衡状态(P<0.05);g.9856267C>A位点在草原型藏羊和湖羊中处于哈代-温伯格不平衡状态(P<0.05);g.9854141G>C位点在7个绵羊品种中均处于哈代-温伯格平衡状态(P>0.05)。关联分析表明,PRLR基因g.38976954C>A位点不同基因型与小尾寒羊各胎产羔数之间无显著关联(P>0.05),该位点不适用于小尾寒羊多羔性状选育;CARTPT基因g.9856267C>A和g.9854141G>C位点不同基因型与小尾寒羊各胎产羔数之间无显著关联(P>0.05),但这2个位点不同基因型各胎产羔数相差较大,推测该位点可能对产羔有影响。

绵羊CARTPT基因的生物信息学分析

试验旨在探究绵羊CARTPT基因所编码蛋白的结构与功能,利用生物信息学软件研究其理化性质、亲疏水性、信号肽、跨膜区域、蛋白质二级结构与三级结构、亚细胞定位和蛋白结构域、糖基化和磷酸化位点,并构建不同物种的CARTPT基因的系统发育树。结果表明:绵羊CARTPT基因CDS区全序列长为351 bp,编码116个氨基酸,编码蛋白的相对分子质量12790.18 Da,理论等电点8.22,脂肪系数114.48,总平均亲水性-0.006,属于分泌蛋白,没有跨膜区域结构;二级结构中主要以α-螺旋与无规则卷曲为主;亚细胞定位分析预测该蛋白最可能在细胞外基质发挥其生物学作用,有1个跨膜结构域;该蛋白质有5个丝氨酸(Ser)、1个苏氨酸(Thr)、2个酪氨酸(Tyr)磷酸化位点;系统进化树发现绵羊与山羊亲缘关系最近。